Quantitative Analysis of Alternative Pre-mRNA Splicing in Mouse Brain Sections Using RNA <em>In Situ</em> Hybridization Assay

Xuan Guo; Yiqing Zhao; Hieu Nguyen; Tonghua Liu; Zhenghe Wang; Hua Lou

doi:10.3791/57889

대체 사전 mRNA 접합 교 잡 시험 현장에서 RNA를 사용 하 여 마우스 뇌 섹션에서의 정량 분석

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Genetics

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Quantitative Analysis of Alternative Pre-mRNA Splicing in Mouse Brain Sections Using RNA In Situ Hybridization Assay

대체 사전 mRNA 접합 교 잡 시험 현장에서 RNA를 사용 하 여 마우스 뇌 섹션에서의 정량 분석

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11:22 min

August 26, 2018

DOI: 10.3791/57889-v

Xuan Guo^1,2, Yiqing Zhao^1,3, Hieu Nguyen¹, Tonghua Liu², Zhenghe Wang^1,3, Hua Lou^1,3,4

¹Department of Genetics and Genome Sciences,Case Western Reserve University, ²Department of Endocrinology,Dongfang Hospital of Beijing University of Chinese Medicine, ³Case Comprehensive Cancer Center,Case Western Reserve University, ⁴Center for RNA Science and Therapeutics,Case Western Reserve University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

현장에서 교 잡 (ISH) 사용 하는 프로토콜 짧은 센스 oligonucleotides 마우스 뇌 섹션에 대체 이전 mRNA 접합 패턴을 감지 하는 설명 되어 있습니다.

이 방법은 대체 pre-mRNA 스플라이싱 분야의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 특히 조직 절편에서 현장에서 대체 접합 패턴을 검사할 수 있는 강력하고 민감한 분석 시스템을 제공합니다. 이 방법을 사용하면 마우스 뇌와 같은 복잡한 생물학적 구조에 포함된 많은 하위 유형에서 선택적 접합을 동시에 분석할 수 있습니다.

이 기술의 주요 장점은 mRNA in situ hybridization에서 충격 정전기 방지 엑손 접합 프로브를 사용하여 isoform 특정 hybridization 신호를 생성한다는 것입니다. 건물 신호 증폭 기술은 검출 감도를 높여 강력한 하이브리드화 신호를 제공합니다. 감지된 신호는 마우스 뇌의 다양한 해부학적 영역에서 바이탈의 백분율 스플라이스를 계산하는 데 사용되는 특정 프로브를 벗어나는 엑손 함유였습니다.

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