Light-patterned Hydrogel Degradation을 사용한 표적 박테리아 콜로니 분리

Method Article

Light-patterned Hydrogel Degradation을 사용한 표적 박테리아 콜로니 분리

September 26th, 2025

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

출처: Fattahi, N., et al. 박테리아 스크리닝, 선택 및 분리를 위한 광분해성 하이드로겔 인터페이스. J. Vis. 경험. (2021).

이 비디오는 UV 광선을 사용하여 광분해성 하이드로겔에서 박테리아 콜로니를 추출하는 방법을 보여줍니다. 특정 콜로니가 선택되고 패턴화된 빛 노출이 국부적인 하이드로겔 분해를 시작하도록 설계되었습니다. 빛의 강도와 지속 시간을 조정한 후 UV 광선이 적용되어 콜로니가 방출됩니다. 그런 다음 콜로니는 튜브를 통해 흡인되고 다운스트림 분석을 위해 튜브로 옮겨집니다.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. 박테리아 균주 및 배양 프로토콜

적절한 성장 배지로 보충된 한천 플레이트의 박테리아 줄무늬 콜로니. 본 보고서에서, B. subtilis (균주 1A1135, Bacillus Genetic Stock Center)를 ATGN (0.079 M KH₂PO₄(인산이수소칼륨), 0.015 M (NH₄)₂SO₄ (황산암모늄), 0.6 mM MgSO₄·7H₂O (황산마그네슘 칠수화물), 0.06 mM CaCl₂·2H₂O (염화칼슘 이수화물), 0.0071 mM MnSO₄·H₂O (황산망간(II) 일수화물), 100μg/mL 암피실린이 보충된 ATGN 한천 플레이트에 100μg/mL 스펙티노마이신 및 대장균(균주 25922, ATCC)이 보충된 0.125 M FeSO₄·7H₂O(황산제일철 칠수화물), 28 mM 포도당, pH: 7 ± 0.2, 15 g/L 한천 플레이트.
참고: 이러한 물질로 하이드로겔 캡슐화 및 방출에 대한 이전 보고에서는 A. tumefacie....

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Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

그림 1: 티올화된 유리 커버슬립의 하이드로겔 형성. (A) 두께가 12.7μm인 스페이서를 반응성 티올기를 포함하는 베이스 커버슬립의 반대쪽 두 면에 배치합니다. (B) 하이드로겔 전구체 용액을 비반응성 불소화 유리 슬라이드 위에 피펫팅합니다. (C) 12.7μm 두께의 하이드로겔을 형성하기 위해 비반응성 유리 슬라이드를 스페이서에 배치합니다. (D) 비반응성 유리 슬라이드를 부드럽게 제거하고 하이드로겔을 베이스 커버슬립에 부.......

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Materials

List of materials used in this article
Name	Company	Catalog Number	Comments
(3-메르캅토프로필)트리에톡시실란	시그마-알드리치	175617-25G	> 95%
알코녹스 세제 분말	알코녹스	1104
황산암모늄	피셔 케미칼	A702-500	ACS 입상 인증
오토클레이브 SK300C	야마토 사이언티픽	18016
고초균 1A1135	Bacillus 유전자 스톡 센터	1A1135
명시야 정립 현미경	올림푸스 주식회사	BX51 시리즈
염화칼슘, 무수	피셔 케미칼	C614-500	데시케이터 펠릿용, 4-20 메쉬
원심분리기 5702	에펜도르프	5702
구연산 일수화물	시그마-알드리치	C1909-500G	ACS 시약, > 99.0%
D-포도당(포도당)	VWR 암레스코 생명 과학	0188-1KG
DOWSIL 184 실리콘 엘라스토머 베이스	다우 실리콘 코퍼레이션		보관 온도: -30-60 °C
DOWSIL 184 실리콘 엘라스토머 경화제	다우 실리콘 코퍼레이션		보관 온도: < 32 C
EPOCH2 마이크로플레이트 분광 광도계	BioTek 인스트루먼트	에포크2
대장균 ATCC 25922	써모 피셔 사이언티픽	R19020
에탄올, 무수	피셔 케미칼	459844
피셔 브랜드 현미경 커버 유리	피셔 사이언티픽	12540ᅡ
Fisherfinest 프리미엄 현미경 슬라이드 플레인	피셔 사이언티픽	12-544-4
과산화수소 용액	시그마-알드리치	216763-500ML	억제제, H2O 30 wt% 함유
Incu-Shaker Mini	벤치 마크	E5-0014-01
이소프로파놀	시그마-알드리치	190764
황산마그네슘, 7-수화물	마크롱 정밀 화학	6066-04	아반토르 퍼포먼스 머티리얼즈, Inc.
메탄올	시그마-알드리치	179337-4L	ACS 시약, > 99.8%
NanoDrop One 분광 광도계	써모 사이언티픽	ND-ONEC-W
질소, 압축	매서슨	UN1066
산소 플라즈마 클리너	해릭 플라즈마	PDC-001-HP
펜타에리스리톨 테트라(메르캅토에틸) 폴리옥시에틸렌(4팔-PEG)	노프 아메리카 코퍼레이션	PTE-100SH	선브라이트-PTE-100SH
인산염 완충 식염수(PBS), 10X	VWR 암레스코 생명 과학	K813-500ML	15 °C–30 °C 사이에서 보관
폴리디메틸 실록산(PDMS) 슬리가드 184	다우 코닝	4019862
다각형400	마이텍스	DSI-D-000
프리미엄 현미경 슬라이드	피셔 사이언티픽	12-544-4	25 x 75 x 1 밀리미터
소금	시그마 생명 과학	S5886-500G	세포 배양에 적합한 바이오시약
수산화나트륨	시그마-알드리치	S8045-500G	BioXtra, > 98%, 펠릿(무수)
인산나트륨 일염기성 이수화물	시그마-알드리치	71505-250G	BioUltra, 분자 생물학용, > 99.0% (T)
스테인레스 스틸 두께 측정기	정밀 브랜드 제품	77739
황산	시그마-알드리치	320501-2.5L
톨루엔, 무수, 99.8%	시그마-알드리치	244511-1L	무수, > 99.8%
트리클로로(1H,1H,2H,2H 퍼플루오로옥틸) 실란(TPS), 97%	시그마-알드리치	448931-10G
트립스 콩 국물	시그마-알드리치	22092-500G	미생물학용
초음파 초음파 발생기	피셔 사이언티픽	FS-110H

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