March 2nd, 2009
GFP - 퓨전 단백질은 널리 공촛점 현미경에 의해 organelles을 시각화하는 데 사용됩니다. 그러나, organelles의 형태에 영향을 변이에 대한 검사는 일반적으로 개별적인 돌연변이 유발이 필요하며 시간이 소요됩니다. 여기, 우리는 동시에 효모 거의 5000이 아닌 필수적인 유전자에 organelle - GFP 표식을 통합하는 방법을 보여줍니다.
이 절차는 먼저 세포 라인을 성장시킨 다음 새로운 플레이트에 어레이를 핀아웃하여 CP one GFP의 어레이를 준비하는 것으로 시작합니다. 동시에 DMA의 새 복사본을 준비합니다. 다음으로 ACP one GFP 어레이를 DMA에 결합하고 이배체를 선택한 다음 포자 형성 배지에서 포자화합니다.
5일 후, Myotic 자손은 LRK 배지에서 발아하며, MAT A haplos만 자랍니다. 두 차례의 추가 선별을 통해 ACP one GFP와 캔 마이신에서 녹아웃된 유전자를 모두 보유한 하플로 세포를 회수합니다. 마지막으로, 플레이트에서 직접 개별 균주를 선택하고 컨포칼 현미경으로 미토콘드리아 형태를 관찰할 수 있습니다.
안녕하세요, 저는 브리티시 컬럼비아 대학교 생명 과학 연구소 세포 및 발달 생물학과 법률 연구소의 Chap T입니다. 안녕하세요, 저는 대출 연구소의 Jesse Chao입니다. 오늘은 로봇 시스템을 사용하여 효모의 다양한 돌연변이 배경에 GFP 마커를 통합하기 위한 고처리량 방법을 보여드리겠습니다.
우리는 실험실에서 이 절차를 사용하여 D, 소포체 및 미토콘드리아와 같은 소기관의 형태를 연구합니다. 시작하겠습니다. 이 프로토콜에는 두 가지 다른 효모 균주를 사용합니다.
CP one GFP는 플라스미드 PKT 1 28을 이용한 A PCR 매개 상동 재조합에 의해 생성되는 ACP one의 C 말단 GFP 태깅을 갖는 균주이다. 변형 배경은 BY 7 0 4 3입니다. 우리는 또한 DMA 균주 또는 결실 돌연변이 어레이를 사용하는데, 이는 비필수 유전자의 약 5,000개의 결실 돌연변이 배열입니다.
이러한 모든 비필수 유전자는 G four 18에서 녹아웃되었습니다. 어레이의 변형 배경은 BY 47 41입니다. 시작하려면 하룻밤 동안 ACP 1 GFP 배양액 5ml를 히스 플레이트에 부어 ACP one GFP 세포의 Alan을 성장시킵니다.
접시가 화염이나 생물학적 흄 후드에서 충분히 건조되도록 합니다. 건조되면 접시를 섭씨 30도에서 밤새 배양합니다. 배양 후 로봇을 사용하여 A CP one GFP 균주를 플레이트당 1,536개의 콜로니로 배열합니다.
동시에 YPDG 4개의 18 플레이트에 복제 고정하여 DMA의 새 복사본을 준비합니다. 그 후, 균주가 자란 후 밤새 섭씨 30도에서 플레이트를 배양합니다. YPD 플레이트에 콜로니를 복제하여 고정하고 오버레이하여 DMA와 함께 A CP one GFP 균주를 만들고 밤새 섭씨 30도에서 플레이트를 배양합니다.
배양 복제 플레이트 후, SD 아래의 콜로니는 배치된 세포를 선택하기 위해 G 4개의 18 플레이트를 쉿쉿 소리를 내며 밤새 섭씨 30도에서 플레이트를 배양합니다. 포자 형성 및 발아 첫 번째 복제 플레이트를 시작하기 위해 이배체를 YPDG 4 개의 18 플레이트 상에 올려 다음 단계에서 포자 형성의 효율성을 높입니다. 하루 복제 플레이트를 위해 섭씨 30도에서 배양한 후, 이배체는 근세포 포자의 형성을 유도하기 위해 감소된 수준의 탄소 및 질소 공급원을 포함하는 향상된 포자 형성 배지에 상륙합니다.
다음으로, 최소 5일 동안 섭씨 25도에서 플레이트를 배양합니다. 배양 후 매트를 발아시키고, LRK 배지에 식민지를 복제하여 myotic 자손을 발아시킵니다. 이 배지는 포자에서 타블로이드 세포의 발아를 유도하고 GFP 대립 유전자와 단일 돌연변이 대립 유전자를 모두 운반하는 세포를 선택하기 위해 2 일 동안 섭씨 30도에서 플레이트를 배양합니다.
Matt A 세포는 유전자 결실을 운반하는 하플로 세포를 선택하는 4개의 18 배지 아래에 복제 도금되어 이 플레이트를 섭씨 30도에서 하룻밤 동안 배양합니다. 다음 복제 플레이트, 매트, 단일 돌연변이의 성장을 위해 선택하기 위해 L-H-R-K-G 4 개의 18 배지에 miotic 자손. 그것은 또한 ACP one GFP가 섭씨 30도에서 밤새 부화하는 것을 품고 있습니다.
그런 다음 플레이트를 섭씨 4도에서 최대 3개월 동안 보관할 수 있습니다. 플레이트에서 직접 CP one GFP를 발현하는 원하는 돌연변이를 시각화하려면 먼저 플레이트에서 원하는 콜로니를 선택합니다. 섭씨 30도에서 세포를 성장시키고 YPD 또는 SD 히스 배지를 초기 로그 단계로 성장시킵니다.
마지막으로, 이 컨포칼 이미지에서 GFP 필터가 설정된 컨포칼 현미경을 사용하여 돌연변이를 시각화하고, ACP one GFP 마커가 있는 돌연변이와 야생형을 컨포칼 현미경으로 시각화하여 미토콘드리아 형태를 연구했습니다. 이 특정 돌연변이는 파괴된 미토콘드리아 표현형을 나타내므로 추가 연구를 위한 좋은 후보입니다. 우리는 로봇 시스템을 사용하여 다클론 마커, CP one GFP를 삭제 돌연변이 어레이에 효율적으로 통합하는 방법을 보여드려야 했습니다.
이 절차를 수행할 때 미디어를 새로 만들고 장소가 건조될 충분한 시간을 확보하는 것이 중요합니다. 너무 습하면 결로가 형성되어 오염 가능성이 높아집니다. 또한 모든 선택 미디어가 이 프로토콜에 중요하므로 올바르게 만들어졌는지 다시 확인해야 합니다.
이 절차는 다른 유형의 마커에도 사용할 수 있습니다. 예를 들어, er을 시각화하기 위해 우리는 일상적으로 air 11 및 GSP 마커를 사용합니다. 그게 다야.
시청해 주셔서 감사드리며 실험에 행운을 빕니다.
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이 연구는 효모의 거의 5,000개의 비필수 유전자에 오르가넬-GFP 마커를 통합하는 방법을 제시하여 오르가넬 형태의 시각화 과정을 간소화합니다. 이 접근법을 사용하여 연구자들은 오르가넬 구조에 영향을 미치는 돌연변이를 효율적으로 스크리닝할 수 있습니다.
This high-throughput yeast organelle morphology method enables systematic interrogation of gene function in organelle biogenesis, supporting target validation in early discovery. By integrating robotic array handling with dual-marker selection, it delivers scalable, reproducible phenotypic data for mechanistic de-risking of genetic hits. The approach accelerates pathway mapping and prioritization of targets affecting mitochondrial or ER function in preclinical programs.
The method fits within early discovery to lead identification by providing organelle morphology data that informs target confidence and pathway relevance before compound screening.