인유두종바이러스와 같이 국소 감염을 일으키는 병원체의 T세포 에피토프를 규명하는 것은 혈중 T세포 수가 제한적이기 때문에 매우 어렵습니다. 본 영상에서는 매우 적은 수의 세포로부터 희귀 T세포를 분리하고 특성을 분석하는 방법을 설명합니다.
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방법 논문
인유두종바이러스와 같이 국소 감염을 일으키는 병원체의 T세포 에피토프를 규명하는 것은 혈중 T세포 수가 제한적이기 때문에 매우 어렵습니다. 본 영상에서는 매우 적은 수의 세포로부터 희귀 T세포를 분리하고 특성을 분석하는 방법을 설명합니다.
인간 유두종 바이러스(HPV)와 같이 국소 감염을 일으키는 병원체에 특이적인 희귀 T 세포를 분리하고 특성화하는 어려움을 극복하기 위한 프로토콜이 개발되었습니다. 포함된 단계는 피험자로부터 T 세포 에피토프(epitope)를 포함하는 HPV 단백질 영역을 식별하고, 인터페론-γ(IFN-γ) 분비를 기반으로 펩타이드 특이적 T 세포를 선택하며, T 세포 클론을 배양하고 특성화하는 것입니다(Fig. 1). 피험자 1은 최근 생검을 통해 고등급 편평 상피내 병변 진단을 받았으며, T 세포를 수집한 당일에 치료를 위해 루프 전기 절제술을 받은 환자였습니다1. 중첩 합성 펩타이드를 사용하여 수행한 IFN-γ 효소 결합 면역 스팟(ELISPOT) 분석을 통해 T 세포 에피토프를 포함하는 인간 유두종 바이러스 16형(HPV 16) E6 및 E7 단백질 내 영역이 식별되었습니다(Fig. 2). 이 분석 데이터는 T 세포 에피토프를 포함하는 영역을 식별하는 것뿐만 아니라, 에피토프 특이적 T 세포의 수를 추정하고 상용 자성 비드(CD8 T-cell isolation kit, Miltenyi Biotec, Auburn CA)를 사용하여 IFN-γ 분비를 기반으로 이들을 분리하는 데 사용되었습니다. 선택된 IFN-γ 분비 T 세포는 웰당 단일 T 세포의 성장을 지원하기 위해 조사된 피더 세포 혼합물이 있는 상태에서 희석하여 단독 배양하였습니다. 이러한 T 세포 클론은 필요한 T 세포 클론 세포 수를 최소화하기 위해, 식별된 영역을 커버하는 펩타이드 및 자가 Epstein-Barr 바이러스 변형 B-림프모구 세포(LCLs, Walls 및 Crawford가 설명한 방식대로 획득)2가 있는 상태에서 IFN-γ ELISPOT 분석을 사용하여 스크리닝되었습니다. ELISPOT 분석에서 일반적으로 사용되는 웰당 1 x 105 세포1,3 대신, 1 x 105 자가 LCLs가 있는 상태에서 1,000개의 T 세포 클론 세포를 사용함으로써 필요한 T 세포 클론 세포 수를 획기적으로 줄였습니다. 자가 LCLs는 T 세포 클론 세포에 펩타이드 항원을 제시할 뿐만 아니라, 웰 내의 높은 세포 밀도를 유지하여 에피토프 특이적 T 세포 클론 세포가 IFN-γ를 분비할 수 있도록 하였습니다. 이는 IFN-γ ELISPOT 분석의 성공적인 수행을 보장합니다. 마찬가지로, IFN-γ ELISPOT 분석은 CD8 T 세포 에피토프(HPV 16 E6 52-61 FAFRDLCIVY)의 최소 및 최적 아미노산 서열과 그 HLA class I 제한 요소(B58)를 특성화하는 데 활용되었습니다. 또한 HPV 16 E6 또는 E7 단백질을 발현하는 백시니아 바이러스에 감염된 자가 LCLs를 사용하여 IFN-γ ELISPOT 분석을 수행하였습니다. 결과는 E6 T 세포 에피토프가 내인성으로 처리되었음을 보여주었습니다. 다른 고위험 HPV 유형의 상동 T 세포 에피토프에 대한 교차 인식 또한 확인되었습니다. 이 방법은 CD4 T 세포 에피토프를 기술하는 데에도 사용될 수 있습니다4.
피험자 1로부터 확립된 CD8 T 세포주를 사용하여 IFN-γ ELISPOT 분석을 수행한 결과, HPV 16 E6 46-70 영역에 T 세포 에피토프가 포함되어 있음이 확인되었으며1 (그림 2), 본 프로토콜을 시작하기 전 IFN-γ 분비 여부를 기준으로 에피토프 특이적 T 세포를 선별하였다(그림 1).
1. 에피토프 특이적 T 세포의 한계 희석법
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전통적으로 면역학자들은 관심 대상인 T세포를 in vitro에서 자극하고, 한계 희석 실험을 수행하여 에피토프 특이적 T세포 클론을 분리함으로써 새로운 T세포 에피토프를 특성화하려 시도했습니다. 이후 T세포 클론은 크롬 방출 분석법을 사용하여 특성화되었습니다 8,9. 하지만 T세포의 빈도가 너무 낮아 분리할 수 없었거나, 특성화를 완료하기에 충분한 T세포 클론 세포를 확보하지 못해 많은 시도가 실패로 돌아갔습니다. 본 연구에서 설명하는 방법은 (1) 관심 T세포의 수가 충분한지 평가하고, (2) IFN-γ 분비를 기준으로 T세포를 선택하여 관심 T세포의 빈도를 높이며, (3) 자가 LCL을 T세포 클론 세포와 함께 파종하는 ELISPOT 분석법을 수행함으로써 적은 수의 T세포 클론 세포를 사용하여 이러한 한계점을 극복합니다. 그림 2 는 잠재적 T세포 에피토프가 존재하는 영역을 식별할 뿐만 아니라, 에피토프 특이적 T세포의 빈도를 평가하기 위해 수행된 ELISPO.......
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저자들은 공개할 사항이 없습니다.
본 연구는 American Cancer Society Scholars Award (RSG-06-180-01-MBC) 및 NIH 보조금 (R01 CA143130 및 UL1RR029884)의 지원을 받아 수행되었습니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| CD8 T 세포 분리 키트 | Miltenyi Biotec | 130-094-156 | |
| Phytohemagglutinin | Remel, Thermo Fisher Scientific | R-30852801 | 2mg/vial |
| Yssel’s 배지 | Gemini Bio Products | 400-102 | 1% pooled human serum |
| 96-웰 라운드 바텀 플레이트 | BD Biosciences | 08-772-17 | |
| 재조합 인간 IL-2 | R&D Systems | 202-IL-050 | 50μg |
| 24-웰 플레이트 | Corning | 07-200-84 | |
| 인산 완충 식염수 | Cellgro | MT-21-031-CV | |
| 1차 anti-IFN-γ 단일클론 항체 (D1K) | Mabtech | 3420-3-1000 | |
| 비오틴 결합 anti-IFN-γ 단일클론 항체 (7B-6) | Mabtech | 3420-6-1000 | |
| Multiscreen HA ELISPOT 플레이트 | EMD Millipore | MAHA S45 10 | |
| Dimethyl Sulphoxide | Sigma-Aldrich | D2650 | 100 ml 병 |
| Pooled Serum, human | Atlanta Biologicals | S40510H | 열불활성화 |
| RPMI 1640 | Cellgro | MT-10-040-CV | |
| Tween-20 | Sigma-Aldrich | P2287-100ml | |
| Vectastain Elite ABC 키트 | Vector Laboratories | NC9313719 | |
| 안정화된 diaminobenzidine | Open Biosystems | MBI 1241 | |
| AID EliSpot 리더 클래식 | Autoimmun Diagnostika GmbH | ELR06 |
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