ヒト筋肉間脂肪組織からの核の単離と下流の単一核RNAシーケンシング

私たちの研究グループでは、ヒトにおける筋肉間脂肪組織(IMAT)の細胞組成と細胞特異的な転写プロファイルの理解を目指しています。IMATは、実際には筋繊維の間や周囲に存在する異所性脂肪貯蔵庫です。コンピューター断層撮影とMRIは、IMATボリュームを定量化することができ、最近、年齢とBMIの両方で増加し、筋肉変性疾患にも関連していることが示されています。

インビトロのセクレトーム研究は最近、IMAT分泌タンパク質がインスリン感受性、炎症プロファイル、およびヒト骨格筋の収縮性タンパク質発現に影響を与える能力を持っていることを示しました。生検中に採取されるIMAT組織の量が限られていることや、脂肪細胞の脂質を多く含む性質により、この組織は組織消化やシングルセルRNA-Seqと互換性がありません。そこで、少量の組織で核を単離し、それを下流の単一核RNA-Seqに利用できるプロトコールを開発したいと考えました。

このプロトコルにより、研究者は、さまざまな代謝性疾患の状態や介入に応答してIMATで発生する組成および細胞特異的な転写変化を決定できます。この情報は、IMATを直接標的にするか、IMATに分泌される因子を標的とすることにより、代謝性疾患を緩和するのに役立つ新しい治療戦略を開発する上で重要になることを願っています。この分野では、IMATの生物学、その細胞起源、IMATの内外に存在する他の細胞とのコミュニケーション、および食事や運動、薬物療法などのライフスタイル介入に対する分子応答に関するデータが著しく不足しています。

これらはすべて、私たちのグループにとって重要な研究課題です。