Name: 자연과 실험실에서 미생물 커뮤니티 - 인터뷰 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00.000+00:00
Duration: 29 min 13 s
Description: 배우세요 미생물과 환경의 상호작용을 메타게놈학과 생물공학을 통해 연구하는 방법을. MIT의 Ed DeLong 교수가 자연과 실험실에서 미생물 커뮤니티의 역할과 유전적 다양성을 탐구하는 혁신적인 연구 접근법을 설명합니다.

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자연과 실험실에서 미생물 커뮤니티 - 인터뷰

Microbial Communities in Nature and Laboratory - Interview

제 이름은 Ed DeLong이며, 매사추세츠 공과대학교의 교수입니다. 저는 실제로 토목 및 환경 공학과 생물 공학 두 곳에 겸임 교수로 재직하고 있는데, 두 분야가 매우 다르기 때문에 다소 이례적인 조합으로 보일 수 있습니다. 저희 연구의 한 측면은 환경, 특히 미생물과 관련이 있으며, 미생물이 환경에 어떤 영향을 미치는지, 그리고 환경이 미생물에 어떤 영향을 미치는지에 관한 것입니다. 이것이 저희 프로그램의 토목 및 환경 공학, 즉 환경 분야에 해당하는 내용입니다.저희가 연구하는 또 다른 분야는 생물 공학과 더 밀접한 관련이 있습니다. 미생물을 움직이게 하는 요인은 무엇일까요? 미생물은 어떻게 구성되어 있을까요?미생물을 구성하는 서로 다른 부분들, 즉 미생물 개체나 미생물 군집이 어떻게 시너지 효과를 내며 함께 작동할까요? 따라서 이 두 분야 사이의 일종의 연합은 상당히 잘 작동합니다. 저의 구체적인 배경은 일반 미생물학이며, 여기에 해양학이 약간 접목되어 있습니다.저는 UC Davis에서 세균학 학사 학위를 받았으며, 이후 Scripps 해양연구소에서 박사 학위를 취득했습니다. 믿기 어려우시겠지만, 제 박사 전공은 사실 해양 생물학입니다.그리고 저는 지금 MIT에 있습니다. 어떻게 이런 일이 가능했을까요? 미생물학 분야는 매우 빠르게 변화해 왔습니다.그리고 현재 우리가 미생물에 대해 이해하고 있는 방식에 큰 영향을 미친 요인 중 하나는 바로 유전체학 분야의 기술적 발전이었습니다. 일반적으로 미생물은 현미경으로 관찰했을 때 정체를 식별하기가 매우 어렵습니다. 모양과 크기가 다양하긴 하지만, 그것만으로는 해당 생물체가 무엇인지 또는 어떤 활동을 하고 있는지에 대해 많은 정보를 얻을 수 없습니다.따라서 일반적으로 미생물학자들은 주로 실험실에서 미생물을 관찰하는 역할에 머물렀으며, 이는 매우 강력한 방법이었습니다. 이는 일종의 의학 미생물학에서 파생된 것입니다. 즉, 화학 물질을 분리하는 것과 마찬가지로 환경에서 미생물을 분리할 수 있습니다.이렇게 순수 배양된 미생물, 즉 단일 미생물 종을 확보하고 나면 해당 종의 표현형과 특성, 그리고 환경 내에서 기능할 수 있게 하는 다양한 속성 등에 대해 학습할 수 있습니다. 하지만 전체 미생물 세계를 이해하는 관점에서 보면 여기에는 두 가지 문제가 있습니다. 바로 실험실 내의 미생물이 실제 환경에서 보이는 것과 항상 동일하게 행동하지는 않는다는 점입니다.그리고 더 큰 또 다

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Research

연구

JoVE Journal

Biology

생물학

흰개미 - 굿 미생물 커뮤니티 미생물 사이의 복잡한 상호 작용을 공부하고있는 훌륭한 시스템입니다 왜 제라드 레드 버터는 설명합니다. 호스트 곤충과 lignocellulose - 굴욕 굿 미생물 사이의 기존의 공생 관계는 물론 굴욕적인 식물 바이오 매스 및 바이오 연료 생성 이러한 미생물의 산업 사용으로 설명합니다.

인터뷰 - 마이트의 H​​indgut에서 미생물 커뮤니티를 조사

미생물 커뮤니티의 생물학 - 인터뷰

필드에서 식물 뿌리의 발굴 뿐만 아니라 endosphere, rhizosphere, 및 토양 샘플의 처리는 DNA 추출 및 데이터 분석 방법 등 자세하게에서 설명 되어 있습니다. 이 문서는 토양, endosphere, rhizosphere microbiomes의 연구에 대 한 이러한 기법을 사용 하 여 다른 실험실을 사용 하도록 설계 되었습니다.

절연 및 토양, Rhizosphere, 및 다년생 잔디 실험에 뿌리에서 미생물 커뮤니티의 분석

토양의 불투명도로 인해 구성 미생물 간의 상호 작용은 세포 분해능으로 쉽게 시각화 될 수 없습니다. 여기에서는 곰팡이 - 미생물 상호 작용을 조사하기위한 새로운 기회를 제공하는 두 가지 미세 유체 도구가 제시됩니다. 이 장치는 다재다능하고 사용하기 쉬우므로 세포 수준에서 높은 시공간 제어 및 고해상도 이미징이 가능합니다.

세포 수준에서 곰팡이 - 미생물 상호 작용을 조사하기위한 미세 유체 도구

퇴비 소우주는 자연에서 발견되는 미생물 다양성을 실험실로 가져와 Caenorhabditis elegans의 미생물 군집 연구를 용이하게합니다. 여기에는 소우주 실험을 설정하기위한 프로토콜이 제공되며, 실험은 환경 미생물 다양성과 벌레 장내 미생물 구성 간의 관계를 탐구하기 위해 환경 미생물 다양성을 조절하는 능력을 보여줍니다.

Caenorhabditis elegans의 마이크로바이옴 연구를 위한 미생물적으로 다양하고 자연과 유사한 환경으로서의 소우주를 퇴비화

우리는 미생물군 및 생물막과 함께 식물 및 곰팡이 바이오매스를 포함하는 매우 이질적이고 섬세한 샘플을 시각화하기 위한 최적화된 주사 전자 현미경 프로토콜을 제안합니다. 이 프로토콜을 사용하면 미생물군 조직의 공간적 차원을 설명할 수 있습니다.

Attine Ants' Gardens의 미생물군: 주사 전자 현미경을 통한 미생물 풍경 시각화

크리스토퍼 CW 휴즈는 체외에서 angiogenesis 공부에 대한 자신의 문화 시스템의 유틸리티를 설명합니다. 그는 지점, 적절한 루멘을 형성하고, anastamosis를 받아야되는 내피 세포가 문화의 혈관 형성하도록 중요한, 아직 미확인, 용해 계수를 분비 섬유아 세포의 중요성을 설명합니다.

크리스토퍼 휴즈 : Angiogenesis 연구를위한 체외 모델 (인터뷰)

Microfluidics를 사용하여 세균 Chemotaxis의 연구 - 인터뷰

이 인터뷰에서 박사 린드 퀴 스트는 단백질 접힘, 프리온 질환과 neurodegenerative 질환 사이의 관계를 설명합니다. 단백질 폴딩의 문제는 현대 생물학의 핵심에 있습니다. 그들의 전통적인 생화 학적 기능 이외에, 단백질은 생물 학적 정보의 전송을 중재하고 따라서 유전 물질로 간주 될 수 있습니다. 단백질의이 최근에 발견된 기능은 인간의 장애 연구에 중요한 의미가 있습니다. 린드 퀴 스트 박사는 또한 모델 생물의 유전 연구를 기반으로 neurodegenerative 질병의 메커니즘을 조사하기 위해 현재의 실험 방법을 설명합니다.

인터뷰 : 단백질 폴딩과 Neurodegenerative 질병의 연구

주로 monolayer 문화 - - 종종 차별화된 기본 세포가 상대적으로 짧은 수명을했고 문화 중에 드 차별되는 단점을 앓고 체외 배양 시스템에서 과거 많은에서. 그 결과, 그들의 장기 특정 기능의 대부분은 급속하게 손실되었다. 따라서 체외에서 이러한 세포에 대한 더 나은 조건을 재현하기 위해, 수정 및 adaptations는 기존 monolayer의 문화되었습니다.

인터뷰 : 줄기 세포 연구에 대한 Bioreactors와 분수 - 수정된 3D - 공사장 공중 발판

배우세요 미생물과 환경의 상호작용을 메타게놈학과 생물공학을 통해 연구하는 방법을. MIT의 Ed DeLong 교수가 자연과 실험실에서 미생물 커뮤니티의 역할과 유전적 다양성을 탐구하는 혁신적인 연구 접근법을 설명합니다.

자연과 실험실에서 미생물 커뮤니티 - 인터뷰

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