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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 G 단백질 결합 수용체 리간드 자극 시 살아있는 HEK293 세포에서 G 단백질 활성화를 실시간으로 측정하기 위한 BRET 기반 바이오센서의 사용을 설명합니다. 여기서, β2-아드레날린성 수용체와 칸나비노이드 1형 수용체는 여러 G 단백질 아형과 다양한 GPCR에 걸쳐 센서의 효율성을 입증하는 예로 사용됩니다.
G 단백질 결합 수용체(GPCR)는 막관통 수용체의 가장 큰 계열을 구성하며, 세포외 자극을 세포내 반응으로 형질전환함으로써 세포 신호 전달에 중요한 역할을 합니다. GPCR 활성화는 이종 삼량체 G 단백질과의 상호 작용을 가능하게 하는 구조적 변화를 초래합니다. 활성화 시 Gα 서브유닛은 GDP-GTP 교환을 거쳐 Gβγ 이량체에서 해리되고 다운스트림 신호 전달 캐스케이드를 유발합니다. GPCR 매개 G 단백질 활성화를 연구하기 위해 생물발광 공명 에너지 전달(BRET) 기반 바이오센서는 매우 민감하고 비침습적인 접근 방식입니다. Schihada 등이 개발한 G 단백질 기반 트리시스트론 활성 센서(G-CASE 바이오센서)는 활성화의 프록시로서 헤테로삼량체 해리를 감지하고 단일 플라스미드 형질감염을 사용하여 GPCR 활성의 실시간 모니터링을 가능하게 하여 공동 형질감염 접근법의 한계를 극복합니다. BRET 분석은 형광 기반 기술에 비해 배경 소음 감소, 광표백 감소, 감도 향상 등 여러 가지 장점을 제공합니다. 이 프로토콜에서 BRET 기반 G-CASE 바이오센서는 살아있는 세포 및 96웰 플레이트에 사용되었습니다. 구체적으로, 우리는 G 단백질 활성화 측면에서 β2-아드레날린성 수용체(β2-AR)와 칸나비노이드 1형 수용체(CB1R)의 활성을 평가합니다. β2-AR을 일시적으로 형질감염한 HEK 293T 야생형 세포와 CB1R을 안정적으로 발현하는 HEK293T 세포를 사용하여 Gs 및 Gi3 G-CASE 바이오센서의 견고성을 확인했습니다. 이 프로토콜은 예를 들어 편향된 신호 전달을 통해 특정 경로를 활성화하는 리간드의 능력을 더 잘 이해하고 따라서 새로운 치료 화합물의 발견을 촉진하기 위해 약리학적 연구 및 고처리량 GPCR 스크리닝에 대한 이 접근법의 유용성을 지원합니다.
G 단백질 결합 수용체(GPCR)는 막관통 수용체의 가장 큰 슈퍼패밀리를 나타내며, 세포외 자극을 세포내 신호 전달 캐스케이드로 형질도입하여 특정 생물학적 반응을 일으키는 역할을 합니다. 이는 시판 약물의 약 30%가 GPCR에 작용하는 중추적인 약리학적 표적입니다1. GPCR 리간드 결합은 수용체의 형태 변화를 유도하여 이종삼량체 G 단백질 및/또는 GPCR 키나아제(GRK) 및 β-아레스틴과의 상호작용을 촉진하여 다운스트림 신호 전달 또는 수용체 내재화를 시작합니다2.
이종 삼량체 G 단백질은 GPCR 신호 전달의 주요 세포내 변환기 역할을 하며 Gα, Gβ 및 Gγ의 세 가지 하위 단위로 구성됩니다. 이러한 헤테로삼량체는 Gα 아형을 기반으로 Gi/o, Gs, Gq 및 G12/13의 4가지 계열로 분류되며, 각 계열은 고유한 신호 전달 경로를 활성화합니다: Gi/o 아형은 아데닐레이트 시클라아제를 억제하는 반면 Gs는 이를 자극하고, Gq는 포스포리파제 C-β를 활성화하고, G12/13은 Rho 계열 GTPase를 조절합니다.
GPCR 활성화는 구조적 재배열로 이어져 초 미만의 동역학 내에서 빠른 G 단백질 결합을 가능하게 합니다. 이 과정은 G 단백질 형태 변화를 유도하여 Gα 서브유닛에서 GDP-GTP 교환을 촉진합니다. GTP 결합은 Gα 서브유닛 형태를 추가로 변경하여 Gβγ 이량체에서 해리되어 신호 전파를 허용합니다. 따라서 G 단백질은 아데닐레이트 시클라제 또는 이온 채널과 같은 다양한 이펙터 단백질을 조절함으로써 세포 반응의 특이성과 시간적 역학을 조절하는 데 중요합니다 3,4,5.
이 프로토콜은 살아있는 세포에서 GPCR 리간드 자극 시 생물발광 공명 에너지 전달(BRET) 기반 바이오센서를 사용하여 G 단백질 활성화 또는 불활성화의 측정을 간략하게 설명합니다. G 단백질 바이오센서 6,7,8,9에 대한 선구적인 작업에서 영감을 받은 G-CASE(G 단백질 트리시스트로닉 활성 센서) 시스템은 Schihada et al.10에 의해 도입되었으며 표지된 Gα와 Gβγ 서브유닛 사이의 BRET를 기반으로 하며 단일 플라스미드 형질감염만 필요로 하는 간소화된 접근 방식을 제공합니다. 이 기능은 이종삼량체 G 단백질의 세 가지 서브유닛(Gα, Gβ 및 Gγ)을 코딩하는 여러 플라스미드의 공동 형질감염과 관련된 문제를 향상시키고 완화합니다. 이 센서는 학술 연구 그룹에서 상업적으로 사용할 수 있습니다( 재료 표 참조).
BRET는 FRET(Förster Resonance Energy Transfer)에 비해 상당한 이점을 제공합니다. BRIT에서는 외부 광원 없이 생물발광 공여체와 형광 수용체 사이에서 에너지 전달이 발생합니다. 이 고유 생물 발광은 자가형광 및 광 산란과 같은 FRET와 관련된 문제를 줄여 배경 신호를 낮추고 분석 감도를 향상시킵니다 6,7,11.
BRET에 외부 여기가 없기 때문에 광표백 및 광독성 효과가 최소화되어 FRET에 비해 배경 신호가 낮아집니다. 결과적으로, BRET 분석은 대부분 향상된 감도를 나타내므로 구성 활성 GPCR의 G 단백질 활성화를 측정할 수 있습니다. BRET 분석의 향상된 감도는 미묘한 생물학적 상호 작용의 검출을 용이하게 하며, 이는 수용체 활성의 정확한 측정이 중요한 약리학적 연구에서 특히 유용합니다.
이러한 바이오센서는 칸나비노이드 수용체 CB1R 및 CB2R의 활성을 분석하기 위해 멤브레인 기반 384웰 분석에서 이러한 바이오센서를 사용하는 방법이 개발된 Scott-Dennis et al.에 의해 최근에 입증된 바와 같이 96웰 또는 384웰 플레이트에서 고처리량 스크리닝으로 변환될 수 있습니다12. 이 기사에서는Gs 단백질과 클래스 A GPCR에 속하는 CB1R에 결합하고 Gi/o 패밀리 단백질을 활성화하는 클래스 A 프로토타입 GPCR로서 β2-AR의 활성을 측정하여 살아있는 세포의 96웰 플레이트에서 이러한 바이오센서의 사용에 대해 설명합니다. 두 개의 G-CASE 바이오센서의 사용이 검증되었습니다: GPCR이 일시적으로(β2-AR 사용) 또는 안정적으로 발현된(CB1R 사용) 있는 HEK 293T 세포에서 Gs 및 Gi3 .
이 실험은 다양한 세포주에서 수행될 수 있으며, 이는 다양한 세포 맥락에서 이 기술의 다양성과 견고성을 입증한다는 점에 유의하는 것이 중요합니다. 이를 통해 이 방법을 다양한 실험 모델에 적용할 수 있으므로 다양한 생리학적 및 약리학적 환경에서 GPCR 신호 전달을 연구하는 데 유용한 도구가 됩니다. 그림 1 은 BRET 기반 G 단백질 활성 센서의 원리를 보여줍니다.

그림 1: BRET 기반 G 단백질 활성 센서의 원리. G 단백질 센서는 Gα, 천연 Gβ 및 Gγ의 세 가지 하위 단위로 구성됩니다. Gα 서브유닛은 작고 밝은 나노루시페라제(Nluc)에 융합되는 반면, Gγ 서브유닛은 원형으로 순열된 금성(cpVenus173)으로 N-말단으로 표지됩니다. 이러한 조작된 G 단백질 서브유닛을 암호화하는 유전자는 단일 플라스미드로 결합됩니다. GPCR에 대한 리간드 결합은 GPCR 구조 변화를 유도하여 G 단백질 모집 및 후속 해리에 이어 GTP 가수분해를 촉진합니다. 이러한 해리는 파트너 간의 에너지 전달을 방해하여 BRET 신호를 감소시킵니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
본 연구에 사용된 시약과 장비는 재료표에 나와 있습니다.
1. 웰 플레이트 파종(1일차)
참고: 멸균 상태를 유지하기 위해 멸균 층류 후드의 모든 세포 배양 프로토콜을 따르십시오. 투명하고 평평한 바닥이 있는 흰색 웰 플레이트는 세포 성장과 생존력을 추적하는 데 사용됩니다. 3.2.1단계에서 스티커를 사용하지 않도록 전체 흰색 웰 플레이트를 사용하십시오.
2. 플라스미드 형질감염(2일차)
참고: 세포 형질감염은 도금 전 부유 세포에 대해 1일차, 1.2.7단계 동안 수행하고 3일차에 데이터 수집을 수행할 수 있습니다.
3. 데이터 수집(3일차)
4. 데이터 분석
참고: 각 판독값의 데이터를 별도의 데이터 스프레드시트 파일로 수집합니다.




그림 2: BRET 분석을 수행하기 위한 주요 단계. 이 프로토콜에 설명된 세 가지 주요 실험 단계(세포 파종, 세포 형질감염 및 BRET 신호 획득)에 대한 개요 및 데이터 수집을 위한 자세한 단계별 가이드. 실험 설정: 1일째, 세포는 30,000개의 세포/웰의 밀도로 평평하고 투명한 바닥이 있는 PLL로 사전 코팅된 흰색 96웰 플레이트에 파종됩니다. 2일째에 세포는 연구된 GPCR 또는 pcDNA3.1 플라스미드와 함께 선택된 G 단백질 센서로 형질감염됩니다. 24시간 배양 후, 리간드 첨가 시 생물발광 및 형광 판독값을 통해 G 단백질 센서 활성을 측정합니다. 데이터 수집: 세포의 HBSS 세척 후 80μL의 HBSS를 웰에 추가하고 535/30nm 단색기를 사용하여 500nm에서 600nm 사이에서 cpVenus173 형광 방출을 측정합니다 (1). 다음으로, Nluc 생물발광은 450/40nm 단색기를 사용하여 ( 2) 및 (3) 첨가 전후에 400nm에서 600nm 사이에서 측정됩니다. 마지막으로, 기저 및 리간드 유도 G 단백질 활성에 대한 BRET 신호는 각각 450/40nm 및 535/30nm 단색기를 사용하여 3분(0.30초의 측정 간격으로 60초의 3주기)( 4) 및 16분(0.30초의 측정 간격으로 60초의 16주기)에 걸쳐 측정됩니다 (5). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
실험 설정 및 실행의 일반화된 체계는 그림 2에 자세히 설명되어 있습니다. 2개의 GPCR의 리간드 활성화에 따른 Gs 또는 Gi/o 계열 단백질의 활성화는 G-CASE 바이오센서를 사용하여 평가되었습니다. 먼저, HEK 293T 세포에 일시적으로 형질감염된 β2-AR인 프로토타입 계열 A GPCR을 연구했습니다. Gs(short)-CASE 단백질 센서와 함께 β2-AR을 발현하는 HEK wt 세포에 작용제(즉, 이소프로테레놀)를 적용했을 때, BRET 신호의 농도 의존적 감소가 관찰되어 Gs 단백질의 활성화를 나타냅니다(그림 3B). ΔBRET 값은 포화에 도달할 때까지 리간드 농도에 따라 감소했으며, 리간드 자극 후 약 5분 후에 고원이 관찰되었습니다. 대조적으로, 빈 pcDNA3.1 플라스미드와 Gs(short)-CASE 단백질 센서로 형질감염된 HEK wt 세포는 이소프로테레놀 자극에 대해 역이지만 낮고 유의하지 않은 반응을 보였습니다(그림 3B). 이 프로토콜에서는 15분의 리간드 자극 후에 얻은 값이 표시됩니다. 결과의 일관성과 시간 선택과의 독립성을 보장하려면 다른 시점을 테스트하여 평형에 도달했는지 확인해야 합니다. 또한 서로 다른 실험의 결과를 비교하려면 각 실험의 활성화 동역학에 따라 시간 선택을 조정해야 합니다.
그림 3C에 표시된 S상 용량-반응 곡선을 생성하기 위해 자극 후 15분(고원이 안정화될 때)에 측정된 ΔBRET 값을 서로 다른 리간드 농도에 대해 플로팅했습니다. 관찰된 EC50(9.4nM ± 2.1nM)은 이소프로테레놀(13nM ± 6nM)13,14에 대한 수용체의 알려진 Kd의 범위 값에 있습니다(그림 3C,D). 이러한 결과는 β2-AR의 존재와 특히 관련된 관찰된 반응으로 G 단백질 활성화를 평가하는 G-CASE 센서의 효율성을 보여줍니다.

그림 3: HEK wt 세포에서 GS 단백질 센서 평가. GS 단백질 센서 및 β2-AR(A) 또는 pcDNA3.1(B)로 형질감염된 HEK wt 세포에 작용제 이소프로테레놀을 첨가했을 때의 동역학 ΔBRET 판독값. (C) 다양한 리간드 농도에서 15분 리간드 자극 후 ΔBRET(%) 값을 피팅하여 얻은 용량-반응 곡선. (D) 이소프로테레놀로 자극된 대조군 pcDNA3.1 및 β2-AR 형질감염 세포 사이의 ΔBRET 최대값 비교. pcDNA3.1 조건에 대한 통계적 차이는 비모수 Mann-Whitney 테스트(**p < 0.01)를 사용하여 테스트되었습니다. 데이터는 이중으로 수행된 세 가지 독립적인 실험의 평균 ± SEM을 보여줍니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
둘째, 바이오센서는 CB1R을 안정적으로 발현하는 HEK 293T 세포주인 HEK CB1 세포에서 테스트되었습니다. 이 세포는 Gi3-CASE 단백질 센서로 일시적으로 형질감염되었습니다. CB1R 작용제 WIN-55,212-2를 사용한 자극은 농도 의존성 ΔBRET 신호를 유도하여 Gi3 경로의 활성화를 나타냅니다(그림 4A). 대조적으로, Gi3-CASE 단백질 센서로 형질감염되고 동일한 조건에서 자극된 HEK wt 세포는 어떠한 반응도 나타내지 않아 CB1R 활성화의 특이성을 확인했습니다(그림 4B). 리간드 활성화 후 약 5분에 정체기에 도달했습니다. 해당 용량-반응 곡선은 HEK-CB1 세포에서 WIN-55,212-2 자극에 의해 유도된 농도 의존적 ΔBRET 반응을 강조한 반면, HEK wt 세포에서는 그러한 반응이 관찰되지 않았습니다(그림 4C). 관찰된 EC50 (112 nM ± 25 nM)은 WIN-55,212-2 (354 nM ± 62 nM)15에 대한 수용체의 알려진 EC50의 범위 값 내에 있습니다 (그림 4C, D). 마지막으로, HEK CB1에서 10μM의 WIN-55,212-2로 작용제 자극 시 15분 동안 얻은 ΔBRET 값의 비교 및 HEK wt 세포는 Gi3 신호 전달 경로의 CB1R 의존성 활성화를 보여줍니다(그림 4D).

그림 4: HEK CB1 세포에서 Gi3 단백질 센서 평가. 작용제 WIN-55,212-2를 HEK CB1(A) 또는 HEK wt 세포(B)에 첨가했을 때의 동역학 ΔBRET 판독값. 리간드 농도(C)에 대해 15분의 리간드 자극 후 ΔBRET(%) 값을 피팅하여 얻은 용량-반응 곡선. WIN-55.212-2(D)로 자극된 대조군 HEK wt와 HEK CB1 세포 간의 ΔBRET 최대값 비교. HEK wt 조건에 대한 통계적 차이는 비모수 Mann-Whitney 테스트(****p < 0.0001)를 사용하여 테스트되었습니다. 데이터는 이중± 수행된 5개의 독립적인 실험의 평균 SEM을 보여줍니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개할 것이 없습니다.
이 프로토콜은 G 단백질 결합 수용체 리간드 자극 시 살아있는 HEK293 세포에서 G 단백질 활성화를 실시간으로 측정하기 위한 BRET 기반 바이오센서의 사용을 설명합니다. 여기서, β2-아드레날린성 수용체와 칸나비노이드 1형 수용체는 여러 G 단백질 아형과 다양한 GPCR에 걸쳐 센서의 효율성을 입증하는 예로 사용됩니다.
HEK-CB1 세포는 M. Guzman(Complutense University, Madrid, Spain)의 친절한 선물이었고 β2-아드레날린성 수용체 플라스미드는 D. Perrais(IINS, Interdisciplinary Institute for Neuroscience, Bordeaux, France)의 친절한 선물이었습니다. Gi3-CASE 및 Gs(short)-CASE는 Gunnar Schulte(Addgene plasmid # 168122; Addgene 플라스미드 # 168124). 일부 일러스트레이션은 BioRender.com 를 사용하여 제작되었습니다. 이 작업은 프랑스 Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche와 프랑스 국립 연구 기관(ANR) PolyFADO(ANR-21-CE44-0019), AlzCaBan(ANR-24-CE44-4647) 및 SCHIZOLIP(ANR-22-CE44-0034)의 자금 지원을 받습니다.
| 고급 96웰 배양판, 흰색에 투명한 평면 바닥, 뚜껑 포함, Greiner bio-one | 더처 | 655983 | |
| 브라이트맥스 클리어라인 화이트 필름 | 더처 | 760245 | |
| 클라리오스타 LVF | BMG 랩텍 | ||
| 디메틸 설폭사이드 (DMSO) | 시그마 | D4540 | |
| DPBS 개조, 염화칼슘과 염화마그네슘 없이 액체, 멸균 여과, 세포에 적합 | 시그마 | D8537 | |
| 둘벡코 수정된 독수리' s 미디엄 (DMEM) 글루타맥스 | 시그마 | D0822 | 37도 온도에서 따뜻함; 사용 전 C 수조 |
| 태아 소 혈청(FBS) | 시그마 | F9665 | |
| 알파<서브>i3서브>-Nluc-Gbeta1-Ggamma2-금성 | 애드진 | 168122 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ 군나르 슐테의 선물 |
| Galphas(짧은 아이소폼)-Nluc-Gbeta3-Ggamma1-금성 | 애드진 | 168124 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ 군나르 슐테의 선물 |
| HEK-293T 안정적으로 CB1R 발현 (HEK CB1) | M. 구즈만(콤플루텐세 대학교, 마드리드, 스페인)의 친절한 기부입니다. | ||
| HEK-293T 야생형 (HEK 중량) | |||
| 이소프로테레놀 | 시그마 | I6504 | H20에 용해되어 &ndash에 저장됨; 20 & deg; C |
| 리포펙타민 2000 | 인비트로젠 | 11668019 | |
| 옵티-MEM I 저감혈청 중량 글루타맥스 보충제 | 피셔 | 11564506 | |
| pcDNA3 플래그 베타-2-아드레날린-수용체 태그 FLAG C-ter | D. 페레의 친절한 기부(IINS, 보르도) | ||
| pcDNA3.1-(empty)-TAG | 애드진 | 138209 | |
| 페니실린/스트렙토마이신 | 시그마 | P4333 | |
| 폴리-L-라이신 용액(PLL) | 시그마 | RNBL7086 | |
| 트립신-EDTA | 시그마 | T3924 | |
| 승률 55,212-2 | 케이맨 케미컬스 | 10009023 | DMSO에 용해되어 &ndash에 보관; 20 & deg; C |