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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
출처: Iredale, J. A., et al. 미세 전극 어레이를 사용하여 척추 통각 회로의 네트워크 활동 기록. J. Vis. 특급 (2022).
이 비디오는 쥐의 척수 절편에서 신경 네트워크 활동을 연구하기 위한 미세 전극 어레이 기반 분석을 보여줍니다. 먼저, 슬라이스의 표재성 등쪽 뿔(SDH)의 전기생리학적 활성을 기록합니다. 그런 다음, 탈분극을 연장하기 위해 칼륨 채널 억제제가 도입되어 뉴런 네트워크 전반에 걸쳐 동기 리듬 활성을 일으킵니다.
검체 채취와 관련된 모든 절차는 연구소의 IRB 지침에 따라 수행되었습니다.
1. 체외 전기생리학
2. 자당 치환 인공 뇌척수액
참고: 자당 치환 aCSF는 절제 및 척수 절단 중에 사용됩니다. 이름에서 알 수 있듯이 자당은 삼투압을 유지하면서 이러한 절차 동안 신경 세포 흥분을 줄이기 위해 NaCl을 대체합니다. 자세한 구성은 표 1을 참조하십시오.
3. 미세 전극 어레이 준비
참고: MEA의 접촉면은 친수성으로 만들기 위해 전처리가 필요합니다.
4. 급성 척수 절제 준비
5. 미세 전극 어레이 기록
참고: 다음 단계에서는 척수 절편에 대한 MEA 기반 실험의 기록 데이터를 사용하는 방법을 자세히 설명합니다. 실험에 따라 여러 MEA 설계를 사용할 수 있습니다. 이 실험에 사용된 MEA에 대한 설계 세부 사항은 표 2 및 그림 2에 나와 있습니다. Egert et al. 및 Thiebaud et al.은 각각 평면 및 3차원(3D) MEA에 대한 자세한 설계 정보를 발표했습니다. 두 MEA 유형 모두 60개의 질화티타늄 전극으로 구성되며, 질화규소 절연층과 질화티타늄 트랙 및 접촉 패드가 있습니다.
표 1: 인공 뇌척수액 조성물.
| 화학 | aCSF(mM) | aCSF (g/100mL) | 자당 치환 aCSF(mM) | 자당 치환 aCSF (g/100 mL) | 고칼륨 aCSF(mM) | 고칼륨 aCSF (g/100mL) |
| 염화나트륨 (NaCl) | 118 | 의0.690 아오 | 이트- | - | 118 | 의0.690 아오 | 이트
| 탄산수소나트륨(NaHCO3) | 25 | 분0.210 | 호25 | 분0.210 | 호25 | 분0.210 | 호
| 포도당 | 10 | 분0.180 | 호10 | 분0.180 | 호10 | 분0.180 | 호
| 염화칼륨(KCl) | 2.5 | 호0.019 | 호2.5 | 호0.019 | 호4.5 | 0.034 | 명
| 인산이수소나트륨 (NaH2PO4 ) | 1 | 개0.012 | 1 | 개0.012 | 1 | 개0.012 |
| 클로라이드마그네슘(MgCl2) | 1 | 개0.01 | 호1 | 개0.01 | 호1 | 개0.01 | 호
| 염화칼슘 (CaCl2 ) | 2.5 | 호0.028 | 2.5 | 호0.028 | 2.5 | 호0.028 |
| 자당 | - | - | 250 | 명8.558 | 분- | - |
표 2: 미세 전극 어레이 레이아웃.
| 미세 전극 어레이 레이아웃 | ||||
| 미세전극 어레이 모델 | 60MEA 200/30iR-Ti | 60-3DMEA 100/12/40iR-티 | 60-3DMEA 200/12/50iR-Ti | 60MEA 500/30iR-Ti |
| 평면 또는 3차원(3D) | 평면 | 3D (3D) | 3D (3D) | 평면 |
| 전극 그리드 | 8 엑스 8 | 8 엑스 8 | 8 엑스 8 | 6 엑스 10 |
| 전극 간격 | 200 μm의 | 100 μm의 | 200 μm의 | 500 μm |
| 전극 직경 | 30 μm의 | 12 μm의 | 12 μm의 | 30 μm의 |
| 전극 높이(3D) | 해당 사항 없음 | 40 μm의 | 50 μm의 | 해당 사항 없음 |
| 실험 | 가로 슬라이스 | 가로 슬라이스 | 시상 + 수평 | 시상 + 수평 |

그림 1: 척수 절편 방향, 장착 및 절단 방법. (A) 가로 슬라이스에는 지지 홈이 절단된 스티로폼 절단 블록이 필요합니다. 척수는 지지 홈의 블록에 기대어 있으며, 탯줄의 등쪽은 블록에서 반대쪽을 향합니다. 블록과 코드는 시아노아크릴레이트 접착제로 절단 스테이지에 접착됩니다. (B) 시상 절편은 절단 단계에 얇은 선의 시아노아크릴레이트 접착제를 놓은 다음 척수를 접착제 옆으로 배치하여 준비합니다. (C) 수평 슬라이스는 절단 스테이지에 얇은 시아노아크릴레이트 접착제 선을 배치한 다음 척수 복부 쪽을 접착제에 아래로 향하게 배치하여 준비합니다.

그림 2: 미세전극 어레이의 조직 위치. (A) 이미지는 MEA가 제자리에 배치된 열린 MEA 헤드스테이지를 보여줍니다. (B) A와 동일하며 MEA 헤드스테이지가 녹음을 위해 폐쇄되고 조직 관류 시스템이 마련되어 있습니다. (C) 이미지는 제조업체에서 제공한 MEA를 보여줍니다. 헤드스테이지의 금색 스프링과 접촉하는 접촉 패드와 조직 목욕 용액과 조직 슬라이스를 담고 있는 MEA 조직 수조가 표시됩니다. 중앙의 빨간색 사각형으로 강조 표시된 영역은 전극 어레이의 위치입니다. (D) 회로도는 이 연구에 사용된 두 개의 MEA 전극 구성을 보여주며, 자세한 내용은 표 2에 나와 있습니다. 기준 전극은 파란색 사다리꼴로 표시됩니다. 왼쪽 MEA 전극 레이아웃은 60전극 정사각형 구성을 보여주며, 직경 30μm 전극이 200μm 간격으로 떨어져 있거나 200μm 간격 및 100μm 간격의 3차원 MEA(60MEA200/12/50iR-Ti 및 60MEA100/12/40iR-Ti)가 있는 제시된 작업 모델 60MEA200/30iR-Ti에서 가장 많이 사용됩니다. 각각. 왼쪽 MEA 전극 레이아웃은 6 x 10 전극 직사각형 레이아웃-60MEA500/30iR-Ti를 보여줍니다. (E) 기록을 위해 배치된 횡척수 절편이 있는 60MEA100/12/40iR-Ti 정사각형 MEA의 고배율 이미지. 슬라이스는 전극 열 3-8에 있습니다. 어떤 조직에도 접촉하지 않는 전극의 맨 윗줄은 기준 전극 역할을 합니다. SDH 영역은 반투명 띠로 나타납니다. 이 경우 SDH는 MEA의 4, 5, 6행과 2, 3, 4, 5, 7열의 전극 위에 놓입니다. 눈금 막대 = 200μm. 약어: MEA = microelectrode array; SDH = 표재성 등뿔.

그림 3: 데이터 기록 및 분석 도구 레이아웃과 세포 외 활동 전위 및 국소 자기장 전위 파형을 보여주는 미세 전극 어레이 기록 예. (A) 회로도는 MEA 데이터 수집에 사용되는 사전 구성된 기록 템플릿을 보여줍니다. MEA2100와 녹음(헤드스테이지/앰프) 도구를 연결하면 데이터의 이름을 지정하고 저장할 수 있습니다. 원시 데이터의 4가지 예시 추적(오른쪽, 5분 에포크)은 베이스라인에서의 활성, 4-AP 적용 후 12분, 설정된 4-AP 활성 후 추가 15분 및 TTX(1μM)의 수조 적용 후 활성을 보여주는 하나의 MEA 채널에 의해 수집되었습니다. 4-AP(두 번째 추적)를 추가하면 배경 소음과 EAP/LFP 활동이 확실히 증가합니다. 중요한 것은 4-AP 유도 활성이 확립된 후 최소 15분 동안 활성이 비교적 안정적으로 유지된다는 것입니다(세 번째 추적). TTX(1μM)를 추가하면 모든 활성(하단 트레이스)이 제거됩니다. (B) 회로도(왼쪽)는 데이터 분석을 위한 분석기 소프트웨어 구성을 보여줍니다. 원시 데이터 탐색기 도구는 녹음 소프트웨어에서 수집한 녹음을 가져오는 데 사용됩니다. 그런 다음 이러한 데이터는 배경 잡음을 제거하기 위해 다른 전극에서 선택한 기준 전극 신호를 빼는 교차 채널 필터 도구를 통해 실행됩니다. 데이터는 EAP 필터와 LFP 필터 도구를 통과하여 각 파형에 대한 신호 대 잡음 관계를 최적화합니다. 이 단계에 따라 EAP 경로 데이터는 임계값이 설정되는 EAP 탐지기 도구로 들어갑니다. EAP는 감지된 다음 EAP 분석기 도구로 전송되며, 여기서 각 이벤트의 지연 시간이 기록되고 txt로 내보내집니다. 파일. 해당 LFP 툴킷을 사용하여 LFP 데이터에 대해 동일한 워크플로가 발생합니다. 오른쪽 트레이스는 다양한 세포 외 파형을 포함하는 단일 MEA 채널의 데이터를 보여줍니다. EAP 및 LFP 신호의 위치는 위의 '카운트 래스터'에서 강조 표시됩니다. 하위 트레이스는 다양한 LFP 신호(다양한 모양에 유의) 및 개별 세포 외 EAP(빨간색 원)를 포함하여 확장된 시간 척도의 파형을 보여주는 상위 기록(빨간색 막대로 표시)의 epoch입니다. LFP/EAP 파형 및 극성은 이러한 신호를 생성하는 뉴런의 수, 기록 전극과의 근접성 및 주변 전극과의 상대적인 위치에 따라 달라집니다. 약어: MEA = microelectrode array; EAP = 세포외 활동 전위; LFP = 국소 자기장 전위; 4-AP = 4-아미노피리딘; TTX = 테트로도톡신.
| 4-아미노피리딘 | 시그마-알드리치 | 275875-5지 | |
| 100% 에탄올 | 써모 피셔 | 아자214-2.5LPL | |
| CaCl2 1M | 뱅크시아 사이언티픽 | 0430/1L | |
| 카보녹스(카보겐 - 95% O2, 5% CO2) | 코어가스 | 219122 | |
| 구부러진 긴 손잡이 스프링 가위 | 정밀 과학 도구 | 15015-11 | 년|
| 맞춤형 공기 인터페이스 배양 챔버 | |||
| 소 태아 세럼 | 써모 피셔 | 10091130 | |
| 겸자 뒤몽 #5 | 정밀 과학 도구 | 11251-30 | 년|
| 포도당 | 써모 피셔 | 아자783-500G | |
| 호스 세럼 | 써모 피셔 | 16050130 | |
| 도립 현미경 | 자이스 | 액시버트10 | |
| 케이클 | 써모 피셔 | 아자383-500G | |
| 케타민 | 세바 | KETALAB04 | |
| 대형 수술용 가위 | 정밀 과학 도구 | 14007-14 | 년|
| Loctite 454 순간 접착제 | 볼트 및 산업 용품 | 엘4543G | |
| MATLAB을 | 참조하십시오.매스웍스 | R2018b를 참조하십시오. | |
| MEA, 3차원 | 멀티채널 시스템 | 60-3DMEA100/12/40iR-Ti, 60-3DMEA200/12/50iR-Ti | 1개의 내부 기준 전극이 있는 60개의 질화티타늄(TiN) 전극이 8x8 정사각형 그리드로 구성되어 있습니다. 전극은 직경이 12μm, 높이가 40μm(100/12/40) 또는 50μm(200/12/50)이고 등거리 간격으로 100μm(100/12/40) 또는 200μm(200/12/50) 떨어져 있습니다. |
| MEA 헤드 스테이지 | 멀티채널 시스템 | MEA2100-HS60 | |
| MEA 인터페이스 보드 | 멀티채널 시스템 | MCS-IFB 3.0 멀티부트 | |
| MEA 네트 | 멀티채널 시스템 | 알라 HSG-MEA-5BD | |
| MEA 관류 시스템 | 멀티채널 시스템 | 조달청2 | |
| MEA, 평면 | 멀티채널 시스템 | 60MEA200/30iR-Ti, 60MEA500/30iR-Ti | 1개의 내부 기준 전극이 있는 60개의 질화티타늄(TiN) 전극, 8x8 정사각형 그리드(200/30) 또는 6x10 직사각형 그리드(500/30)로 구성됨. 전극은 직경이 30μm이고 200μm(200/30) 또는 500μm(500/30) 간격으로 등거리 떨어져 있습니다. |
| 재질 보기 MgCl2 | 써모 피셔 | 아자296-500G | |
| 현미경 카메라 | 모틱 | 모티캠 X Wi-Fi | |
| 다중 채널 분석기 소프트웨어 | 멀티채널 시스템 | V 2.17.4 | |
| Multi Channel Experimenter 소프트웨어 | 멀티채널 시스템 | V 2.17.4 | |
| 염화나트륨 | 써모 피셔 | 아자465-500G | |
| 나HCO3 | 써모 피셔 | 아자475-500G | |
| 나H2PO4 | 써모 피셔 | ACR207805000 | |
| 롱거스 | 정밀 과학 도구 | 16021-14 | 년|
| 작은 봄 가위 | 정밀 과학 도구 | 91500-09 | 년|
| 작은 수술용 가위 | 정밀 과학 도구 | 14060-09 | 년|
| 자당 | 써모 피셔 | 아자530-500G | |
| 초강력 접착제 | 시아노아크릴레이트 접착제 | ||
| 테트로도톡신 | 아브캠 | AB120055 | |
| 방진 테이블 | 뉴포트 | VH3048W-OPT | |
| 진동하는 마이크로톰 | 라이카 | VT1200 S |