Name: DNAマイクロアレイチップ法による マイコバクテリウム 種の同定 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: 学ぶDNAマイクロアレイチップ法によるマイコバクテリウム種の同定。高感度・高特異性で迅速な診断を実現し、臨床微生物学における早期診断と患者治療の改善に貢献する革新的な分子診断技術です。

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<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
<li>Michelet, L., Boschiroli, M. L. Mycobacterium uberis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMichelet%2C+L+%22Microorganisms%22">Microorganisms</a>. 8 (11), 1701(2020).</li>
<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0.9%塩化ナトリウム注射(NaCl)</td><td>福州 HAIWANGFUYAO</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>アプライドバイオシステムズ増幅装置</td><td>サーモフィッシャーサイエンティフィック</td><td>Veriti 96ウェルサーマルサイクラー</td><td></td></tr><tr><td>キャピタルバイオ LuxScan10K/B</td><td>キャピタルバイオ</td><td>ルクススキャン10K/B</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio スライドウォッシャー 24&nbsp;</td><td>キャピタルバイオ</td><td>スライドワッシャー24&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp;遠心分離機&nbsp;</td><td>エッペンドルフ</td><td>5424R型</td><td>MaX.速度 15000 min-1</td></tr><tr><td>ハイブリダイゼーションバッファー</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>HybSet遺伝子マイクロアレイチップとカバー</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>マイコバクテリウム種同定キット</td><td>キャピタルバイオ</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>ネガティブコントロール、ポジティブコントロール</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>核酸抽出器</td><td>天龍</td><td>ジーンロテックス 96</td><td></td></tr><tr><td>PCR増幅試薬</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>pH 6.8リン酸緩衝液</td><td>上海元業バイオテクノロジー</td><td>R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>ピペッターとチップ</td><td>サーモサイエンティフィック</td><td>0.1 - 10 & ミュー;L、2 - 20 & ミュー;L、および20〜200&m。L、100-1000 &L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA核酸抽出または精製キット</td><td>天龍</td><td>qEx-DNA/RNA</td><td></td></tr><tr><td>SDSの</td><td>キャピタルバイオ</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>水酸化ナトリウム(NaOH)</td><td>XILONGS&nbsp;科学的</td><td>XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>SSCの</td><td>キャピタルバイオ</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>サーモスタット式ウォーターバス</td><td>スルイ</td><td>HH-W600</td><td></td></tr></tbody></table>

dnaマイクロアレイチップ法による マイコバクテリウム 種の同定

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

肯定的な結果 マイコバクテリウム属(内部統制、IC)および結核菌のプローブの場合、それらの陽性結果値はReceiver Operating Charactery(ROC)法によって決定されます。他の16個のNTMの検出に使用されるプローブの場合、それらの正の結果値はパーセンタイル法によって決定されます。
実験的な品質管理 ポジティブコントロール製品の検出結果は、「結核菌 複合体」である必要があります( 図3Aに示すように)。ネガティブコントロール製品の検出結果は、「 マイコバクテリウムなし」である必要があります( 図3Bに示すように)。対照産物の結果に誤りがある場合、同一実験中の全ての試料の結果は無効とされ、再審査が必要になります。
結果の解釈...

DNAマイクロアレイチップ法による マイコバクテリウム 種の同定

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

identification-of-mycobacterium-species-by-dna-microarray-chip-method

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この動画では、抗体マイクロアレイチップを用いて環境試料中のシアノバクテリア株を検出する方法を実演しています。さまざまな細菌を運ぶサンプルは、印刷された抗体と相互作用し、蛍光色素標識抗シアノバクテリア株抗体による免疫染色は、異なるスポットでの蛍光を通じて特定のシアノバクテリア株の存在を明らかにします。...

抗体マイクロアレイチップを用いたシアノバクテリア株検出技術

増幅マイクロアレイは大幅にエンドユーザーのために、マイクロアレイのワークフローを合理化し、単一の室内に非対称PCR増幅およびマイクロアレイハイブリダイゼーションを兼ね備えています。マイクロアレイワークフローを簡略化する日常的低リソース環境において使用することができるマイクロアレイに基づく診断を作成するために必要な最初のステップである。...

多剤耐性を実証<em&gt;結核菌</em&gt;増幅マイクロアレイ

顕微解剖は、広範囲の組織内のDNA、RNA、およびタンパク質の試験のために使用されている。レーザーキャプチャー顕微鏡（LCM）は、最も一般的に使用される方法ですが、新しい製粉技術、mesodissectionは、最近になって提供されています。私たちは、 結核菌肉芽腫の組織スライドを組み込みmesodissectedホルマリン固定パラフィンからのRNA抽出を示しています。...

回復への新規マイクロダイセクションアプローチ<em&gt;結核菌</em肺肉芽腫、ホルマリン固定パラフィン包埋から&gt;特異的転写

このビデオの記事は、遺伝子標的と2成分系の応答調節因子の結合部位を決定するためのin vitroのマイクロアレイベースの方法を説明します。...

細菌のための2つの成分​​規制システムを遺伝子標的を決定するために、DNA親和性精製チップ（DAP-チップ）方法

マトリックス支援レーザー脱離/イオン化飛行時間型質量分析(MALDI-TOF MS)および分子技術(16S...

16S rRNAの遺伝子配列決定およびMALDI-TOF MSによるレア細菌性病原体の同定

人間が消費する淡水貯留層にシアノバクテリア毒素が存在することは、水管理当局にとって大きな懸念事項です。水質汚染のリスクを評価するために、この記事では、抗体マイクロアレイチップを使用して、液体および固体サンプル中のシアノバクテリア株を野外で検出するためのプロトコルについて説明します。...

検出するための実験プロトコールシアノバクテリア抗体マイクロアレイチップと液体と固体試料中の

ここでは、提案する食細胞-結核菌 abscessusの相互作用を調査する 2 つのプロトコル: 細菌の細胞内の欠乏と RNA...

貪食細胞における細胞内のレプリケーションの結核菌 abscessusの病原性マーカーの同定

EUCASTは、自動血液培養のための直接抗菌剤感受性試験(AST)プロトコルを開発しました。しかし、質量分析に基づく微生物同定への依存は、自動微生物同定システムにおける直接接種調製プロトコルを使用することで回避することができます。このアプローチでは、サンプル収集から24時間以内にASTレポートを提供できます。...

質量分析を伴わないEUCAST RAST法を容易にする自動微生物同定システムを用いた直接微生物同定(英語)

iChip技術は、安価でシンプルな in-situ 分離装置を利用しており、土壌からの新規微生物の発見率を高めます。新しい微生物は、他のアプリケーションの中でも、土壌マイクロバイオームや天然物の発見に関連するさらなる研究に使用できます。...

iChip技術を用いた土壌微生物の分離

このプロトコルは、マイコバクテリアから高品質なDNAを抽出するためのCTAB法を説明し、硬く菌酸豊富な細胞壁による課題を克服します。このプロセスには、酵素による消化、CTABによる細胞溶解、有機抽出およびエタノール沈殿によるDNA精製が含まれます。この方法は分子研究に適したDNAを生成し、マイコバクテリア研究にも信頼性があります。...

セチルトリメチルアンモニウム・ブロマイド技術によるマイコバクテリウム種からの全ゲノムデオキシリボ核酸抽出

学ぶDNAマイクロアレイチップ法によるマイコバクテリウム種の同定。高感度・高特異性で迅速な診断を実現し、臨床微生物学における早期診断と患者治療の改善に貢献する革新的な分子診断技術です。

DNAマイクロアレイチップ法による マイコバクテリウム 種の同定

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