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방법 논문

마이크로위성 DNA 게노티핑 및 유동 세포분석분석분석포르민고정파라핀내장화증모금조직

8.6K 조회수

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DOI:

10.3791/60366

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2019년 10월 20일

 ,  ,  , 

이 논문에서

요약

수다디형 두더지(Hydatidiform moles)는 어금니 게놈에 대한 부모의 기여와 형태학적 특징에 따라 분류될 수 있는 이기종 빈치학을 가진 비정상적인 인간 임신입니다. 여기서, 멀티플렉스 마이크로위성 DNA 의전성 및 포르말린 파라핀 내장 어금니 조직의 유동 세포분석프로토콜은 결과의 해석 및 통합과 함께 상세히 기술된다.

초록

수다디폼 두더지(HM)는 과도한 트로포블라아제 증식과 비정상적인 배아 발달을 특징으로 하는 비정상적인 인간 임신입니다. 현미경 형태 학적 평가, 완전한 HM (CHM) 및 부분 HM (PHM)에 따라 HM의 두 가지 유형이 있습니다. 이들은 어금니 게놈에 대한 부모의 기여에 기초하여 더 세분화될 수 있습니다. 형태학 및 유전자형 분석에 의한 HM의 이러한 특성화는 환자 관리및 이 흥미로운 병리학의 근본적인 이해에 매우 중요합니다. HM의 형태학적 분석은 광범위한 관찰자 간 가변성의 영향을 받으며 HM을 CHM 및 PHM으로 정확하게 분류하고 수경 비 어금니 낙태와 구별하기에 충분하지 않다는 것이 잘 문서화되어 있습니다. Genotyping 분석은 주로 포르말린 고정 파라핀 임베디드 (FFPE) 개념작용의 제품에서 DNA 와 조직에 수행되며, 이는 최적의 품질보다 적고 결과적으로 잘못된 결론으로 이어질 수 있습니다. 이 문서에서는, FFPE 어금니 조직의 다중 지질 분석 및 유동 세포 분석 분석을 위한 상세한 프로토콜은, 이 방법의 결과의 해석과 더불어, 그들의 문제 해결 및 형태학적 평가와의 통합과 더불어 제공됩니다 , p57KIP2 면역성 화학 및 현장 혼성화 (FISH)에서형광은 정확하고 견고한 진단에 도달합니다. 여기에서 저자는 약 400개의 개념 작용 제품을 분석하여 지난 10년 동안 배운 방법과 교훈을 공유합니다.

서론

수다디폼 두더지(HM)는 비정상적인 배아 발달, 트로포블라스트의 과증식, 융모융물(CV)의 수경 변성을 특징으로 하는 비정상적인 인간 임신입니다. 역사적으로, HM은 형태학적 평가1에기초하여 완전한 HM(CHM) 및 부분 HM(PHM)의 두 가지 유형으로 나뉘었다. 그러나, 형태학적 평가만으로는 HM을 두 개의 아류형(CHM 및 PHM)으로 분류하고 이를 비어치 유산2,3,4와구별하기에 충분하지 않은 것으로 나타났다.

CHM과 PHM은 악성 종양에 다른 성향을 가지고 있기 때문에, 환자에게 적절한 후속 및 관리를 제공하기 위해 HM의 유전자 형 유형을 정확하게 결정하는 것이 중요합니다. 따라서 지난 수십 년 동안 어금니 조직에 대한 부모의 기여를 확인하고 HM의 올바른 분류에 도달하기 위해 여러 가지 방법론이 개발되고 발전했습니다. 여기에는 핵형 분석, 염색체 밴딩 다형성, 인간 백혈구 항원 (HLA) 혈청학적 입력, 제한 단편 길이 다형성, 가변 수의 탠덤 반복, 마이크로 위성 유전자 변형, 유세포 분석 및 p57이 포함됩니....

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프로토콜

이 연구 는 McGill 기관 검토 위원회에 의해 승인 되었다. 모든 환자는 연구 결과에 참여하고 다양한 병리학 부에서 검색 된 개념작용 (POC)의 FFPE 제품을 가지고 서면 동의를 제공했습니다.

참고: 유세포 분석에 의한 지질형 분석 및 계략 측정을 위한 몇 가지 방법이 있지만, 여기에 제공된 프로토콜은 각각에 대해 하나의 플랫폼을 사용하여 하나의 분석 방법을 설명합니다.

1. 게놈

  1. 최고의 FFPE 블록 선택
    1. 개념작용의 각 FFPE 제품 (POC)를 위해, 현미경 검사법에 의하여 형태학적 평가를 위해 섹션 1.2 및 1.3에 기술된 대로 4 μm 두께의 헤마톡실린 및 에오신 (H&E) 염색 된 단면을 준비하십시오.
    2. H&E 슬라이드와 가벼운 현미경을 사용하여 가장 많은 양의 융모 융모(CV)를 가진 FFPE 블록을 선택하고, 가능하다면 모계 조직과 섞이지 않고 CV가 분리된 블록을 선택합니다.
  2. 단면화
    1. 선택한 블록을 얼음 위에 15분 동안 놓아 서 단면을 용이하게 합니다.
    2. ....

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결과

어금니 조직의 복잡성과 다양한 유전자형이 있을 수 있다는 사실은 형태학적 평가, p57 면역 조직 화학, 마이크로 위성 유전형 분석, 유세포 분석 및 FISH와 같은 여러 방법의 엄격한 분석 및 사용을 필요로합니다. 예를 들어, 한 환자(1790)는 POCs의 마이크로어레이 분석에 의해서만 삼엽수인 것으로 밝혀진 2개의 PHM을 참조하였다. 환자는 그러므로 재발하는 PHM으로 진단되었습니다. 환자와 그녀의 파트너의 DNA와 함께 그녀의 두 "PHM"의 마이크로 위성 유전자 형질 태핑은 환자의 첫 번째 두더지가 삼엽핍 분산증(그림 9A)동안, 그녀의 두 번째 "PHM"은 삼엽이식 유전자형을 가지고 있음을 밝혔다(그림 9 B)와따라서 PHM이 아니라 비어치 유산이다.

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토론

HM은 이질적인 병인을 가진 이상한 인간 적인 임신이고 그들의 정확한 분류 및 진단을 도전하게 하는 다른 조직학 및 genotypic 모형이 있습니다. 조직 병리학 적 형태 학적 평가는 종종 부정확입증되었고 따라서 HM을 CHM 및 PHM으로 분류하고 비 어금니 유산과 구별하기 위해 자체적으로 신뢰할 수 없습니다. 따라서 HM의 정확한 진단은 멀티플렉스 마이크로위성 DNA 지질분석, 유세포분석에 의한 계략 분석, FISH에 의한 계략 분석, p57KIP2 면역조직화학 과 같은 다른 방법의 사용을 필요로 한다. 이러한 각 방법에는 고유한 제한 사항과 장점이 있습니다.

멀티플렉스 지노티핑 및 유량 세포분석의 한계와 장점

모성 오염은 FFPE 조직으로 일할 때 가장 일반적인 문제 중 하나이며 오진으로 이어질 수 있으므로 POC 조직에서 모계를 분리하는 것이 중요합니다. 그것은 지질 형질.......

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공개 사항

저자는 공개 할 것이 없다.

감사의 글

저자는 원래 의 흐름 세포 분석 프로토콜을 공유 소피 패트리어와 마리안 파레시 감사, 공급 및 시약을 제공하는 프로메가와 Qiagen. 이 작품은 레소 Québécois en 생식및 건강 연구를 위한 캐나다 연구소 (MOP-130364)에 의해 R.S에 지원되었습니다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
BD FACS Canto IIBD BioSciences338960
모세관 전기 영동 기기 : Genomes Applied Biosystems 3730xl DNA 분석기응용 바이오 시스템313001R
(http://www.tcag.ca)
구연산Sigma251275
Cytoseal 60, 조직 병리학 장착 매체Fisher
Eosin Y 원액 (1%)FisherSE23-500D
FCSalyzer - 유세포 분석 소프트웨어SourceForge-https://sourceforge.net/projects/fcsalyzer/
FFPE Qiagen kitQiagen80234
ForcepsFine Science Tools11295-51절편 및 세척 공정용
Glacial 아세트산 (농축)SigmaA6283-500mL
유리 커버 슬립 : 커버 유리Fisher12-541a
HematoxylinFisherCS401-1D
고 탈 이온화 포름 아미드 : Hi-Di 포름 아미드Thermofisher4311320
IHC 플랫폼 : 벤치 마크 UltraRoche-Kimwipes
Ultident30-34120
마이크로톰라이카RM2135
마이크로톰 블레이드Fisher12-634-1C
Nitex 필터링 메시, 48 μ mFilmar74011http://www.filmar.qc.ca/index.php?filet=produits&id=51&lang=en ; 다른 필터도 적합하지만 이것은 비 연구 회사의 저렴하고 효과적인 옵션입니다.
p57 항체Cell Marque457M
파스퇴르 피펫VWR53499-632
PCR 기계Perkin Elmer, Applied BiosystemsGeneAmp PCR System 9700
PeakScanner 1.0유전형 분석을 위한응용 Biosystems4381867
돼지 위 점막의 펩신시그마P7012
폴리스티렌 라운드 바닥 튜브BD 팔콘352058
양전하 슬라이드 : Superfrost Plus 25x75mmFisher1255015
PowerPlex 16 HS SystemPromega CorporationDC2102
Propidium IodideSigmaP4864
소 췌장에서 추출한 리보뉴클레아제 ASigmaR4875
분리 매트릭스: POP-7 폴리머써모피셔4352759
UltraPureAgarose Fisher16500-500
크실렌피셔X3P1GAL
응용 유전체학 센터에서 제공하는 23244257 소프트웨어.

참고문헌

  1. Szulman, A. E., Surti, U. The syndromes of hydatidiform mole. II. Morphologic evolution of the complete and partial mole. American Journal of Obstetrics & Gynecology. 132 (1), 20-27 (1978).
  2. Fukunaga, M., et al.

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