C. 선 충 배설 운하 드 노 보 편광 막 속의 시각적 vivo에서 분석에 대 한 고유한 단일 셀 모델입니다. 이 프로토콜 표준 유전 RNAi 및 이미징 접근, 식별 및 분자 단 세포 tubulogenesis, 그리고 꼭대기 막 및 루멘 속 감독의 특성에 대 한 적응의 조합을 설명 합니다.
이 콘텐츠를 보려면 JoVE 구독이 필요합니다. 로그인하거나 오늘 무료 평가판을 시작하세요.
방법 논문
C. 선 충 배설 운하 드 노 보 편광 막 속의 시각적 vivo에서 분석에 대 한 고유한 단일 셀 모델입니다. 이 프로토콜 표준 유전 RNAi 및 이미징 접근, 식별 및 분자 단 세포 tubulogenesis, 그리고 꼭대기 막 및 루멘 속 감독의 특성에 대 한 적응의 조합을 설명 합니다.
4 선 충 C. 배설 운하는 좁은 튜브를 거의 동등 하 게 멀리 확장된 세포내 endotubes 구축 하 고 막 및 submembraneous 루멘 안정화와 함께 단일 셀에서 동물의 길이 통해 확장 꼭대기 캐릭터의 골격입니다. 배설 셀 확장의 길이 약 2, 000 번 드 노 보 편광 막 속, 세포내 루멘 morphogenesis vivo에서 평가 대 한 독특한이 모델을 만드는이 운하를 생성 및 단 세포 tubulogenesis입니다. 여기에 제시 된 프로토콜 표준 라벨, 이득 및 손실-의-기능 유전자 또는 RNA 간섭 (RNAi) 결합 하는 방법을 보여줍니다-, 그리고를 사용 하 여이 모델 기능 분자 수준에서이 프로세스를 분석 하 고 시각적으로 해 부 현미경 접근. 표기 방법의 예를 들어, 프로토콜 tubulogenesis의 실시간 분석을 위한 유전자 변형 동물 형광 성 융해 단백질의 생성을 설명합니다. 유전 접근의 예를 들어, 그것은 함수 이득 낭 성 운하 형을 수정 하도록 설계 된 시각적 RNAi 기반 상호 작용 스크린의 핵심 포인트를 강조 표시 합니다. 특정 방법을 설명 하는 방법: 레이블 및 형광 단백질; 표현 하 여 운하를 시각화 타겟된 RNAi 라이브러리를 구성 하 고 전략을 RNAi 운하 morphogenesis;의 분자 분석에 대 한 심사 시각적으로 고기;의 수정 평가 형광 현미경 검사 법;를 해 부하 여 점수 confocal 현미경 검사 법;에 의해 더 높은 해상도에서 subcellular 운하 구성 요소 특징 그리고 시각적 매개 변수를 측정. 방식은 확인 및 intracellular 루멘 phylogenetically 보존된 과정에 참여 하 고 단 세포 유전자에 대 한 선 충 C. 배설 채널의 활용에 관심이 있는 탐정에 대 한 유용 morphogenesis 튜브.
모든 내부 장기의 튜브, 전송 및 가스, 액체 및 영양분의 교환 및 변화 낭비의 배설물 같은 그들의 여러 가지 기능에 대 한 중요 한 구성 됩니다. 그들의 편광된 캐릭터, 독특한 꼭대기와 lumenal 멤브레인과 이러한 특정 기능, 적응 하 고 결함 그들의 엔도-및 플라즈마 멤브레인 시스템의 속에는 인간의 질병1,2의 빈번한 원인이. 튜브는 맥 관 구조와 내부 장기의 대부분은 다세포 이며 intercellularly;는 루멘을 형성 그러나, 침 루멘을 형성, 단 세포 관, 수 예, 나타낼 만큼 인간의 모 세관 침대2의 30-50%. 비록 그들의 microdomains 튜브의 특정 기능 (예를 들어, 꼬마 장 microvilli 대 배설 운하 canaliculi에 따라 다를 수 있습니다 멀티-및 단 세포 튜브의 편광된 막 구성 면에서 유사 하다 선 충; C. 선 충 장 tubulogenesis 종이 동반 참조)3. 편광된 막 속 및 tubulogenesis의 원리는, metazoans 중 보존 하 고 유사한 분자 기계는 그들에 지시
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
1. 형광 성 융해 단백질 14 C. 선 충 Excretory 운하 라벨
참고: 장 tubulogenesis에 함께 종이 참조 3 현장에서 항 체 절차를 배설 운하에 얼룩으로 라벨에 대 한. C. 선 충 배설 운하 엔도-및 플라즈마 막, 발기인 배설도 운전 하는 식의 예제를 보려면 표 2를 시각화 하는 데 유용 하 게 입증 하는 분자의 예제를 보려면 표 1을 참조 하 고 표 3 마커 및 발기인의 더 포괄적인 컬렉션에 대 한 리소스에 대 한 다른 fluorophores의 선택에 대해 참조를 포함 하 여.
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
이 프로토콜에는 시각과 분자로 분석 단 세포 tubulogenesis 및 단일 셀에서 세포내 루멘 morphogenesis C. 선 충 배설 운하를 사용 하는 방법을 설명 합니다. 성인 기 중반 embryogenesis의 시간에서 그들의 확장, 동안 4 개의 배설 운하 그들의 basolateral 및 그들의 canalicular 및 endosomal endomembrane 시스템을 제공 하는 독특한 모델을 함께 꼭대기/lumenal 막 확장 계속 드 노 보 의 비보에 분석 편광 막 속 (그림 1). 꼭대기 막 같은 subcellular 구성 요소, 세포질, 및 endosomal canalicular 소포 대 특정 형광 성 융해 단백질 (프로토콜 섹션 1에서에서 설명), 표현 하 여 구상 될 수 있다 그리고 그들은 서로 의해 구별 될 수 있다 더블 또는 트리플 (
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
C. 선 충 유전 다양성, 투명성, 간단한 몸 계획, 고정 세포 계보는 우수한 morphogenesis의 분석 모델 만들. 이 프로토콜 표준 유전 조작 및 이미징 결합 하는 방법을 설명 합니다 2 미크론의 활용 연구 얇은 편광된 막과 세포내 루멘 속 단일 셀 튜브에서 연구 선 충 C. 배설 운하.
라벨
C. 선 충 배설 운하 허용 하는 라이브 분석 (여기에 설명 된), 형광 성 융해 단백질의 표정 또는 항 체 또는 화학 얼룩 (참조 창 자 tubulogenesis 항 체 얼룩이 지기에 대 한 종이 동반 표시 될 수 있습니다. 3). 두 개 이상의 다른 fluorophores, 또는 이들의 조합 식 다른 기술, 라벨 수 있습니다 (그림 2) 이러한 얇은 tubules의 고해상도 영상 해 부에 대 한. 운.......
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
저자 들은 아무 경쟁 금융 관심사 선언 합니다.
우리 엠 부 (캔자스의 대학, 캔사스, 미국), K. Nehrke (로체스터 대학 의료 센터, 로체스터, 뉴욕, 미국), 꼬마 유전학 센터, 건강의 국가 학회, 연구 인프라의 투자 감사 프로그램 (P40 OD010440)입니다. 이 작품은 NIH GM078653, MGH는 224570 V.G.에 SAA 223809 교부 금에 의해 지원 되었다
....액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.
| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Cloning | |||
| Plasmid pPD95.75 | Addgene | Cat. No. 37464 | |
| PCR Kit | Qiagen | Cat. No. 27106 | |
| 결찰 키트 | New England Biolabs, | Cat. 아니요. E2611L | |
| DNA 마커 | Thermo Scientific | Cat. 아니요. SM1331 | |
| 아가로스 DNA 등급 | 피셔 사이언티픽 | 고양이. 아니요. BP164-100 | |
| 유능 세포 | New England Biolabs | Cat. 아니요. C2987H | |
| 트리스 | 피셔 사이언티픽 | 고양이 아니요. BP154-1 | |
| EDTA | 시그마 | Cat. 아니요. ED-1KG | |
| 아세트산 | 피셔 사이언티픽 | 고양이. 아니요. A38S-500 | |
| 에티듐 브로마이드 | 피셔 사이언티픽 | 고양이. 아니요. BP1302-10 | |
| Equipments | |||
| PCR machine | MJ 연구 | 고양이. 아니요. PTG-200 | |
| 원심분리기 | Eppendorf | 고양이. No. 5415C | |
| 수조 | 정밀 과학 | 고양이. 번호 666A3 | |
| 젤 러닝 기구 | Fisher Scientific | Cat. 번호 09-528-165 | |
| 젤 실행 전원 | 공급 장치 Fisher Scientific | Cat. No. 45-000-465 | |
| 분자 이미저 젤 독 XR 시스템 | Bio-Rad | Cat. 번호 1708195EDU | |
| Nanodrop 분광 광도계 | Thermo Scientific | Cat. 아니요. 표준 | |
| C. elegans related1 | 1see reference19를 참조하십시오. | ||
| 프로토콜은 LB Medium 및 plates2 | 2see reference19를 참조하십시오. | ||
| 트립톤 | Acros Organics | 카탈로그 번호 611845000 | |
| 효모 추출물 | BD Biosciences | 카탈로그 번호 212750 | |
| NaCl | 시그마 | 카탈로그 번호 S7653 | |
| Bacto Agar | BD Biosciences | 카탈로그 번호 214040 | |
| 암피실린 | 시그마 | 카탈로그 번호 A0116 | |
| Tetracycline | Fisher Scientific | 카탈로그 번호 프로토콜은 BP912 | |
| M9 Medium2< | sup>2see reference19를 참조하십시오. | ||
| NaCl | Sigma | 카탈로그 번호 S7653 | |
| KH2PO4 | Sigma | 카탈로그 번호 P0662 | |
| Na2HPO4 | Sigma | 카탈로그 번호 S7907 | |
| MgSO4 | Sigma | 카탈로그 번호 M2773 | |
| NGM 플레이트 2 | 2see reference19를 참조하십시오. | ||
| NaCl | 시그마 | 카탈로그 번호 S7653 | |
| 펩톤 | BD Biosciences | 카탈로그 번호 211677 | |
| 트립톤 | Acros Organics | 카탈로그 번호 611845000 | |
| Bacto Agar | BD Biosciences | 카탈로그 번호 214040 | |
| MgSO4 | Sigma | 카탈로그 번호 M2773 | |
| CaCl2 | Sigma | 카탈로그 번호 C3881 | |
| 콜레스테롤 | 시그마 | 카탈로그 번호 C8667 | |
| K2HPO4 | Sigma | Cat. 번호 P3786 | |
| KH2PO4 | Sigma | Cat. 번호 P0662 | |
| RNAi plates3 | 3see reference21 참조. | ||
| NaCl | 시그마 | 카탈로그 번호 S7653 | |
| 펩톤 | BD Biosciences | 카탈로그 번호 211677 | |
| 트립톤 | Acros Organics | 카탈로그 번호 611845000 | |
| Bacto Agar | BD Biosciences | 카탈로그 번호 214040 | |
| MgSO4 | Sigma | 카탈로그 번호 M2773 | |
| CaCl2 | Sigma | 카탈로그 번호 C3881 | |
| 콜레스테롤 | 시그마 | 카탈로그 번호 C8667 | |
| K2HPO4 | 시그마 | 카탈로그 번호 P3786 | |
| KH2PO4 | Sigma | 카탈로그 번호 P0662 | |
| IPTG | US Biological | 고양이 번호 I8500 | |
| Carbenicillin | Fisher Scientific | 고양이 번호 BP2648 | |
| NaOH | Fisher Scientific | 카탈로그 번호 SS266-1 | |
| 차아염소산나트륨 | Fisher Scientific | 카탈로그 번호 50371500 | |
| Bacteria | |||
| OP50 박테리아 | CGC | ||
| HT115 박테리아 | CGC | ||
| 게놈 와이드 RNAi 라이브러리 | |||
| Ahringer 게놈 와이드 RNAi 공급 라이브러리 (ref21,58,59) | 출처 BioScience | ||
| C. elegans ORF-RNAi 공급 라이브러리 (ref60) | 출처 BioScience | ||
| Imaging related | |||
| Lidocaine | MP Biomedicals,LLG | Cat. no. 193917 | |
| 재료 | |||
| Vacuum Grease Silicone | Beckman | Cat. no. 335148 | |
| 현미경 슬라이드 | Fisher Scientific | 카탈로그 번호 4448 | |
| 조직 배양 플레이트, 6 웰 | 코닝 Inc. | 카탈로그 번호 08-772-33 | |
| Equipment | |||
| SMZ-U 해부 현미경(Nikon) | |||
| SZX12 해부 현미경(Olympus), 고출력 스테레오 형광 부착물(Kramer Scientific), Q 캡처 소프트웨어가 있는 CCD 카메라 및 X-Cite 형광 램프(Photonic Solutions) 장착. | |||
| TCS SL 레이저 스캐닝 컨포칼 현미경(Leica Microsystem) | |||
| ECLIPSE Ti-E 도립 현미경(Nikon) |
액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.