있도록 임상 사례 보고서에 대 한 메타 데이터 추출 방법 고급 생물 의학 개념의 이해

이 방법은 질병 증상, 진단 및 치료 절차 및 임상 사례 보고서에서 환자 결과에 대한 구조화 된 보기를 제공하여 질병 및 병리학에 대한 질문에 대답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 생물 의학 문헌의 모든 환자 코호트에 적용 될 수 있다는 것입니다. 희귀하거나 신흥 조건의 역학 연구를 보다 현실화합니다.

이 방법을 사용하면 후속 텍스트 분석 워크플로우가 보다 직관적이고 구현하기 쉽습니다. 풍부한 메타데이터로 텍스트 데이터 머신을 읽을 수 있도록 함으로써 임상 사례 보고서를 찾기 쉽고, 접근 가능하며, 상호 운용 가능하며, 재사용 가능하거나 공정한 데이터 리소스로 설정할 수 있습니다. 이 방법의 중심은 선택한 임상 사례 보고서에 포함된 모든 임상 정보를 추출하는 데 사용되는 메타데이터 템플릿이다.

그림과 같이 워크플로우를 따라 임상 사례 보고서 코퍼스의 조립이 허용됩니다. 임상 사례 보고서에서 의료 콘텐츠의 찾기 능력, 접근성, 상호 운용성 및 재사용성을 향상시킵니다. 제어된 어휘에서만 용어를 제공하는 대신 각 필드에 컨텍스트 세부 정보를 포함합니다.

일반적으로 반복되는 단어와 구를 생략합니다. 기여 템플릿에서 일반적으로 헤더에 있는 문서 내에서 식별된 특정 용어를 세미콜론으로 구분된 키 용어로 제공합니다. 인구 통계학적 가치를 제공합니다.

특히 성별 및/또는 성별, 연령 인종 또는 국적을 포함하여 환자의 배경을 설명하는 텍스트 진술. 특정 기관 주소 이외의 임상 내러티브 내에서 언급 된 지리적 위치를 제공합니다. 빈번한 환자 활동이나 일반적인 건강과 관련된 행동을 설명하는 텍스트 문을 포함하여 라이프 스타일 값을 제공합니다.

실제로, 이것은 자주 흡연 또는 알코올 소비 습관을 포함 하지만 또한 태양 노출을 포함 될 수 있습니다., 다이어트 또는 신체 활동의 특정 유형의 주파수. 형제 자매, 부모 및 기타 가족 구성원이 경험한 사건의 임상 관찰을 설명하는 텍스트 진술 및 사건을 포함하여 가족 역사를 언급하는 병력 가치를 제공합니다. 유전 적 조건과 부정적인 관찰뿐만 아니라.

인구 통계 학적 또는 라이프 스타일 섹션에서 다루지 않는 환자 배경을 설명하는 텍스트 문을 포함하여 사회 역사를 언급하는 값을 제공합니다. 진술에는 직업 역사와 사회적 습관이 포함될 수 있습니다. 임상 발표가 시작되기 전에 발생한 의료 관측, 치료 또는 기타 사건을 설명하는 텍스트 진술을 포함하여 환자의 의료 및 외과 병력을 참조하는 값을 제공합니다.

본표에 명시된 바와 같이 질병의 국제 통계분류 및 관련 건강 문제에 사용된 질병에 기초하여 다음 16개 질병 시스템 범주 중 하나 이상을 지정하고, 개정(10)을 표에 명시한다. 제공된 증상의 발병, 기간, 심각도 또는 해결에 대한 초기 프레젠테이션에서 시작되는 징후 또는 증상의 의학적 관찰을 설명하는 텍스트 진술을 포함한 모든 징후 및 증상에 대한 세부 정보를 제공합니다. 초기 임상 발표 시 존재하는 뚜렷한 질병을 설명하는 용어 나 문구를 포함하여 모든 comorbidities의 세부 정보를 제공합니다.

진단 목적으로 완료된 의료 절차의 이름을 포함하여 모든 진단 기술 및 절차에 대한 세부 정보를 제공합니다. 시험, 시험 및 상상력과 같은. 뿐만 아니라 시험이 수행 된 조건과 관련, 해부학 적 위치.

그러나 테스트 결과를 제외합니다. 진단에 대한 자세한 내용을 제공합니다. 질병의 진단을 설명하는 텍스트 문을 포함.

최종 진단이 모호하더라도. 모든 실험실 값과 테스트 결과를 제공합니다. 진단 테스트의 이름, 해당 값 및 테스트가 수행된 조건을 포함합니다.

수치및 정성적 값을 모두 사용할 수 있습니다. 병리학에 대한 세부 정보를 제공합니다. 병리학 및 조직학 연구의 모든 결과를 설명하는 텍스트 문을 포함.

총 병리학, 면역학 또는 현미경 연구와 같은. 일부 용어는 진단 기술 및 절차 섹션에서 사용되는 용어와 겹칠 수 있습니다. 모든 약리학 요법을 제공합니다.

치료 과정에서 사용되는 약물 요법과 치료가 언제 어떻게 중단되었는지를 설명하는 텍스트 진술을 포함하십시오. 항생제 또는 특정 약물 이름과 같은 일반적인 용어를 사용 하 여. 모든 중재 절차를 제공합니다.

치료 과정에서 사용되는 치료 절차와 절차가 중지 된 시기와 방법을 설명하는 텍스트 문과 침습적 인 절차도 포함하십시오. 다른 치료를 용이하게하기 위해 완료 의료 기기 또는 절차의 이식. 환자 결과를 제공합니다.

보고서에 설명 된 임상 프리젠 테이션의 끝으로 환자의 건강을 설명하는 텍스트 진술을 포함. 후속 테스트를 포함합니다. 그런 다음 모든 진단 이미지, 수치, 비디오 또는 애니메이션 및 테이블의 수를 제공합니다.

보고서에 포함된 모든 시각적 미디어를 표시된 형식으로 포함합니다. 그림과 이미지를 구별하려면 이미지를 임상 진단의 모든 제품으로 계산합니다. 사진, 마이크로 그래프, 심전도 리듬 이미지 또는 진단 이미징의 다른 제품을 포함합니다.

수치는 다른 모든 이미지로 간주되어야 합니다. 일반적으로 데이터 플롯 및 그림을 포함합니다. 이 표에서는 완료된 임상 사례 보고서 메타데이터 주석의 두 세트의 예가 표시됩니다.

첫 번째 예제에는 각 값의 이상적인 형식을 설명하는 모의 데이터가 포함됩니다. 두 번째 예제에는 희귀 한 조건에 대한 실제 간행된 임상 사례 보고서에서 추출 한 값을 포함하지만; 아크로피부염 장내병증. 이 방법은 무료 텍스트 임상 문서의 부기에 대한 인간 및 자동화 된 접근 방식을 모두 용이하게합니다.

구조화 된 메타데이터 표준 템플릿을 설정하여 여기에 포함된 정보에 액세스 가능하고 유용합니다. 이 메서드에서 생성된 메타데이터는 명명된 엔터티 인식과 같은 다운스트림 텍스트 분석을 지원합니다. 연구원이 생체 의학 문헌에 나타난 환자 코호트에 걸쳐 징후와 증상, 진단 기술 및 절차 및 실험실 값에 대한 정보를 추출할 수 있게 합니다.