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Research Article
Adekunle T. Bademosi1, Elsa Lauwers2, Rumelo Amor3, Patrik Verstreken2, Bruno van Swinderen3, Frédéric A. Meunier1
1Clem Jones Centre for Ageing Dementia Research, Queensland Brain Institute,The University of Queensland, 2VIB Centre for Brain and Disease Research, KU Leuven Department of Neurosciences,Leuven Institute for Neurodegenerative Disease (LIND), 3Queensland Brain Institute,The University of Queensland
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
여기에 우리가 설명 단일 분자 사진 활성화 지역화 현미경 라이브 초파리 melanogaster 의 모터 신경 맨끝에 실시 될 수 있습니다 하는 방법 3 유 충 탈피.
최고 해결책 현미경 검사 법 기술의 증가 수는 나노 세포 세계 지배 메커니즘을 밝히기를 돕고 있습니다. 살아있는 세포에 개별 분자의 시각화에 대 한 특별 액세스 제공 단일 분자 이미징 기세를 얻고 있다. 여기, 우리가 초파리 애벌레에 단일 입자 추적 사진 활성화 지역화 현미경 (sptPALM)을 수행 하기 위해 개발 하는 기술을 설명 합니다. 도킹, 프라이 밍, 및 포함 하는 신경 전달 물질의 융합을 추진 하는 주요 연 접 단백질에 의존 하는 시 냅 스 통신 플라즈마 막으로 소포. 단백질 지질 및 단백질-단백질 상호 작용의 범위는 밀접 하 게 이러한 프로세스 조절 및 연 접 단백질 따라서 이동성 각 이러한 키 이벤트와 관련 된 변화를 전시. 이 단백질의 이동성 그대로 살아있는 동물에 그들의 생리 기능으로 연결 하는 어떻게 조사 하 고 행동의 그들의 정확한 메커니즘을 이해 하는 데 필수적 이다. 높은 해상도 vivo에서 단백질 이동성 추출 광학 투명성, 접근성, 등 침투 깊이 한계 극복 필요 합니다. Photoconvertible 형광 단백질 Syntaxin-1A를 약간의 간접 조명을 통해 시각 및 모터 신경 터미널에서 또는 제 3의 모터 신경 축 삭을 따라 추적 수 연 접 단백질에 초파리 를 탈피 하는 방법 설명 유 충입니다.
신경 통신 원형질 막1시 냅 스의 소포를 포함 하는 신경 전달 물질의 규제 융합을 통해 발생 하는 신경 전달 물질 방출에 의존 합니다. Exocytosis2,,34,,56 라고 하는이 프로세스는 매우 동적 이며 업 또는 다운-통제 자극7의 속도 변동에 따라 될 수 있습니다. 이러한 프로세스에 관련 된 단백질 브라운 모션 적용 되며 따라서 전체 조직 유지 하는 다양 한 바인딩 이러한 생리 기능을 보강 하는 작업의 수를 표시. 플라즈마 막 단백질은 매우 동적, 원형질 막7,,89,10,11에 nanoclusters로 분자의 측면 트래핑을 허용 12. 따라서, 이러한 단백질의 이동성 조사 작업8의 그들의 모드를 명료 하 데 도움이 됩니다. 지금 알려진 다 측면 빠른 기동성을 전시 하 고 옆쪽으로 분자 제공할 수 있다 nanoclusters 내에서 트랩핑 녹는 N-ethylmaleimide 민감한 요소 첨부 단백질 수용 체 (SNAREs), 예를 들면 Syntaxin-1A, 같은 시 냅 스 단백질 창 고 그리고 소포 융해9,13,,1415에 대 한 사이트.
Photoconvertible 형광 단백질 단위체 (m) Eos16,17 가18, 등의 최근 개발 허용 했다 접근의 사용을 통해 신경 플라즈마 막 단백질의 전체 해상도 등 사진 활성화 지역화 현미경 (팜) 및 확률적 광학 재건 현미경 (폭풍)14,,1519. 이러한 발전 성과 교양된 라이브 세포와 신경 생물학 단백질의 nanoclustering에 대 한 조사를 활성화 했습니다. 최근에, 연구는 실시 되었습니다 명료 (비슷한 높은 해상도)에서 역학과 라이브 그대로 생물의 신경에 있는이 막 단백질의 조직 같은 생쥐, 꼬마 선 충, 및 를 초파리 melanogaster14,20,,2122.
하지만 또한 같은 hindrances를 극복 하는 능력 뿐만 아니라 (예: 팜, 폭풍우, 및 photoconvertible fluorophores), 최근에 개발 된 슈퍼 해상도 이미징 도구를 사용 해야 역학과는 단백질에서 생체 내에서 의 조직 조사 단백질 및 이미징 레이저의 침투 깊이 접근으로 그대로 동물에 세포내 단백질 이미징 본질적으로 이미지 그대로 마우스의 해 마 같은 그대로 동물의 생활 조직 내의 깊은 포함 하는 구조 단백질으로 도전 이다. 따라서, 단백질 또는 직물의 표면 가까이는 몇 군데 더 쉽게. Vivo에서 화상 진 찰과 다른 어려움은 동물에서 재현성 보장 이다. 로 해부학 한 샘플에서 다른 다를 수 있습니다, 다른 그대로 동물 샘플에서 복제의 용이성과 구조를 선택 하면 증명할 수 있는 또한 도전. 틀에 박힌 구조를 사용 하 여 같은 synapses, 이러한 어려움 들을 극복에 도움이.
최근 연구 결과 다른 조사 예는 조직/기관의 표면에 단백질 조직 몇 군데 있다 하는 동안 꼬마 선 충22, 같은 광학 투명 한 표 피와 동물에서 단백질 이동성을 몇 군데 있다 살아있는 마우스21의 두개골을 통해 대뇌 피 질의 뉴런에 걸 이미지입니다. 경우에 따라 마 취약 사용 되었습니다 움직이지; 동물 유지 그러나, 특정 마 취약 관심사의 단백질을 저하 수 있습니다. 따라서 오류를 최소화 하기 위해 vivo에서 화상 진 찰 동안 동물을 움직이기 힘 드는 유지 하는 대체 수단을 탐험 한다.
슈퍼 해상도 이미징 vivo에서 다른 경고는 관심사의 단백질을 조명 하는 데 사용 하는 레이저 부정적인 주변 조직에 영향을 미칠 수 및 따라서 여기 강도 가능한 한 낮게 유지는 것이 좋습니다. 레이저에 의해 주변 조직의 조명 또한 배경 신호를 증가 경향이 있다. 낮은 자극 강도 사용 하 여 백그라운드를 줄이는 데 도움이 됩니다, 그리고 그것은 되 고 경고는 또한 형광 단백질 광자 수확량에서 감소 이어질 수 있습니다. 분석 하는 동안 배경 빼기 대안 이미지 분석 전에 배경 신호를 줄이기 위해 수단으로 사용 될 수 있습니다.
초파리 는 vivo에서 특정 단백질 기능 조사에 대 한 기초가 튼튼한 유전 도구 제공 이미징에 대 한 이상적인 유기 체를 선물 한다. 상류 활성화 순서 (UAS)-Gal4 시스템 단백질의 시간적, 공간적 표현 가능 하 고 따라서 neurotransmission23, 조작 하는 데 사용 될 그런 초파리 과도 사용 하 여 열 유전자 자극 수용 체 잠재력 하위 가족 A1 (dTRPA1)24 또는 광학 유전자 자극 훨씬 red 이동 CsChrimson25 를 사용 하 여 이미징14와 결합 될 수 있다. 우리는이 시스템에서 수행 하는 단일 분자 이미징 vivo에서 의 합병증의 많은 극복 하 고 지금 설명 하는 방법 단일 입자 추적 실시 될 수 있습니다 초파리 melanogaster 3 탈피 애벌레에서.
1. 유전자 변형 초파리 mEos2 태그 단백질 표현 디자인
2입니다. 유 충 탈피 3의 해 부
3. 약간 비스듬한 조명 단일 입자 추적 현미경
4. 단일-분자 지역화 고정된 애벌레에
위에 나열 된, Syntaxin-1A-mEos2 유전자 변형 Drosophilamelanogaster 했다 프로토콜을 사용 하 여 생성 (그림 1). 유전자 변형 3 탈피 초파리 애벌레 PDMS 원통형 자료 (그림 2A-F)에 해 부 했다. Syntaxin-1A의 단일 분자를 시각화 하려면 우리는 약간 비스듬한 레이저 조명14TIRF 현미경에 팜 사용.
Syntaxin-1A의 단일 분자는 두 번째 복 부 세그먼트의 6 근육에 모터 신경 연 접 맨끝에 추적 했다. MEos2의 녹색 형광 형식 1b boutons 488 nm 레이저 (그림 3A)를 사용 하 여 흥분 하는 경우에 Syntaxin-1A-mEos2의 저해상도 이미지와 같이 검출 될 수 있었다. 이미징 실험, 405 nm 및 561 nm 여기 레이저 이미징 깊이 했다 133.5 및 165.6 nm, 각각. 녹색 이미지는 16 개별 프레임의 평균으로 인수 되었다. 이 녹색 이미지는 photoconverted 동영상 혼자 연 접 모터 신경 맨끝을에 지 방화의 분석을 제한 하는 데 사용 하는 관심의 영역을 만드는 사용 되었다.
취득된 photoconverted sptPALM 영화 분석 슈퍼 해결된 강도, 확산 계수, 생성 및 궤적 지도 (그림 3A). Syntaxin-1A-mEos2 이동성 개별 궤적 (그림 3B)의 제곱 변위 (MSD)의 분석에 의해 정량 추가 되었다. 통계 비교를 할 수 있는 엠 곡선 (그림 3B)에서 영역을 사용 하 여. 이동성의 추가 분석 Syntaxin-1A-mEos2의 확산 계수 분포 있고이 부동 인구 (그림 3C)을 모바일의 비교에서 통계적으로 계산 될 수 있습니다.

그림 1 : MEos2 태그 구문을 생성. pFL44S-attB-MCS-w + 벡터 BamHI 및 XbaI 오는지. 겹치는 연쇄 반응 (PCR) 관심 (POI)의 단백질을 인코딩 조각 그리고 mEos2, 각각, 수 복제 될, 예를 들어 ura3- 효 모 세포에서 vivo에서 재결합 또는 깁슨 어셈블리. 참고 Syntaxin-1A-mEos2 transgene 생성, 우리는 구조 복제 어귀 생 Syntaxin-1A 발기인 및 종결자 시퀀스. 결과 구문 이후에 표현 관심 (POI)의 mEos2 융합 단백질 유전자 변형 플라이 라인을 만들 초파리 배아에 주입 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 2 : 초파리 유 충 해 부 및 간접 조명입니다. (A) 스키마 초파리 유 충 절 개 반 원통형 PDMS 기지에 실시를 보여주는. 모 깎기 애벌레에 열렸다는 PDMS의 minutien 핀을 사용 하 여 젤. (B-C) 유 충 PDMS 준비 슈나이더의 곤충 매체를 포함 하는 유리 바닥 문화 접시 안에 배치 했다. 약간 비스듬한 조명 구성에 TIRF 현미경 모터 신경 맨끝에서 Syntaxin-1A-mEos2를 시각화 하기 위해 사용 되었다. (D F) 해 부 초파리 애벌레는 반 원통형 PDMS 기지. 유 충은 팜 슈퍼 해상도 현미경에 몇 군데와 애벌레 PDMS 준비 슈나이더의 중간, 가득 이미징 접시에 배치 되었다. 스케일 바, 10 m m. (이 그림 수정 되었습니다14에서). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

그림 3 : Vivo에서 Syntaxin-1A-mEos2 연 접 모터 신경 터미널에서 추적. (A) A 저해상도 TIRF의 이미지 Syntaxin-1A-mEos2 형식 1b 모터 신경 맨끝에. Photoconversion 영화 분석 33 Hz 생성 된 sptPALM 초 해결, 확산 계수, 강도와 궤적에서 지도 몇 군데. 5,309 개별 궤적 군데 이상의 16000 프레임 영화 수집 했다. 스케일 바, 3 μ m입니다. (B-C) Syntaxin-1A-mEos2의 제곱 변위 (MSD) 6 다른 모터 신경 맨끝;에서 플롯은 MSD 곡선 (AUC) 지역 이동성의 수준을 계량에 사용 되었다. 확산 계수 분포 보여;의 비율으로 양이 정해질 수 있는 모바일 및 부동 Syntaxin-1A 인구 모터 신경 터미널 당 ~ 2400 궤도의 평균 가져온 (n = 3 애벌레). 데이터의 평균 표준 오차로. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
저자는 공개 없다.
여기에 우리가 설명 단일 분자 사진 활성화 지역화 현미경 라이브 초파리 melanogaster 의 모터 신경 맨끝에 실시 될 수 있습니다 하는 방법 3 유 충 탈피.
우리가 단일 분자 분석 종류 그들의 지원을 위해 장 바티스트 Sibarita와 다니엘 Choquet (IINS, CNRS/보르도의 대학) 감사합니다. 우리는 특히 닉 Valmas 감사와 비디오와 그들의 도움에 대 한 제시카 Mcgaw (QBI, 퀸즐랜드의 대학) 녹음, 음성으로 그래픽 디자인을 그림. 이 작품은 호주 연구 협의회 (AR) 검색 프로젝트에 의해 지원 되었다 (F.A.M. DP170100125), 호주 연구 협의회 (F.A.M. LIEF 그랜트 LE0882864), 미래 친교 (FT100100725 B.V.S.), 호주 연구 협의회 (LIEF 부여 F.A.M에 LE130100078입니다.) 그리고 NHMRC 프로젝트 부여 (B.V.S.에 APP1103923). F.A.M. NHMRC 수석 연구원 (ONT1060075)입니다.
| PDMS (Sylgard 184 실리콘 엘라스토머 키트) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
| 유리 바닥 배양 접시 | In Vitro Scientific | D29-20-1.5-N | |
| 광학 실체 현미경 | Olympus | SZ51 | |
| 곡선 핀셋 (스타일 5/45) | 전자 현미경 과학 | 0208-5AC-PO | |
| Minutien 핀 (0.1mm) | Fine Science Tools | 26002-10 | |
| Schneider's Insect Medium | Sigma, Life Sciences | S0146 | |
| Vannas Spring Scissors | Fine Science Tools | 15000-00 | |
| Fine Forceps (Dumont #5) | Fine Science Tools | 11254-20 | |
| ELYRA PS.1 Microscope | Zeiss | PS.1 | |
| Phosphate Buffered Saline (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
| 파라포름알데히드(16%) | 전자 현미경 과학 | 15710 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
| 일반 염소 혈청 | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Maxyclear 스냅잠금 마이크로 원심분리기 튜브(1.7mL) | Axygen | MCT-175-C | |
| Zen Black 수집 소프트웨어 | Carl Zeiss, 2012 | ||
| Metamorph 소프트웨어 | Molecular Devices | 7.7.8 | PALM Tracer 플러그인 |
| 플라이 스트레인 | w1118; HA-SX1A-메오스2 |