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방법 논문

대장포에이성 줄기및 전구세포주에서 짧은 헤어핀 RNA 중재 유전자 녹다운에 의한 수지상 세포 개발 연구

3.2K 조회수

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DOI:

10.3791/62730

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2022년 3월 7일

 ,  , 

이 논문에서

요약

여기서 우리는 체외 DC 분화에 대한 안정적인 녹다운 세포주를 얻기 위해 shRNA의 렌즈바이러스 트랜스듀션을 사용하여 수지상 세포(DC)의 개발에 관여하는 잠재적 전사 인자를 선별하기 위한 프로토콜을 제공합니다.

초록

수지상 세포 (DC)는 선천적이고 적응성 면역 반응을 연결하는 중요한 항원 제시 세포입니다. DC는 이질적이며 기존의 DC(cDC) 및 플라즈마 사이토이드 DC(pDC)로 나눌 수 있습니다. cDC는 순진한 T 세포를 위한 항원 제시를 전문으로 합니다. 한편, pDC는 바이러스 감염 시 다량의 타입 I 인터페론(IFN-I)을 생성할 수 있다. DC의 사양은 골수(BM)의 DC 전구체의 초기 단계에서 발생하며 전사 인자(TFs)의 네트워크에 의해 정의됩니다. 예를 들어, cDC는 높은 표현 ID2, PC는 높은 표현 E2-2 동안. 점점 더 많은 DC 하위 집합이 식별되고 있기 때문에 DC 개발을 제어하는 특정 TF를 이해하는 데 관심이 증가하고 있습니다. 여기서, 우리는 짧은 머리핀 RNA (shRNA)를 불멸의 조혈 줄기 및 선조 세포 (iHSPC) 라인으로 운반하는 렌즈 바이러스를 전달하여 시험관 내에서 DC 분화에 중요한 TFs를 선별하는 방법을 확립합니다. 안정적인 녹다운 세포 주 cDC 및 pDC 전위는 셀토메트리에 의해 분석된다. 이 접근은 시험관내선에서 선조에게서 DC 운명을 잠재적으로 지배하는 유전자를 확인하는 플랫폼을 제공합니다.

서론

DC는 선천적이고 적응형 면역의 주요 레귤레이터입니다1. DC는 주로 두 개의 기능적으로 구별되는 인구, 즉 pDC 및 cDC로 분류됩니다. 또한 cDC는 각각 I 형 및 유형 II cDC 또는 cDC1 및 cDC2의 두 개의 하위 집합을 포함합니다2. pDC, 발현 BST2, Siglec-H, 및 mice3,4에서 CD11c의 중간 수준은 염증 및 바이러스 감염 동안 많은 양의 IFN-I를 분비할 수 있는 세포입니다5. 그들의 강력한 IFN-I 생산 능력 때문에, 그(것)들은 또한 전신 루푸스 홍반성 (SLE)6를 포함하여 자기 면역 질병의 진행에 있는 중요한 역할을 하기 위하여 의심됩니다. cDC1s는 XCR1, CD8a, CLEC9A 및 CD103의 표면 발현에 의해 정의된 마우스7, 항원 교차 프레젠테이션을 통해 세포독성 CD8+ T 세포(CTL)의 활성화 및 편광에 전문화되어, 세포내 병원체 및 암에

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프로토콜

렌티바이러스의 취급은 국립 대만 대학 의과 대학의 환경 보건 및 안전학과의 규정에 따라 수행됩니다.

1. 불멸의 조혈 줄기 및 선조 세포주 준비 (iHSPC)

  1. 100 ng/mL FL 및 1 μM β-estradiol을 포함하는 완전한 RPMI 1640 배지에서 iHSPC 세포줄을 유지합니다.
  2. 3일마다 1:10의 비율로 세포를 통과합니다.
    참고: 10% 태아 소 혈청(FBS), 5 x 10-5M β-메르카포에탄올, 10 μg/mL 젠타미신으로 보충하여 완전한 RPMI 1640 배지를 만듭니다. 재조합 뮤린 FL도 시판됩니다.

2. 렌티바이러스 트랜스듀션

  1. 플레이트 iHSPC는 100 ng/mL FL, 1 μM β-estradiol 및 8 μg/mL 폴리브레인을 포함하는 완전한 배지의 1mL에서 12웰 플레이트에서 1 x 105 셀/웰의 밀도로.
    참고: 폴리브레인의 농도는 세포 유형에 따라 다르며 일반적으로 4-8 μg/mL 범위에 있습니다.
  2. 100의 감염 (MOI)의 복합성에 각 우물에 shRNA 운반 렌티 바이러스를 추가합니다.
    참고: 렌티바이러스 벡터는 푸오....

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결과

렌티바이러스 벡터 pLKO.1-Puro의 지도가 표시됩니다(도 1). lacZ에 대한 shRNA를 발현하는 렌즈바이러스(비표적 제어), Tcf4 및 iHSPCPc에서 IHSPCC에서 확인된 녹다운 효율은 tcf4의 발현이 shLacZ iHSPCPC(그림 2A)에 비해 shTcf4 iHSPC에서 감소된 것으로 나타났습니다. 한편, id2의 감소된 발현은 shLacZ iHSPC 제어(도 2B)에 비해 shId2 iHSPC에서도 관찰되었다. shLacZ, shTcf4 및 shId2 iHSPC 세포주 FL을 가진 시험관내 pDC 및 cDC로 분화되었다. shLac.......

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토론

Lentivirus 기반 shRNA 벡터는 종종 세포로 바이러스 성 변환에 의해 유전자 침묵에 사용되며 숙주 게놈으로 안정적인 통합을 허용합니다. 그러나, 상이한 세포 모형에 있는 각종 감과 효율을 고려해야 하고, 이 문제점을 극복하기 위하여 접근의 다수가 취해졌습니다.

폴리브레인은 세포막상에서 전하를 중화시킬 수 있는 다정화 폴리머로, 이를 통해 배관20 동안 세포에 대한 비리온의 결합을 강화한다. 그것은 트랜스듀션 속도를 증가 시키는 효과적인 방법이지만, 또한 과도 한 금액을 추가할 때 일부 세포 유형에 독성. 이 경우 폴리브레인의 독성을 테스트하고 상이한 세포에서 농도를 최적화하는 것이 요구된다. 프로타민 황산염, 양이온 화합물, 어쩌면 세포 생존을 증가 시키기 위해 다른 접근 21. 더욱이, 감염 당일에 완전한 매체를 새로 고침하면 트랜스듀션 후 생존율을 나타낼 수 있다.

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공개 사항

저자는 공개 할 것이 없습니다.

감사의 글

Tz-Ling Chen 박사의 기술 지원에 감사드립니다. 우리는 shRNA 렌즈바이러스 (http://rnai.genmed.sinica.edu.tw)를 제공하는 국립 RNAi 코어 시설 (학계 시니카, 대만)에 감사드립니다. 이 작품은 대만 과학기술부(대부분 108-2320-B-002-037-MY3 및 MOST 109-2320-B-002-002-054-MY3)에 의해 지원되었다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
Antibodies
APC/Cy7 anti-mouse CD11c AntibodyBiolegend117324(클론: N418)
FITC 안티-마우스/human CD11b 항체Biolegend101206(클론: M1/70)
PE anti-mouse/human B220 AntibodyBiolegend103208(Clone: RA3-6B2)
Cell culture
1.5 mL 마이크로 튜브  ExtraGeneTUBE-170-C
12-well tissue culture-treated plateFalcon353043
Fetal bovine serum (FBS)Corning35-010-CV
RPMI 1640 mediumgibco11875-085
Reagent
β-estradiolSigma-AldrichE2758-250MG
β-mercaptoethanol (β-ME)Sigma-AldrichM6250
FACS 버퍼홈메이드포뮬러: 1xPBS+0.5 %FBS+0.1%NaN3
Flt3 리간드 (FL)홈메이드
폴리브렌Sigma-AldrichTR-1003-G
PuromycinInvivogenant-pr-1
TRIsureBIOLINEBIO-38032
shRNA (Taregt sequence/clone ID)Company
shId2  (GCTTATGTCGAATGATAGCAA/TRCN0000054390)RNAi 컨소시엄 (TRC)
shLacZ (CGCGATCGTAATCACCCGAGT/TRCN0000072224)RNAi 컨소시엄 (TRC)
shTcf4 (GCTGAGTGATTTACTGGATTT/TRCN0000012094)RNAi 컨소시엄 (TRC)

참고문헌

  1. Steinman, R. M., Witmer, M. D. Lymphoid dendritic cells are potent stimulators of the primary mixed leukocyte reaction in mice. Proceedings of the National Academy of Sciences. 75 (10), 5132-5136 (1978).
  2. Guilliams, M., et al.

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