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방법 논문

조 혈 줄기 세포의 작은 숫자에 대 한 프로토콜을 더럽혀 서 부

10.4K 조회수

DOI:

10.3791/56855

2018년 8월 22일

이 논문에서

요약

프로토콜 blotting 표준 서 500 조 혈 줄기 또는 조상 세포로 몇 가지 분석을 위해 최적화 되었다. 최적화 포함 셀 샘플의 처리, 튜브, 사이 전송 제한 및 직접 Laemmli 샘플 버퍼에 세포를 lysing 주의 한다.

초록

조 혈 줄기 세포 (HSCs)는 드문 셀, 오래만 25000 ~ phenotypic 포함 된 마우스 골 수와 함께 다시 채우기 HSCs 용어. 서쪽 더 럽 히 프로토콜 최적화 되었고 HSCs (500-15000 셀)의 작은 숫자의 분석에 적합 합니다. Phenotypic HSCs 정화, 정확 하 게 계산, 고 직접 Laemmli 샘플 버퍼에서 lysed. Lysates 셀의 동등한 숫자를 포함 하는 나트륨 라우릴 황산 염의 polyacrylamide 젤 전기 이동 법 (SDS 페이지)에 의해 분석 되었다 오 점 준비 하 고 더럽혀 프로토콜 표준 서에 따라 처리. 이 프로토콜, 2000-5000를 사용 하 여 HSCs는 정기적으로 분석 될 수 있다, 그리고 어떤 경우에 데이터는 몇 가지 대부분의 출판물에 20000 ~ 40, 000 셀에 비해 500 셀으로에서 얻을 수 있습니다. 이 프로토콜 다른 조 혈 모 세포에 일반적으로 적용 되 고 표준 실험실 절차를 사용 하 여 셀의 작은 숫자의 일상적인 분석을 수 있습니다.

서론

조 혈 줄기 세포 (HSCs)는 모든 혈액 계보를 야기할 수 있는 각자 경신 세포 이다. 그들은 생 화 확 적인 분석을 어려운 렌더링 골 수에서 비교적 드문 셀입니다. 접근 cytometry, 같은 희귀 세포 분석을 위한 적합 한 세포 표면 마커 및 세포내 단백질의 상대적인 양을 측정 하는 데 매우 유용 했습니다. 그러나, 항 체 접근을 사용 하 셀 permeabilization 절차의 사용을 필요로 하는 세포내 단백질의 분석 하 고 모든 세포 표면 epitopes 살아이 절차1,2. 또한, 다른 단백질 isoforms 또는 분열 제품을 구분 하는 항 체는 종종 cytometry, 사용할 수 없습니다 그리고 그러므로 조사 여전히 의존 서쪽 오 점 특정 유형의 분석.

세포 lysates의 서쪽 오 점 분석은 대부분 실험실에서 일상적인 절차입니다. 세포 세포 표면 분자의 epitopes를 유지 하는 기본 조건에서 순화 될 수 있다 그리고 세포 lysates 수 이후에 준비 하 고 분석 했다. 그러나, 서쪽에 의해 인구 오 점 드문 기본 셀에 단백질의 분석 euthanizing 충분 한 세포를 얻기 위해 동물의 많은 수를 요구할 수 있습니다. ....

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프로토콜

모든 절차는 기관 동물 사용 및 관리 지침에 따라 수행 되어야 합니다. 절차 murine 조 혈 줄기와 조상 세포 (HSCs, HPs)의 분석을 위해 개발 되었다 그러나 다른 세포 인구의 분석을 위해 적응 시킬 수 있다.

1. 교류 Cytometry 절연 Murine HSCs 및 HPs의

  1. 문학6에 설명 된 대로 murine 골 수 세포를 수확.
    참고: 그림 1그림 2에 표시 하는 데이터에 골 C57BL/6J 쥐에서 수확 했다.
  2. 제조업체의 지침에 따라 마우스 리니지 고갈 키트를 사용 하 여 골 수 세포의 계보 소모를 수행 합니다.
  3. 설명7에 대 한 관심의 세포 표면 마커 항 체와 세포를 품 어. 그림 1그림 2에 나와 실험에서 Sca 1, 키트, Flt3, 및 계보 (Lin) 마커 Mac1, Gr1, CD3e, B220, 그리고 Ter119 항 체 사용 됩니다.
  4. 정....

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결과

500-2000 순화 HSCs와 HPs에서 대표적인 결과 그림 1그림 2에 표시 됩니다. 그림 1 에서 β-말라 신호에서 몇 가지 500 HSCs로 검출 될 수 있다 고 HPs 한 마우스의 골 수에서 정화. Note는 3.0 m m 우물에 로드 보다 500 HPs에서 훨씬 더 강력한 신호 생산 로드는 lysates 1.5 m m 우물. 그림 2 은 EIF4G의 서쪽 오 점 및 Rps6의 인 산화 (p-Rps6), 둘 다 단백질 번역12, HSCs의 규칙에 관련 되 고 HPs와 줄기 세포에 의해 자극 없이 (SCF) 생체 외에서요인.

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토론

서 부 럽 조직 또는 세포에 특정 단백질 및 신호 통로의 활성화를 탐지 하기 위한 일반적인 기술입니다. 작은 조정에 일반적으로 사용 되는 절차를 도입 하 여 정기적으로 15000 HSCs, 그리고 경우에 따라 몇 가지로 500 HSCs 15 다른 단백질 (자료 테이블)을 감지할 수 있었습니다. The most이 프로토콜의 중요 한 단계는: 1) 정확 하 게 계산 셀, 2) 튜브, 사이 전송의 수를 최소화 및 3) lysing Laemmli 샘플 버퍼와 직접 셀. Lysing Laemmli 샘플 버퍼 셀 펠 릿, 우리는 보다는 제거는 상쾌한의 모든 셀 펠 릿에서 하 고 다시 만약 우리가 대신 튜브에 남아 있는 작은 양의 상쾌한 동등한 추가 Laemmli 샘플 버퍼에서 중단 발견 Laemmli 샘플 버퍼 x 2의 볼륨, 우리 셀 손실을 피할 수 있습니다. 셀 손실의 위험을 감소 또한 centrifuging 진동 물통 회전자에 셀. 트리밍 빗 이빨 잘의 폭을 줄이는 탐지의 감도 향상.

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공개 사항

저자는 선언 하는 관심의 충돌이 있다.

감사의 글

국립 보건원 부여 R01 CA149976 (N.A.S)이이 작업을 지원 합니다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
나트륨 도데 실 설페이트 (SDS)피셔 사이언티픽BP166-500SDS-PAGE
템 드피셔 사이언티픽BP150-20SDS-PAGE
30 % 아크릴 아미델 비스 솔루션바이오 라드1610158SDS-PAGE
1.5M 트리스 HCl pH8.8TEKNOVAT1588SDS 페이지
1.0M 트리스 HCl pH6.8TEKNOVAT1068SDS 페이지
과황산 암모늄피셔 사이언티픽BP179-25SDS-PAGE
미니 프로티안 3 빗Bio-Rad1653360SDS-PAGE
미니 프로티안 테트라 셀Bio-Rad1658005EDUSDS-PAGE
전송 시스템Bio-Rad1704155EDU전송
PowerPac HC 전원 공급 장치Bio-Rad1645052EDU전기 영동
이미징 시스템Bio-Rad1708195신호 감지
4x Laemmli 샘플 버퍼Bio-Rad1610747EDU샘플 준비
10x Tris/Glycine/SDS 전기영동 버퍼Bio-Rad1610732EDU전기영동
2-MercaptoethanolBio-Rad1610710EDU샘플 준비
RTA Mini PVDF 전송 키트, 40인용 블롯Bio-Rad1704272전달
프로테아제 억제제 칵테일 시그마11697498001시료 준비
인산가수분해효소 억제제 칵테일골드 생명공학GB-450-1시료 준비
EIF4G세포 신호 전달2469WB 항체, 1000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): 그림2
p-Rps6세포 신호4858WB 항체, 1000 세포에서 검증
항체 농도: 1:1000
참조(그림): Fig2
actin(HRP conjugated)abcamab49900WB 항체, 500개 세포에서 검증
항체 농도: 1:5000
참조(그림): Fig1, Fig2
LC-3Abcamab48394WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (그림 5)
S6세포 신호 전달2317WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (그림 4)
4EBP1세포 신호9644WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
p-4EBP1Cell Signaling2855WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
TSC2Cell Signaling4308WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig4)
HSP90세포 신호4877WB 항체, 15000 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (Fig5)
PTENCell Signaling9188WB 항체, 15000 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
mTORCell Signaling2983WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
p-mTORCell Signaling5536WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
PP2ABCell Signaling4953WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
p-AMPKaCell Signaling2535WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:1000
참조(그림): ref5 (FigS1)
actinSanta Cruzsc-47778WB 항체, 15000개 세포에서 검증됨
항체 농도: 1:3000
참조(그림): ref5 (Fig4)
lineage depletion kit (마우스)Miltenyi Biotec130-090-858조혈 줄기 및 전구 세포 정제
LS 컬럼Miltenyi Biotec130-041-305조혈 줄기 및 전구 세포 정제
SCFPeproTech250-03인산화 자극
APC-Cy7 c-kit 항체ThermoFisherA15423세포 분류
항 B220ThermoFisher48-0452-82세포 분류
안티-CD3eThermoFisher48-0031-82세포 분류
안티-Mac1ThermoFisher48-0112-82셀 분류
안티-Gr1ThermoFisher48-5931-82셀 분류
안티-Ter119ThermoFisher48-5921-82셀 분류
스페이서 플레이트, 1.0 mm 통합 스페이서Bio-Rad1653311SDS-PAGE
BSAResearch Products InternationalA30075막 차단
세럼Atlanta BiologicalsA12450중간 보충제
세포 계수기InvitrogenAMQAF1000세포 계수
ThermoFisher  S17040세포 계수
플림Denville ScientificE3012신호 감지
의료용 필름 프로세서KonicaSRC-101A신호
감지 Supersignal West Femto 최대 감도 기판Therom Scientific34096신호 감지
Allegra X-15R 원심분리기(로터 SX4750A)Beckman CoulterX-15R샘플 준비
BLUEstain protein ladderGold BiotechnologyP007-500전기영동
세포 분류기BDFACSAria II시료 준비
IncublockDenville ScientificI0510전기영동

참고문헌

  1. Krutzik, P. O., Clutter, M. R., Nolan, G. P. Coordinate analysis of murine immune cell surface markers and intracellular phosphoproteins by flow cytometry. J Immunol. 175 (4), 2357-2365 (2005).
  2. Du, J., et al.

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