Name: 早期がん検出におけるパーソナライズされたタンパク質コロナプロファイリングのための標準化されたSDS-PAGEワークフロー (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-19T12:50:00.000+00:00
Duration: 10 min 2 s
Description: 学ぶナノ粒子タンパク質コロナプロファイリングによる膵管腺がんの早期診断法。SDS-PAGEワークフローは再現性が高く低コストで、臨床現場でのがん特異的バイオマーカー検出に適用可能です。

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<ol><li>Cai, R., Chen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+crown+and+the+scepter%3A+Roles+of+the+protein+corona+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Mater%22%5BJournal%5D)">The crown and the scepter: Roles of the protein corona in nanomedicine.</a> Adv Mater. 31 (45), 1805740(2019).</li>
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<li>Renzi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structuring+lipid+nanoparticles%2C+DNA%2C+and+protein+corona+into+stealth+bionanoarchitectures+for+in+vivo+gene+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Structuring lipid nanoparticles, DNA, and protein corona into stealth bionanoarchitectures for in vivo gene delivery.</a> Nat Commun. 15 (1), 9119(2024).</li>
<li>Van Dorpe, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+automated+liquid+handling+in+the+separation+workflow+of+extracellular+vesicles+enhances+specificity+and+reproducibility%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">Integrating automated liquid handling in the separation workflow of extracellular vesicles enhances specificity and reproducibility.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 157(2023).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+protein+corona+on+graphene+oxide%3A+Implications+for+biomedical+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">The influence of protein corona on graphene oxide: Implications for biomedical theranostics.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 267(2023).</li>
<li>Jiříčková, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+and+applications+of+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22Materials%22%5BJournal%5D)">Synthesis and applications of graphene oxide.</a> Materials. 15 (3), 920(2022).</li>
<li>Saorin, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+redefined+protocol+for+protein+corona+analysis+on+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nanosci+Au%22%5BJournal%5D)">A redefined protocol for protein corona analysis on graphene oxide.</a> ACS Nanosci Au. , (2025).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-protein+corona+enhances+accuracy+of+Ca-19.9-based+pancreatic+cancer+classification%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-protein corona enhances accuracy of Ca-19.9-based pancreatic cancer classification.</a> Nanoscale. 17 (12), 7066-7075 (2025).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+the+accuracy+of+pancreatic+cancer+clinical+staging+by+exploitation+of+nanoparticle-blood+interactions%3A+A+pilot+study%5BTitle%5D)+AND+%22Pancreatology%22%5BJournal%5D)">Improving the accuracy of pancreatic cancer clinical staging by exploitation of nanoparticle-blood interactions: A pilot study.</a> Pancreatology. 18 (6), 661-665 (2018).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+decade+of+the+liposome-protein+corona%3A+Lessons+learned+and+future+breakthroughs+in+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">A decade of the liposome-protein corona: Lessons learned and future breakthroughs in theranostics.</a> Nano Today. 47, 101657(2022).</li>
<li>Wu, S. Y., An, S. S. A., Hulme, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+applications+of+graphene+oxide+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">Current applications of graphene oxide in nanomedicine.</a> Int J Nanomedicine. 10 Suppl 1, 9-24 (2015).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+detection+of+pancreatic+cancer+by+combining+a+nanoparticle-enabled+blood+test+and+plasma+levels+of+acute-phase+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Multiplexed detection of pancreatic cancer by combining a nanoparticle-enabled blood test and plasma levels of acute-phase proteins.</a> Cancers. 14 (19), 4658(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1.5MLプロテインLoBindチューブ</td><td>エッペンドルフ</td><td>22431081</td><td></td></tr><tr><td>10倍のトリス/グリシン/SDS</td><td>バイオラッド</td><td>1610732</td><td></td></tr><tr><td>遠心分離機</td><td>ラボテクニク</td><td>Z 216 MK ヘルムレ</td><td>18,620 RCFで4度、20分間使用;C</td></tr><tr><td>ケミドックイメージングシステム</td><td>バイオ・ラッド</td><td>12003153</td><td>ゲル画像取得に使用</td></tr><tr><td>クロロホルム</td><td>シグマ・オルドリッチ</td><td>C2432-1L</td><td>DOTAP用の溶剤</td></tr><tr><td>コーニング1-200およびマイクロ;L ユニバーサルフィット バルクパックドピペットチップ</td><td>コーニング</td><td>4845</td><td></td></tr><tr><td>クライテリオンTGX シミフリープレキャストジェル</td><td>バイオラッド</td><td>5678095</td><td></td></tr><tr><td>蒸留水 6 x 1L</td><td>サーモフィッシャー</td><td>15230001</td><td></td></tr><tr><td>DOTAP(1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウム-プロパン)</td><td>アヴァンティ極性脂質</td><td>890890P-200mg</td><td>カチオン性リポソームの製剤に用いられ、クロロホルムに溶解し、蒸発、水和し、押し出されます</td></tr><tr><td>エンデューロ 300V電源</td><td>labnet&nbsp;</td><td>E0303-230V</td><td></td></tr><tr><td>GloMax ディスカバーマイクロプレートリーダー</td><td>プロメガ</td><td>GM3000</td><td></td></tr><tr><td>金ナノ粒子(クエン酸塩安定化)</td><td>シグマ・オルドリッチ</td><td>742031-25ML</td><td>ナノマテリアルとして使用され、さらなる精製なしで使用された</td></tr><tr><td>グラデーションポリアクリルアミドゲル(4&ndash;20% TGX)</td><td>バイオ・ラッド</td><td>5678095</td><td>SDS&ndashで使用;ページ</td></tr><tr><td>グラント・インストゥルメント&nbsp;サーモシェイカーHC24N(24本×1.5mLマイクロチューブ)</td><td>フィッシャー・サイエンティフィック</td><td>PHMT-PSC24N</td><td></td></tr><tr><td>グラフェン酸化物(GO)溶液</td><td>グラフェネア</td><td>GO-4-1000</td><td>ナノマテリアルとして使用され、0.25 mg/mLに希釈し、超音波処理</td></tr><tr><td>ヒトプラズマ(HP)</td><td>シグマ・オルドリッチ</td><td>P9523-5ML</td><td>ナノ粒子インキュベーションに使用</td></tr><tr><td>ImageLabソフトウェア</td><td>バイオラッド。バージョン 6.1.0.07</td><td>/</td><td>ゲル画像をtiffファイルとしてエクスポートするために使用</td></tr><tr><td>Laemmliロードバッファ2倍</td><td>バイオラッド</td><td>1610737</td><td>ペレットの再懸浮に使用</td></tr><tr><td>MATLAB</td><td>MathWorks。バージョンR2022a</td><td>/</td><td>画像処理、データ解析、プロファイル計算に使用</td></tr><tr><td>ミニエクストルーダー</td><td>アヴァンティ極性脂質</td><td>610020</td><td>リポソーム製剤に使用</td></tr><tr><td>NuPAGEサンプル還元剤(10倍)</td><td>サーモ・サイエンティフィック</td><td>NP004</td><td></td></tr><tr><td>リン酸塩塩水バッファー</td><td>コーニング&nbsp;</td><td>21-031cm</td><td>DOTAP-HPサンプルに使用</td></tr><tr><td>ピアースBCAプロテインアッセイキット、1キット(1リットル)</td><td>サーモフィッシャー</td><td>23225</td><td></td></tr><tr><td>ピペットチップ 0.5〜10ul クリア</td><td>アクシゲン</td><td>T-300-STK</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN L P10L、0.5-10 & micro;L、メタルエジェクター</td><td>ギルソン</td><td>FA10002M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P20、2-20およびマイクロ;L、メタルエジェクター</td><td>ギルソン</td><td>F144056M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P200、20-200およびマイクロ;L、メタルエジェクター</td><td>ギルソン</td><td>F144058M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAX 自動ピペッティングシステム</td><td>ギルソン</td><td>GSYS0021</td><td>自動サンプル取り扱いに使用</td></tr><tr><td>ポリカーボネートフィルター(0.1 & micro;m)</td><td>アヴァンティ極性脂質</td><td>610005-1EA</td><td>リポソーム押出に使用</td></tr><tr><td>Precision Plus Protein オールブルーのプレスティンドプロテイン標準</td><td>バイオラッド</td><td>1610373</td><td></td></tr><tr><td>Precision Plusタンパク質 染色されていない標準 nbsp;</td><td>バイオラッド</td><td>1610363EDU</td><td></td></tr><tr><td>ビブラセルソニックケーター VC505</td><td>ソニックス・アンド・マテリアルズ社</td><td>VC505</td><td></td></tr><tr><td>ゼータサイザー</td><td>マルバーン</td><td>ZS90</td><td>動的光散乱(DLS)および微小電気泳動(ME)測定に使用</td></tr></tbody></table>

早期がん検出におけるパーソナライズされたタンパク質コロナプロファイリングのための標準化されたsds-pageワークフロー

Standardized SDS-PAGE Workflow for Personalized Protein Corona Profiling in Early Cancer Detection

早期がん検出におけるパーソナライズされたタンパク質コロナプロファイリングのための標準化されたSDS-PAGEワークフロー

The formation of a personalized protein corona (PC) on nanoparticles (NPs) upon exposure to biological fluids has emerged as a promising, minimally ...

standardized-sds-page-workflow-for-personalized-protein-corona

Research

JoVE Journal

Cancer Research

がん研究

我々は、その後、表面抗原（DotScan...

抗体マイクロアレイと蛍光多重を用いた大腸癌の細胞表面タンパク質のプロファイリング

RPPAは、蛍光標識抗体を用いて、同時に尋問するニトロセルローススライド上に印刷されたサンプルの何百ものタンパク質の発現を可能にします。このテクニックは、明細胞腎癌内薬物治療の異質の効果を研究するために適用されています。...

個々の腎細胞がんの中のタンパク質発現変動を探るために逆相タンパク質アレイ（RPPA）の使用

癌細胞プロテオームの詳細な分析は、新規の薬物標的と診断バイオマーカーの同定を容易にします。ここでは、液体および固体腫瘍に由来するがん細胞亜集団における(リン酸化)プロテオームの定量解析のための実験ワークフローについて説明します。これは、細胞濃縮戦略と定量的なSuper-SILACベースの質量分析を組み合わせることで達成されます。...

液体および固形腫瘍由来の癌細胞のプロテオームの定量的質量分析プロファイリング

このビデオの目的は、臨床の場で珍しい変異を検出するために、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）参照標準細胞株およびデジタル滴PCR（ddPCR）分析から、自動化されたDNAの抽出を実行する方法を実証することです。 FFPEサンプルにおける変異を検出することはFFPEサンプルでddPCRの臨床的有用​​性を示します。...

ホルマリン固定パラフィン包埋参照標準細胞株にBRAF V600E変異を検出するデジタルドロップレットPCRを採用

RNAベースのアプローチを使用して、固形腫瘍組織の定量的免疫プロファイルを決定し、免疫腫瘍学バイオマーカー探索のための臨床コホートを活用することは、分子および情報学的プロトコルを介して記述されています。...

固形腫瘍の予知免疫モデリング

ここでは、腫瘍微小環境をより適切に特徴付け、特定の細胞集団を特定するために、空間オミクス技術の関心領域(ROI)を微調整するためのプロトコルについて説明します。プロテオミクスアッセイでは、カスタマイズされたプロトコルを自動化してROIを選択し、トランスクリプトミクスアッセイでは50 μmのROIを利用して微調整することができます。...

組織におけるタンパク質およびRNA発現の空間プロファイリング:仮想マイクロダイセクションの微調整へのアプローチ

プロテオミクス調節不全は、びまん性浸潤性神経膠腫の蔓延に重要な役割を果たしますが、いくつかの関連タンパク質は未同定のままです。デジタル空間処理(DSP)は、浸潤性神経膠腫の浸潤および遊走に寄与する可能性のある候補タンパク質の発現差を特徴付けるための効率的でハイスループットなアプローチを提供します。...

成人型びまん性浸潤神経膠腫における微小環境のキャラクタリゼーションのためのディジタル空間プロファイリング

ここでは、ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片の単離関心領域を用いた質量分析法に基づくプロテオミクス法を確立します。このプロトコールは、アーカイブされたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片の特定の組織領域からのプロテオームを解析するために使用されます。...

選択した組織領域を用いた質量分析ベースのプロテオミクスのための合理化されたアプローチ

ここでは、化学プローブと質量分析を使用して、天然細胞および組織からの疾患特異的タンパク質間相互作用の捕捉と同定を可能にするプロトコルを提示します。得られた相互作用データセットは、専用のWebベースのプラットフォームを介して分析され、動的なネットワーク機能不全と疾患に関連する経路の変化を明らかにします。...

疾患における機能不全タンパク質間相互作用のマッピング

このプロトコルは、早期転移性疾患を検出し、マクロ転移へのその後の進行を予測するために、乳癌骨転移のラットモデルにおける磁気共鳴画像(MRI)および陽電子放出断層撮影/コンピュータ断層撮影(PET/CT)に由来する画像化パラメータを組み合わせて使用する機械学習アルゴリズムを訓練するように設計された。...

実験ラットモデルにおける骨転移の早期発見のための機械学習アルゴリズム

学ぶナノ粒子タンパク質コロナプロファイリングによる膵管腺がんの早期診断法。SDS-PAGEワークフローは再現性が高く低コストで、臨床現場でのがん特異的バイオマーカー検出に適用可能です。

早期がん検出におけるパーソナライズされたタンパク質コロナプロファイリングのための標準化されたSDS-PAGEワークフロー

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