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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
여기에서는 쥐의 증가된 크기와 무게를 수용하기 위해 MouseWalker 장치를 재설계하여 구축된 RatWalker 시스템에 대해 설명합니다. 이 시스템은 좌절된 전체 내부 반사(FTIR), 고속 비디오 캡처 및 오픈 액세스 분석 소프트웨어를 사용하여 보행 매개변수를 추적하고 정량화합니다.
파킨슨 병 (PD)은 흑질의 도파민 성 (DA) 뉴런의 손실로 인한 진행성 신경 퇴행성 장애입니다. 팔 스윙 감소, 느린 보행 속도 및 짧은 걸음을 포함한 보행 이상은 PD 환자에게 흔하며 질병 초기에 나타납니다. 따라서, PD의 동물 모델에서 운동 패턴의 정량화는 질병 경과 동안 및 치료 치료시 표현형 특성화에 중요 할 것이다. PD의 대부분의 경우는 특발성입니다. 그러나 PD의 유전 적 형태의 확인은 동물 모델을 만드는 데 활용할 수있는 미토콘드리아 품질 관리에 관여하는 두 가지 단백질 인 Pink1 및 Parkin의 기능 상실 돌연변이와 같은 유전자 돌연변이 및 변이를 발견했습니다. 마우스는 Pink1 및 Parkin (단일 및 복합 결실)의 손실시 신경 퇴행에 내성이있는 반면, 쥐에서는 Parkin 결핍이 아닌 Pink1이 흑질 DA 뉴런 손실 및 운동 장애를 유발합니다. 여기에서, 우리는 Pink1 녹아웃 (KO) 쥐에서 이전에보고 된 바와 같이 뒷다리 끌림을 특징으로하는 Pink1과 Parkin의 결합 손실이 있기 전에 Pink1과 Parkin의 결합 손실이있는 자유롭게 걷는 어린 (2 개월) 수컷 쥐의 보행 변화를 밝히기위한 FTIR 이미징의 유용성을보고합니다 (4-6 개월에 관찰).
가장 흔한 연령 관련 신경 퇴행성 운동 장애 인 PD는 흑질에서 DA 뉴런의 손실로 인해 발생합니다. 이러한 nigral DA 뉴런의 손실과 선조체로의 DA 입력은 PD 1,2 환자에서 관찰된 운동 기능 장애로 이어집니다. 파킨슨증으로 통칭되는 PD 환자의 정의 운동 특성에는 강직, 휴식 떨림, 서맥증, 자세 불안정 및 현미경 사진이포함됩니다3. 또한, PD 환자에서 흔히 볼 수 있는 보행 장애는 질병 1,4,5의 진행 초기에 나타납니다. 건강한 식습관과 규칙적인 운동과 같이 PD의 진행을 늦추는 데 도움이 되는 특정 생활 방식이 제안되지만 현재 PD에 대한 치료법은 없으며 증상을 관리하는 약물만 있습니다. 이것은 개선 된 치료법을 희망하는 추가 조사의 필요성을 남깁니다. 따라서 PD 동물 모델에서 보행 패턴의 특성화는 모델의 관련성뿐만 아니라 PD를 제어하기위한 치료 치료가 운동 장애를 예방하거나 개선하는 방법을 특성화하는 중요한 도구입니다.
치료 치료를 테스트하는 데 사용 된 다양한 PD 동물 모델이 있지만 각각에는 한계가 있습니다. 예를 들어, 신경독 1- 메틸 -4- 페닐 -1,2,3,6- 테트라 하이드로 피리딘 (MPTP)으로 처리 된 동물 모델은 니그랄 DA 뉴런 손실 및 후속 선조체 적응에 중요한 과정에 대한 풍부한 정보를 산출했으며, PD 발병 기전에서 미토콘드리아의 역할을 지적했다. 그러나, MPTP 모델의 병리학적 배경은 인간PD6에서와 같이 신경변성 과정이라기보다는 독성인 성질을 갖는다. 추가의 화학적 유도성 모델에는 6-하이드록시도파민(6-OHDA) 및 로테논이 포함됩니다. 6-OHDA는 DA 뉴런에 약물을 선택적으로 축적하여 PD를 유도하기 위해 사용된 최초의 제제였으며, 이는 결국 뉴런을 죽이고 PD와 유사한 증상을 유발합니다. 이 모델은 암페타민과 아포 모르핀7에 대한 반응의 행동을 조사하여 DA 고갈을 추적하는 데 처음 사용되었습니다. PD 유도의이 방법은 DA 및 그의 수용체8에 영향을 미치는 약리학 적 제제의 스크리닝에 유용한 것으로 입증되었다. 6-OHDA 모델은 정량화 가능한 운동 결함을 추적하기위한 훌륭한 모델이지만,이 모델은 뉴런의 점진적인 손실과 Lewy 신체의 형성이 동물에게 어떤 영향을 미치는지 보여주지 않습니다. 유도의 다른 방법인 로테논은 티로신 하이드록실라제 및 DA 수송체의 손실과 함께 흑질선조체 뉴런의 점진적인 퇴행을 갖는 것으로 나타났으며,이는 시간 경과에 따른 뉴런의 손실을 추적하는 더 나은 모델을 허용합니다9. 로테논 처리된 래트는 서맥운동증, 자세 불안정, 및 불안정한 보행10을 보였다. 그러나,이 방법은 쥐의 상이한 균주간에 광범위하게 가변적 인 것으로 밝혀졌으며, 이는 로테 논이 신뢰할 수있는 PD 모델11,12,13인지 여부에 대한 의문을 불러 일으켰다. 보행 분석은 쥐에서 PD의 유도에 의해 영향을받는 것으로 나타 났지만, 현재까지 유 전적으로 유도 된 PD 쥐 모델은 활주로를 자유롭게 걸어 보행 분석에 쉽게 사용되지 않았습니다.
자유롭게 걷는 설치류의 운동 장애를 분석하는 한 가지 방법은 FTIR 이미징을 활용하여 수행 할 수있는 운동 학적 보행 분석입니다. 이 확립 된 방법은 FTIR을 기반으로 한 광학 터치 센서를 사용하며, 설치류가 활주로(14,15,16)를 따라 이동할 때 발자국을 기록하고 추적합니다. 다른 방법과 비교하여 FTIR은 발자국을 방해 할 수있는 동물 신체의 마커에 의존하지 않습니다. 비디오 데이터의 생성은 다양한 설치류 모델에 대한 역동적이고 재현 가능한 보행 패턴을 생성하기 위해 결합될 수 있는 4개의 팔다리 모두의 디지털 발자국을 생성합니다. 이미징 기반 보행 분석의 원리는 설치류가 활주로를 걸어 내려갈 때 각 개별 발을 잡고 시간이 지남에 따라 접촉 면적을 측정하는 것입니다. 각 자세는 발 면적의 증가 (제동 단계에서)와 발바닥 면적의 감소 (추진 단계에서)로 표시됩니다. 이것은 발바닥 신호가 감지되지 않는 스윙 단계에 의해 진행됩니다. 비디오 평가 후 야생형(WT) 대 PD 모델을 비교하는 데 사용할 수 있는 여러 매개변수가 생성됩니다. 매개변수의 몇 가지 예는 스텝 길이(발이 한 스텝에서 커버하는 거리), 스윙 지속시간(발이 활주로와 접촉하지 않는 시간), 스윙 속도(스윙 지속시간의 함수로서의 스텝 길이) 및 스텝 패턴(대각선 스텝, 측면 스텝 또는 거들 스텝)입니다.
쥐의 초기 보행 패턴 변화를 밝히기위한 FTIR의 유용성을 입증하기 위해 PD의 유전 적 쥐 모델을 사용했습니다. PD의 대부분의 경우는 특발성입니다. PD의 유전적 형태의 확인은 동물 모델18을 만드는 데 활용될 수 있는 미토콘드리아 품질 관리17에 관여하는 두 단백질인 Pink1 및 Parkin의 기능 상실 돌연변이와 같은 유전자 돌연변이 및 변이체를 밝혀냈습니다. 불행히도, 마우스는 이러한 단백질 (단일 및 조합)의 손실시 신경 퇴행에 내성이 있습니다 19,20,21. 쥐에서 Pink1은 파킨 결핍이 아니지만 흑질질 DA 뉴런 손실 및 운동 장애22를 유발하지만 완전한 침투는 없습니다. 따라서 우리는 결합 된 Pink1 / Parkin 이중 녹아웃 (DKO) 쥐 모델을 생성했는데, 이는 수컷 Pink1 KO 쥐22에서보고 된 명백한 시각적으로 명백한 뒷다리 끌림 표현형을 표시하지만 지금은 더 높은 비율로 나타납니다 : 100-30 개월 사이에 남성의 50-4 % 대 6 %.
이 방법은 마우스14의 운동 결손을 분석하는 데 효과적이지만, 쥐의 크기와 무게를 수용하기위한 FTIR 이미징 보행 시스템 사양은 이전에는 비상업적으로 사용할 수 없었습니다. 여기에서는 쥐의 크기와 무게에 맞게 조정된 것을 제외하고 MouseWalker14를 모델로 한 수정된 FTIR 보행 이미징 시스템인 RatWalker를 구축하는 방법을 설명합니다. 이 시스템은 광학 효과 FTIR을 사용하여 분석을 위해 동물 발자국을 시각화하고 이후에 기록하는 방법을 제공합니다. 동물의 발이 광 도파관(플랫폼)과 접촉하면 광 경로가 중단되어 가시적인 산란 효과가 발생하며, 이는 국내 등급의 고속 비디오 촬영 및 오픈 소스 소프트웨어를 사용한 처리를 사용하여 캡처됩니다. 이 연구는 PD의 유전 적 쥐 모델에서 보행 변화를 연구 할 때 FTIR 영상의 힘을 보여줍니다. 예를 들어, 빠르면 4 개월에 수컷 DKO 쥐에서 명백한 시각적 운동 변화 (즉, 뒷다리 끌림)가 관찰되는 반면, FTIR을 사용하면 생후 2 개월에 수컷 DKO 쥐의 게이트 이상을 발견 할 수 있습니다.
모든 동물 연구는 네브래스카 대학 의료 센터 기관 동물 관리 및 사용위원회 (IACUC)의 승인을 받았습니다.
1. 보행 장치
참고: MouseWalker14에서 모델링된 RatWalker는 쥐와 생쥐 사이의 스텝 길이의 차이에 비례하여 치수로 설계되었습니다. 측면 조명 백라이트, 통로 인클로저, 광 도파관 통로, 거울 및 카메라로 구성됩니다(그림 S1). 엇갈린 위치에 있는 LED 스트립은 추가 재료를 수용하기 위해 통로와 백라이트 도파관의 양쪽에 사용되었습니다. 수정 된 보행 장치를 만드는 데 필요한 재료는 표 S1에서 찾을 수 있습니다.
2. 장비 설정
3. 동물 순응
참고: 첫 번째 실험 1주일 전에 수정된 보행 장치를 통해 동물을 실행합니다.
4. 보행 절차
5. 비디오 전처리
참고: 고속 카메라로 캡처한 비디오는 120fps 및 1080p 해상도의 mp4 형식으로 렌더링됩니다. 분석 소프트웨어 다운스트림의 부담을 덜어주려면 먼저 불필요한 푸티지를 다듬고 LosslessCut 소프트웨어(버전 3.23.7, https://github.com/mifi/lossless-cut)를 사용하여 각 비디오에서 오디오를 제거한 다음 오픈 소스 소프트웨어 FFmpeg(버전 4.2, http://ffmpeg.org/)를 사용하여 mp4 비디오 스트림을 png 이미지 시퀀스로 변환합니다. 참고 : tiff와 같은 다른 무손실 형식을 png 대신 사용할 수 있습니다.
6. 보행 처리
참고: 보행 데이터는 무료로 제공되는 소프트웨어인 MouseWalker (http://biooptics.markalab.org/MouseWalker/)14를 사용하여 처리 및 정량화됩니다.
7. 데이터 분석
쥐 식민지 유지 관리
Pink1 및 파킨 단일 KO 래트의 생성 및 특성은 앞서22에 기술되었다. Pink1 및 Parkin 단일 KO 래트는 SAGE Labs (현재 Envigo에서 입수 가능)로부터 입수하였다. DKO 쥐는 Pink1-/- 쥐와 Parkin-/- 쥐를 교배하여 Pink1+/-/Parkin+/- 쥐를 얻었고, 이는 Pink1-/-/Parkin-/- 쥐를 얻기 위해 교배되었습니다(Envigo에서 입수할 수 있음). Park6 (Pink1을 코딩하는 유전자)에서 26 bp의 결실을 확인하기 위해, 5'-CCCTGGCTGACTATCCTGAC-3' 정방향 및 5'-CCACCCACTACTACT-3' 역방향 프라이머를 사용하여 유전형 분석을 수행하였다. Park2 (파킨을 코딩하는 유전자)에서 5 bp의 결실은 DNA가 정방향 5'-GGTGTCTTGGCTCAGTGTGA-3' 및 역방향 5'-GCCACCCAGAATAGCATCTC-3'을 사용하여 증폭된 후 시험하였다. 증폭된 중합효소연쇄반응(PCR) 샘플을 시퀀싱을 위해 ACGT Inc(일리노이주 휠링)로 보냈다(도 S7). 모든 래트는 롱 에반스 후드 (LEH) 배경에 보관하였다. DKO 쥐는 생존 가능하고 비옥했습니다. 그러나 분만 당시 DKO 댐의 사망률이 높았습니다 (약 30 %). 이 실험에는 수컷 쥐만 사용되었습니다. 쥐는 12시간의 명암주기와 쥐 차우와 물에 자유롭게 접근할 수 있는 온도 조절 환경에 보관되었습니다.
결과
14에서 적응 된 쥐에 대한 FTIR 보행 분석 시스템의 유용성의 예로서, 우리는 2 개월의 수컷 WT 및 Pink1 / Parkin DKO 쥐에 대한 보행 분석을 수행하여 운동 학적 보행 분석의 사용이 인간의 시각 인식에서 관찰되지 않은 미묘한 운동 장애를 발견 할 수 있는지 여부를 결정했습니다 생후 4 개월부터 시작되는 총 운동 문제가 나타나기 전에.
마우스14에 대한 이전의 보행 연구와 유사하게, 적응 된 FTIR 시스템은 걷는 쥐에 의해 생성 된 발자국 패턴과 신체 중심에 의해 생성 된 경로를 표시 할 수있었습니다 (그림 1A). WT에 비해 DKO 쥐의 체중 증가에도 불구하고 (그림 1B), FTIR 신호의 강도에 의해 결정된 보행 표면 (히트 맵으로 시각화 됨)에 적용된 발 압력은 변경되지 않았습니다 (그림 1C). 보행 속도의 함수로서 여러 보행 매개 변수를 평가 한 결과 (그림 1D-H), 보행 속도와 걸음 길이가 WT와 DKO 쥐간에 유사하다는 것을 관찰했습니다 (그림 1D). 그러나 WT와 DKO 쥐의 변화는 느린 보행 속도에서 자세 단계와 스윙 지속 시간에서 분명해졌습니다 (그림 1E, F). 다리가 스탠스 단계에있는 스텝 사이클의 비율 (스탠스 지속 시간 / 기간)은 듀티 팩터이며,이 매개 변수는 달리기의 일반적인 듀티 팩터가 감소함에 따라 스탠스 단계보다 스윙 단계에서 더 많은 시간을 소비하는 것을 강조합니다 (그림 1G). 다시 말하지만, 차이점은 저속에서 강조 표시됩니다. 또한, WT 동물에서는 속도가 증가함에 따라 스윙 속도가 증가하는 반면, DKO 쥐에서는 상관 관계가 둔해진다 (그림 1H).
FTIR 보행 분석은 또한 자유롭게 걷는 쥐의 신체에 대한 각 다리의 자세 위상 추적 플롯을 허용했습니다(그림 2A, B). 자세 추적은 신체 길이로 정규화되며 발 터치다운(전방 극한 위치, AEP)에서 자세 단계 끝(후방 극한 위치, PEP)까지 신체 중심을 기준으로 하는 발의 위치로 정의됩니다. 발 위치를 비교했을 때, 우리는 AEP (왼쪽 뒷다리)와 PEP (오른쪽 뒷다리)에서 유의 한 변화를 관찰했는데, 이는 발 터치 다운 (AEP) 동안 왼쪽 뒷다리가 몸에 더 가깝다는 것을 시사하는 반면, 오른쪽 뒷다리는 WT 쥐와 비교하여 DKO에서 발 이륙 (PEP) 동안 몸에서 더 멀리 떨어져 있습니다 (그림 2C).
몇 가지 추가 파라미터가 WT와 비교하여 DKO 래트에서 유의하게 변경되었다. 특히 뒷다리 스윙 패턴의 변화가 밝혀졌습니다. 왼쪽 및 오른쪽 뒷다리의 스윙 속도는 WT 쥐에 비해 DKO 쥐에서 증가한 반면(그림 3A), 왼쪽 및 오른쪽 뒷다리의 스윙 지속 시간은 감소했습니다(그림 3B). 참고로 스텝 길이는 변경되지 않았습니다(그림 4).

그림 1. 풋프린트 패턴 및 단계 매개변수 분석. (A) WT 및 (B) DKO 쥐의 대표적인 발자국 패턴은 픽셀 강도를 나타내는 (상단 패널) 발자국 히트 맵과 신체 경로를 나타내는 수평선뿐만 아니라 다른 색상으로 표시된 개별 발 (하단 패널) : 왼쪽 앞 (LF, 노란색), 왼쪽 뒷다리 (LH, 파란색), 오른쪽 앞 (RF, 주황색) 및 오른쪽 뒷다리 (RH, 녹색). (c) 각 WT (n = 7) 및 DKO (n = 8) 래트에 대한 평균 보행 속도. SEM을 의미합니다. 중요하지 않습니다. (디-에이치) 단계 파라미터는 WT(n=7) 및 DCO(n=8) 래트에서의 속도의 함수이다. 선형 회귀선과 R 제곱 값이 포함됩니다. (D) WT 및 DKO 랫트에서 스텝 길이는 속도에 따라 증가합니다. (E) 스윙 지속 시간은 WT 래트의 속도에 반비례하지만 DKO 래트에서는 그렇지 않습니다 (유의하지 않음). (F) WT 및 DKO 래트에서 기립 지속 시간은 속도에 따라 감소합니다. (G) 듀티 팩터는 DKO 래트에서 속도에 반비례하지만, WT 래트에서는 그렇지 않다(유의하지 않음). (H) 스윙 속도는 WT 래트에서 속도에 따라 선형적으로 증가하지만 DKO 래트에서는 증가하지 않습니다(유의하지 않음). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2. 자세 추적 및 발 위치 분석. (A) 코 (빨간색 실선), 머리 윤곽 (파란색 점선), 꼬리 윤곽 (녹색 점선), 신체 중심 (흰색 점선) 및 발자국 (원 : 녹색, RF 및 하늘색, LH)으로 시각화 된 WT 쥐 (배경 보정 전후)에 대한 대표적인 보행 트랙 분석. (B) 자유롭게 걷는 WT 및 DKO 쥐에 대한 자세 추적의 대표적인 플롯. (c) WT (n=7) 및 DKO (n=8) 래트에서의 발 위치를 나타내었다. AEP, 전방 극단 위치; PEP, 후방 극단 위치; L, 왼쪽; R, 오른쪽; F, 앞발; H, 뒷발. 이원 분산 분석 및 Sidak의 다중 비교 검정을 사용한 WT (p < 0.05 *, 0.001 ***)와 비교하여 유의합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3. 뒷발 스윙 매개 변수는 DKO 쥐에서 변경되었습니다. WT (n = 7) 및 DCO (n = 8) 랫트에서 (A) 발이 움직이는 속도와 (B) 발이 공중에 떠있는 시간의 앞발 및 뒷발 측정. L, 왼쪽; R, 오른쪽; F, 앞발; H, 뒷발. SEM의 평균. 웰치의 보정과 함께 스튜던트의 쌍을 이루지 않은 양측 t-검정을 사용한 WT(p < 0.01**)와 비교할 때 유의합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4. DKO 쥐에서 변경되지 않은 단계 길이. WT(n=7) 및 DCO(n=8) 래트에서의 보폭의 앞발 및 뒷발 측정. L, 왼쪽; R, 오른쪽; F, 앞발; H, 뒷발. SEM의 평균. Welch의 보정과 함께 스튜던트의 쌍을 이루지 않은 양측 t-검정을 사용한 WT(유의하지 않음)와 비교하여 유의합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 테이블. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 경쟁하는 재정적 이익이 없다고 선언합니다.
여기에서는 쥐의 증가된 크기와 무게를 수용하기 위해 MouseWalker 장치를 재설계하여 구축된 RatWalker 시스템에 대해 설명합니다. 이 시스템은 좌절된 전체 내부 반사(FTIR), 고속 비디오 캡처 및 오픈 액세스 분석 소프트웨어를 사용하여 보행 매개변수를 추적하고 정량화합니다.
KS와 HF는 파킨슨 병 연구에 대한 연구를 지원 한 Michael J Fox Foundation for Parkinson 's Research에 감사드립니다.
| <강>알루미늄강> | |||
| 1.5" 알루미늄 각도 (1/8 "- 6063) | 크기 : 8' 수량 : 8 | ||
| 1 " 알루미늄 스퀘어 튜브 (1/16" - 6063) | 치수: 8' 수량: 4 | ||
| 32 게이지 알루미늄 시트 | 치수: 10' 수량: 1 | ||
| 1" 알루미늄 튜브 (1/8 "- 6063") | 크기 : 8' 수량 : 1 | ||
| < 강>아크릴< / 강> | |||
| 7/32 " 투명 아크릴 시트 | 크기 : 4'x8' 수량 : 2 | ||
| 1/8 " 흰색 아크릴 시트 55 % (2447) | 크기 : 4'x8' 수량 : 1 | ||
| < 강> 거울 < / 강> | |||
| 7 / 32 " 유리 거울 | 치수: 60"x12" 수량: 1 | ||
| LED | |||
| 5050 LED 테이프 라이트 (녹색) | 치수: 16.4' 수량: 1 | ||
| 5050 LED 테이프 라이트 (빨간색) | 치수: 16.4' 수량: 1 | ||
| 카메라 | |||
| GoPro Hero 6 Black | 수량: 1 | ||
| 삼각대 | 크기: 57" 수량: 1 |