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방법 논문

효율적인 생성 및 급지대 무료 Ipsc CRISPR Cas9 시스템을 사용 하 여 인간의 췌 장 세포에서의 편집

9.8K 조회수

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DOI:

10.3791/56260

⸱

2017년 11월 8일

이 논문에서

요약

이 CRISPR/Cas9 ribonucleoproteins 및 수정된 된 특성을 사용 하 여 편집 다음 프로토콜 자세히 설명 발자국 없는 유도 만능 줄기 세포 (Ipsc)의 세대 급지대 무료 조건에서 인간의 췌장암 세포에서 단일 셀 복제합니다.

초록

배아와 유도 만능 줄기 세포는 자기 갱신 하 고 신체의 여러 세포 유형으로 차별화 수 있습니다. 만능 세포는 따라서 재생 의료에서 연구를 위한 탐 낼 고 현재 안과 질환, 당뇨병, 심장 질환 및 다른 질환에 대 한 임상 실험에서. 다양 한 응용 프로그램에 대 한 iPSC의 게놈을 조정 하기 위한 추가적인 기회를 제공 하는 편집 기술 CRISPR/Ca 시스템을 포함 하는 게놈의 최근 발전을 함께 하는 특수 세포 유형으로 차별화 하는 잠재력 모델링, 유전자 치료, 몇 가지 이름을 차별화의 경로 바이어 싱 하는 질병을 포함 하 여. 사용 가능한 편집 기술, 연쇄 상 구 균 pyogenes 에서 CRISPR/Cas9 진 핵 게놈의 사이트 편집에 대 한 선택의 도구로 떠오르고 있다. CRISPRs, 저렴, 쉽게 액세스할 수 있으며 대상된 편집 공학에서 매우 효율적인. Cas9 nuclease 및 가이드 시퀀스 (20-메 르)는 3 뉴클레오티드 "NGG" protospacer-인접-모티브 (PAM) 보편적인 Cas9 바인딩 추적 RNA (함께 원하는 genomic 소재 시에 Cas9을 타겟팅에 대 한 인접 게놈 대상에 특정 시스템 요구 함께 라는 단일 가이드 RNA 또는 sgRNA). 여기에 우리가 현재는 단계별 급지대 및 발자국 무료 iPSC의 효율적인 생성에 대 한 프로토콜 및 게놈 iPSC Cas9 ribonucleoprotein (RNP) 단지를 사용 하 여 편집에 대 한 방법론을 설명. 프로토콜 편집 게놈 효과적 이며 Cas9 단백질 및 동시에 전달 하는 셀에 하나 이상의 대상에 대 한 사전 complexing sgRNAs에 의해 쉽게 다중화 될 수 있다. 마지막으로, 우리는 식별 및 원하는 수정 Ipsc의 특성화에 대 한 간단한 접근 방법을 설명합니다. 함께 찍은, 개요 전략 생성 및 iPSC 매니폴드 응용 프로그램의 편집을 능률적으로 예상 된다.

서론

요소를 프로그래밍의 overexpression에 의해 만능 상태로 인간 체세포의 재프로그래밍 질병 모델링, 재생 의료 및 약물 개발에 응용 프로그램과 함께 줄기 세포 연구를 혁명 있다. 여러 가지 비 바이러스 성 재활 방법을 프로그래밍 요소와 Ipsc, 생성의 배달을 위해 사용할 수 있지만 과정은 노동 집약 하 고 매우 효율적인1. 바이러스 성 방법 비록 효율적 바이러스 통합 및 tumorigenicity2,,34의 문제와 관련 된 있습니다. 이 원고에서 우리 제공 요소를 프로그래밍 하 고 그들의 유전자5에 어떤 바이러스 성 벡터 시퀀스의 통합 부족 발자국 무료 iPSC 라인 설정에 대 한 세포질 센다이 바이러스를 사용 하 여를 보고 합니다. 센다이 바이러스는 RNA 바이러스는 감염 후 세포 세포질 ~ 10 구절에서 희석 하 고 풍부 하 게, 신속 하 고 효율적인 프로그래밍6,7을 선도 재활 요소를 생성 합니다. 설립된 Ipsc 공급기 무....

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프로토콜

1. 프로그래밍 프로토콜

  1. 기본 인간의 췌 장 세포에서 인간 iPSC의 세대
    1. 6-잘 1.5 mg/mL 차가운 콜라겐 접시 하 고 1 h. 위해 37 ° C에서 젤 코트
    2. 접시 인간의 기본 췌 장 세포는 콜라겐에 Prigrow III 매체 (~ 1-1.5 × 10 5 셀)에 코팅 6 잘 플레이트에 하루 약 2.5 × 10 5 셀 또는 적어도 60%를 달성 하기 위해-2 초기 통로의 날에 잘 당 confluency 변환 (0 일)입니다. 첫 번째 연구를 위해 0에 원하는 confluency 하나 잘 얻을 적어도 2-3 웰 스 접시. 셀 하나 이상 잘 컨트롤 사용.
    3. 변환 (0 일)의 날, 따뜻한 불리고 수를 각 잘 물 욕조에 Prigrow III 매체의 1 mL. 수확 10 %FBS 매체 1 mL의 트립 신/EDTA를 사용 하 여 5 분의 1 mL에 한 컨트롤에서 셀 또는 셀 셀 수 수행을 분리 하는. 10 %FBS 매체, 추가 DMEM, 10 %FBS, 1 %L-글루타민, 1% 나트륨 Pyruvate와 1% 비 본질적인 아미노산.
    4. 수 셀 카운터를 사용 하 여 세포의 생존 능력을 확인 하 고 계산 셀 번호 및 바이러스 titer에 따라 목표....

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결과

이 책에서 우리 통합 또는 발자국 무료 센다이 바이러스 벡터를 사용 하 여 인간의 췌 장 세포에서 iPSC의 세대에 대 한 간단 하지만 효율적인 프로토콜을 따라 했습니다. 그림 1A 이 재활 프로토콜의 도식 적인 표현을 보여준다. Prigrow III 매체에 경작 하 고 센다이 바이러스 위에서 설명한 대로 불리고 인간의 췌 장 세포가 상업적으로, 구매 되었다. 췌 장 세포를 형성 하는 불리고 스핀 0, 당일 센다이 바이러스 변환 후 ~ 5 일에 대 한 모든 형태학 상 변화를 보여주지 않았다 하지만 다음 더 큰 핵과 nucleoli 반올림 될. 일부 초기 식민지 주 후 변환 후 보였다 하지만 그들은 했다 하지, 우리의 경험, 이러한 식민지 신속 하 게 분열 하 고는 일반적으로 '초기 부분적으로 재설정된 셀'을 강력한 식민지를 설정 하지 않습니다. 약 10-15 일 후 변환, 작은 밝은 식민지 관찰 했다 고 성장 (

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토론

Ipsc 인간의 체세포의 재프로그래밍 기본적인 생물학 연구, 맞춤된 의학, 질병, 약물 개발 모델링과 재생 의학16의 분야에 큰 향상을 제공 하고있다. 호스트 게놈으로 통합의 위험 바이러스의 사용을 필요로 하는 인간의 iPSC 세대의 많은 현재 및 널리 사용 되는 방법 또는 episomal 벡터와 낮은 효율을 프로그래밍. 여기, 우리는 Ipsc 공급기 무료 센다이 바이러스, ' 무료 '와 효율적인 프로그래밍 리드와 인간의 췌 장 세포에서 생성 하는 효율적인 방법 제시. 결과 인간의 Ipsc는 무료로 바이러스 transgenes, pluripotency를 유지 하 고 알 수 없는 외 인 요인의 사용을 방지. 그래서 우리는 피더 세포에 기본 췌 장 세포를 재설정 다음 식민지 확장, 문화 및 특성에 대 한 막 급지대 무료 이동 Ipsc 공급기 무료 조건에서의 세대 낮은 재활 효율이 있다. 이러한 기술의 융합 신뢰할 수 있는 안정적이 고 보다 효율적인 iPSC 프로그래밍을 제공합니다.

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공개 사항

BT는 쳐도 생물 과학 주식 회사의 창립 멤버

감사의 글

실험실에서 박사 Anjali Nandal에 박사 후 펠로 십 그랜트와 탐험 그랜트에 의해 지원 되었다 메릴랜드 줄기 세포 연구 기금 BT (TEDCO)에서.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
센다이 바이러스 벡터 - CytoTune-iPS 2.0 KitInvitrogenA16517얼음 위에서 해동; S 번호 : 1
Trypsin EDTAGibco Life Tech25300-0540.05 %, 100 ml; S 아니오: 2
바위 억제물 (Y-27632)MiliporeSCM075사용 10 μ M; S 번호: 3
DMEM/F-12 매체Invitrogen11330-032S 번호: 4
혈청 대체(KSR)Gibco10828028S 번호: 5
DMEMInvitrogen119600691X; S No: 6
소 태아 혈청Thermo ScientificSH30071.03부분 표본; S 아니오: 7
L-글루타민 (Glutamax, 100X), 액체Thermo Scientific350500611/100; S 아니오: 8
비필수 아미노산Gibco11140-0501/100; S No: 9
2-메르캅토에탄올Gibco2198502355 mM, 1/1,000; S No: 10
Hausser HemacytometersHausser Scientific02-671-54S No: 11
0.1% 젤라틴 용액STEMCELL Technologies790337º에서 배양; C 1 시간; S 번호 : 12
SSEA-4 항체Santacruzsc-217041/100; S 번호: 13
TRA-1-81 항체세포 신호4745S1/200; S No: 14
OCT4 항체Santa Cruzsc-52791/1,000; S 번호 : 15
콜라겐 I, 쥐 꼬리생명 기술A10483-01차갑게 유지하십시오. S No: 16
Alexa Fluor 형광 488/568 (2차 항체)InvitrogenA21202/A100421/2,000; S 번호: 17
DPBS하이클론SH30028LS1X; S No: 18
100-mm 조직 배양 접시Falcon353003S No: 20
96-웰 조직 배양 플레이트Falcon353078S No: 21
6-웰 조직 배양 플레이트Falcon353046S No: 22
해부 범위 니콘SMZ745S No: 23
피킹 후드NuAireNU-301S No: 24
15  ml 원심분리기 튜브Greiner Bio-One188271S No: 25
50  ml 원심분리기 튜브Greiner Bio-One227261S No: 26
Sodium pyruvateInvitrogen11360S No: 28
β-mercaptoethanolSigmaM7522S No: 29
Prigrow III mediumABMTM003S No: 31
Countess™ Cell CounterInvitrogenC10227S No: 32
Faxitron X-ray systemFaxitronCellRadS No: 33
AccutaseInnovative cell TechnologiesAT-104S No: 34
CollagenaseLife Technologies171040191mg/ml 재고; S No: 35
DispaseSTEMCELL Technologies7923S No: 36
hESC 인증 matrigelBD Biosciences354277희석하려면 차가운 DMEM/F-12를 사용하십시오. S 번호: 37
bFGFR & D233-FB재고 10 ug/ml; S 번호 : 38
파라 포름 알데히드EMS15710PBS의 4 % 주식; S 번호 : 39
TRA-1-60산타 크루즈사우스 캐롤라이나 - 217051/100; S 번호: 40
nanogReproCELLRCAB0004P-F1/100; S 번호: 41
트윈 20시그마P9416-100MLS 번호: 42
알칼리 인산가수분해효소 키트Stemgent00-0055S 번호: 43
Cas9 단백질PNA BioCP01-50해동 및 분취; S 번호: 44
염소 또는 당나귀 혈청시그마D9663/G9023S 번호: 45
Triton X-100SigmaX100-100MLS 번호: 46
DAPIThermo ScientificD1306S 번호: 47
TrisSigma9285-100MLS 번호: 48
NaCLSigmaS7653-250GS 번호: 49
EDTASigmaBP2482-500S 번호: 50
T4 DNA 리가제NEBM0202TS No: 51
Mega Shortscript T7 kitThermo ScientificAM1354S No: 52
Mega Clear kitThermo ScientificAM1908S No: 53
SMC4BD Biosciences354357S No: 54
FibronectinSTEMCELL Technologies7159S No: 55
CloneJET 클로닝 키트Thermo ScientificK1232S No: 56
Fragment analyzerTMAdvanced AnalyticalS No: 57
mTeSR1 medium kitSTEMCELL Technologies5850실온; S No: 58
동결 매체 mFreSR™STEMCELL Technologies5855S No: 59
냉동 매체 CryoStor®STEMCELL Technologies7930S No: 60
MEFsGlobalstemGSC-6301GS No: 61
L-glutamineInvitrogen25030081S No: 62
인간 췌장 세포ABMT0159S No: 63
STEMdiff™ 신경 유도 매체줄기세포 기술5835S 번호: 64
RPMIThermofisher11875-093S 번호: 65
2% B27-인슐린ThermofisherA1895601S 번호: 66
CHIR99021Stemcell Technologies72052S 번호: 67
IWP4Stemcell Technologies72552S 번호: 68
2% B27Thermofisher17504044S 번호: 69
MCDB 131Life Technologies10372019S 번호: 70
중탄산나트륨시그마-알드리치S8761-100MLS 번호: 71
포도시그마-알드리치G8270-100GS 번호: 72
BSAProliant68700S 번호: 73
GDF8Pepro-Tech120-00S 번호: 74
TUJ1 항체EMD MiliporeAB9354S No: 75
NKX2-5 항체Santa CruzSc-14033S No: 76
SOX17 항체R & D 시스템AF1924S No: 77
Propidium iodideThermo ScientificP3566S No: 78
Amaxa 4D-nucleofector™LonzaAAF-1002S No: 79
FACSAria II(세포 분류기)BD biosciencesSORP UVS No: 80
개의 당

참고문헌

  1. Malik, N., Rao, M. S. A review of the methods for human iPSC derivation. Methods Mol. Biol. 997, 23-33 (2013).
  2. Yu, J., et al. Induced pluripotent stem cell lines derived from human somatic cells. Science. 318, 1917-1920 (2007).
  3. Takahashi, K., Yamanaka,....

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