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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 집속 초음파 혈액 뇌 장벽(BBB) 개방, 결과 유전자 발현 평가 및 조직학적 검사를 통한 화학 유전 수용체의 신경 조절 활성 측정을 통해 유전자 전달에 필요한 단계를 설명합니다.
ATAC(Acoustically Targeted Chemogenetics)는 특정 신경 회로의 비침습적 제어를 허용합니다. ATAC는 집속 초음파(FUS) 유도 혈액-뇌 장벽 개방(FUS-BBBO), 아데노 관련 바이러스(AAV) 벡터를 사용한 유전자 전달, 엔지니어링된 화학 유전학, 단백질 수용체 및 동족 리간드를 사용한 세포 신호 활성화의 조합을 통해 이러한 제어를 달성합니다. ATAC를 사용하면 단일 비침습적 초음파 응용 프로그램을 사용하여 밀리미터 단위의 정밀도로 크고 작은 뇌 영역을 모두 transduction할 수 있습니다. 이 형질 도입은 나중에 약물을 사용하여 자유롭게 움직이는 동물에서 장기간의 비 침습적 장치없는 신경 조절을 허용 할 수 있습니다. FUS-BBBO, AAV 및 화학 유전학이 여러 동물에서 사용되었기 때문에 ATAC는 다른 동물 종에서도 사용할 수 있도록 확장 가능해야 합니다. 이 논문은 이전에 발표된 프로토콜을 확장하고 복잡한 MRI 호환 FUS 장치가 필요 없이 MRI 유도를 통해 FUS-BBBO를 사용하여 작은 뇌 영역에 유전자 전달을 최적화하는 방법을 간략하게 설명합니다. 또한 이 프로토콜은 모든 실험실에서 3D 프린팅할 수 있고 다양한 종 또는 맞춤형 장비에 맞게 쉽게 수정할 수 있는 마우스 타겟팅 및 구속 구성 요소의 설계를 설명합니다. 재현성을 돕기 위해 프로토콜은 ATAC 개발에서 미세 기포, AAV 및 정맥 천자가 어떻게 사용되었는지 자세히 설명합니다. 마지막으로 ATAC를 활용한 연구의 예비 조사를 안내하는 예제 데이터가 표시됩니다.
광유전학 1,2 및 화학유전학 3,4,5와 같은 회로 특이적 신경 조절 기술의 사용은 신경 회로 장애로서의 정신 상태에 대한 우리의 이해를 발전시켰습니다. 신경 회로는 연구하기 어렵고 일반적으로 특정 세포 유형, 뇌 영역, 분자 신호 전달 경로 및 활성화 시기에 의해 정의되기 때문에 뇌 질환 치료에서 제어하기가 훨씬 더 어렵습니다. 연구 및 임상 응용 모두에 이상적으로 이러한 제어는 비침습적으로 수행되지만 정확하고 비침습적인 신경 조절을 모두 달성하는 것은 어렵습니다. 예를 들어, 신경 활성 약물은 비침습적으로 뇌에 도달할 수 있지만 뇌 전체에 작용하여 공간적 특이성이 부족합니다. 반면, 전기 뇌심부 자극은 특정 뇌 영역을 제어할 수 있지만 특정 세포 유형을 제어하기 어렵고 수술과 장치 배치가 필요하다6.
ATAC(Acoustically Targeted Chemogenetics7)는 공간적, 세포 유형 및 시간적 특이성을 가진 신경 조절을 제공합니다. 공간 표적화를 위한 집속 초음파 유도 혈액뇌장벽 개방(FUS-BBBO), 세포 유형 특이적 프로모터의 제어 하에 유전자를 비침습적으로 전달하기 위한 아데노 관련 바이러스 벡터(AAV) 사용, 약물 투여를 통해 선택적으로 형질감염된 신경 회로를 조절하기 위한 조작된 화학유전학적 수용체의 세 가지 기술을 결합합니다. FUS는 밀리미터 단위의 공간 정밀도로 인간의 뇌를 포함한 조직 깊숙이 초점을 맞추는 초음파의 능력을 활용하는 FDA 승인 기술입니다. 고출력에서 FUS는 본태성 진전에 대한 FDA 승인 치료를 포함하여 비침습적 표적 절제술에 사용된다8. FUS-BBBO는 저강도 초음파와 전신적으로 투여된 미세 기포를 결합하여 초음파 초점에서 혈관에서 진동하여 BBB9의 국부적, 일시적(6-24시간) 및 가역적 개방을 초래합니다. 이러한 개구부는 설치류(10) 및 비인간 영장류(15)에서 심각한 조직 손상 없이 단백질(9,10), 소분자(small molecule)11 및 바이러스 벡터(viral vector)7,12,13,14를 뇌로 전달할 수 있게 한다. FUS-BBBO16,17에 대한 임상 시험이 진행 중이며, 이는 이 기술의 가능한 치료 적용을 나타냅니다.
AAV를 이용한 바이러스 유전자 전달은 최근 FDA 및 EU 규제 승인을 주요 이정표로 삼아 CNS 장애에 대한 임상 사용으로 빠르게 발전하고 있습니다. 마지막으로, 화학유전학적 수용체(chemogenetic receptors)18, 예컨대 디자이너 약물에 의해 독점적으로 활성화된 디자이너 수용체(Designer Receptors Activated Exclusive by Designer Drugs, DREDDs)는 형질전환 또는 형질감염된 동물(transfection된 동물)에서 뉴런 흥분에 대한 약리학적 제어를 제공하기 위해 신경과학자들에 의해 널리 사용된다19,20. DREADD는 내인성 리간드가 아닌 합성 화학유전학적 분자에 반응하도록 유전적으로 조작된 G 단백질 결합 수용체(GPCR)로, 이러한 리간드의 전신 투여가 DREADD 발현 뉴런의 흥분성을 증가시키거나 감소시킵니다. 이 세 가지 기술이 ATAC에 결합되면 공간, 세포 유형 및 시간적 정밀도로 선택된 신경 회로의 비침습적 변조에 사용할 수 있습니다.
여기에서는 간단한 3D 프린팅 표적 장비를 사용하여 마우스에서 FUS-BBBO로 뇌 영역을 정확하게 표적화하는 방법론을 포함하여 FUS-BBBO11 에 대해 이전에 발표된 프로토콜을 확장하고 업데이트합니다. 또한 FUS-BBBO를 ATAC에 적용하는 방법을 보여줍니다. 우리는 화학유전학적 수용체를 운반하는 AAV의 전달과 조직학에 의한 유전자 발현 및 신경 조절의 평가에 필요한 단계를 보여줍니다. 이 기술은 유전자 발현 또는 신경 조절을 위해 크거나 여러 뇌 영역을 표적으로 삼는 데 특히 적용할 수 있습니다. 예를 들어, 피질의 넓은 영역은 FUS-BBBO로 쉽게 형질도입되고 화학유전학을 사용하여 조절될 수 있습니다. 그러나 대체 기술인 두개내 주사를 통한 유전자 전달에는 많은 수의 침습적 주사와 개두술이 필요합니다. FUS-BBBO와 그 응용분야인 ATAC는 뇌 영역이 더 크고 침습적으로 표적으로 삼기 어려운 다양한 크기의 동물로 확장할 수 있습니다.
모든 실험은 캘리포니아 공과대학(California Institute of Technology)의 기관 동물 관리 및 사용 위원회(Institutional Animal Care and Use Committee)에서 승인한 프로토콜에 따라 수행되었으며, 여기서 데이터는 원래 J.O.S.에 의해 획득되었습니다.
1. 동물 마구 및 이미지 안내 하드웨어의 설계 및 3D 프린팅
2. 초음파 시스템 설명
3. 동물 준비
4. MRI 유도 타겟팅
참고: 맞춤형으로 설계된 표적 가이드를 사용하면 MRI 내에 초음파 변환기를 배치할 필요가 없으며 브레그마 및 람다 라인에 스테레오택스를 제로화하여 표적을 수행하기 위해 피부를 절개할 필요가 없습니다. 아래 단계에 따라 타겟팅 프로세스를 수행합니다.
5. 주사액 준비
알림: 마이크로버블 용액은 압력에 매우 민감합니다. 결과적으로, 얇은 바늘을 통한 격렬한 혼합 또는 빠른 주입은 미세 기포를 붕괴시키고 BBB 개방의 효능을 감소시킬 수 있습니다. 또한 미세 기포는 물보다 가벼우며 튜브, 카테터 또는 주사기 상단으로 떠오를 수 있습니다(그림 4). 매 주입 직전에 마이크로버블 용액을 재현탁하는 것이 좋습니다.
6. 인소네이션 절차
7. BBB 개방의 MRI 평가
참고: BBB 개구부의 MRI 평가는 다른 곳에서 자세히 설명되었습니다11. BBB 개방 위치는 T1 강조 Gd 조영제를 주사받은 마우스에서 더 밝은 영역으로 시각화할 수 있습니다.
8. 화학유전학적 리간드를 이용한 DREADD 자극
9. 유전자 발현 및 화학유전학적 활성화의 조직학적 평가
참고: 실험 종점(예: 행동 연구 종료, 유전자 발현에 필요한 시간)이 달성되면 유전자 발현의 위치와 존재를 확인하는 것이 중요합니다.
10. c-Fos에 대한 면역염색을 통한 신경 활성화 평가
ATAC 프로토콜을 수행하는 첫 번째 단계는 원하는 뇌 영역에 FUS-BBBO를 표적화하는 것입니다. 예를 들어, 설명된 프로토콜에 따라 해마를 FUS-BBBO로 표적으로 삼고 조영제와 DREADD를 운반하는 AAV9를 마우스에 주입한 다음 마우스 뇌의 이미지를 획득하는 FLASH 3D MRI 시퀀스를 주입했습니다. T1 신호 향상은 해마 영역(그림 6)과 뇌의 다른 부분(그림 7)에서 달성되었습니다. 몇 주 후, DREADD는 표적 뇌 영역 내에서 발현되었습니다. 많은 DREADD가 형광 리포터(예: mCherry)에 융합되는 동안 포름알데히드로 관류 및 고정 과정은 이러한 단백질의 형광을 크게 감소시키는 것으로 밝혀졌습니다. mCherry 또는 DREADD에 대한 면역염색은 이전 경험을 바탕으로 발현의 보다 신뢰할 수 있는 검출을 유도했습니다(그림 8). 이전 실험에서, 마우스의 ~85%가 FUS-BBBO7에 따라 발현을 보였다. DREADD의 충분한 발현 수준에 대한 간단한 테스트는 세포 수준에서 기능을 테스트하는 것입니다. 예를 들어, 화학유전학적 리간드 또는 식염수 대조군, 예컨대 CNO19, 데스클로로클로자핀 28, 또는 기타29를 제공하고, 심장 관류 및 고정 전에 2시간을 대기시킴으로써 수행될 수 있다. 그런 다음 뇌 절편을 뉴런의 활성 증가를 나타내는 c-Fos 단백질30과 DREAD에 대해 공동 면역염색했습니다. DREADD를 표적으로 하는 뇌 부위가 식염수7을 투여받은 그룹과 비교했을 때 화학유전학적 리간드를 투여받은 그룹에서 c-Fos 양성인 신경 핵의 수가 유의하게 더 많거나 FUS-BBBO를 받지 않은 반대쪽 부위와 비교했을 때 실험은 성공적인 것으로 간주되었습니다. 주목할 점은, 이러한 리간드 중 일부가 DREADD의 발현 없이 비특이적으로 뉴런을 활성화할 가능성이 있다는 것입니다. 예를 들어, CNO는 생쥐에서 낮은 수준의 클로자핀으로 대사되는 것으로 나타났으며, 이는 BBB를 통과하여 높은 효능의 DREADD를 활성화시킨다27. 그러나 비특정 위치에도 결합하는 것으로 나타났습니다. 모든 실험에서와 마찬가지로, 화학유전학적 연구(31)에 모든 적절한 대조군을 포함시키는 것이 중요하다. 한가지 가능한 대조군은 원하는 행동 또는 조직학적 분석에 대한 약물 단독의 효과를 배제하기 위해 절차 없이 야생형 마우스에 화학유전학적 리간드를 투여하는 것이다. 또 다른 대조군은 4개의 그룹을 포함할 수 있다: DREADD + 리간드, DREADD + 비히클, EGFP + 리간드, EGFP + 비히클, 이는 FUS-BBBO를 이용한 유전자 전달 및 화학유전학적 리간드 둘 다의 임의의 잠재적 효과를 설명할 것이다.

그림 1: ATAC에서 FUS의 MRI 유도 표적화 프로세스. (a) 이어바, 노즈콘 및 MRI 스캐너 내부에 들어갈 수 있는 플랫폼이 있는 마우스 배치. (b) MRI에서 볼 수 있는 3D 프린팅 가이드(파란색)를 이어바 프레임 끝에 부착한 다음 4개의 스냅온 볼트(반투명 파란색)가 포함된 표면 MRI 코일 홀더로 제자리에 고정했습니다. (c) 시상 MRI(왼쪽 패널)에서 3D 프린팅된 가이드의 모양으로, 변환기의 가상 표현의 하단이 가이드의 하단과 정렬(노란색 반원)되어 있습니다. 오른쪽 패널은 MRI에서 3D 프린팅된 가이드의 모습을 관상 보기에서 보여줍니다. 밝은 원은 MRI 대비가 강한 폴리젯 지지체 재료로 만들어졌습니다. 십자가는 플라스틱으로 형성되었습니다. 노란색 원은 입체 프레임 내부의 가이드와 동심원으로 정렬된 변환기 위치를 나타냅니다. (d) 뇌 구조를 표적으로 삼기 위해 가상 변환기를 마우스 위의 z 방향으로 이동하여 초음파 원뿔/하우징의 두께와 일치시켰습니다. 이 경우, 수조의 두께 때문에, 트랜스듀서는 정확한 타겟팅을 위해 가이드 위로 8.2 mm 이동하였다. MRI 영상 데이터를 사용하여 뇌 구조를 선택하고 MRI 좌표를 기록하여 정위 기계에 입력했습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 사용된 소프트웨어의 인터페이스. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: MRI 좌표 공간을 정체 기기와 일치시키는 프로세스. (a) 트랜스듀서 홀더 내의 3개의 구멍은 MRI 가이드 내의 3개의 구멍과 정렬되었으며 3개의 원추형 타겟팅 볼트는 전체 어셈블리에 굴곡을 일으키지 않고 삽입되었습니다. (b) 이상적으로는 세 개의 볼트가 모두 구멍의 중앙에 위치합니다. (c) 정렬에 부정확성이 있는 경우 세 개의 볼트가 모두 맞지 않는 경우(예: 1°의 작고 감지할 수 없는 요의 경우 하나의 볼트만 맞고 반대쪽 볼트는 MRI 가이드에 고정됩니다. 또는 볼트가 강제로 통과할 때 전체 어셈블리의 눈에 띄는 굴곡이 있을 수 있습니다. (d) 볼트 피팅의 확대도. 볼트는 최상의 정확도를 위해 동심원으로 배치해야 합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 주사기 내 미세 기포의 신속한 재분배. (a) 주사기는 혼합 후 5초 후에 촬영하였다. (b) 1분 후, 1mL 투베르쿨린 주사기 상단 근처에 일부 기포 농축액을 보여주는 명확하게 보이는 층이 있었습니다. 이 예는 특히 마이크로 버블 용액을 사용했습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: 트랜스듀서의 중심을 MRI 가이드의 중심 위에 배치하는 과정. (a) 이 문서에 표시된 모델에서 빨간색 캐리어는 그림 10.56b에 표시된 위치에서 여기에 표시된 위치로 3mm 앞으로 이동하도록 설계되었습니다. (b) 초음파 처리 전에 파란색 MRI 가이드를 제거하고 초음파 통과를 보장하기 위해 마우스와 변환기 (주황색) 사이에 초음파 젤을 적용했습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 6: BBB 개구부의 MRI 시각화. (a) BBB 개구부의 축 방향 보기. 화살촉으로 지정된 더 밝은 영역은 MRI T1 조영제의 혈관외 유출을 나타냅니다. (b) FUS-BBBO(화살촉)로 표적화된 등쪽 해마와 해마 위 피질의 관상 보기. (c) FUS-BBBO(화살촉)로 표적이 된 중앙 해마의 관상 보기. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 7: 이 논문에 설명된 3볼트 표적화 시스템을 사용한 4개의 뇌 부위 표적화 예. 화살촉이 있는 영역은 BBB가 MRI 조영제가 확산된 부위를 열었습니다. 4개의 사이트는 아래에서 위로 각 BBB 개구부 사이에 ~150초를 두고 연속적으로 표적이 되었습니다. 마지막 BBB 개봉 후 2분 이내에 촬영한 이미지입니다. 스케일 바는 2mm입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 8: DREADD 표현식 감지. (a) DREADD에 부착된 형광단에 대한 면역염색, 이 경우 mCherry는 일부 연구에서 신뢰할 수 있는 검출 방법이었습니다. (b) (a)에서와 동일한 조건을 사용하여 해마를 표적으로 하는 DREADD가 있는 또 다른 대표적인 섹션에서 mCherry의 형광 자체는 강한 배경과 상대적으로 약한 신호를 생성했습니다. (c) 음성 대조군으로 AAV의 전신 주사를 받았지만 FUS-BBBO를 받지 않은 마우스를 사용했습니다. mCherry 면역염색에 의해 유의한 발현을 발견할 수 없습니다. 스케일 바는 500mm입니다(a, c의 데이터는 권한이 있는7 에서 수정됨, Copyright 2020 Nature-Springer). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
이해 상충이 없습니다.
이 프로토콜은 집속 초음파 혈액 뇌 장벽(BBB) 개방, 결과 유전자 발현 평가 및 조직학적 검사를 통한 화학 유전 수용체의 신경 조절 활성 측정을 통해 유전자 전달에 필요한 단계를 설명합니다.
이 연구는 Brain and Behavior Foundation, NARSAD Young Investigator Award의 지원을 받았습니다. 여러 3D 프린팅 구성 요소는 원래 Fabien Rabusseau(Image Guided Therapy, France)가 설계했습니다. 저자는 원고 준비에 기술적인 도움을 준 John Heath(Caltech)와 Margaret Swift(Caltech)에게 감사드립니다.
| 21게이지 바늘(BD) | Fisher Scientific | 14826C | |
| 25게이지 버터플라이 카테터 | Harvard Bioscience | 725966 | |
| 30게이지 바늘(BD) | Fisher Scientific | 14826F | |
| 흡수성 파란색 패드 | Office Depot | 902406 | |
| Anti-c-Fos 항체 | Santa Cruz Biotechnology | SC-253-G | |
| Anti-mCherry 항체 | Thermofisher | PA534974 | |
| Bruker Biospec 70/30 | Bruker | 맞춤형 | 에는 RF 코일, |
| Clozapine-n-oxide | ,Tocris | 4936 | |
| 맞춤형으로 설계된 3D 프린팅 마우스 하네스 및 MRIgFUS 표적 구성 요소가 | 포함됩니다 | szablowskilab.org/downloads | |
| 사용자 정의 MRIgFUS 기계 | ImageGuidedTherapy | N/A | |
| Definity microbubbles | Lantheus | DE4 | |
| 탈기 아쿠아소닉/초음파 젤 | Fisher Scientific | 5067714 | |
| 탈모 crè me | Nair | n/a | |
| 8요소 환형 어레이 트랜스듀서 | Imasonic Inc. | 맞춤형 | |
| 에탄올 패드 / 알코올 면봉 (70 %) (BD) | Office Depot | 599893 | |
| Heparin | Sigma-Aldrich | H3149-25KU | |
| Isoflurane | Patterson Veterinary | 07-893-1389 | |
| Ketamine | Patterson Veterinary | 07-890-8598 | |
| 중성 완충 포르말린 (10 %) | Sigma-Aldrich | HT501128-4L | |
| 광섬유 수중청음기 | Precision Acoustics | ||
| PE10 튜빙 | Fisher Scientific | NC1513314 | |
| 연동 펌프 | |||
| 인산염 완충 식염수(PBS) | Sigma-Aldrich | 524650-1EA | |
| Prohance 조영제 | Bracco | 0270-1111-04 | |
| Saline | Fisher Scientific | NC9054335 | |
| 2차 항체, 당나귀-안티 염소 | ThermoFisher | A-11055 | |
| 2차 항체, 당나귀-안티 토끼 | ThermoFisher | 84546 | |
| 수술용 가위(스트레이트) | Fisher Scientific | 17467480 | |
| ThermoGuide 소프트웨어 | ImageGuidedTherapy | ||
| 조직 접착제(Gluture) | Fisher Scientific | NC9855218 | |
| 투베르쿨린 주사기 (1 mL) (BD) | Fisher Scientific | 14823434 | |
| VeroClear 3D 인쇄 가능한 재료 | Stratasys | RGD810 | |
| Vialmix 마이크로 버블 활성화 장치 | Lantheus | VMIX | |
| 진동 마이크로 톰 | Compresstome | VF-300 | |
| Xylazine | Sigma-Aldrich | X1251-1G |