방법 논문

식물에 동결의 3 차원 적외선 비디오를 제작 하기 위한 프로토콜

DOI:

10.3791/58025

2018년 9월 12일

이 논문에서

요약

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여기, 우리는 3 차원에서 냉동 딸기 식물 이미지를 프로토콜 제시. 약간 다른 각도에서 위치 하는 두 개의 적외선 카메라는 3 차원에서 식물의 관찰 하는 빨간색-파란색 anaglyph 비디오를 생산 하는 데 사용 됩니다.

초록

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식물에 동결 모니터링할 수 있습니다 적외선 (IR) thermography를 사용 하 여 때 물 얼음 장, 그것은 열을 제공 하기 때문에. 그러나, 색상 대비 문제 만들 2 차원 (2D) 적외선 이미지 다소 해석 하기 어려운. IR 이미지 또는 비디오 3 차원 (3D)에 고정 하는 식물의 보기 얼음 nucleation에 대 한 사이트의 더 정확한 식별 뿐만 아니라 동결의 진행 하게된다. 이 종이, 냉동 딸기 식물의 3D 적외선 비디오를 생성 하기 비교적 간단한 방법을 보여 줍니다. 딸기는 예기치 않은 봄을 복종 되는 경제적으로 중요 한 작물은 세계의 많은 지역에서 이벤트를 동결입니다. 딸기에 어의 정확한 이해 사육 및 재배 조건 동결 동안 식물에 손해를 방지 하기 위해 더 경제적인 방법으로 제공 합니다.

기술은 냉동 딸기를 필름에 약간 다른 각도에서 두 개의 적외선 카메라의 위치를 포함 한다. 두 개의 비디오 스트림은 동시에 모두 카메라를 기록 하는 화면 캡처 소프트웨어를 사용 하 여 정확 하 게 동기화 됩니다. 녹음은 다음으로 가져올 수 이미징 소프트웨어 고 anaglyph 기술을 사용 하 여 처리. 빨강 파랑 안경을 사용 하 여, 3D 비디오 것입니다 쉽게 그것은 잎 표면에 얼음 nucleation의 정확한 위치를 확인 하려면.

서론

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3 물리적 차원의 세계에 살고 있는에 불구 하 고 연구원 차원에서 시각적 관찰을 보고 제한 많습니다. 2D 이미지는 일반적으로 충분 한 중요 한 정보를 전달, 깊이 대 한 정보의이 부족 인식 하 고 실제 개체의 복잡성을 이해 하는 우리의 능력을 제한 합니다. 1

깊이 대 한 정보에서이 결핍1초기 1900 년대 상업 영화 산업에서 주로 3D 동영상을 생산 하는 인센티브 제공. 그러나, 분명 3D 정보를 생성 하는 스틸 이미지와 비디오에 그 이미지를 생산에 관련 된 복잡 한에 의해 방해 있다. 3D 영화를 생성 하는 간단한 방법은 입체 사진에 사용 하는 원칙을 기반으로 합니다. 입체 사진 3D 이미지는 두뇌에 약간 다른 각도에서 동일한 개체의 두 이미지를 사용 합니다. 이 가능 하 게를 각 눈의 각 이미지 (, 왼쪽된 이미지에서 왼쪽된 눈 및 오른쪽 이미지에서 오른쪽 눈)에 찾아야 합니다. 때문에 눈은 자연스럽 게 이렇게 하지, 입체 헤드 기어가 가능한1수 있도록 설계 되었습니다. 여러 입체 3D 영화, 레드와 그린 (또는 녹청)를 사용 하 여 색상 인터레이스 또는 anaglyph 방법만 개발 하는 동안 사용도 편광 인터레이스, 시간 다중화 기술과 헤드 마운트 디스플레이, 보기 안경은 간단 하 고 가장 비싼 방법 중 하나입니다. 3D 영상과 관련 된 다양 한 기술의 종합적인 검토에 대 한 Geng1리뷰를 참조.

원칙에 따라 적외선 thermography를 사용 하 여 식물에 동결 모니터링 때 물 얼음 장, 그것은 내부 에너지2를 포기 해야 합니다. 이 에너지는 열, 전자기 스펙트럼의 적외선 영역에서 감지 되는 형태로 것입니다. 카메라 IR 에너지를 기록할 수 19293부터 사용에서 되었습니다. Cecardi 그 외 여러분 에서 IR 필름 공장에서 냉동 기술을 사용 하 여 첫 번째 게시 된 보고서는 2, 하지만 사용 하는 카메라의 해상도 조직을 동결 시작 되는 위치를 정확 하 게 결정 하기 어려운 있습니다. Wisniewski 외. 4 더 높은 해상도 카메라를 사용 하 여 여러 식물 종에서 얼음 nucleation의 더 정확한 사이트를 결정 합니다. 적외선 온도 기록 향상에 사용 된 기술로, 더 높은 해상도 이미지5 와 얼음 형성6의 정확한 세포질 지역화 동결 장벽 같은 발견 이끌어 냈다.

IR에서 과목을 촬영 한 어려움은 온도 있는 작은 차이 의해 발생 합니다. 이 어려운 정확 하 게 어떤 객체는 /는 동결을 결정 하 고 비슷한 색상을 시야에서 대부분의 개체를 발생 합니다. 잎 또는 밀6뿌리와 같은 특정 조직에 동결의 순서를 결정할 때 중요 한 수 있습니다. 식물 동결의 IR 비디오 3d에서 이미지 수, 식물의 어느 부분에에서 특정 시점에서 동결 결정의 정확도 향상 시킬 수 있습니다.

딸기 재배 자에 대 한 상당한 관심사의 동결 온도 미국의 특정 분야에 작물 이다. 일부 성장 조건 하에서 2-3 주 지난 봄 평균 전에 동결 표시 딸기 꽃에 대 한 일반적입니다. 동결 이벤트는 꽃의 죽음에 애팔래치아 산맥7 그리고 일반적으로 결과의 일부 지역에서 6 월 처럼 늦게 발생할 수 있습니다. 따라서, 서 리 보호는 중요 한 딸기 재배 자가에 따라 지역에 동결 이벤트. 예를 들어, 노스 캐롤라이나, 딸기 재배 서 리-를 보호 해야 합니다, 평균, 4-6 서 리 이벤트 전에 꽃과 1-2 초 동안 하드 동결 개화 기간8사이. 더 관용 냉동 딸기 genotypes을 개발 하기 위해, 그것은 얼어 얼음 nucleation 및 식물의 다른 부분으로 전파의 사이트 등의 다양 한 측면을 이해 하는 것이 중요. 적외선 온도 기록 이러한 문제를 해결 하는 효과적인 수단을 제공 합니다.

여기, 우리는 anaglyph 메서드를 사용 하 여 3D에 동결 이벤트를 기록 하기 위한 기법을 설명 하기 위해 딸기를 사용 합니다. 딸기는 나뭇잎과 꽃 3D 공간에 널리 배포 하 고 2D 적외선 비디오에서 볼 때 차별화 하는 데 어려울 수 있습니다 때문에이 예제에 대 한 적합 합니다.

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프로토콜

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1입니다. 준비

  1. 장비, 재료, 및 냉동 플랜트의 비디오 기록 하는 소프트웨어를 수집 합니다.
    1. 프로그래밍 가능한 냉장고에 , 전원 스위치를 설정 하 여 시작 하 고 0 ° c 온도 설정 프로그램-8 ° C에서 1 ° C/h에 도달 하는 냉장고.
  2. 장소 한 6 주 오래 된 딸기 식물 2-5 꽃 1 L 용기에 냉동 실에 성장 했다.
  3. 2 적외선 카메라 (예를 들어, FLIR T620 카메라) 설정 죔 띠와 나무의 작은 블록을 사용 하 여 렌즈의 올바른 수렴 각도 생산.
    참고: 최적의 거리 2 카메라의 렌즈의 중심 공간 눈1 또는 약 7 cm 사이의 거리와 동일 하 일반적으로 여겨진다.
  4. 10 x 10 cm 실험실 잭과 잭 냉동 실에 초점을 이미지 허용 하도록 공장에 충분히 가까이 위치에 둘 다 카메라를 탑재 합니다. 카메라를 세로 및 가로로 조정 식물의 동일한 부분은 모두 카메라에서 볼 수 있도록. 잭 2 이미지 전체 공장 및 토양의 일부를 포함 하는 방식에 수직으로 둘 다 카메라를 사용 합니다.
  5. 2 카메라를 USB 콘센트 USB 커넥터를 사용 하 여 컴퓨터에 연결 합니다.
  6. 2 a/C 콘센트를 식물의 지속적인 모니터링을 허용 하도록 두 카메라에 꽂습니다.

2. 컴퓨터와 기록에 대 한 소프트웨어 설치

  1. 2 윈도우 (1 창 각 카메라에 대 한) 소프트웨어의 IR 카메라 소프트웨어 2에 대 한 아이콘을 두 번 클릭 하 여 열고 x. 왼쪽된 창에서 왼쪽된 카메라와 오른쪽 창에서 바로 카메라를 연결할 도움말 메뉴의 지침을 따릅니다.
    참고: 소프트웨어를 사용 하 여 자세한 도움말 메뉴를 통해 액세스할 수 있습니다. 단색 팔레트 빨강-파랑 색조 3D 렌더링에 대 한 사용의 필요성 때문에이 예제에 대 한 가장 적합 하다.
  2. 프로그램에 대 한 아이콘을 두 번 클릭 하 여 화면 캡처 소프트웨어를 엽니다. 캡처 프레임을 클릭 하 고 그래서 그것은 포함 하는 동시에 둘 다 카메라의 화면 캡처 수 있도록 카메라 프레임을 드래그 하 여 조정 합니다.
    참고: 동시에 두 카메라 로부터 비디오 스트림을 캡처 화면 왼쪽 및 오른쪽 플레이의 완벽 한 동기화를 허용 하기 때문에 결정적 이다.
  3. 비디오 프로세싱 소프트웨어에 쉽게 처리에 대 한 3-h 단위로 비디오를 기록 합니다.
    참고: 그것은 불가능 알고 정확 하 게 식물 동결 것 이다, 그래서 몇 시간 전에 동결 이벤트 기록 하는 것이 중요 하다. 옵션을 세그먼트에 기록이 소프트웨어의 기능 이므로이 3 h에 대 한 기록으로 설정 하는 것이 좋습니다. 소프트웨어 자동으로 3 h 녹음을 저장 하 고 새 녹음을 시작. 각 3-h 녹음 파일 자동으로 받게 됩니다 숫자 시퀀스 이름 뒤. 각 비디오 파일 될 것입니다 10 ~ 20 기가바이트, 그래서 충분 한 공간 사용할 수 있도록이 크기의 여러 파일에 대 한 하드 드라이브에.
  4. 컨트롤러 메뉴에서 실행 을 선택 하 여 냉동 프로그램을 시작 하 고 화면 캡처를 시작 합니다. 다음 창에서 Rec 버튼을 누릅니다. 확인 화면 캡처 중인 영역을 보여주는 개요 빨간색으로 바뀝니다.
  5. -8 ° c 냉동 딸기 식물을 기록 하 고 1 시간에 대 한 냉동 고의 온도 개최.
  6. 냉장고 + 2 ° c.에 될 때까지 2 ° C/h에서 냉장고의 온도 높이 녹음을 중지 합니다.
    참고: 동결 시간 총 14 h는.
  7. .Mp4 형식에서.mov 파일 변환 소프트웨어를 사용 하 여 관심의 파일을 변환 합니다.
    참고:이 경우에, 1 이상의 동결 이벤트를 포함 하는 단일 3 h 파일 사용 됩니다.

3. 비디오 이미징 소프트웨어를 사용 하 여 비디오를 처리

참고: 비디오 이미징 소프트웨어는이 예제에서 사용 됩니다. 소프트웨어를 사용 하는 방법에 대 한 자습서를 온라인에서 사용할 수 있습니다. 이 예제에서는 소프트웨어의 기본적인 지식을 가정 합니다. "구성", "레이어", 및 "렌더링 대기열", 뿐만 아니라 다양 한 패널 및 그들을 조작 하는 방법 등의 용어에 대 한 이해로 간주 됩니다.

  1. 이미징 소프트웨어에 관심의.mov 파일을 가져오고 파일 [프로젝트] 패널의 아래쪽에 있는 구성 아이콘을 드래그 하려면 [프로젝트] 패널 안에 아무 곳 이나 두 번 클릭. 다음 원래 동영상을 포함 하는 동일한 폴더에 프로젝트를 저장 합니다.
    참고: 기록 하는 비디오 미리 보기 창에 표시 됩니다.
  2. 미리 보기 창 아래 관심 영역 아이콘을 클릭 하 고 커서를 사용 하 여 개요만 왼쪽된 카메라에서 녹화.
  3. 구성 아이콘을 만들 동일한 비디오의 두 번째 구성 같은.mov 비디오를 끕니다. 반복 단계 3.3, 하지만이 시간, 바로 카메라를 선택 하려면 커서를 사용.
  4. 구성 선택 > 왼쪽된 볼에 대 한 관심의 영역을 자르기 Comp . 오른쪽 보기 위해 이것을 반복 합니다. 왼쪽과 오른쪽을 나타내는 각 구성을 이름을 바꿉니다.
  5. 왼쪽된 구성 구성 을 선택 하면 상단에 주 메뉴에, 그리고 그것에 클릭 하 여 강조 > 렌더링 대기열에 추가.
  6. 렌더링 대기열에서 출력 모듈 에 클릭 하 고 비디오 (예를 들어, QuickTime 비디오) 비디오로 렌더링 될 것 이다 있는지 확인 합니다. 빠른 렌더링을 허용 하려면 해상도 줄이기 위해 렌더링 설정 을 클릭 합니다. 출력을, 이름 비디오 딸기 왼쪽에 클릭 하 고 원래 기록과 프로젝트와 같은 폴더에 저장. 저장을 클릭 한 다음 렌더링 패널의 오른쪽 상단에 버튼을 렌더링 을 클릭 합니다.
  7. 딸기 오른쪽 구성에 대 한 3.6 단계를 반복 합니다.
  8. [프로젝트] 패널을 두 번 클릭 하 고 그냥 렌더링 했다 딸기 왼쪽과 오른쪽 딸기 동영상을 가져옵니다.
  9. 동영상을 둘 다 선택 하 고 [프로젝트] 패널의 아래쪽에 있는 구성 아이콘 들을 드래그 하십시오. 여전히 기간을 요구 하는 팝업 화면에서 3 h 동안 5 0 3을 입력 합니다.
    참고: 정확 하 게 동기화, 두 동영상 [프로젝트] 패널에 있을 것입니다 하지만 [컴포지션] 패널에서 맨 위에 있는 영상만 표시 됩니다.
  10. 다른 이미지를 보려면 레이어를 해제 하는 작은 안구 에 클릭 합니다. 커서를 사용 하 여 미리 보기 패널에는 이미지의 회전 제어를 허용 하도록 제어/W 를 누릅니다. 커서를 사용 하 고 상위 레이어 클릭, 상단 또는 동일한 회전 평면에서 두 이미지는 되도록 하단 보기의 회전 부분을 조정 합니다. 다음에 X-및 Y-평면 3D 안경 서브루틴 내에서 직접 조정 합니다.
  11. [컴포지션] 패널의 최상위 레이어를 강조 표시 하 고 효과 선택 > 시각 > 상단에 있는 메뉴에서 3 차원 안경 .
    참고: 3D에 대 한 매개 변수 안경 효과 나타납니다 컨트롤 패널 내부.
  12. [컨트롤] 패널에서 "왼쪽된 보기"의 오른쪽에 있는 상자를 클릭-제어판 [프로젝트] 패널에서 분리 되지 않는다, [프로젝트] 패널의 상단에 컨트롤 패널 탭을 클릭 합니다. 드롭 다운 메뉴에서 [컴포지션] 패널에서 2 동영상 목록, "왼쪽된 보기"에 대 한 목록에 video. "오른쪽 보기"에 대 한이 단계를 반복 합니다.
  13. 3D 보기의 오른쪽에 있는 상자에서 빨강 파랑 LR을 선택 합니다.
  14. 빨강 파랑 안경을 사용 하 여, [프로젝트] 패널에서 보기를 검사 합니다. 3D 보기 정확 하 게 보인다, 스왑 왼쪽-오른쪽을 클릭 해 보십시오. 어떤 고스팅 및 눈 긴장을 제거 현장 융합세로 맞춤 조정 합니다.
  15. 비디오의 3D 측면 허용 하는 때, 그것을 클릭 하 여 구성 강조 표시 하 고 구성 선택 > 렌더링 대기열에 추가 단계 3.7에서에서 완료 했다. 프로젝트의 다른 파일 같은 폴더에 비디오를 렌더링 합니다.
    참고:이 파일을 보다 큰 있을 것입니다. 일단 파일 렌더링 된 비디오 프로세싱 소프트웨어를 사용 하 여 작은 파일 크기로 다시 렌더링 수 있습니다.

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결과

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놀랍게도, (보충 비디오 1) 냉동 딸기 식물의 IR 비디오 표시 모든 잎/꽃 같은 시간에 얼어. 나뭇잎과 꽃 개별적으로 서로 다른 온도에서 얼어 붙 었지만 잎 동결 이전 꽃 보다 그리고 더 높은 온도에. 또한, 동결 나뭇잎에 하지만 반드시 각 잎에 있는 동일한 위치에서 시작 했다. 이러한 결과 딸기에 이전 설명 하지, 하는 동안 비슷한 결과 다른 식물 종6에서 발견 되었습니다. 일단 잎, 냉동 얼음 식물의 왕관에 잎 자루 아래 진행. 때 냉장고 온도 1 또는 2도 추운, 꽃 동결 시작 하는 꽃 받침 및 꽃잎과 소켓 (그림 1)에 신속 하 게 확산 되었다. 소켓 대부분 다른 공장 부품, 물 동결의 큰 금액을 제안 보다 더 밝은 색상 (따뜻한)에 남아 있었다.

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토론

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두 개의 적외선 카메라는이 프로토콜에 대 한 필요 그리고 그들은 약간 다른 각도1주제 겨냥 한다. 이 떨어져, 5-8 cm에서 렌즈 필요 하지만 둘 다 촬영 주제에 같은 장소에서 목적으로 해야 합니다. 시청자의 눈에 대 한 대리의 일종으로 2 카메라 렌즈의 생각. 왼쪽된 카메라는 왼쪽된 눈과 오른쪽 눈에 바로 카메라를 유사 합니다. 그래서 빨강 파랑 안경을 쓰고, 왼쪽된 눈만 볼 수 왼쪽된 이미지와 오른쪽 눈만 오른쪽 이미지 후 처리 소프트웨어 왼쪽된 이미지를 붉은 색과 파란색, 오른쪽 이미지 색조 것입니다. 즉, 고정 이벤트를 기록할 때 IR 카메라 소프트웨어의 회색조 색상표를 사용 하는 것이 중요. 두뇌 2 이미지 뷰어 3D1관찰 됩니다 결합 됩니다.

이 프로토콜에 또 다른 중요 한 단계를 동시에 둘 다 카메라의 출력을 캡처 화면 캡처 소프트웨어의 사용 이다. 두 카메라의 출력을 동시에 포착...

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공개 사항

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저자는 공개 없다.

감사의 글

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이 작품은 농 무부 자체 자금에 의해 지원 되었다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
T620 적외선 카메라 및 소프트웨어FLIR55903-51222 카메라가 필요합니다. 소프트웨어는 Windows 기반 컴퓨터에서만 작동합니다.
After EffectsAdobe15.0.1.73후반 제작 비디오 편집 소프트웨어
BandicamBandisoft4.1.2.1385화면 캡처 소프트웨어
실험실 가위 잭   EiscoCH0642A스틸 플랫폼 13X15 cm
고정 스트랩벨크로90441카메라를 잭에 고정합니다. 최소 길이 60cm x 너비 2cm여야 합니다
미디어 컨버터iSkysoft10.0.6mp4 파일을 .mov로 변환하는 소프트웨어입니다.
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참고문헌

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  1. Geng, J. Three-dimensional display technologies. Advances in Optics and Photonics. 5, 456-535 (2013).
  2. Ceccardi, T. L., Heath, R. L., Ting, I. P. Low-temperature exotherm measurement using infrared thermography. HortScience. 30, 140-142 (1995).
  3. Wimmer, B. History of thermal imaging, Security Sales and Integration. , Framingham, MA, USA. (2011).
  4. Wisniewski, M., Lindow, S. E., Ashworth, E. Observations of ice nucleation and propagation in plants using infrared video thermography. Plant Physiology. 113, 327-334 (1997).
  5. Kuprian, E., Tuong, T., Pfaller, K., Livingston, D. P., Neuner, G. Persistent supercooling of reproductive shoots is enabled by structural ice barriers being active despite an intact xylem connection. Public Library of Science ONE. 11, e0163160(2016).
  6. Livingston, D. P. III, Tuong, T. D., Murphy, J. P., Gusta, L., Wisniewski, M. E. High-definition infrared thermography of ice nucleation and propagation in wheat under natural frost conditions and controlled freezing. Planta. 247, 791-806 (2017).
  7. Boyles, R. P., Raman, S. Analysis of climate patterns and trends in North Carolina (1949-1998). Environment International. 29 (2-3), 263-275 (2003).
  8. Poling, E. B. Managing Cold Events. A Growers' Guide to Production, Economics and Marketing. Poling, E. B. , NC Strawberry Association. Siler City. 75-97 (2015).
  9. Hacker, J., Neuner, G. Ice porpagaion in plants visualized at the tissue level by infrared differential thermal analysis (IDTA). Tree Physiology. 27, 1661-1670 (2007).
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재인쇄 및 허가

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