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방법 논문

조 혈 줄기 세포의 작은 숫자에 대 한 프로토콜을 더럽혀 서 부

10.5K 조회수

⸱

DOI:

10.3791/56855

⸱

2018년 8월 22일

 ,  , 

이 논문에서

요약

프로토콜 blotting 표준 서 500 조 혈 줄기 또는 조상 세포로 몇 가지 분석을 위해 최적화 되었다. 최적화 포함 셀 샘플의 처리, 튜브, 사이 전송 제한 및 직접 Laemmli 샘플 버퍼에 세포를 lysing 주의 한다.

초록

조 혈 줄기 세포 (HSCs)는 드문 셀, 오래만 25000 ~ phenotypic 포함 된 마우스 골 수와 함께 다시 채우기 HSCs 용어. 서쪽 더 럽 히 프로토콜 최적화 되었고 HSCs (500-15000 셀)의 작은 숫자의 분석에 적합 합니다. Phenotypic HSCs 정화, 정확 하 게 계산, 고 직접 Laemmli 샘플 버퍼에서 lysed. Lysates 셀의 동등한 숫자를 포함 하는 나트륨 라우릴 황산 염의 polyacrylamide 젤 전기 이동 법 (SDS 페이지)에 의해 분석 되었다 오 점 준비 하 고 더럽혀 프로토콜 표준 서에 따라 처리. 이 프로토콜, 2000-5000를 사용 하 여 HSCs는 정기적으로 분석 될 수 있다, 그리고 어떤 경우에 데이터는 몇 가지 대부분의 출판물에 20000 ~ 40, 000 셀에 비해 500 셀으로에서 얻을 수 있습니다. 이 프로토콜 다른 조 혈 모 세포에 일반적으로 적용 되 고 표준 실험실 절차를 사용 하 여 셀의 작은 숫자의 일상적인 분석을 수 있습니다.

서론

조 혈 줄기 세포 (HSCs)는 모든 혈액 계보를 야기할 수 있는 각자 경신 세포 이다. 그들은 생 화 확 적인 분석을 어려운 렌더링 골 수에서 비교적 드문 셀입니다. 접근 cytometry, 같은 희귀 세포 분석을 위한 적합 한 세포 표면 마커 및 세포내 단백질의 상대적인 양을 측정 하는 데 매우 유용 했습니다. 그러나, 항 체 접근을 사용 하 셀 permeabilization 절차의 사용을 필요로 하는 세포내 단백질의 분석 하 고 모든 세포 표면 epitopes 살아이 절차1,2. 또한, 다른 단백질 isoforms 또는 분열 제품을 구분 하는 항 체는 종종 cytometry, 사용할 수 없습니다 그리고 그러므로 조사 여전히 의존 서쪽 오 점 특정 유형의 분석.

세포 lysates의 서쪽 오 점 분석은 대부분 실험실에서 일상적인 절차입니다. 세포 세포 표면 분자의 epitopes를 유지 하는 기본 조건에서 순화 될 수 있다 그리고 세포 lysates 수 이후에 준비 하 고 분석 했다. 그러나, 서쪽에 의해 인구 오 점 드문 기본 셀에 단백질의 분석 euthanizing 충분 한 세포를 얻기 위해 동물의 많은 수를 요구할 수 있습니다. ....

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프로토콜

모든 절차는 기관 동물 사용 및 관리 지침에 따라 수행 되어야 합니다. 절차 murine 조 혈 줄기와 조상 세포 (HSCs, HPs)의 분석을 위해 개발 되었다 그러나 다른 세포 인구의 분석을 위해 적응 시킬 수 있다.

1. 교류 Cytometry 절연 Murine HSCs 및 HPs의

  1. 문학6에 설명 된 대로 murine 골 수 세포를 수확.
    참고: 그림 1 과 그림 2에 표시 하는 데이터에 골 C57BL/6J 쥐에서 수확 했다.
  2. 제조업체의 지침에 따라 마우스 리니지 고갈 키트를 사용 하 여 골 수 세포의 계보 소모를 수행 합니다.
  3. 설명7에 대 한 관심의 세포 표면 마커 항 체와 세포를 품 어. 그림 1 과 그림 2에 나와 실험에서 Sca 1, 키트, Flt3, 및 계보 (Lin) 마커 Mac1, Gr1, CD3e, B220, 그리고 Ter119 항 체 사용 됩니다.
  4. 정....

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결과

500-2000 순화 HSCs와 HPs에서 대표적인 결과 그림 1 과 그림 2에 표시 됩니다. 그림 1 에서 β-말라 신호에서 몇 가지 500 HSCs로 검출 될 수 있다 고 HPs 한 마우스의 골 수에서 정화. Note는 3.0 m m 우물에 로드 보다 500 HPs에서 훨씬 더 강력한 신호 생산 로드는 lysates 1.5 m m 우물. 그림 2 은 EIF4G의 서쪽 오 점 및 Rps6의 인 산화 (p-Rps6), 둘 다 단백질 번역12, HSCs의 규칙에 관련 되 고 HPs와 줄기 세포에 의해 자극 없이 (SCF) 생체 외에서요인.

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토론

서 부 럽 조직 또는 세포에 특정 단백질 및 신호 통로의 활성화를 탐지 하기 위한 일반적인 기술입니다. 작은 조정에 일반적으로 사용 되는 절차를 도입 하 여 정기적으로 15000 HSCs, 그리고 경우에 따라 몇 가지로 500 HSCs 15 다른 단백질 (자료 테이블)을 감지할 수 있었습니다. The most이 프로토콜의 중요 한 단계는: 1) 정확 하 게 계산 셀, 2) 튜브, 사이 전송의 수를 최소화 및 3) lysing Laemmli 샘플 버퍼와 직접 셀. Lysing Laemmli 샘플 버퍼 셀 펠 릿, 우리는 보다는 제거는 상쾌한의 모든 셀 펠 릿에서 하 고 다시 만약 우리가 대신 튜브에 남아 있는 작은 양의 상쾌한 동등한 추가 Laemmli 샘플 버퍼에서 중단 발견 Laemmli 샘플 버퍼 x 2의 볼륨, 우리 셀 손실을 피할 수 있습니다. 셀 손실의 위험을 감소 또한 centrifuging 진동 물통 회전자에 셀. 트리밍 빗 이빨 잘의 폭을 줄이는 탐지의 감도 향상.

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공개 사항

저자는 선언 하는 관심의 충돌이 있다.

감사의 글

국립 보건원 부여 R01 CA149976 (N.A.S)이이 작업을 지원 합니다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
나트륨 도데 실 설페이트 (SDS)피셔 사이언티픽BP166-500SDS-PAGE
템 드피셔 사이언티픽BP150-20SDS-PAGE
30 % 아크릴 아미델 비스 솔루션바이오 라드1610158SDS-PAGE
1.5M 트리스 HCl pH8.8TEKNOVAT1588SDS 페이지
1.0M 트리스 HCl pH6.8TEKNOVAT1068SDS 페이지
과황산 암모늄피셔 사이언티픽BP179-25SDS-PAGE
미니 프로티안 3 빗Bio-Rad1653360SDS-PAGE
미니 프로티안 테트라 셀Bio-Rad1658005EDUSDS-PAGE
전송 시스템Bio-Rad1704155EDU전송
PowerPac HC 전원 공급 장치Bio-Rad1645052EDU전기 영동
이미징 시스템Bio-Rad1708195신호 감지
4x Laemmli 샘플 버퍼Bio-Rad1610747EDU샘플 준비
10x Tris/Glycine/SDS 전기영동 버퍼Bio-Rad1610732EDU전기영동
2-MercaptoethanolBio-Rad1610710EDU샘플 준비
RTA Mini PVDF 전송 키트, 40인용 블롯Bio-Rad1704272전달
프로테아제 억제제 칵테일 시그마11697498001시료 준비
인산가수분해효소 억제제 칵테일골드 생명공학GB-450-1시료 준비
EIF4G세포 신호 전달2469WB 항체, 1000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): 그림2
p-Rps6세포 신호4858WB 항체, 1000 세포에서 검증
항체 농도: 1:1000
참조(그림): Fig2
actin(HRP conjugated)abcamab49900WB 항체, 500개 세포에서 검증
항체 농도: 1:5000
참조(그림): Fig1, Fig2
LC-3Abcamab48394WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (그림 5)
S6세포 신호 전달2317WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (그림 4)
4EBP1세포 신호9644WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
p-4EBP1Cell Signaling2855WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
TSC2Cell Signaling4308WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
HSP90세포 신호4877WB 항체, 15000 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig5)
PTENCell Signaling9188WB 항체, 15000 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
mTORCell Signaling2983WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
p-mTORCell Signaling5536WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
PP2ABCell Signaling4953WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
p-AMPKaCell Signaling2535WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
actinSanta Cruzsc-47778WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:3000
참조(그림): ref5 (Fig4)
lineage depletion kit (마우스)Miltenyi Biotec130-090-858조혈 줄기 및 전구 세포 정제
LS 컬럼Miltenyi Biotec130-041-305조혈 줄기 및 전구 세포 정제
SCFPeproTech250-03인산화 자극
APC-Cy7 c-kit 항체ThermoFisherA15423세포 분류
항 B220ThermoFisher48-0452-82세포 분류
안티-CD3eThermoFisher48-0031-82세포 분류
안티-Mac1ThermoFisher48-0112-82셀 분류
안티-Gr1ThermoFisher48-5931-82셀 분류
안티-Ter119ThermoFisher48-5921-82셀 분류
스페이서 플레이트, 1.0 mm 통합 스페이서Bio-Rad1653311SDS-PAGE
BSAResearch Products InternationalA30075막 차단
세럼Atlanta BiologicalsA12450중간 보충제
세포 계수기InvitrogenAMQAF1000세포 계수
ThermoFisher  S17040세포 계수
플림Denville ScientificE3012신호 감지
의료용 필름 프로세서KonicaSRC-101A신호
감지 Supersignal West Femto 최대 감도 기판Therom Scientific34096신호 감지
Allegra X-15R 원심분리기(로터 SX4750A)Beckman CoulterX-15R샘플 준비
BLUEstain protein ladderGold BiotechnologyP007-500전기영동
세포 분류기BDFACSAria II시료 준비
IncublockDenville ScientificI0510전기영동
기

참고문헌

  1. Krutzik, P. O., Clutter, M. R., Nolan, G. P. Coordinate analysis of murine immune cell surface markers and intracellular phosphoproteins by flow cytometry. J Immunol. 175 (4), 2357-2365 (2005).
  2. Du, J., et al.

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