Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow

Gajendra W. Suryawanshi; Song Xu; Yiming Xie; Tom Chou; Namshin Kim; Irvin S. Y. Chen; Sanggu Kim

doi:10.3791/55812

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유전학

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양방향 레트로 바이러스 통합 사이트 PCR 방법론 및 정량적 데이터 분석 워크 플로

Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow

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Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow

양방향 레트로 바이러스 통합 사이트 PCR 방법론 및 정량적 데이터 분석 워크 플로

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12:53 min

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June 14, 2017

DOI:

10.3791/55812-v

DOI:

10.3791/55812-v

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12:53 min

June 14, 2017

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Gajendra W. Suryawanshi*^1,2, Song Xu*³, Yiming Xie¹, Tom Chou³, Namshin Kim⁴, Irvin S. Y. Chen^1,5, Sanggu Kim⁶

¹UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA)²Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA)³Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA)⁴Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology ⁵Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA)⁶Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)

Summary

이 원고는 상향 및 하향 벡터 - 숙주 접합 DNA를 동시에 분석 할 수있는 양방향 통합 사이트 분석을위한 실험 절차 및 소프트웨어 분석을 설명합니다. 양방향 PCR 제품은 모든 다운 스트림 시퀀싱 플랫폼에 사용할 수 있습니다. 결과 데이터는 통합 DNA 표적의 높은 처리량, 정량적 비교에 유용합니다.