2011년 9월 16일
우리는 공장에서 단백질 - 단백질 상호 작용을 테스트하는 기술을 개발했습니다. 노란색 형광 단백질 (YFP은) 2 비 중복 조각으로 분할합니다. 각 조각은 융합 단백질의 표현을 활성화, 게이트웨이 시스템을 통해 관심의 유전자에 프레임에 복제됩니다. 심리 단백질이 상호 작용을 때 YFP 신호의 Reconstitution에만 발생합니다.
두 단백질 간의 상호작용을 테스트하려면, Gateway 클로닝 기술을 사용하여 관심 있는 두 유전자를 BF 및 벡터에 클로닝해야 합니다. 이 컨스트럭트들을 Agrobacterium GV3101에 형질전환합니다. 해당 컨스트럭트를 포함하는 GV3101 박테리아 배양액을 혼합하여 잎에 공동 침투시킵니다.
두 후보 단백질이 서로 상호작용하는 경우, 공초점 현미경을 사용하여 YFP 신호를 관찰할 수 있습니다. BFC 기법의 주요 목적은 두 단백질 간의 상호작용을 테스트하는 것입니다. vavo에서 당사는 연구자들이 BFC 및 이중 하이브리드 분석을 모두 쉽게 수행할 수 있도록 gateway 호환 BFC 및 이중 하이브리드 벡터 시리즈를 제작하였습니다.
이 영상에서는 BFC 시스템의 간편한 사용법을 시연하겠습니다. BiFC 발현 시스템에서 단백질 및 단백질 간 상호작용을 테스트하기 위해, 먼저 GV 3 1 0 1 박테리아 배양액을 준비해야 합니다.
플레이트에서 단일 콜로니를 선택하여 적절한 항생제가 포함된 5 mL의 YEB 배지에 접종합니다. 그런 다음 이 배양액을 28°C에서 하룻밤 동안 배양하며, 진탕 속도는 분당 200회(200 rpm)로 설정합니다.
박테리아 배양액은 다음 날 아침에 준비되어야 합니다. 박테리아가 과성장하지 않았는지 확인하십시오. 배양액을 인큐베이터에서 꺼내어 각 배양액의 일부를 멸균된 1.5 mL 원심분리 튜브에 옮깁니다.
원심분리 튜브를 데스크탑 원심분리기에 넣습니다. 실온에서 1000 G로 10분 동안 박테리아를 원심분리한 후 상층액을 제거합니다. 그런 다음 침투 배지 1배량을 추가하고 몇 번 가볍게 두드려 재현탁하여 펠렛을 세척합니다.
세척 단계를 두 번 더 반복하십시오. 이는 박테리아 배지에 남아 있는 항생제 흔적을 제거하는 데 중요하며, 제거하지 않을 경우 침투 후 식물 세포가 파괴될 수 있습니다. 최종 세척 후, 펠렛을 0.5 mL의 침투 배지에 재현탁하십시오. 침투 배지를 공시료로 사용하여 분광광도계로 이 박테리아 현탁액의 OD600을 측정하십시오.
OD 측정 후, 침투 배지를 사용하여 OD를 조정해야 합니다. 최종 OD는 1에서 1.2 사이여야 합니다. 다음 단계로 넘어가기 전에 모든 세균 현탁액을 준비하십시오.
두 가지 후보 단백질에 해당하는 동일한 양의 박테리아 현탁액을 옮겨 새 1.5 mL 튜브에 넣고 혼합합니다. 이제 박테리아 혼합물을 침투시킬 준비가 되었습니다. 모든 조합을 준비하고, 음성 대조군을 포함하는 것을 잊지 마십시오. 침투에는 5~6주 된 Nicotiana benthamiana 식물을 사용해야 합니다.
침투 전 기공을 열어주기 위해 식물을 생장실에서 꺼내 한 시간 동안 암조건에 둡니다. 이는 침투 과정을 돕습니다. 부유 상태의 박테리아 현탁액 약 100 µL를 취합니다.
바늘이 없는 수컷 슬립 팁 주사기를 사용하여 혼합합니다. 주사기 팁을 잎의 뒷면에 대십시오. 손가락으로 잎의 윗면을 받쳐 줍니다.
일반적으로 플런저를 아래로 누릅니다. 액체가 잎의 기공을 통해 확산되는 것을 확인할 수 있으며, 침투 후에는 중간 엽육 조직의 공극이 더 얇아진 느낌이 듭니다. 침투시킨 부위를 마커 펜으로 표시하십시오. 그렇게 하지 않으면 이틀 후에 어떤 부위에 침투시켰는지 식별할 수 없게 됩니다. 서로 다른 박테리아 혼합액을 침투시켜야 하는 경우, 반드시 장갑에 50% ethanol을 분사하거나 침투 작업 사이에 장갑을 교체하십시오.
교차 오염을 방지하기 위해 침투 지점 사이에 1m의 늑골 간격을 두십시오. 침투 후 5일까지 24시간마다 PFA 신호를 모니터링해야 합니다. 샘플을 고정하기 위해 서로 다른 크기의 커버 슬리브 두 개를 사용할 수 있습니다.
먼저, 노치 커버 슬리브 위에 미세 수분 한 방울을 떨어뜨립니다. 그런 다음 침투 구역 내의 조직 조각을 칼로 작게 절단합니다. 시료 내의 구역 정맥은 피하도록 주의하십시오.
절단된 칼 조직을 슬라이드 위 물속에 놓은 다음, 작은 커버글라스를 덮고 가볍게 누릅니다. 이제 시료를 현미경으로 관찰할 수 있습니다. 여기서는 BIFC 신호를 시각화하기 위해 NACA T CSS P two 공초점 현미경을 사용합니다.
일반적인 형광 현미경도 사용할 수 있습니다. 공초점 현미경은 더 나은 이미지를 제공하며 약한 신호를 검출할 수 있습니다. 이 NCAs P two 시스템에서 VFC 신호를 검출하려면 YFP 파라미터를 사용할 수 있습니다.
여기 있는 YFP 프리셋을 더블 클릭하면 여기에서 여기에서 여기에서 여기에서 여기에서 여기에서 여기에서 excitation이 자동으로 켜지고 emission 검출 범위가 설정됩니다. 다른 시스템을 사용하고 계신다면, 매뉴얼을 참조하여 파라미터를 적절하게 설정하시기 바랍니다. 이 영상을 시청하신 후, unbe MI Transcend 발현 시스템을 사용하여 단백질-단백질 상호작용을 테스트하기 위한 BFCE를 수행하실 수 있기를 바랍니다.
이 절차는 담배 및 AY 식물에도 적용할 수 있습니다. 당사의 BFC 벡터에는 각각 HA 및 flag 태그가 포함되어 있으므로, 필요한 경우 co IP를 수행하여 상호작용을 검증할 수 있습니다.
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본 연구는 분할 황색 형광 단백질(YFP) 기법을 이용하여 식물의 단백질-단백질 상호작용을 테스트하는 새로운 기술을 제시합니다. 관심 유전자와 프레임을 맞추어 YFP 조각들을 클로닝함으로써, 연구자들은 단백질 상호작용을 나타내는 YFP의 재구성을 관찰할 수 있습니다.
식물 시스템에서의 단백질-단백질 상호작용 분석은 농약 및 바이오 의약품 발굴 과정에서 표적 검증과 메커니즘의 리스크 감소를 지원합니다. Gateway 호환 BiFC 시스템은 정량적 형광 판독값을 통한 재현 가능한 in vivo 상호작용 스크리닝을 가능하게 하여, 초기 단계의 표적 평가에서 예측 신뢰도를 높여줍니다. 이러한 접근 방식은 간접 분석에 대한 의존도를 낮추고, 식물 생물학 팀과 중개 연구 팀 간의 교차 기능적 협업을 지원합니다.
BiFC 시스템은 초기 발견 연속체 내에 적합하며, 식물 기반 치료제 발견 과정에서 리드 물질 확인 단계 이전의 가설 검증 및 분석법 개발을 지원합니다.