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방법 논문

항체 Microarray 및 형광 멀티플렉싱을 사용하여 대장암 세포 표면 단백질 프로파일

13.5K 조회수

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DOI:

10.3791/3322

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2011년 9월 25일

이 논문에서

정오 공지

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요약

그러면 표면 항원 (DotScan CRC microarray)를 인식 맞춤 항체 microarrays에 캡처되어 가능한 단일 세포를 생산하는 대장암 (CRC)의 disaggregation에 대한 절차를 설명했다. microarray에 바인딩된 세포의 하위 인구는 형​​광 염료와 태그 단클론 항체를 사용하여 형광 멀티플렉싱하여 프로파일 수 있습니다.

초록

CRC의 현재 예측과 분류 histopathologic 및 임상 결과를 통합하는 시스템을 준비에 의존합니다. 그러나, CRC 케이스의 대다수에서, 세포 기능 장애는 단백질 표현과 사후 translational 수정 수정 1 수많은 돌연변이의 결과이다.

차별화 (CD) 항원의 클러스터를 포함하여 세포 표면 항원,의 숫자 CRC 잠재적인 전조 또는 전이성 생체으로 확인되었습니다. 이러한 항원들은 종종 자신의 표현으로 종양의 진행이나 ​​다른 세포 유형, 같은과 상호 작용과 변화를 이상적인 생체를 종양 - 침투 lymphocytes (TILs)와 종양 - 관련 macrophages (리버 탐)를.

암 하위 분류와 예지를위한 immunohistochemistry (IHC)의 사용은 물론 일부 종양 유형 2,3에 대해 설정됩니다. 그러나, 하나의 '표지'는 clinico - 병적인 준비 이상의 전조 중요성을 표시하거나 모든 CRC 케이스의 일상 병리보고에 사용하기 위해 광범위한 수용을 받고있다.

질병 phenotypes의 전조 충화에 더 최근의 접근 방법은 여러 '표시'를 사용하는 표면 단백질 프로파일에 의존합니다. 같은 iTRAQ로 proteomic 기술을 이용하여 종양의 표현 프로 파일링이 biomarkers4의 발견을위한 강력한 도구이지만, 그것은 진단 실험실에서 일상적인 사용을위한 최적되지 않고 혼합 인구의 서로 다른 세포 유형을 구분할 수 없습니다. 또한, 종양 조직의 대량는 이러한 방법으로 정화 플라즈마 막 glycoproteins의 프로파일이 필요합니다.

이 비디오에서 우리는 DotScan CRC의 항체 microarray를 사용하여 disaggregated CRC 샘플에서 가능한 세포의 표면 프로테옴 프로 파일링위한 간단한 방법을 설명했다. 122 - 항체 microarray는 CRC 40 잠재적인 전조 마커의 검출을위한 위성 지역과 함께 혈통 특정 백혈구 마커, 접착 분자, 수용체 및 염증 및 면역 반응 5 마커의 범위를 인식 표준 82 - 항체 영역으로 구성되어 있습니다 . 세포는 그들이 해당 항원을 표현하는 항체에 캡처됩니다. 광학 스캔에 의해 결정 점 당 세포 밀도, 그 항원, 항체 6 항원과 친화력의 표현의 수준을 표현하는 세포의 비율을 반영합니다.

CRC 조직이나 정상적인 창자 점막 들어, 광학 스캔은 세포의 혼합 인구의 immunophenotype을 반영합니다. 형광 멀티플렉싱은 다음 배열에 캡처 관심 세포의 선택된 하위 인구 프로파일에 사용할 수 있습니다. 예를 들어, 알렉사 647 - 안티 상피 세포 유착 분자 (EpCAM, CD326)는 Phycoerythrin - 안티 인 경우에는 3 번 CD에 들어, 사용하는 동안, CRC 세포뿐만 아니라 정상적인 창자 점막의 상피 세포를 감지하는 데 사용한 냄비 - 상피 분화 항원이다 T - 세포 7 침투 감지합니다. DotScan CRC microarray는 해부학적인 몸의 구조 기반 CRC의 준비 시스템 진단 대안에 대한 프로토 타입을해야합니다.

프로토콜

그림 1
CRC의 수술 표본에서 살고 세포 현탁액의 준비를 위해 그림 1. 워크플로우.

1. 임상 샘플 disaggregation

모든 샘플은 프로토콜 번호 X08 - 164 아래의 정보를 동의를 얻어 로얄 프린스 알프레드 병원 (Camperdown, NSW, 호주)과 콩코드 송환 병원 (콩코드 웨스트, NSW, 호주)에서 수집되었다.

  1. 신선한 대장암 (CRC) 또는 adenoma의 표본, 그리고 정상적인 창자 점막 종양에서 적어도 10cm를 수집합니다. 절제술 후 최대 12 H 4에서 행크의 균형 소금 솔루션 산도 7.3 (HBSS) ° C에서 저장 샘플.
  2. 생물 학적 안전 캐비닛 클래스 II의 모든 임상 샘플 처리, 인간의 병원체에 대한 안전 규정을 따르십시오. 이 메스 블레이드를 사용하여 배양 접시에있는 2mm 큐브에 샘플을 해부하다.
  3. 37 60 분 가끔 부드러운 혼합....

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토론

이 비디오에서는, 우리는 DotScan 항체 microarray는 CRC 조직의 세포 집단을위한 표면 항원 프로필을 연구하기위한 간단한 세미 양적 방법으로 사용할 수있는 방법을 보여줍니다.

에너지 종속 프로세스 (예 : 항원이 상한 및 / 또는 pseudopodia 형성) 보육시 항체 점들에 전체 세포의 회사 바인딩에 필요한 것으로 나타납니다 때문에 조직에서 가능한 단일 세포 현탁액 구하기, 실험의 성공에 중요 죽은 세포는 그 후에 씻어하는 동안. 1 형 collagenase가 처음 조직 disaggregation8에 대한 고용했지만, 그것이 적은 테아제 오염 물질로 세포 점막에 덜 손상을 collagenase 4로 대체되었다. 이 변경 사항은 휴대폰 생산량, 생존 또는 바인딩 패턴에 영향을주지 않았다. 일부 종양 및 제어 샘플에서 점액이 세포 수율 감소하고 세포 캡처 방해. 점액이 끈적 거림은 -80 10 % DMSO / FCS에 disaggregated 세포 현탁액 ° C.......

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공개 사항

관심 없음 충돌 선언하지 않습니다.

감사의 글

우리는 로얄 프린스 알프레드와 CRC와 정상적인 장 점막의 신선한 샘플 수집에 대한 콩코드 송환 병원의 해부 병리학 연구소에서 직원을 감사드립니다. 작품은 암 연구소 뉴사우스 웨일즈 Translational 프로그램 권한 부여에 의해 투자되었다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
시약이나 장비의 명칭 회사 카탈로그 번호 댓글
행크스 '균형 소금 솔루션 시그마 - 올드 리치 H6136 - 10X1L 25 MM Hepes (시그마 # H3375)와 버퍼
Airpure 생물 학적 안전 캐비닛 클래스 II 웨스팅 하우스 1687-2340/612
외과 블레이드 리빙스톤 090609 100 팩
이 MM Hepes와 RPMI 1640 시그마 - 올드 리치 R4130 - 10X1L
Collagenase 유형 4 워싱턴 4188
Deoxyribonuclease 1 시그마 - 올드 리치 DN25 - 1G
Terumo 주사기 (10 ML) Terumo SS 10 L 100 박스
Filcon 필터 (200 μm의) BD Biosciences 340615
Filcon 필터 (50 μm의) Filcon 필터 (50 μm의) Filcon 필터 (50 μm의) Filcon 필터 (50 μm의) 340603
태아 송아지 혈청 Gibco / Invitrogen 10099-141
5810 R을 원심 분리기 Eppendorf 7017
디메틸 sulphoxide 시그마 - 올드 리치 D2650
Trypan 파랑 시그마 - 올드 리치 T8154
Hemocymeter Technocolor Neubar Hirschmann 사용할 수 없습니다
라이트 현미경 니콘 니콘 TMS
Cyrovial 튜브 Greiner 바이오 - 원 121278
Cryo의 동결 contrainer Nalgene 5100-0001
DotScan 항체 microarray 키트 Medsaic 사용할 수 없습니다
DotScan microarray 페인트 트레이 Medsaic 사용할 수 없습니다
KimWipes 킴벌리 - 클락 4103
37% 포름 알데히드 시그마 - 올드 리치 F1635 - 500ML
DotReaderTM Medsaic 사용할 수 없습니다
소 혈청 알부민 시그마 - 올드 리치 A9418 - 10G
열 inactivated AB 혈청 2% Invitrogen 34005100
Phycoerythrin - 복합 인 경우에는 3 번 CD에 들어 베크 만 보습 바로 앞에 달린 풀베는 날 ET386
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MultiExperiment 뷰어 v4.4 TM4 Microarray 소프트웨어 스위트 오픈 - 소스 소프트웨어 (참조 11)

참고문헌

  1. Steinert, R., Buschmann, T., vander Linden, M., Fels, L. M., Lippert, H., Reymond, M. A. The role of proteomics in the diagnosis and outcome prediction in colorectal cancer. Technol. Cancer. Res. Treat. 1, 297(2002).
  2. Eifel, P., Axelson, J. A., Costa, J., Crowley, J., Curran, W. J., Deshler, A., Fulton, S., Hendricks, C. B., Kemeny, M., Kornblith, A. B., Louis, T. A., Markman, M., Mayer, R., Roter, D.

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재인쇄 및 허가

정오


Formal Correction: Erratum: Colorectal Cancer Cell Surface Protein Profiling Using an Antibody Microarray and Fluorescence Multiplexing
Posted by JoVE Editors on 7/03/2015. Citeable Link.

The author's email has been corrected in the publication of Colorectal Cancer Cell Surface Protein Profiling Using an Antibody Microarray and Fluorescence Multiplexing. There was an error with the author, Jerry Zhou's, email. The author's email has been updated to:

j.zhou@uws.edu.au

from:

jzho7551@mail.usyd.edu.au

태그

세포 표면 프로파일링표면 항원CD 항원세포 캡처형광 스캐닝조직 소화생존 세포