이 연구는 2차원(2D) 스크래치 상처 이동 분석 및 3차원(3D) 스페로이드 발아 분석과 함께 RNA 추출 및 면역세포화학을 포함한 각각의 다운스트림 분석 방법과 함께 in vitro 혈관 신생을 연구하는 데 적합한 분석법으로 제시합니다.
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방법 논문
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이 연구는 2차원(2D) 스크래치 상처 이동 분석 및 3차원(3D) 스페로이드 발아 분석과 함께 RNA 추출 및 면역세포화학을 포함한 각각의 다운스트림 분석 방법과 함께 in vitro 혈관 신생을 연구하는 데 적합한 분석법으로 제시합니다.
혈관신생은 종양 성장 또는 신생혈관 안질환을 포함한 신체 내 생리학적 및 병리학적 과정 모두에서 중요한 역할을 합니다. 근본적인 분자 메커니즘에 대한 자세한 이해와 신뢰할 수 있는 스크리닝 모델은 질병을 효과적으로 표적으로 삼고 새로운 치료 옵션을 개발하는 데 필수적입니다. 혈관신생을 모델링하기 위해 여러 in vitro assay가 개발되었으며, 분자 수준에서 혈관신생 동인을 규명하고 치료 표적을 스크리닝하기 위해 통제된 환경이 제공하는 기회를 활용하고 있습니다.
이 연구는 인간 제대 정맥 내피 세포(HUVEC)를 사용하여 체외 에서 혈관 신생을 조사하기 위한 워크플로우를 제시합니다. 2D 설정에서 내피 세포 이동을 측정하는 라이브 셀 이미징 시스템을 활용한 스크래치 상처 이동 분석과 콜라겐 매트릭스가 제공하는 3D 설정에서 내피 세포 발아를 평가하는 스페로이드 발아 분석에 대해 자세히 설명합니다. 또한 RNA 추출 및 면역세포화학을 포함한 3D 환경에서 전사체학(transcriptomics)과 같은 추가 분자 분석을 가능하게 하는 시료 전처리 전략을 간략하게 설명합니다. 전체적으로 이 프레임워크는 과학자들에게 체외 혈관신생 분석에 대한 과학적 연구를 추구할 수 있는 신뢰할 수 있고 다재다능한 도구 세트를 제공합니다.
혈관신생술은 기존의 혈관에서 새로운 혈관이 형성되는 것을말하며1 생리적 발달 및 병리학적 조건에서 중요한 과정이다. 이는 망막(retina)2 또는 발달 중인 중추신경계(central nervous system)3와 같이 대사 활동이 활발한 조직에 에너지를 공급하고, 손상된 조직4을 치유하는 과정에서 필수적이다. 반면에 비정상적인 혈관 신생은 수많은 질병의 기초가 됩니다. 대장암이나 비소세포폐암과 같은 고형암은 혈관신생을 촉진하여 종양의 성장과 필요한 에너지 공급을 촉진한다5. 암 외에도 당뇨병성 망막병증 또는 연령 관련 황반 변성과 같은 눈의 신생 혈관 질환은 선진국에서 실명의 주요 원인으로 비정상적인 혈관 성장의 결과입니다 6,7. 근본적인 발병 기전에 대한 자세한 이해는 예를 들어 혈관 증식성 안구 질환과 같은 병리학적 상태를 더 잘 제어하면서 상처 치유에서 생리적 혈관 신생을 향상시킬 수 있는 방법을 이해하는 데 중요합니다.
세포 수준에서, 혈관 내피 세포는 혈관 신생에서 다양한 신호 분자에 의해 활성화되어 세포 증식과 이동을 시작한다8. 세포는 이어서 계층으로 조직되며, 비증식하는 팁 세포는 발달 중인 혈관 분지(8)의 선두 가장자리에 선체(filopodia)를 형성합니다. 이와 함께 빠르게 증식하는 줄기 세포가 팁 세포를 따라가며 새로 나오는 혈관의 형성에 기여합니다. 그 후, pericyte 또는 평활근 세포와 같은 다른 세포 유형이 모집되어 초기 분지9를 더욱 안정화시킨다.
혈관 내피 세포 수준에서 분자 과정을 탐구하기 위해 수많은 in vitro 프로토콜이 개발되었으며 최근에는10 검토되었습니다. 이러한 분석은 일반적으로 두 가지 범주로 나뉩니다: 더 단순하지만 확장 가능한 2D 접근 방식과 더 정교한 3D 프로토콜. 최근 프로젝트에서 우리는 2D 긁힌 상처 이동 분석과 3D 스페로이드 발아 분석(11 ) 간의 포괄적인 비교 분석을 수행하여 차이점의 정도와 혈관 신생의 다양한 측면을 모델링할 수 있는 능력을 평가했습니다12.
둘 다 신뢰할 수 있고 쉽게 구현할 수 있다는 장점을 제공하지만, 분자 수준에서 3D 스페로이드 발아 분석은 대사 스위치 또는 세포-매트릭스 상호 작용과 같은 생체 내 데이터와 비교하여 혈관 신생의 주요 측면을 해결하는 데 유리했습니다. in vitro angiogenesis assay는 신호전달 경로(13)의 혈관조절 전위를 평가하고 치료제를 스크리닝하는 데 사용되기 때문에, in vitro 결과를 in vivo 환경으로 이전하는 것이 필수적이다. 또한, 통제된 조건에서 혈관 생성 과정의 표적 조절에 대한 반응으로 분자 변화를 특성화하기 위한 RNA 및 단백질 수준에 대한 오믹스 기반 분석의 기회는 생체 내 설정에 비해 중요한 이점으로 남아 있습니다14,15.
이 간행물에서는 단백질 수준에서의 전사체 분석을 위한 RNA 염기서열 분석 및 면역조직화학과 같은 후속 분자 분석을 포함하여 살아있는 세포 이미징 이동 분석 및 스페로이드 발아 분석의 활용을 통해 혈관 신생 관련 질문을 탐구하기 위한 주요 분석을 제시합니다.
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1. HUVEC 세포 배양
알림: 멸균 작업 조건(멸균 작업대)에서 다음 단계를 모두 수행하십시오.
2. 스크래치 상처 이동 분석
참고: 긁힌 상처 이동 분석은 완료하는 데 3일이 소요됩니다(그림 1). 멸균 작업 조건(멸균 작업대)에서 다음 단계를 모두 수행합니다.
3. 2D 배양 세포를 이용한 RNA 추출
알림: 멸균 작업 조건(멸균 작업대)에서 3.3단계까지 다음 단계를 모두 수행합니다.
4. 2D 배양 세포를 이용한 면역세포화학
알림: 멸균 작업 조건(멸균 작업대)에서 4.4단계까지 다음 단계를 모두 수행하십시오.
5. 회전 타원체 발아 분석
참고: 스페로이드 발아 분석은 완료하는 데 3일이 걸립니다(그림 2). 멸균 작업 조건(멸균 작업대)에서 5.7단계까지 다음 단계를 모두 수행합니다.
6. 3D 배양 세포를 이용한 RNA 추출
7. 3D 콜라겐 매트릭스에서 스페로이드의 면역세포화학(Immunocytochemistry)
8. 인간 망막 미세혈관 내피 세포(HRMVEC)
주의: 설명된 모든 단계는 미세혈관 내피 세포, 예를 들어 인간 망막 미세혈관 내피 세포(HRMVEC)에 대해서도 수행할 수 있습니다. 이 경우 배지를 배양 및 각 분석의 특정 단계를 위해 10% 소 태아 혈청(FBS)을 포함하는 특정 미세혈관 내피 세포 배지로 전환해야 합니다. 분석 프로토콜에 대한 HRMVEC별 차이점은 다음과 같습니다.
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이동 분석의 경우, 완전히 형성된 세포 단층의 존재가 시스템에서 정확하게 감지되도록 t = 0h 시점에서 캡처된 이미지를 철저히 검사하는 것이 중요합니다(그림 1B). 또한 스크래치 테두리의 선명도와 직진도를 확인해야 합니다(그림 1B). cell-free 영역에는 이물질이 거의 없어야 합니다. 분석이 끝날 때, 예를 들어 25ng/mL VEGF를 양성 대조군으로 자극한 그룹은 원래의 긁힌 영역에서 성공적인 이동을 보여야 합니다(그림 1B). 기술적 문제의 예는 고르지 못한 세포 성장, 이중 긁힘 또는 긁힘 경계의 물결 모양으로 나타날 수 있습니다(그림 1C). 또한 음성 대조군(EBM 자극 샘플)과 양성 대조군(VEGF 샘플) 사이에 상당한 동적 범위를 설정하는 것이 중요합니다(...
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이 보고서에서는 in vitro에서 혈관신생을 연구하기 위한 기능적 및 분자적 판독과 함께 다양한 기법을 제시했습니다.
마이그레이션 분석은 습식 실험실 작업의 모든 분야에서 사용되는 잘 정립된 기술을 나타냅니다. 스크리닝 및 용량 반응 실험에 적합한 96웰 형식, WoundMaker 도구로 생성된 표준화되고 재현 가능한 상처 크기, 최대 24시간 동안 타임랩스 이미징을 통해 이동 역학을 관찰할 수 있는 기회 및 자동 이미지 정량화 소프트웨어를 활용하기 위해 상업적으로 이용 가능한 라이브 셀 이미징 접근 방식을 선택했습니다. 그러나 혈관신생 분석 소프트웨어가 장착된 생명세포 이미징 시스템이 실험실이나 핵심 시설에 있어야 합니다. 특정 라이브 셀 이미징 현미경 또는 기타 특수 장비를 필요로 하지 않는 수많은 대체 실험 설정이 확립되었습니다10.
우리의 경험에 비추어 볼 ...
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저자는 이 프로젝트에 대한 이해 상충이 없음을 선언합니다.
저자는 소피 크뤼거(Sophie Krüger)와 가브리엘레 프린츠(Gabriele Prinz)의 탁월한 기술 지원에 감사를 표한다. 스페로이드 새싹을 정량화하기 위한 ImageJ 플러그인을 개발한 Sebastian Maier와 IncuCyte 시스템을 사용해 준 Lighthouse Core Facility, Zentrum für Translationale Zellforschung (ZTZ), Department of Medicine I, University Hospital Freiburg에 감사드립니다. 그래픽은 biorender.com 로 만들어졌습니다. 이 연구는 Deutsche Forschungsgemeinschaft [Bu3135/3-1 + Bu3135/3-2 to F.B.], Medizinische Fakultät der Albert-Ludwigs- Universität Freiburg [Berta-Ottenstein-Program for Clinician Scientists and Advanced Clinician Scientists to F.B.], Else Kröner-Fresenius-Stiftung [2021_EKEA.80 to F.B.], German Cancer Consortium [CORTEX fellowship for Clinician Scientists to J.R.], Volker Homann Stiftung [to J.N.+F.B.], Freunde der Universitäts-Augenklinik Freiburg 등의 지원을 받았다 e.V." [P.L.에게]
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 10x 미디엄 199 | Sigma-Aldrich | M0650 | |
| Alexa Fluor 647-conjugated AffiniPure F(ab)' 2-프래그먼트 | 잭슨 IR | 115-606-072 | |
| Axio Vert. A1 | Zeiss | ||
| CapturePro 2.10.0.1 | JENOTIK 광학 시스템 | ||
| 콜라겐 타입 1 쥐 꼬리 | Corning | 354236 | |
| Collagenase D | Roche | ||
| 내피 세포 기초 매체 | Lonza | CC-3156 | EBM |
| 내피 세포 성장 매체 | Lonza | CC-3162 | EGM |
| 에틸렌디아민테트라아세트산 | Serva | 11290.02 | EDTA |
| 소 태아 세럼 | Bio& SELL | S 0615 | FBS |
| 인간 엄빌리컬 베인 내피 세포, 풀드 | Lonza | C2519A | HUVEC |
| IncuCyte ImageLock 96-웰 플레이트 | Sartorius | 4379 | |
| Incucyte S3 라이브 셀 분석 시스템 | Sartorius | ||
| Methocel | Sigma | m-0512 | |
| 10% FBS가 있는 미세혈관 내피 세포 배지 | PB-MH-100-4090-GFP | PELOBiotech | |
| NaOH | Carl Roth | P031.2 | |
| Phalloidin-Fluorescein Isothiocyanate 표지(0.5mg/mL 메탄올) | Sigma-Aldrich | P5282-.1MG | Phalloidin-FITC |
| 인산염 완충 식염수 | Thermo Fisher Scientfic | 14190-094 | PBS |
| 1차 인간 망막 미세혈관 내피 세포 | 세포 시스템 | ACBRI 181 | |
| ThermoFisher Scientific의 NucBlue Invitrogen | 을 사용한 ProLong Glass Antifade Mountant | 2260939 | |
| QIAzol Lysis Reagent | QIAGEN | 79306 | |
| 재조합 인간 혈관 내피 성장 인자 | PeproTech | 100-20 | VEGF |
| 제곱 페트리 접시 | Greiner | 688102 | |
| Trizol | Qiagen | 79306 | |
| Trypsin | PAN-Biotec | P10-024100 | |
| VEGF-R2 (monoclonal) | ThermoFisher Scientific Inc. | B.309.4 | |
| WoundMaker | 장갑 | 4493 |
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