June 17th, 2009
이 동영상은 문서 해안 해양 물 샘플을 수집 및 바이오 매스 농도, 핵산 정화, 세포 풍부, 영양 및 추적 가스 분석 등 다양한 어플 리케이션을위한 스트림을 처리하는 방법을.
안녕하세요, 저는 브리티시 컬럼비아 대학교 미생물학 및 면역학과 스티븐 할람 연구실의 엘레나 코바입니다. 오늘은 물리적, 화학적, 생물학적 분석을 위해 바닷물을 수집하는 절차를 보여 드리겠습니다. 우리는 실험실에서 이 절차를 사용하여 해양 물의 해양 그래픽 매개변수를 연구합니다.
시작하겠습니다. 먼저 각 캐스트의 캐스트 수와 깊이가 할당되고, 그 다음에는 샘플링할 깊이가 할당되고, 현재 캐스트에 대해 수집될 총 볼륨이 결정됩니다. go flow 및 kin-water samp링 장치가 열린 위치에 있고 모든 밸브와 꼭지가 닫혀 있습니다.
CTD를 라인 바닥에 부착하고 프로필에서 가장 깊은 깊이를 위해 물 속으로 내립니다. CTD 직후 라인에 샘플링 장치를 가져옵니다. 라인이 장치 브래킷에 제대로 끼워져 있고 나사가 조여졌는지 확인하십시오.
물 속으로 내리기 전에 가장 깊은 샘플링 깊이를 제외한 각 장치에 가중 메신저를 부착하십시오. 첫 번째 지정된 깊이와 다음 깊이 사이의 선과 거리를 낮추고 다른 샘플링 장치를 장착합니다. 대량의 물 샘플이 수집되는 깊이 간격의 경우 총 2개의 x 12리터 병이 약 0.75미터 간격으로 연속적으로 적재됩니다.
모든 장치가 라인에 연결된 후 라인을 가장 깊은 깊이로 낮추고 2분이 경과할 때까지 기다립니다.메신저를 보내 각 장치를 닫는 위치로 트립합니다. 라인을 복구하기 전에 몇 분이 지나갈 수 있습니다.
모든 장치가 닫혀 있는지 확인하려면 라인을 감고 물에서 나올 때 각 장치를 데크에 내립니다. 단백질 DNA 또는 RNA 정제를 위해 많은 양의 시료가 필요한 깊이의 경우 두 개의 샘플링 장치를 동시에 사용할 수 있습니다. 한 병에서 즉시 RNA를 수집하여 선박에서 여과합니다.
다른 병에 담긴 화학 물질과 영양소를 샘플링한 후 남은 물을 차 안으로 배출하여 20리터의 최종 부피를 생성합니다. 소량 시료의 경우, 여과를 위해 1리터의 물을 멸균 Nalgene 병에 담아 두십시오. 일반적으로 16 깊이 간격의 저용량 샘플은 16 x 1 리터 샘플로 수집되고 6 x 20 리터 샘플은 대용량 샘플로 수집됩니다.
가스 샘플을 채취할 때는 항상 산소 및 미량 가스 샘플을 채취하십시오. 먼저 물 샘플링 장치의 꼭지에 얇은 튜브 조각을 부착합니다. 튜브의 다른 쪽 끝을 glos 세럼 병에 넣습니다.
세럼 병을 세 번 헹굽되 물을 샘플링하고 기포가 없도록 넘칠 때까지 채웁니다. 50마이크로리터의 염화수은을 혈청 병에 추가합니다. 샘플에 기포가 유입되지 않도록 주의하십시오.
고무 마개 C로 혈청 병을 밀봉하고 알루미늄 캡으로 압착한 다음 얼음에 보관하여 질산염, 인산염 및 규산염을 포함한 영양소 측정을 위한 샘플을 수집합니다. 먼저 60cc 주사기를 샘플 물로 헹굽니다. 그런 다음 0.2마이크로미터 아크로 디스크 필터를 일렬로 부착합니다.
주사기를 통해 약 2ml의 물을 밀어 넣습니다. 필터를 제거합니다. 폴리에틸렌 병에 약 10ml의 정수된 물을 세 번 헹굽니다.
헹굴 때 병을 흔든 다음 여과된 샘플을 병에 약 3/4 정도 채웁니다. 샘플을 얼음에 보관하십시오. 암모니아 측정을 위한 샘플을 수집하기 위해 원위 물의 수집 튜브를 비웁니다.
먼저 수집 튜브를 헹굽니다. 그러나 물을 완전히 샘플링합니다. 10ml 눈금이 매겨진 실린더에 샘플 수도관을 채우고 눈금이 매겨진 실린더에서 5ml의 샘플 물을 추출하고 실린더에서 나머지를 비웁니다. 그런 다음 5ml를 빈 실린더에 다시 추가합니다.
모든 깊이의 샘플이 각 튜브에 7.5ml의 암모늄 작업 시약으로 수집되었습니다. 세포 수를 위한 샘플을 수집하려면 5.4ml, 37% 형식 높이가 포함된 사전 라벨링된 50ML Falcon 튜브를 50% 최종 농도를 위해 4% 튜브가 넘치지 않도록 주의하십시오. 샘플을 수집하기 위해 샘플을 얼음에 보관하십시오.
황화수소 측정용. 3ml, 20%아연 아세테이트가 들어 있는 사전 라벨링된 50ML Falcon 튜브를 맨 위에 채웁니다. 튜브가 넘치지 않도록 주의하십시오.
소량을 수집하기 위해 샘플을 얼음에 보관하십시오. 바이오매스 농축용. 1리터의 Nalgene 병을 맨 위로 채우면 바이오매스 농도를 위해 많은 양을 수집할 수 있습니다.
20리터 카보이를 맨 위까지 채웁니다. 해수 샘플링의 최종 결과는 약 32에서 48입니다. 가스 샘플, 32 암모늄 샘플.
16개의 황화수소 샘플.세포 계수를 위한 16개의 샘플. 20리터 승용차 6대, 1리터 병 16개, 스테렉스 4개.
포인트 2: 미생물 바이오매스를 포함하는 2개의 마이크로미터 필터는 나중을 위해 보존됩니다. RNA 분리. 지금까지 생화학 분석을 위해 다양한 종류의 물 샘플을 수집하는 방법을 시연했습니다.
이를 위해서는 많은 준비와 계획이 필요합니다. 따라서 여행을 떠나기 이틀 전에는 물건을 정리하고 하루는 청소를 위해 예산을 세우고, 바닷물이 퍼럴트 펌프나 현장 장비를 운반하는 데 사용되는 알루미늄 자고 상자에 닿지 않도록 하십시오. 장비를 존중하는 마음으로 다루면 앞으로 오랫동안 잘 사용할 수 있습니다.
그게 다야. 시청해 주셔서 감사드리며 실험에 행운을 빕니다.
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이 비디오는 해양 표면수 샘플 수집 방법과 바이오매스 농도, 핵산 정제, 세포 밀도, 영양소 및 미량 가스 분석을 포함한 다양한 후속 응용 프로그램을 위해 샘플을 처리하는 방법을 문서화합니다.
Robust seawater sampling and collection protocols are foundational for generating high-quality datasets in marine biopharma discovery, enabling accurate assessment of environmental variables and biological materials. These methods underpin downstream analyses such as nucleic acid purification, cell abundance quantification, and nutrient profiling, which are critical for target validation and mechanistic de-risking in marine-derived drug discovery. Standardized collection ensures reproducibility and comparability across discovery programs, supporting portfolio-wide decision-making.
Seawater sampling and collection methods are positioned at the front end of the marine biopharma discovery continuum, providing foundational material for workflows spanning target validation, screening, and translational research.