이것은 포괄적인 Xenopus 샘플링 프로토콜의 첫 번째 부분입니다. 표본 조직은 심실, 동맥 줄기, 왼쪽 간엽, 담낭, 폐, 췌장, 비장, 후두, 식도, 위, 장, 고환, 지방체, 난관, 쌍을 이루는 신장, 좌골신경총, 피부, 흉선 및 눈 전체입니다.
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이것은 포괄적인 Xenopus 샘플링 프로토콜의 첫 번째 부분입니다. 표본 조직은 심실, 동맥 줄기, 왼쪽 간엽, 담낭, 폐, 췌장, 비장, 후두, 식도, 위, 장, 고환, 지방체, 난관, 쌍을 이루는 신장, 좌골신경총, 피부, 흉선 및 눈 전체입니다.
Xenopus 는 오랫동안 척추동물의 발달과 질병을 조사하기 위한 중추적인 모델 유기체였으며, 세포 과정과 유전자 기능에 대한 깊은 통찰력을 제공해 왔습니다. 배아 제노푸스(Xenopus)에 대한 풍부한 정보에도 불구하고, 성체 조직 샘플링을 위한 표준화된 방법, 특히 정량적 단백질체학(quantitative proteomics)과 같은 현대적인 접근법에 대한 표준화된 방법에는 상당한 격차가 남아 있습니다. 이 연구는 성인 Xenopus의 여러 조직을 빠르고 정확하며 효율적으로 샘플링하기 위한 포괄적인 프로토콜을 소개합니다. 이 프로토콜은 다른 항아리와 비교하여 미묘한 해부학적 차이와 관련된 문제를 해결하여 개구리 해부에 대한 경험이 부족한 사람들에게도 재현성을 보장합니다. 이 프로토콜은 시료의 신선도를 우선시하여 고품질 생화학 분석에 최적화되어 있습니다. 우리는 한 시간 이내에 최대 18개의 조직을 신속하게 수집할 수 있도록 촉진하고 있습니다. 또한 이 방법은 관류 및 비관류 조건에 적용되어 다양한 실험 요구 사항에 대한 유연성을 제공합니다. 이 연구는 Xenopus laevis 와 tropicalis 에 대한 중요한 방법론적 격차를 메울 뿐만 아니라 유사한 양서류 모델에 기술을 적용하는 연구자들에게 귀중한 자원으로 작용하여 비교 생물학 및 진화 연구의 범위와 신뢰성을 향상시킵니다.
Xenopus 는 특히 발달 및 진화적 맥락에서 인간 질병을 연구하기 위해 마우스, 제브라피시 및 기타 모델 유기체에 비해 고유한 이점을 제공합니다. 외부 배아 발달과 크고 쉽게 조작할 수 있는 배아는 내부적으로 발달하고 침습적 절차가 필요한 마우스에서 어려운 실시간 관찰 및 실험적 개입(예: 조직 이식, 유전자 편집)을 가능하게 합니다. 또한, Xenopus의 3개의 방이 있는 심장과 사지동물의 팔다리는 선천적 결함1, 사지 재생2 및 심장 발달3 연구를 위한 보다 직접적인 진화적 다리를 제공합니다. 생쥐와 달리 제노푸스 올챙이는 포유류에는 없는 재생 과정을 모델링하여 팔다리와 장기를 재생할 수 있으며, 수생 생활 단계에서는 환경 또는 독소 영향에 대한 비침습적 연구를 수행할 수 있습니다. 더 빠른 육종, 더 낮은 비용 및 더 적은 윤리적 제약과 결합된 Xenopus 는 포유류 시스템에서 복제하기 어려운 기관 발생 및 스트레스 반응에 대한 고처리량, 기계론적 연구에 탁월합니다.
이 논문은 Xenopus 올챙이4에 사용할 수 있는 성인 Xenopus 조직의 정확하고 재현 가능한 장기 샘플링에 대한 명확한 지침을 제공하는 것을 목표로 합니다. 성체 Xenopus의 "디지털 해부"5 및 "마이크로 CT 영상"6을 사용할 수 있지만, 마우스와 같은 다른 성체 모델에 대해 제공되는 자세한 지침 없이는 성체 Xenopus에서 일관된 장기 및 조직 샘플링을 달성하는 것은 어렵습니다 7,8,9.
6가지 중요한 조직에 대한 샘플 가이드를 사용할 수 있지만10 Xenopus 에 대한 구체적이고 광범위한 해부 및 샘플링 가이드는 현재 사용할 수 없습니다. Rana sp.11 에 대한 포괄적인 해부 가이드가 존재하며 다른 아누란12에 대한 다양한 교실 해부 매뉴얼을 사용할 수 있지만, 표본 채취 기술이나 양서류 해부학에 경험이 없는 개인의 경우 Xenopus 와 다른 아누란 간의 미묘한 차이로 인해 기존 자원이 일관되고 반복 가능한 조직 샘플링에 적합하지 않습니다.
이 가이드는 단백질체학 및 면역화학을 위해 조직 신선도를 우선시하기 위해 개발되었습니다. 숙련된 사용자는 한 시간 이내에 한 개인으로부터 모든 조직을 수집할 수 있습니다. 사용자가 경험이 부족한 경우, 대체하기 더 어려운 동물을 희생하기 전에 다른 이유로 안락사된 표본에 대해 이 프로토콜을 시도하는 것이 좋습니다.
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모든 실험은 하버드 의과대학 IACUC(Institutional Animal Care and Use Committee IS 00001365_3)의 규칙 및 규정에 따라 승인되고 수행되었습니다. 샘플링 전에 관류 프로토콜13 을 따르는 경우 2.3단계로 건너뜁니다.
1. 준비(관류 없음)
2. 샘플링
참고: 동물이 관류된 경우 2.3단계로 건너뜁니다. 모든 여백은 약 25mm여야 합니다. 집게와 가위는 깨끗이 닦거나 샘플 사이에 교체해야 합니다. 모든 조직은 안락사 후 1시간 이내에 샘플링하여 신선도를 극대화해야 합니다.
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이 프로토콜의 모든 단계를 따름으로써, 심장실, 동맥 줄기, 좌측 간엽, 담낭, 폐, 췌장, 비장, 후두, 식도, 위, 장, 고환, 지방체, 난관, 쌍을 이루는 신장, 좌골신경총, 피부, 흉선 및 눈 전체를 안락사 후 한 시간 이내에 깨끗하게 절제했습니다(그림 1, 그림 2, 그림 3, 그림 4, 그림 5, 그림 6 참조, 그림 7, 그림 8
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여기에 제시된 프로토콜은 다양한 경험 수준의 사용자에게 유연성을 제공하는 동시에 적시에 효율적인 방식으로 필수 조직을 수집할 수 있도록 설계되었습니다. 신규 사용자는 체계적인 조직 수집을 보장하기 위해 설명된 대로 프로토콜의 각 단계를 따르는 것이 좋습니다. 그러나 경험이 많은 사용자는 특정 단계를 건너뛰고 필요한 조직만 샘플링할 수 있습니다. 예를 들어, 장간막 뒤에 위치한 비장에 접근하는 것은 췌장을 샘플링하지 않고도 단순히 위를 이동시키는 것만으로 달성할 수 있습니다. 이러한 적응성을 통해 특정 연구 요구 사항에 따라 샘플링 프로세스를 맞춤화할 수 있습니다. 조직 분해 속도와 대사 활성은 장기에 따라 다르지만, 신속하게 작업하고 냉각 완충액을 사용하면 결과 샘플에 미치는 영향을 최소화할 수 있습니다.
이 프로토콜은 효율성을 위해 설계되어 한 시간 이내에 최대 18개의 조직을 수집할 수 있습니다. 이 방법의 한계는 ...
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저자는 선언할 경쟁 이해관계가 없습니다.
이 작업은 NIH의 OD R24 보조금 ODO31956의 지원을 받았습니다. 또한 Samantha Jalbert와 Jill Ralston의 도움과 지원에 감사드립니다.
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