생물학을 가르치는 것은 실험을 통해 학생들에게 더 자극을 줄 수 있습니다. 이 원고는 학생들이 고칼로리 다이어트, 굶주림 및 노화와 관련된 가설을 공식화하고 테스트하도록 장려하기 위해 교실에서 사용할 수 있는 두 가지 다르지만 보완적인 프로토콜을 제시합니다.
방법 논문
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생물학을 가르치는 것은 실험을 통해 학생들에게 더 자극을 줄 수 있습니다. 이 원고는 학생들이 고칼로리 다이어트, 굶주림 및 노화와 관련된 가설을 공식화하고 테스트하도록 장려하기 위해 교실에서 사용할 수 있는 두 가지 다르지만 보완적인 프로토콜을 제시합니다.
예쁜꼬마선충(C. elegans )은 생물학이 간단하여 투명하고 기생충이 없는 선충으로, 세포 또는 세포의 분자 함량을 염색하여 생물학 교육에 유용한 도구입니다. Lugol 염료(요오드-요오드화 칼륨 용액)는 글리코겐 저장을 염색하기 위해 생화학에서 널리 사용되었습니다. 이러한 맥락에서 다른 식단 및 산소 수치와 같은 다른 조건의 영향 외에도 먹이를 먹은 동물과 굶주린 동물 간의 차이를 관찰할 수 있습니다. 에리오글라우신(Erioglaucine)은 장 장벽의 손실을 나타내는 파란색 염료입니다. 장 장벽이 손상되지 않으면 파란색 염료가 내강 내부에 얼룩이 생깁니다. 그러나 이러한 무결성이 파괴되면 염료가 체강 내로 누출됩니다. 교사는 실체현미경이나 현미경을 사용하여 생리학적 및 생화학적 변화를 시연하거나 학생들이 과학적 질문을 하고 이러한 분석을 사용하여 가설을 세우고 테스트하도록 유도할 수 있습니다. 본 프로토콜은 예쁜꼬마선충(C. elegans )에서 학생들이 쉽게 수행할 수 있는 두 가지 염색 기법을 설명합니다.
고등학교에서 생물학을 가르치는 것은 끊임없는 도전입니다. 주목할 만한 점은, 기술의 접근과 사용은 교수-학습 과정에 중요한 발전을 가져왔지만, 인공 지능 챗봇과 같은 도구는 쉽게(때로는 부정확한) 응답을 얻기 때문에 합리화하고 증거를 찾는 것을 더 어렵게 만듭니다1. 그렇기 때문에 교실에서 탐구 기반 접근 방식에서 실제 실험과 함께 과학적 방법을 사용하는 것은 학생들의 비판적 사고, 창의성 및 기술적 기술을 개발하거나 자극하는 중요한 전략입니다2.
이러한 맥락에서, 자유로운 살아있는 선충 Caenorhabditis elegans 는 다음과 같은 특별한장점 때문에 교육 목적3을 위한 실험에 성공적으로 사용되어 왔다: 그것은 기생충이 아니며 먹이에 사용되는 대장균 은 생물안전 레벨 1이므로 생물학적 위험을 거의 0에 가깝게 줄인다. 그것은 우아하고 정량화 가능한 운동 움직임을 가지고 있어 학생들이 관찰하는 것이 흥미롭습니다. 그리고 투명하여 장기 관찰이 가능하지만 생체 분자의 존재 또는 생리적 변화의 발생을 나타낼 수 있는 색소로 염색할 수도 있습니다4. 따라서 생화학 및 노화와 같은 생리적 변화와 관련된 간단한 가정을 교실에서 가설을 세우고 테스트할 수 있습니다.
글리코겐은 (1→4)-α 글리코시드 선형 결합과 (1→6)-α 글리코시드 결합을 가진 글루코실 잔기에 의해 형성된 포도당 분자의 길고 분지된 사슬에 의해 형성된 저장 탄수화물이며, 근육 수축, 세포 분화 및 혈당 유지에 특히 중요하다5. 글리코겐은 글리코겐 합성효소의 인슐린 활성화로 인해 수유 후 합성됩니다. 운동이나 단식 중에는 에피네프린 또는 글루카곤이 각각 글리코겐 인산화효소를 활성화하여 다당류를 분해하여 근육 세포에 포도당-6-인산을 제공하거나 유리 포도당을 방출하여 저혈당을 회피합니다 6,7. 글리코겐 수준의 변화는 암을 포함한 다양한 생리학적 및 병태생리학적 조건에서 세포 분화, 신호전달, 산화 환원 조절 및 줄기에 영향을 미친다8. 예쁜꼬마선충(C. elegans)에서 글리코겐은 주로 식도 근육, 피하, 장, 뉴런 및 주로 체벽 근육에서 발견된다9. 글리코겐 함량은 요오드가 요오드-글리코겐 복합체를 형성하는 나선형 코일에 결합하여 눈에 띄는 선명한 청색-검정색 또는 갈색-검정색을 제공하기 때문에 Lugol의 요오드 용액을 사용하여 측정할 수 있으며, 이는 예쁜꼬마선충10에서 글리코겐 함량을 입증하는 데 성공적으로 사용되었습니다. 높은 포도당 공급으로 인한 글리코겐 축적은 벌레의 수명을 단축시켜 노화 과정을 가속화 할 수 있음이 입증되었습니다11,12. 또한 대사 장애, 기타 호르몬 및 생체 이물(xenobiotics)에 대한 노출은 글리코겐 대사를 변화시킬 수 있습니다13,14. 따라서 예쁜꼬마선충의 글리코겐 함량에 대한 실험은 다양한 요인이 신진대사를 방해할 수 있고 운동, 식이요법, 질병 및 노화와 같은 횡단적 주제와 관련된 기본 생화학에 대한 수업 중 토론을 자극할 수 있기 때문에 매우 흥미롭습니다.
노화는 세포 손상으로 인한 시간에 따른 기능 저하입니다. 이러한 손상은 산화 스트레스, 텔로미어 감소, 단백질 소실, 염증 및 심지어 불용성 다원체(polyglucosan body)15의 축적과 관련될 수 있습니다. 노화의 특징 중 하나는 유기체의 일생 동안 발생하는 여러 만성 질환과 관련된 장 무결성의 감소입니다16. 장 항상성의 유지는 장 상피의 무결성에 달려 있으며, 이는 물리적 장벽을 형성하고 인접한 상피 세포를 연결하는 접합 단백질에 의해 지원됩니다. 이 상피에 손상이 있을 때, 간질로의 발광 함량의 누출이 발생한다17. 이 메커니즘에 기초하여, 스머프 테스트는 이 청색 염료 Erioglaucine disodium salt가 장막을 통과하지 않고 내강18에 남아 있기 때문에 여러 동물 모델에서 장 무결성을 확인하는 데 사용되었습니다. 지렁이가 병원체에 감염되고 일부 독성 물질이나 노화에 오염되어 틈새 무결성이 변경되면 염료가 장벽을 통과하여 지렁이 전체에 퍼져 온통 파란색으로 변합니다. 이 분석을 통해 노화의 생리학에 대해 논의하고 웜을 다양한 조건에 노출시킴으로써 이 과정을 가속화하거나 지연시킬 수 있는 요인에 대해 실험할 수 있습니다. 여기의 프로토콜은 학생들이 생화학 및 생리학과 관련된 가설을 공식화하고 테스트하도록 선동하고 자극하기 위해 수업에서 쉽게 수행할 수 있는 이 두 가지 염료 기반 방법을 자세히 설명합니다.
프로토콜의 첫 번째 부분은 예쁜꼬마선충 모델10의 글리코겐 함량을 정성적 및 정량적으로 분석할 수 있는 적용 가능성을 보여줍니다. 프로토콜의 두 번째 부분의 목적은 예쁜꼬마선충(C. elegans) 장의 무결성을 평가하는 것입니다. 이 기술을 사용하면 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 노화를 모니터링할 수 있으며, 장막의 무결성을 평가할 수 있습니다. 또한, 물질이 노화를 가속화하거나 지연시키는지, 그리고 어떤 물질이 장 장벽에 독성 잠재력을 가지고 있는지 여부를 평가할 수 있다(19).
본 연구에 사용된 예쁜꼬마선충(C. elegans ) 균주는 브리스톨 N2 야생형이었다. 그러나 유사한 성장률을 보이는 균주를 사용하여 절차를 복제할 수 있으며, 동일하거나 유사한 기능을 갖는 것을 고려하여 장비 교체의 필요성에 따라 또는 특정 균주에는 특정 유지 및/또는 민감도 요구 사항이 있으므로 사용되는 균주에 따라 방법을 조정해야 합니다. 이 정보는 Caenorhabditis Genetics Center (CGC) 또는 WormBase 웹 사이트에서 얻을 수 있습니다. 이러한 변경은 분석법의 재현성에 영향을 미치지 않아야 합니다.
참고 : 대장균 OP50 (E. coli OP50) 박테리아 및 Bristol N2 야생형 균주는 CGC, University of Minnesota, USA 또는 C. elegans 실험실의 기증을 통해 얻을 수 있습니다. 연구자의 안전을 위해 개인 보호 장비를 사용하는 것이 필수적입니다. 차아염소산염 및 수산화나트륨과 같은 시약의 농도는 낮지만 이러한 화학 물질과 관련된 잠재적 위험을 최소화하기 위해 원고에서 강조한 대로 권장되는 PPE를 착용하는 것이 중요합니다.
1. 글리코겐 함량

그림 1: 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 전체 글리코겐 함량 분석 개략도. 글리코겐 함량 분석을 수행하기 위해 여기에서 수행된 실험의 개략도. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
2. 장 투과성 평가

그림 2: 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 전체 장 투과성 분석 개략도. (A) 예쁜꼬마선충 준비. (B) Erioglaucine disodium salt로 염색. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
글리코겐 함량 분석은 글리코겐 합성 또는 분해에 영향을 줄 수 있는 다양한 균주에 대한 비교 연구와 같은 다양한 테스트 조건을 스크리닝하기 위한 강력하고 신속한 방법을 제공합니다. 이 연구에서 L4 웜은 단식, 섭식, 포도당이 풍부한 그룹의 세 가지 뚜렷한 테스트 조건을 받았습니다. 분석은 세 번 수행되었으며 각 분석에서 각 조건이 두 번 복제되었습니다. 대표 이미지가 그림 3에 표시되어 있습니다. 각 분석 후, Lugol의 요오드 용액으로 염색된 웜을 실체현미경을 사용하여 관찰하고, 웜의 염색과 관련하여 그룹 간에 정성적 비교를 수행했습니다. 육안 관찰 측면에서, 공복 그룹(굶주림)의 기생충은 E. coli OP50(일반)을 먹인 지렁이와 E . coli OP50 및 D-glucose(고포도당)를 먹인 지렁이에 비해 덜 강렬한 얼룩을 보였습니다. 또한 E. coli OP50 및 D-glucose(고포도당)를 먹인 벌레는 가장 강렬한 염색을 나타냈습니다.

그림 3: 글리코겐 함량 분석의 대표 이미지. 예쁜꼬마선충(C. elegans )의 글리코겐 수치는 요오드 염색을 통해 평가되었습니다. 현미경 이미지는 대표적인 예쁜꼬마선충(C. elegans worms)이 48시간 동안 (A) 굶주림, (B) 규칙적인 또는 (C) 고혈당 조건에 노출된 것을 묘사합니다. 웜을 Lugol의 요오드/M9 완충액(1%)에 5분 동안 담가 1.4단계에서 자세히 설명한 절차에 따라 염색했습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
장 투과성 결과는 장이 온전한 어린 기생충(L4)과 노화로 인해 장막이 손상된 늙은 기생충(성충 7일째)의 염색 차이를 보여줍니다(그림 4). 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장은 소화와 신진대사에 중요한 역할을 하고 스트레스 반응과 노화 조절을 위한 신호 센터 역할을 하기 때문에 건강에 매우 중요한 조직이다21. 어린 벌레에서 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장은 장 내용물의 누출을 방지하는 강력한 장벽으로 구성되어 있습니다. 그러나 이러한 벌레가 나이가 들어감에 따라 장 장벽 기능이 감소하고 세포와 미세 융모의 점진적인 분해와 노화 장에 박테리아가 축적되어 파괴에 더 민감해집니다21,22. 어린 예쁜꼬마선충(C. elegans)이 염료인 에리오글라우신 디소듐 염(Erioglaucine disodium salt)을 섭취하면 선충의 장이 염색됩니다(그림 4A). 반면에, 노화된 지렁이는 염료의 유출을 나타내어 지렁이의 몸 전체에 침투하는 것을 관찰할 수 있으며, 이는 장막의 손상을 나타냅니다(그림 4B).

그림 4: 예 쁜꼬마선충(C. elegans )이 에리오글라우신 디소듐 염으로 염색한 대표 이미지. 현미경 이미지는 장이 손상되지 않은 예쁜꼬마선 충(L4기)과 장이 파열된 기생충(성체 7일 째)을 보여줍니다. 웜을 2.2.4 단계에 따라 25 % Erioglaucine 디 소듐 염 용액에 3 시간 동안 담가 염색 하였다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림 1: 예쁜꼬마선충 윤곽을 선택하기 위한 ImageJ 스크린샷. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 그림 2: 평균 계산을 위한 ImageJ 스크린샷. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 표 1: 배지, 완충액 및 배양 레시피. 현재 프로토콜에 사용되는 다양한 미디어, 버퍼 및 문화권의 구성입니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 1: 웜의 글리코겐 함량을 정량화하기 위한 ImageJ 소프트웨어에 대한 자세한 설명입니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
요약하면, 이 프로토콜은 Lugol 염색을 사용하여 개별 예쁜꼬마선충(C. elegans worms)의 글리코겐 함량에 대한 정성적 평가를 제공합니다: 간단하고 강력하며 신속한 분석법입니다. Lugol 염색은 세포 내 해상도에서 분자 데이터의 획득을 용이하게 하는 무표지 및 비침습적 접근 방식으로, 단일 웜 내에서 글리코겐 함량 변동을 모니터링할 수 있습니다(10). 또한 이 분석은 최소한의 장비 요구 사항으로 인해 비용 효율성의 이점을 제공합니다. 이미지를 캡처하는 데 현미경이나 실체현미경만 필요하며, 모든 사진에 대해 동일한 조명/밝기/노출 설정만 있으면 휴대폰 카메라를 사용하여 쉽게 얻을 수 있습니다. 또한 특정 절차적 조정은 이 프로토콜의 효율성을 향상시킬 수 있습니다. 플로우 후드 및 원심분리기와 같은 더 복잡한 실험실 장비는 알코올 램프와 중력 침전으로 대체할 수 있습니다. 이러한 대안을 통해 이 방법을 훨씬 더 예산 친화적이고 다양한 연구자가 이용할 수 있습니다. 연구자 외에도 교육자는 학교에서 교육 목적으로 이 분석을 사용하여 글리코겐 저장 및 생합성과 관련된 변화를 설명할 수 있습니다.
기존의 효소 분석법은 글리코겐 수치를 정량화할 수 있지만, Lugol 염색은 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 글리코겐 저장량을 평가하기 위한 민감하고 정확하며 비용 효율적인 고처리량 방법으로서의 가능성을 보여줍니다. 우리 연구에서 데이터는 세 가지 조건 간의 염색에서 눈에 띄는 차이를 보여주었으며, 이는 수유 조건과 염색 강도 사이의 잠재적인 상관 관계를 시사합니다. 다시 말해, 염색 강도는 글리코겐 함량에 정비례하기 때문에 서로 다른 공급 그룹 간의 글리코겐 함량의 변화를 나타냅니다. 이러한 초기 관찰 및 증거를 통해 학생들은 다양한 식품, 음료 또는 화학 시약과 같은 다양한 요인이 선충의 글리코겐 함량에 영향을 미칠 수 있는지 여부를 묻고 조사할 수 있습니다.
이 접근 방식의 한 가지 단점은 수동 절차와 주관적인 해석에 의존한다는 것입니다. 육안 관찰에 따라 점수가 할당되는 염색 평가의 주관적인 특성으로 인해 여러 분석가 간에 변동이 발생할 수 있으며, 이로 인해 결과 해석에 변동이 발생할 수 있습니다.
이 보고서는 또한 Erioglaucine disodium salt 염료를 사용하여 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장 무결성을 평가하는 방법을 보여줍니다. 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장 장벽 기능 상실은 표피선을 통해 흡수되지 않는 파란색 염료를 벌레에게 먹이면 평가할 수 있습니다. 이 검사는 장에서 염료가 누출되는 것을 확인할 수 있게 해주는데, 만화 스머프23처럼 동물이 파랗게 변하기 때문에 스머프 검사로 알려져 있습니다. 이 방법론은 이전에 장 평가를 위해 유사한 방법을 사용하여 Drosophila melanogaster 및 Danio rerio에 적용되었습니다24,25. 예쁜꼬마선충(C. elegans)에서는 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장 무결성을 검증하기 위한 간단하고 재현 가능한 기술로 간주되는 Erioglaucine disodium salt와 함께 동일한 원리의 기술을 사용했습니다 19,26.
이 프로토콜은 선충의 노화 유도 또는 지연을 평가하는 데 사용할 수 있으며 복잡한 장비를 사용할 필요없이 쉽고 빠른 방법으로 예쁜꼬마선충 (C. elegans)의 장에 있는 물질의 독성 가능성을 확인하는 데 사용할 수 있으므로 이 방법을 경제적으로 실행 가능하게 만듭니다19,27. 과학 연구에 사용하는 것 외에도 교사는 예쁜꼬마선충(C. elegans)의 장 투과성 변화를 조사하기 위해 교육 기관에서 교육 목적으로 이 분석을 사용할 수도 있습니다. 간단한 검사로 노화에 대한 가설과 화학 시약이 선충의 장 장벽에 미치는 영향에 대한 가설을 조사할 수 있습니다.
분석은 대체품이 분석법 재현성을 유지하기 위해 동일하거나 유사한 기능을 제공하는 한 연구의 목적에 따라 다른 예쁜꼬마선 충 균주 및 유충 단계를 사용하도록 조정할 수 있습니다. 성공적인 분석을 위해서는 프로토콜에 언급된 대로 노화된 웜을 3시간 동안 염색하는 것이 중요합니다. 그 후, 과도한 염료를 제거하기 위한 세척은 이 방법에서 중요한 단계이며 상층액과 함께 벌레가 제거되지 않도록 조심스럽게 수행해야 합니다. 물질 평가의 경우, 프로토콜에서 발견되는 한계 중 하나는 선충의 장막을 용해시키는 쉽게 접근할 수 있는 양성 대조군을 찾기가 어렵다는 것입니다.
저자는 밝힐 것이 없습니다.
D.S.A는 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento(CNPq/브라질), 보조금 번호 #301808/2018-0, #313117/2019-5, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul(FAPERGS/Brazil), 보조금 번호, 21/2551-0001963-8, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior(CAPES, N.S.J 및 A.C.S의 경우 금융 코드 001)의 자금 지원을 인정합니다.
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