무균 및 무균 조건에서 초파리 melanogaster의를 양육하는 방법이 제공된다. 플라이 배아는, 차아 염소산 나트륨에 dechorionated 멸균 다이어트에 무균 적으로 전송하고, 밀폐 용기에 양육된다. 박테리아와식이 요법과 배아를 접종은 무균 협회에 이르게하고, 세균의 존재는 전신 초파리 균질 도금에 의해 확인된다.
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무균 및 무균 조건에서 초파리 melanogaster의를 양육하는 방법이 제공된다. 플라이 배아는, 차아 염소산 나트륨에 dechorionated 멸균 다이어트에 무균 적으로 전송하고, 밀폐 용기에 양육된다. 박테리아와식이 요법과 배아를 접종은 무균 협회에 이르게하고, 세균의 존재는 전신 초파리 균질 도금에 의해 확인된다.
최근 몇 년 동안 무수한 동물의 특성과 행동에 대한 미생물의 영향이 점점 더 인식되고 있습니다. 초파리 Drosophila melanogaster는 미생물이 없는(axenic) 조건 또는 정의된 미생물 군집(gnotobiotic)에서 큰 크기의 초파리를 기르는 접근 방식을 통해 동물 숙주와 미생물 상호 작용을 이해하기 위한 모델입니다. 이 연구는 초파리 배아 채취, 차아염소산염 탈부착 및 살균, 멸균 식단으로의 전환 방법을 간략하게 설명합니다. 멸균된 배아는 50ml 원심분리기 튜브에 담겨 멸균 사료로 옮겨지며, 발육 중인 유충과 성충은 바이알이 열릴 때까지 외인성 미생물이 없는 상태로 유지됩니다. 대안적으로, 정의된 미생물총(microbiota)을 가진 파리는 멸균 사료와 배아에 관심 미생물 종을 접종하여 사육할 수 있습니다. 우리는 초파리 에서 대표적인 gnotobiotic microbiota를 확립하기 위해 4가지 박테리아 종의 도입을 설명합니다.마지막으로, 액세닉 초파리(axenic Drosophila)가 성인이 될 때까지 박테리아가 없는지 테스트하는 것을 포함하여 박테리아 군집 구성을 확인하기 위한 접근 방식을 설명합니다.
대부분의 동물은 밀접하게 죽음 일에 출생에서 박테리아 ( '미생물')과 연결되어 있습니다. 미생물이없는 ( '무균') 및 미생물 관련 ( '기존') 동물의 비교는 미생물 대사, 영양, 혈관, 간, 호흡기, 면역, 내분비 및 신경 기능이 포함 동물 건강의 다양한 측면을 영향을 보여 주었다. 열매는 초파리 melanogaster의 3,4- 미생물의 존재 하에서 이러한 프로세스의 많은 이해 및 동물 건강에 5,6- 미생물의 영향을 연구하기위한 주요 모델 비행. 어떤 박테리아 종은 모든 개인 ( '코어')에 존재하지 않지만 아세토 및 락토 바실러스 종은 수치 모두 실험실 사육 및 야생 잡은 D.의 미생물을 지배 melanogaster의. Acetobacteraceae, Firmi (Komagataeibacter 및 글루 포함) 기타및 장내 세균 (예 : 엔테로 및 로이코 노 스톡 등) cutes 중 하나 높은 풍부 7-12에서 낮은 풍부에서 초파리 개인에서 자주 본, 또는 불규칙하게 존재한다.
초파리와 포유 동물의 미생물은 내 세대 14,19에 걸쳐 일정하지 않습니다. 미생물에 의존하는 특성을 측정 할 때 미생물의 변덕은 표현형 노이즈가 발생할 수 있습니다. 예를 들어, 초파리 15-18에서 Acetobacteraceae 영향 지질 (중성 지방) 저장. Acetobacteraceae 다른 19 이상의 유리 병의 파리에서 더 풍부 경우, 동종 파리는 서로 다른 표현형 (20)를 가질 수있다. 쥐 14 미생물의 변덕의 문제에 대한 해결책은 마우스 새끼로 (Schaedler 식물 변경) 각각의 새로운 세대를 8 지배적 인 미생물 종의 정의 사회를 도입하여, 1960 년대 이후 실제로있다각 강아지가 마우스 미생물 동일한 키 부재에 노출되는 것을 보장한다. 미생물이 연구 (32)의 주 대상이 아니며, 실험 조건의 다양한 키 미생물의 존재를 확인하기 위해 전례를 설정하는 경우에도이 방법은 미생물 조성에 대한 제어합니다.
초파리 영양 미생물의 영향을 정의하려면, 무균 플라이 라인을 도출하기위한 여러 가지 프로토콜은 배아의 차아 염소산 dechorionation (중 파생 드 노보 각 세대 또는 멸균 사료로 전송하여 generationally 유지) 및 항생제 치료 (13)를 포함하여 개발되었다. 항생제 처리 및 시리얼 전송, 드 노보 dechorionation와 교란 변수 (예를 들어, 계란 밀도, 잔류 오염 미생물, 오프 - 타겟 항생제 효과)의 대 더 제어 모두 용이성과 신속성 등 다양한 접근 방법에 장점이있다. 상관없이 방법의배아를 무균하는 특정 미생물 종의 준비, 도입은 정의 ( '무균') 사회와 초파리의 문화를 허용한다. 또한, Schaedler 식물의 사용을 모방,이 커뮤니티는 각 유리 병의 특성-에 영향을 미치는 미생물의 존재를 확인하고 미생물의 변덕의 합병증을 피하기 위해 (만 단계 6-7 다음) 종래 누워 계란에 접종 할 수있다. 여기에서 우리는 배아의 드 노보 dechorionation에 의해 무균 및 무균 초파리를 제기하기위한 프로토콜을 설명하고 소개 또는 오염 미생물 분류군의 존재를 확인합니다.
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1. 문화 박테리아 (시작 ~ 1 주 달걀을 따기 전)
2. 멸균 다이어트를 준비합니다
3. 달걀 누워 케이지를 준비합니다
4. 달걀을 수집
5. Dechorionate 계란과 무균 D로 전송보자구
6. 무균 4 세균 종을 사용하여 파리 확인
불임 7. 측정 CFU로드 / 테스트
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무균 파리의 성공적인 양육은 D.의 전신 homogenizations에서 더 CFUs의 분리에 의해 확인 melanogaster의 성인 (그림 1). 도금 균질가 식민지를 산출하는 경우 또는, 유리 병은 오염 및 폐기해야합니다. 무균 파리를 들어, 네 개의 박테리아 균주의 각은 성인 파리 (그림 1)과 관련된 총 가능한 CFUs의 차이를 보여, 5 성인 남성의 풀에서 분리 하였다. 각 세균 종은 뚜렷한 형태를 가지며, 시각 (도 2)를 구별 할 수있다. 하나 이상의 콜로니 종류가 검출되지 않으면 박테리아 접종원을 준비하고 에러가있을 수있다 (예를 들어, 세정, 정규화 혼합) 또는 대응하는 종 배양 조건과 호환되지 않을 수있다 (예를 들어 초파리 밀도 23 또는 유전자형 2...
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여기에 설명 된 방법은 함께 무균 성인 18,27의 시리얼 전송 또는 항생제 치료 13,18 포함 무균 파리, 양육의 대체 방법으로, 배아 dechorionation 8,11,18,25,26,27에 대한 몇 가지 방법 중 하나입니다. 다른 dechorionation 방법은 에탄올 세척을 포함 11,25,26를 줄이거 나 8 차아 염소산 치료를 확장합니다. (에탄올 세척하지 않고) 여기에 설명 된대로 사육 할 때 100 초파리 유전자형이 무균했다 ~ 대부분의 이전 연구에서,하지만 일부 라인은 오염 (24)을 폐기했다 : 다른 세척 단계는 서로 다른 비행 유전자형을 양육 도움이 될 수. 에탄올 세척 이상 차아 염소산 치료를 사육하는 경우 아마도 약간의 오염 된 라인은 무균했을 것이다. 여기에 설명 된 방법은 특정 호스트의 유전자형에 대한 무균 파리의 고립으로 이어질하지 않을 경우 우리는 ...
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저자는 공개 아무것도 없어.
이 프로토콜의 일부 세부 사항은도 원고에 도움이되는 의견을 제공 박사 아담 돕슨의 도움으로 최적화되었다. 이 작품은 국립 보건원에 대한 재단에 의해 지원되었다 (FNIH) 허가 번호 R01GM095372 (JMC, A (CN) W, AJD 및 AED). FNIH 허가 번호 1F32GM099374-01 (PDN), 브리검 영 대학교 시동 기금 (JMC, MLK, MV). 출판 비용은 브리검 영 대학교 생명 과학 대학 식물과 야생 동물 과학 부서에 의해 지원되었다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 맥주 효모 | MP Biomedicals, LLC. | 903312 | http://www.mpbio.com/product.php?pid=02903312 |
| 포도 | 시그마 Aldrich | 158968-3KG | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/aldrich/158968?lang=en®ion=US |
| 한천 | 피셔 - Lab Scientific | fly802010 | |
| https://www.fishersci.com/shop/products/drosophila-agar-8-100mesh-10kg/nc9349177 Welch의 100 % 포도 주스 농축액 | 월마트 또는 기타 식료품점 | 9116196 http://www.walmart.com/ip/Welch-s-Frozen-100-Grape-Juice-Concentrate-11.5-oz/10804406 | |
| 케이지: 32 oz. 반투명 라운드 델리 컨테이너 | Webstaurant 스토어 | 999L5032Y | http://www.webstaurantstore.com/newspring-delitainer-sd5032y-32-oz-translucent-round-deli-container-24-pack/999L5032Y.html |
| 반투명 라운드 델리 컨테이너 뚜껑 | Webstaurant 스토어 | 999YNL500 | |
| http://www.webstaurantstore.com/newspring-delitainer-ynl500-translucent-round-deli-container-lid-60-pack/999YNL500.html 재고 병 | Genesee Scientific | 32-130 | https://geneseesci.com/shop-online/product-details/?product=32-130 |
| Droso-Plugs | Genesee Scientific | 49-101 | https://geneseesci.com/shop-online/product-details/?product=49-101 |
| 나일론 메쉬 | Genesee Scientific | 57-102 | https://geneseesci.com/shop-online/product-details/715/?product=57-102 |
| 플라스틱 부싱 | 홈 디포 | 100404002 | http://www.homedepot.com/p/Carlon-1-in-Non-Metallic-Terminal-Adapter-E943FR-CTN/100404002 |
| 플라스틱 부싱 캡 | 홈 디포 | 100153897 | http://www.homedepot.com/p/1-1-4-in-rigid-plastic-insulated-bushing-2-pack-27529/100153897 |
| 표본 컵 | MedSupply Partners | K01-207067 | http://www.medsupplypartners.com/covidien-specimen-containers.html |
| 리피터 M4 | Eppendorf | 4982000322 https://online-shop.eppendorf.us/US-en/Manual-Liquid-Handling-44563/Dispensers--Burettes-44566/Repeater-M4-PF-44619.html | |
| 50 ml 원심분리기 튜브 | TrueLine 원심분리기 튜브 | TR2003 | |
| https://www.lpsinc.com/Catalog4.asp?catalog_nu=TR2003 Food Boxes | 대한민국 Scientific | 2316-5001 | |
| http://www.usascientific.com/search.aspx?find=2316-5001 용해 매트릭스 D 벌크 | MP Biomedicals, LLC. | 116540434 | http://www.mpbio.com/search.php?q=6540-434&s=Search |
| 필터 피펫 팁, 300 μ l | USA Scientific | 1120-9810 | http://www.usascientific.com/search.aspx?find=1120-9810 |
| 페트리 접시 | 실험실 제품 판매 | M089303 | https://www.lpsinc.com/Catalog4.asp?catalog_nu=M089303 |
| Ethanol | Decon Laboratories, INC. | 2701 | http://www.deconlabs.com/products.php?ID=88 |
| 페인트 브러시 | 월마트 | 5133 | |
| http://www.walmart.com/ip/Chenille-Kraft-5133-Acrylic-Handled-Brush-Set-Assorted-Sizes-colors-8-Brushes-set/41446005 집게 | Fisher | 08-882 | |
| https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-medium-pointed-forceps-3/p-128693 가정용 표백제 (6-8% 차아염소산염) | 월마트 | 550646751 | http://www.walmart.com/ip/Clorox-Concentrated-Regular-Bleach-121-fl-oz/21618295 |
| 유니버설 펩톤 | 제네시 사이언티픽 | 20-260 | https://geneseesci.com/shop-online/product-details/?product=20-260 |
| 효모 추출물 | Fisher Scientific | BP1422-500 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisher-bioreagents-microbiology-media-additives-yeast-extract-3/bp1422500?matchedCatNo=BP1422500 |
| 인산이칼륨 | 시그마 Aldrich | P3786-1KG | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/search?term=P3786-1KG&interface=All& N=0& 모드=match%20partialmax& lang= ko& 지역=US& focus=제품 |
| 암모늄 구연산 | 염 시그마 Aldrich | 25102-500g | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/search?term=25102-500g&interface=All&N =0& 모드=match%20partialmax& lang= ko& 지역=US& focus=제품 |
| 아세트산 나트륨 | VWR | 97061-994 | https://us.vwr.com/store/catalog/product.jsp?catalog_number=97061-994 |
| 황산 마그네슘 | Fisher Scientific | M63-500 | |
| https://www.fishersci.com/shop/products/magnesium-sulfate-heptahydrate-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-3/m63500?matchedCatNo=M63500 황산 망간 | 시그마 Aldrich | 10034-96-5 | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/search?term=10034-96-5&interface=CAS%20No.&N=0&mode=match %20부분최대& 언어=ko& 지역 =US& focus=제품 |
| MRS 파우더 | Sigma Aldrich | 69966-500G | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sial/69966?lang=en®ion=US |
| 96웰 플레이트 리더 | BioTek (Epoch) | NA | http://www.biotek.com/products/microplate_detection/epoch_microplate_ spectrophotometer.html |
| 1.7 ml 원심분리기 튜브 | USA Scientific | 1615-5500 | |
| http://www.usascientific.com/search.aspx?find=1615-5500 필터 피펫 팁, 1,000 μ l | USA Scientific | 1122-1830 | |
| http://www.usascientific.com/search.aspx?find=1122-1830 96 웰 플레이트 | Greiner Bio-One | 655101 | https://shop.gbo.com/en/usa/articles/catalogue/article/0110_0040_0120_0010/ 13243/ |
| Ceramic Beads | MP Biomedicals, LLC. | 6540-434 | http://www.mpbio.com/product.php?pid=116540434 |
| 조직 균질화 장치 | MP Biomedicals, LLC. | 116004500 | |
| http://www.mpbio.com/product.php?pid=116004500 클래스 1 생물 안전 캐비닛 | Thermo Scientific | 모델 1395 | http://www.thermoscientific.com/en/product/1300-series-class-ii-type-a2-biological-safety-cabinet-packages.html |
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An erratum was issued for: Rearing the Fruit Fly Drosophila melanogaster Under Axenic and Gnotobiotic Conditions. The Protocol was updated.
Step 6.1.4.2 of the Protocol was updated from:
If using the 4 species described here, normalize cells to equivalent colony forming unit (CFU)/ml densities (OD600 to CFU conversion determined previously20) using this equation:
E = ((O-B) x V x D)/C
where E = volume to resuspend pellet in (μl), O = OD600 bacteria, B = OD600 blank media, D = fold-dilution, V = µl bacterial culture prior to centrifugation, C = OD600 of predetermined constant. See Supplemental Code File for examples of calculations using these equations. For spectrophotometers that automatically blank, use "O" in place of "O-B".
Note: The predetermined constants (units OD600, normalized to 107 CFU ml-1, constants derived in20) are as follows: A. tropicalis (0.052), A. pomorum (0.038), L. brevis (0.056), L. plantarum (0.077).
to:
If using the 4 species described here, normalize cells to equivalent colony forming unit (CFU)/ml densities (OD600 to CFU conversion determined previously20) using this equation:
E = ((O-B) x V x D)/C
where E = volume to resuspend pellet in (μl), O = OD600 bacteria, B = OD600 blank media, D = fold-dilution, V = µl bacterial culture prior to centrifugation, C = OD600 of predetermined constant. See Supplemental Code File for examples of calculations using these equations. For spectrophotometers that automatically blank, use "O" in place of "O-B".
Note: The predetermined constants (units OD600, normalized to 107 CFU ml-1, constants derived in20) are as follows: A. tropicalis (0.053), A. pomorum (0.038), L. brevis (0.077), L. plantarum (0.056).