Why is null hypothesis testing critical for viable cell count comparisons?

Null hypothesis testing enables objective evaluation of whether observed differences in viable bacterial counts between wild-type and cellulose-deficient strains are statistically significant, supporting robust target validation decisions.

How does independent variable isolation improve root colonization assays?

Isolating variables such as cellulose production allows teams to attribute changes in root colonization directly to specific genetic or biochemical factors, increasing mechanistic clarity in the discovery pipeline.

What do quantitative dependent variable measurements enable in this protocol?

Quantitative measurement of viable cell counts provides reproducible data for comparing bacterial adhesion and colonization, enabling reliable assessment of intervention effects and supporting data-driven advancement decisions.

Why are replication requirements important for cross-functional collaboration?

Replication ensures that viable cell count results are consistent and reproducible across teams, facilitating cross-functional data integration and increasing confidence in portfolio-level decisions.

What statistical analysis capabilities are needed before implementing viable count assays?

Teams require statistical tools to analyze differences in viable counts, assess significance, and control for experimental variability, ensuring that assay outputs support rigorous R&D decision-making.

생존 세포 수를 이용한 병원성 박테리아에 의한 토마토 묘목의 뿌리 정착 평가

JoVE Encyclopedia of Experiments

Microbiology

0 views • 2:30 min • February 26th, 2026

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

멸균된 모래에서 키운 토마토 묘목을 담은 용기를 가져가세요.

묘목 뿌리는 셀룰로오스를 생성하는 야생형 또는 셀룰로오스 결핍 돌연변이 균주에 접종됩니다.

한 용기에서 밀봉 재료를 제거하고, 멸균지 위에 뒤집은 뒤, 식물이 들어 있는 모래 원통을 두드려 풀어줍니다.

모래 실린더를 길게 갈라서 뿌리를 드러내세요.

그 후 뿌리를 멸균 완충제에 담가 흔들어 느슨하게 붙은 박테리아를 떼어냅니다.

다른 뿌리에 대해서도 같은 과정을 반복하세요.

씻은 뿌리를 신선한 버퍼로 옮기세요. 소닉 처리를 해서 단단히 붙어 있는 박테리아를 방출하세요.

이 초음파 현탁액을 사용해 연속 희석물을 준비하고, 한천에 플레이트링한 뒤 배양하여 생존 가능한 박테리아가 집단을 형성할 수 있도록 합니다.

야생형 균주에서 셀룰로오스 결핍 돌연변이체보다 더 높은 생존 개체 수는 셀룰로오스 섬유가 뿌리 표면에 박테리아 부착을 촉진하는 데 중요한 역할을 함을 강조합니다.

모래에서 자란 식물에서 발견되는 생존 박테리아의 수를 확인하려면, 먼저 용기 위아래의 밀봉 재료를 제거하세요.

용기를 멸균된 종이 위에 올려놓고 용기를 표면에 살짝 두드려 모래를 느슨하게 한 뒤, 식물이 든 모래를 용기에서 부드럽게 들어 올립니다.

모래 원통과 식물이 종이 위에 자유롭게 나오면, 모래를 가운데로 갈라서 식물 뿌리를 드러냅니다. 원한다면 용기 가장자리와 뿌리 근처에서 모래 샘플을 채취하세요. 이는 박테리아의 확산, 축적, 성장을 파악하는 데 유용할 수 있습니다.

뿌리를 들어 올리고 느슨하게 붙어 있는 모래와 박테리아를 적절한 양의 물이나 버퍼에 담근 뒤 부드럽게 흔들어 제거합니다. 적절한 배지인 루리아 아가(Luria agar)에 도판하여 결과 부탁액 내 박테리아의 생존 가능한 세포 수를 확인한다. 이는 뿌리와 느슨하게 연관된 박테리아의 수를 나타냅니다. 마지막으로 초음파 검사로 단단히 결합한 박테리아를 제거하고 그 수를 측정합니다.