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울트라 성능 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 (UPLC-MS)에 의해 혈청 대규모 비 타겟 Metabolomic ...
울트라 성능 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 (UPLC-MS)에 의해 혈청 대규모 비 타겟 Metabolomic ...
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JoVE Journal Chemistry
Large Scale Non-targeted Metabolomic Profiling of Serum by Ultra Performance Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (UPLC-MS)

울트라 성능 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 (UPLC-MS)에 의해 혈청 대규모 비 타겟 Metabolomic 프로파일

Full Text
13,526 Views
07:34 min
March 14, 2013

DOI: 10.3791/50242-v

Corey D. Broeckling1, Adam L. Heuberger1, Jessica E. Prenni1

1Proteomics and Metabolomics Facility,Colorado State University

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a protocol for non-targeted metabolite profiling of serum using ultra performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry (UPLC-MS). It details the workflow from sample preparation to data analysis and metabolite identification.

Key Study Components

Area of Science

  • Metabolomics
  • Mass Spectrometry
  • Biochemistry

Background

  • Non-targeted metabolite profiling is crucial for understanding metabolic processes.
  • UPLC-MS is a widely used technique for analyzing complex biological samples.
  • Quality control is essential for ensuring the reliability of analytical results.
  • Identifying small molecule biomarkers can aid in various biomedical research applications.

Purpose of Study

  • To establish a robust method for metabolite extraction and analysis.
  • To ensure analytical stability through quality control measures.
  • To facilitate the identification of biomarkers in serum samples.

Methods Used

  • Extraction of metabolites in a plate format.
  • Establishment of a quality control sample.
  • Mass spectral data acquisition on QC and randomized serum samples.
  • Data pre-processing and statistical analysis for metabolite identification.

Main Results

  • Successful profiling of metabolites in serum samples.
  • Identification of potential small molecule biomarkers.
  • Demonstration of the robustness of the UPLC-MS method.
  • Insights into metabolic variations in serum.

Conclusions

  • The protocol provides a reliable framework for non-targeted metabolite profiling.
  • Quality control measures enhance the reproducibility of results.
  • UPLC-MS is effective for identifying biomarkers in serum.

Frequently Asked Questions

What is non-targeted metabolite profiling?
It is a technique used to analyze a wide range of metabolites in biological samples without prior knowledge of their identities.
Why is quality control important in metabolite profiling?
Quality control ensures the reliability and reproducibility of the analytical results over time.
What role does UPLC-MS play in this study?
UPLC-MS is used to separate and identify metabolites in serum samples effectively.
How can the results of this study be applied?
The results can be used to identify small molecule biomarkers for various diseases and conditions.
What are the key steps in the metabolite profiling workflow?
Key steps include sample preparation, data acquisition, data analysis, and metabolite identification.
Is this method applicable to other biological samples?
Yes, the method can be adapted for various biological matrices beyond serum.

질량분석법(UPLC-MS)과 결합된 초고성능 액체 크로마토그래피에 의한 비표적 대사 산물 프로파일링은 대사를 조사하는 강력한 기술입니다. 이 문서에서는 시료 조직 및 준비, 데이터 수집, 데이터 분석, 품질 관리 및 대사 산물 식별을 포함하여 혈청의 비표적 대사 산물 프로파일링에 사용되는 일반적인 워크플로우를 간략하게 설명합니다.

이 절차의 전반적인 목표는 대규모 실험에서 혈청의 강력한 비표적 대사 산물 프로파일링을 수행하는 것입니다. 먼저 대사 산물을 플레이트 형식으로 추출합니다. 견고한 QC 시료 및 분석법을 확립하여 시간 경과에 따른 분석 안정성을 보장합니다.

그런 다음 복제에서 QC 및 무작위 혈청 샘플에 대한 질량 스펙트럼 데이터를 획득하고 데이터, 전처리, 통계 분석 및 대사 산물 식별을 진행합니다. U-P-L-C-M-S에 의한 비표적 대사 산물 프로파일링 결과는 혈청에서 저분자 바이오마커를 식별하는 데 활용될 수 있습니다. 혈청 분석을 위해 여기에 프로토콜이 제시되어 있습니다.

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대사체 프로파일링 비표적 분석 UPLC-MS 혈청 분석 워크플로우 시료 전처리 데이터 수집 품질 관리 대사체 식별

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