Stereo-seq による種に依存しないトランスクリプトームの包括的な空間プロファイリング

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2025年10月31日

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Anna K. Casasent^*¹ , Danielle L. Stolley^*¹ , Basant T. Gamal^*² , Arnold Dahay² , Samuel Mok² , Lidia Rocha³ , Vincent Li³ , Arizona T. Nguyen³ , Boyu Zhang⁴ , Clay T. Brasuell⁴ , Erika J. Thompson⁴ , Thomas Huynh³ , Jared K. Burks¹ , Sammy Ferri-Borgogno²

¹Department of Hematopoietic Biology and Malignancies, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ²Department of Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ³Department of Veterinary Medicine & Surgery, University of Texas MD Anderson Cancer Center, ⁴Department of Genetics, The University of Texas MD Anderson Cancer Center

^* These authors contributed equally

この記事では、組織構造を維持しながら多様なトランスクリプトームの高解像度マッピングを可能にするStereo-seqを使用して、ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片から宿主、ウイルス、真菌、およびマイクロバイオームRNAの包括的な空間トランスクリプトームプロファイリングを実行するプロトコルを紹介します。