방법 논문

매트릭스 보조 레이저 탈 착/이온화 질량 분석에서 탄수화물 이온 신호를 강화 하는 효율적인 샘플 준비 방법

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DOI:

10.3791/57660

2018년 7월 29일

이 논문에서

요약

샘플 준비 과정 동안 개혁 결정 구조에 의해 MALDI 질량 분석에서 탄수화물 이온 신호를 향상을 위한 프로토콜은 설명 했다.

초록

샘플 준비는 탄수화물의 질량 분석 (MS) 분석에 중요 한 과정 이다. 매트릭스 보조 레이저 탈 착 또는 이온화 (MALDI) MS 선택 탄수화물 분석에서의 방법 이지만, 가난한 이온 신호 및 데이터 재현성 탄수화물 샘플의 심각한 문제가 계속. 탄수화물의 정량 분석을 위해 뛰어난 데이터 품질을 제공 하는 효과적인 분석 프로토콜은 필요 합니다. 이 비디오 신호 강도 향상 하 여 MALDI MS에서 탄수화물의 데이터 변화를 최소화 샘플 준비 프로토콜을 보여 줍니다. 건조와 샘플 방울의 결정 화, 후 크리스탈 형태학 대량 spectrometric 분석 전에 메탄올에 의해 개혁 이다. 탄수화물 신호에 향상은 MALDI 이미징 질량 분석 (IMS)으로 시험 된다. 실험 결과 크리스탈 개혁 결정 구조를 조정 하 고 재분배 탄수화물 analytes 보여 줍니다. 기존의 MALDI-MS, 메탄올 보여줍니다 훨씬 더 나은 신호 강도, 이온 이미지 배포 및 데이터 안정성과 개혁 탄수화물 크리스탈 형태학의 말린된 방울 준비 방법 비교 때문에 여기에서 설명 하는 프로토콜 샘플 구성에 변화를 포함 하지 않는, 그들은 일반적으로 다양 한 탄수화물과 행렬에 적용 됩니다.

서론

탄수화물 분석 한 중요 하 고 어려운 주제 이다입니다. 탄수화물과 그들의 유도체 재생 중요 한 역할 살고 있는 생물1,2,3. 이러한 분자 구조를 복잡 하 고 분해 하는 경향이 있다. 그들의 많은 명확 하 게 분리와 검출 때문 특징 될 수 없습니다. 매트릭스 보조 레이저 탈 착 또는 이온화 (MALDI) 질량 분석 (MS)의 다양 한 감도 및 이해할 수 있는 결과4, 생체 분석에 적용 된 있지만 계속 탄수화물 MALDI MS를 사용 하 여 분석 이러한 분자5의 낮은 이온화 효율 인해 주요 도전 하. 화학 derivatization 탄수화물6,7, 이온화 효율을 개선 하는 일반적인 방법 이지만 이러한 절차는 시간 및 샘플 사용. 게다가, derivatized 탄수화물의 이온화 효율의 단백질 보다 여전히 낮습니다. 따라서, 복잡 한 절차 없이 MALDI MS에서 탄수화물 신호를 개선 하는 방법의 개발이 필요 하다.

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프로토콜

1. 샘플 접시 늘어진

  1. 샘플 접시의 청소
    1. 청소 하는 동안 샘플 플레이트의 오염을 피하기 위하여 니트 릴 장갑을 착용 한다.
    2. 손 세척 세제 솔루션 (1.0 mg/mL)의 100.0 mL과 샘플 접시.
    3. 손-세척-이온 증 류 물 (DDW) 샘플 접시.
    4. 씻어 MeOH의 30.0 mL과 샘플 접시 표면.
    5. 샘플 접시는 완전히 물에 잠기 다 때까지 600 mL 비이 커에 채우기 DDW와 샘플 접시를 넣어.
    6. 비 커는 초음파에 넣어 ( 테이블의 자료를 참조) 목욕 하 고 15 분 (200 W, 40 kHz)의 샘플 접시를 sonicate.
    7. 샘플 접시를 꺼내와 물 방울 가압된 질소를 사용 하 여 날 려 버릴.
    8. 0.2 µ L MeOH의 MeOH 다른 장소에 확산 여부를 확인 하려면 샘플 접시에 입금.
      참고: 만약 다른 명소 MeOH 병합, 반복 단계 1.1.3-1.1.5; 그렇지 않은 경우에 다음 단계를 수행 하십시오.
  2. 챔버 온도 건조의 규제....

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결과

SLeA 의 대표적인 SEM 이미지 DHB DD를 사용 하 여 준비와 혼합 하 고 recrystallization 메서드는 그림 1에 나와 있습니다. 전형적인 DHB 형태학 DD 메서드가 준비 테두리 샘플 관광 명소의 중심에 미세 결정 구조에서 큰 바늘 모양의 결정 이다. 이러한 바늘 모양 결정의 일반적인 길이 ~ 100 µ m. MeOH에 의해 recrystallization, 후 샘플 더 큰 지역 정밀한 조각 모양의 결정으로 균일 하 게 덮여 있다. "찌 질" 결정의 길이 대략 20-50 µ m. Recrystallized 견본 기존의 DD 샘플에 의해 생성 한 그들 보다 더 큰 효과적인 표면 영역을 제공.

IMS 결과 조각 모양의 결정 일반적으로 더 높은 탄수화물 신호 강도와 더 균질 .......

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토론

샘플이 MALDI 양 DD에서 중요 한 문제는 가장 일반적으로 사용 되는 샘플 준비 방법, 결과 결정은 매우 이질적인 것 이다. 이러한 샘플 가난한 쏜 총에 및 샘플 샘플 신호 재현성을 보여줍니다. 따라서, 데이터 수집 하는 동안 "달콤한 명소" 샘플 영역에 대 한 검색 MALDI 실험에서 일반적인 절차 이다. 이러한 다른 유형의 샘플 루틴 분석에 정량화를 위한 적합 하지 않습니다.

현재 연구에서 MALDI 샘플 형태학은 recrystallization에 의해 최적화 됩니다. 탄수화물 신호 강도 및 recrystallization 데이터 안정성 개선 탄수화물과 행렬 사이의 향상 된 합동에 기인 된다. 대부분 탄수화물과 행렬의 친수성 특성 때문에 MeOH MALDI 결정과 탄수화물 분해 효율적으로 수 있습니다. 관찰 증 착 및 MeOH의 빠른 증발 작은 조각 모양의 결정 구조에 대형 바늘 모양의 DHB 크리스탈 개혁 보여줍니다. 이 프로세스는 또한 샘플 분리를 최소화 하 고 표면 .......

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공개 사항

저자는 공개 없다.

감사의 글

저자 아무 승인 있다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
시약
세제 분말, Alconox242985
메탄올머크, 106009
아세토니트릴머크100003,
2,5-디하이드록시벤조산(DHB)알파, AesarA11459
시알릴-루이스 A(SLeA)Sigma-AldrichS1782
MaltoheptaoseSigma-AldrichM7753
피펫 팁Mettler Toledo17005091
미세 원심분리기 튜브AxygenMCT-150-C
Equipment
Milli-Q 정수 시스템MilliporeZMQS6VFT1
파우더 프리 니트릴 장갑MicroflexSU-690
600 mL 비커Duran2110648
초음파 세척기DeltaDC300H
습도계Wisewind5330
질소 가스 유량계DwyerRMA-6-SSV
K 형 열전대Digitron311-1670
소용돌이 믹서과학 산업  SI-0236
미니 원심분리기Select BioProductsForce Mini 
피펫Rainin피펫 라이트 XLS
실체현미경OlympusSZX16
온도 제어 가능 건조 챔버이 실험실
Ultraflex II TOF/TOF 질량분석기Bruker Daltonics
MTP 384 타겟 플레이트, 광택 스틸, BCBruker Daltonics8280781
Flexcontrol 버전 3.4Bruker Daltonics제어 소프트웨어
Fleximaging 버전 2.1Bruker Daltonics이미징 소프트웨어
Flexanalysis 버전 3.4Bruker Daltonics분석 소프트웨어
, :

참고문헌

  1. Holme, D. J., Peck, H. Analytical Biochemistry. , 3rd edn, Addison Wesley Longman Limited. (1998).
  2. Costello, C. E. Time, life ... and mass spectrometry - New techniques to address biological questions. Biophysical Chemistry. 68 (1-3), 173-188 (1997).
  3. Caroff, M., Karibian, D.

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재인쇄 및 허가

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