방법 논문

쥐 뇌 절편에서 RNA 발현을 연구하기 위해 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용한 현장 혼성화

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2025년 7월 8일

이 논문에서

초록

출처: Shokry, I. M., et al. 세로토닌 증후군을 앓고 있는 쥐의 파라포름알데히드 접두사 뇌에 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용한 빠른 In Situ 혼성화. J. Vis. 특급 (2015).

이 비디오는 세로토닌 증후군의 영향을 받는 쥐의 뇌 조직에서 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용하여 세로토닌 수용체 RNA 합성을 감지하는 방법을 보여줍니다. 이 프로토콜에는 조직 전처리, 프로브 혼성화 및 효소 검출이 포함되어 현미경으로 세로토닌 수용체 RNA 발현을 시각화하고 정량화합니다.

프로토콜

동물 샘플과 관련된 모든 절차는 해당 동물 윤리 검토 위원회에 의해 검토되고 승인되었습니다.

1. 준비

  1. 조직 준비 및 절편
    1. 쥐를 신선/식염수(SAL, 0.9% NaCl), 접두사/SAL 및 접두사/3,4-메틸렌디옥시메스암페타민(MDMA, 표 1의 세부 정보 참조)의 세 그룹으로 무작위로 할당합니다.
    2. 2시간 간격으로 SAL 및 MDMA 그룹에 각각 1ml/kg SAL 및 10mg/kg MDMA를 복강내로 3회 투여합니다. 동물이 6일 동안 치료에서 살아남을 수 있도록 합니다.
    3. 7일째에 5mg/kg 자일라진을 복강내로 조합하여 100mg/kg 케타민을 쥐에게 투여하여 깊은 마취(, 각막 깜박임 및 꼬리 꼬집 반사 상실)
    4. 를 합니다.
    5. 신선/SAL 그룹의 경우 신선한 뇌 검사를 위해 쥐의 목을 빠르게 자르고 뇌를 제거합니다.
    6. 접두사/SAL 및 접두사/MDMA 그룹의 경우 흉골을 따라 약 10-12cm 정도 절단한 다음 흉골 끝을 노출시킵니다.
    7. 지혈로 흉골 끝을 잡고 날카로운 가위로 횡격막을 양쪽 측면으로 자른 다음 갈비뼈를 가로질러 위쪽으로 자르고 폐와 평행하게 자릅니다.
    8. 한 손으로 작은 집게로 심장의 복부 끝을 잡습니다. 다른 손으로 18G 주사기 바늘로 좌심실을 뚫습니다(바늘의 어댑터 면은 Y자형 실리콘 호스로 얼음처럼 차가운 SAL과 파라포름알데히드 용기 및 연동 펌프에 연결되어 있습니다).
    9. 중간 수준의 유속(~5ml/min)에서 SAL 펌프를 켜고 집게로 오른쪽 심방에 구멍을 뚫어 복귀 순환이 빠져나갈 수 있도록 합니다. 30분 동안 SAL 관류를 유지합니다.
    10. 파라포름알데히드 펌프를 중간 수준으로 켜고 얼음처럼 차가운 4% 파라포름알데히드가 동물을 30분 동안 관류시키도록 합니다.
    11. 관류 기구를 제거하고 동물의 목을 베십시오. 두개골의 정중선을 후전방으로 절단한 다음 두개골을 펄럭여 두개강을 노출시킵니다.
    12. 두개골강에서 주걱으로 뇌를 제거하고 4% 파라포름알데히드 25ml가 들어 있는 50ml 원심분리 튜브에 뇌를 넣습니다. 파라포름알데히드 함유 튜브 안에 뇌를 4ºC 냉장고에서 24시간 동안 보관합니다.
    13. 30% 자당 용액 25ml가 들어 있는 50ml 원심분리 튜브에 뇌를 넣고 4ºC에서 3일 동안 방치합니다. 마지막으로, 뇌를 사용할 때까지 -80°C의 비닐 봉지에 보관하십시오.
    14. 임베딩 매체가 있는 척에 뇌를 장착하고 뇌가 포함된 임베딩 매체를 -26ºC의 온도에서 저온 유지 장치에 동결합니다. 신선하게 얼어붙은 뇌를 20μm 절편으로 자르고 파라포름알데히드 접두사가 붙은 뇌를 10μm 절편으로 자릅니다. 슬라이드를 섹션으로 터치하여 섹션을 실온(RT) 현미경 슬라이드로 이동합니다.
    15. RT에서 4시간 동안 자연 건조합니다. 사용할 때까지 -80°C에서 단단히 밀봉된 백에 섹션 슬라이드를 보관하십시오.
  2. 탈수
    1. -80°C 냉동고에서 슬라이드를 가져와 세 가지 테스트 중 하나로 섹션을 할당합니다: 세로토닌 5-HT2A 수용체 유전자(ht2a), ppiB(펩티딜프롤릴 이소머라제 B 유전자, 양성 대조군) 또는 dapB(박테리아 디하이드로디피콜리네이트 환원효소 유전자, 음성 대조군);볼펜으로 섹션을 표시하고 라벨을 붙입니다(연필을 사용하지 마십시오). RT에서 5분 동안 슬라이드를 100% 알코올에 담그십시오. 흄 후드에서 슬라이드를 5분 동안 건조시킵니다.
  3. 전처리
    1. Pretreatment-20 시약의 1 μl(알칼리성 인산가수분해효소 불활성화)를 슬라이드의 섹션에 피펫팅합니다. 슬라이드를 수분 트레이의 랙 레일에 놓습니다(트레이는 반응 용액의 증발을 방지하기 위해 높은 습도를 유지하기 위해 뚜껑으로 덮여 있음).
    2. 수평 셰이커의 수분 트레이를 10분 동안 저속으로 부드럽게 흔듭니다. 이중 증류수(ddH2O)로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. Pretreatment-2 시약 150ml가 들어 있는 200ml 비커에 슬라이드를 담급니다(파라포름알데히드 고정에 의해 유도된 가교 결합 파괴). 슬라이드를 100ºC에서 총 5분 동안 끓입니다(RNA 구조의 열 유도 복원).
    3. ddH2O로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 슬라이드를 100% 알코올에 5분 동안 넣고 흄 후드에서 5분 동안 건조시킵니다. 소수성 펜을 사용하여 조직 단면에서 선택한 영역(: 그림 1에 설명된 바와 같이 시상 및 시상하부를 포함한 비피질 구조) 주위에 원을 그립니다.
    4. Pretreatment-3 시약 10μl를 선택한 각 영역에 피펫팅하고(프로브 침투 증가) 수분 트레이를 뚜껑으로 덮습니다. 수평 셰이커가 장착된 하이브리드화 오븐에 트레이를 놓고 오븐 온도를 40ºC로 설정합니다. 트레이를 30분 동안 부드럽게 흔듭니다. ddH2O로 2분 동안 슬라이드를 두 번 세척합니다.

2. 하이브리드화 및 증폭

  1. 선택한 영역에 각각 10μl의 htr2a, ppiBdapB 프로브 시약을 피펫팅합니다. 시약의 증발을 방지하기 위해 수분 트레이를 뚜껑으로 덮으십시오. 수평으로 설정된 셰이커를 저속으로 가볍게 흔듭니다. 슬라이드를 40ºC의 오븐에서 2시간 동안 배양합니다.
  2. 세척액으로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-1 시약 10μl를 피펫팅하고 슬라이드를 흔들어 40ºC에서 30분 동안 배양합니다.
  3. 세척 버퍼로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-2 시약 10μl를 피펫팅하고 슬라이드를 흔들어 40ºC에서 15분 동안 배양합니다.
  4. 세척 버퍼로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-3 시약 10μl를 피펫팅하고 슬라이드를 흔들어 40ºC에서 30분 동안 배양합니다.
  5. 세척 버퍼로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-4 시약 10μl를 피펫팅하고 슬라이드를 흔들어 40ºC에서 15분 동안 배양합니다.
  6. 세척 버퍼로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-5 시약 10μl를 피펫팅하고 슬라이드를 흔들어 30분 동안 상온에서 배양합니다.
  7. 세척 버퍼로 슬라이드를 2분 동안 두 번 세척합니다. 선택한 각 영역에 Amplification-6 시약 10μl를 피펫으로 넣고 15분 동안 실온에서 슬라이드를 흔들고 배양합니다. 세척 버퍼로 2분 동안 슬라이드를 두 번 세척합니다.

3. 신호 감지

  1. 선택한 각 영역에 10μl의 적색 시약을 피펫팅합니다(시약은 1:60 비율로 적색-B와 적색-A를 혼합한 것이므로 즉시 사용해야 함). 수평 셰이커의 수분 트레이에 슬라이드를 RT로 놓고 저속으로 10분 동안 부드럽게 흔듭니다.
  2. 10분 동안 (ddH2O)로 슬라이드를 두 번 세척합니다. 오븐에서 15분 동안 60ºC에서 슬라이드를 건조시킵니다. 5분 동안 흄 후드 아래에 자일렌에 슬라이드를 놓습니다. 선택한 각 영역에 20μl의 자일렌 기반 장착 매체를 피펫팅하고 커버 슬립으로 덮습니다.

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결과

표 1. 실험 설계

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신선한파라포름알데히드 접두사a
bSALbMDMAc
대상 프로브 (htr2a)
포지티브 프로브 (ppiB)

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공개 사항

이해 상충이 선언되지 않았습니다.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
RNAscope 음성 대조군 프로브-DapB고급 세포 진단, INC310098
RNAscope 전처리 4고급 세포 진단, INC320046
RNAscope 2.0 HD 시약 키트 - 빨간색고급 세포 진단, INC310036
RNAscope 프로브 - Rn-PPIB고급 세포 진단, INC313921
쥐 Htr2a고급 세포 진단, INC300031
크라이오스타트라이카CM 1850
수평 셰이커폭스바운드88032-088
혼성화 오븐써모 피셔 사이언티픽222000
Superfrost Plus 현미경 슬라이드피셔 사이언티픽12-550-15
소수성 펜벡터H-4000
현미경올림푸스프로비스 AX70

재인쇄 및 허가

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