Name: AFM 기반 힘 분광학을 위한 단일 분자의 공유 부착 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-03-16T14:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 37 s
Description: 학습하세요 AFM 기반 힘 분광학에서 단일 분자의 공유 부착 방법을. 플라즈마 처리, 실란화, 중합체 부착 단계를 통해 PEG, 폴리스티렌 등 다양한 중합체의 기계적 특성을 정밀 측정할 수 있습니다.

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B.N.B. 및 T.H.는 독일의 우수 전략에 따라 도이치 포르충제마인샤프트(DFG, 독일 연구 재단)의 자금 지원을 인정합니다 – EXC-2193/1 – 390951807, gefördert durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) im Rahmen der Exzellenzstrategie des Bundes und der Länder – EXC-2193/1 – 390951807, 및 부여 HU 997/1-13 (프로젝트 # 420798410). M.G.는 헤센 주 고등 교육, 연구 및 예술부의 LOEWE 프로젝트 iNAPO 의 프레임에서 부분적인 지원을 인정합니다. 우리는 고품질의 금 코팅 실리콘 웨이퍼의 기부에 대한 응용 솔리드 스테이트 물리학 IAF에 대한 프라운 호퍼 연구소에서 박사 볼프강 브로너와 아그네 주카우스카이트 박사에게 감사드립니다.

참고: 회로도 개요는 그림 1을 참조하십시오.
1. 시약 설정
참고 : 이 프로토콜에 사용되는 중합체는 다음과 같습니다 : 말미드 폴리에틸렌 글리콜 트리에톡시실란 (실란 - PEG-말, 5 kDa), 티올 폴리에틸렌 글리콜 티올 (HS-PEG-SH, 35 kDa), 티올 종단 폴리(N-isopropylacrylamide) (PNiPAM-SH, 637 kDa) 및 티올 종단 폴리스티렌 (PS-SH, 1.3 mDa).
<ol><li>원자 전달 라디칼 중합을 통해 잘 정의된 고 어금니 질량 PNiPAM-SH를 준비하고, 그 다음에 문헌18에기재된 바와 같이 티올 모에티의 도입을 위한 기능성 말단기의 전환 및 감소를 준비한다. 자세한 구조는 그림 1을 참조하십시오.</li>
	<li>화학 물질의 저장을 위해, 대기 산소와 습기에 노출을 피하기 위해 질소 분위기와 건조 글로브 박스 시스템 내에서 작은 aliquots을 준비합니다. PEG 및 PNiPAM은 흡습성45,,46 및 PEG, PNiPAM 및 PS의 기능적 단부가 주변 조건33,47,,48에서저장될 때 쉽게 산화되는 것으로 알려져 있다., 모든 화학 물질은 -20 °C에서 보관해야합니다.</li>
	<li>분석 등급 용매 이상사용. 또한 단일 분자 실험은 모든 오염에 매우 민감하기 때문에 초순수를 사용하여 AFM 캔틸레버 칩과 유리 제품을 헹구십시오.</li>
</ol>2. 장비 설정
참고: 핀셋과 비커는 스테인리스 스틸 또는 유리로 만든 사용주입니다. 안전한 그립을 위해 반전된 핀셋을 사용합니다(예: 낮은 스프링 상수를 갖는 모델 R3 SA).
<ol><li>유리 제품 및 핀셋을 청소하기 위해 RCA (초순수, 과산화수소 및 암모니아 (5: 1:1)) 솔루션을 준비하십시오.</li>
	<li>용기를 비커에 넣고 유리 제품이나 핀셋이 완전히 덮일 때까지 RCA로 채웁니다.</li>
	<li>80 °C에서 1 시간 동안 2.2 단계에서 비커를 가열합니다.</li>
	<li>매운 냄새가 더 이상 (적어도 세 번) 확인할 수 없을 때까지 초순수로 용기를 헹구는다.</li>
	<li>오븐 (120 °C)에 건조 유리 제품 및 핀셋.</li>
</ol>3. 팁 기능화
참고 : 모든 단계는 유기 증기의 흡입을 피하기 위해 연기 후드에서 수행해야합니다. 또한 장갑, 실험실 코트 및 눈 보호가 필요합니다. 오염을 피하기 위해 모든 단계에 니트릴 또는 라텍스 장갑을 사용하십시오. 톨루엔을 사용할 때는 용매 내성 장갑을 착용하십시오. 달리 명시되지 않는 한 모든 단계는 RT에서 수행됩니다.
<ol><li>AFM 캔틸레버 칩 MLCT-Bio-DC에 산소 플라즈마를 적용하여 표면 활성화를 수행합니다. 참고 : 추가 기능화 단계를위한 플라즈마 처리의 효율은 플라즈마 챔버내의 산소 함량과 함께 확장됩니다.<ol>
<li>새로 세척된 핀셋을 사용하여 AFM 캔틸레버 칩을 플라즈마 챔버(40kHz, 600W)에 놓습니다.</li>
		<li>사용자 정의 수정 활성화 프로그램을 사용: 대피 (0.1 mbar) – 의 압력에 산소 홍수: 0.2 mbar (4 분) – 플라즈마 프로세스 (전원: 40%, 기간: 2 분, 공정 압력: 0.2 mbar).</li>
		<li>AFM 캔틸레버 칩에 오염물질이 공기에 흡착되는 것을 방지하기 위해 챔버를 환기시키고 즉시 3.2.2 단계로 계속 진행하십시오.</li>
	</ol></li>
	<li>실란화 및 PEGylation 참고: 타이밍은 단계 간의 중요한 매개 변수입니다. 대기 시간 동안 가능한 한 신선한 솔루션을 준비합니다. 말레미드 기는 수성 매체에서 가수분해를 받고 티올은 용액33,,47에서 이황화로 쉽게 산화되어 AFM 팁 기능화 반응을 방해한다.<ol>
<li>실란-PEG-말 용액을 용매 내성 플라스틱 또는 유리 튜브에 톨루엔(1.25 mg/mL)으로 준비하고 평평한 페트리 접시에 6 mL의 용액을 부어 각각 3 mL. 참고: SMFS 실험에서 여러 프로브 폴리머의 결합이 관찰되는 경우, 실란-PEG-mal을 비기능성 실란-PEG와 혼합하면 앵커링 포인트의 수를 줄일 수 있다. 상이한 질량(즉, 윤곽 길이)을 가진 패시베이션 층 PEG의 조정을 위해27을사용할 수 있다.</li>
		<li>60 °C35에서3 시간 동안 실란 -PEG 말 용액 (페트리 접시 당 최대 10 칩)에서 3.1.3 단계 직후AFM 캔틸레버 칩을 배양하십시오.</li>
		<li>페트리 접시를 오븐에서 꺼내서 용액을 적어도 10 분 동안 식힙니다.</li>
		<li>각 AFM 캔틸레버 칩을 조심스럽게 헹구어 보시고 자합니다. 예를 들어 용액에 담을 때 이러한 칩을 약간 기울여 공기 용매 인터페이스를 통과할 때 AFM 캔틸레버에 모세관력이 미치는 영향을 줄입니다.<ol>
<li>PEG 및 PS 폴리머의 경우 톨루엔으로 세 번 헹시다.</li>
			<li>PNiPAM 폴리머의 경우 톨루엔으로 한 번, 에탄올로 두 번 헹구어 두 번 헹구어 두 번.</li>
		</ol>
</li>
		<li>제어 AFM 캔틸레버 칩으로 적어도 두 개의 AFM 캔틸레버 칩을 선택하고 3.3 단계를 건너뛰고 다음과 같이 헹구어 용매의 극성을 증가시다.<ol>
<li>PEG와 PS 폴리머의 경우 에탄올로 두 번, 초순수로 한 번 헹구어 두 번 헹구어 두 번.</li>
			<li>PNiPAM 폴리머의 경우 초순수로 두 번 헹구어 보시고 라닙시. 참고: 제어 AFM 캔틸레버 칩은 폴리머 부착을 제외한 모든 기능화 단계를 거쳤습니다(단계 3.3). 그들은 SMFS 실험에 사용되는 기능화 공정, AFM 캔틸레버 칩 홀더 시스템, 표면 및 용매의 청결을 증명하는 역할을합니다.</li>
		</ol>
</li>
	</ol></li>
	<li>공유 폴리머 부착 참고 : AFM 캔틸레버 팁이 말미미드 그룹으로 완전히 덮일 것으로 예상되지만, 말미미드가 비활성 PEGs47로이어지는 물에서 가수 분해를 겪기 때문에 단일 프로브 폴리머에 대한 결합 부위가 몇 개 있습니다. 이러한 비활성 PEG는 위에서 설명한 대로 패시베이션 계층역할을 합니다.<ol>
<li>3mL 페트리 접시에 다음 중합체 용액 중 하나에서 3.2.5 단계 직후 AFM 캔틸레버 칩을 인큐베이션합니다. 각각의 중합체가 제대로 용해되지 않으면 40°C 수조를 사용하고 용액을 잘 저어줍니다. 참고: 티올 종단 폴리머의 사용은 실란-PEG-말의 말미미드 그룹과의 반응을 방해하는 이황화 결합의 형성으로 이어질 수 있으므로, 특히 3.3단계가 수용성중합체(33)에대한 수성 완충제에 적용되는 경우 환원제가 권장된다.<ol>
<li>PEG 및 PS 폴리머의 경우, 60°C에서 1시간 동안 톨루엔에서 1.25 mg/mL의 농도를 사용하십시오.</li>
			<li>PNiPAM 폴리머의 경우 RT에서 3시간 동안 에탄올에 1.25 mg/mL의 농도를 사용하십시오. 참고: SMFS 실험에서 다중 프로브 폴리머의 결합이 관찰되면 중합체의 농도를 감소시켜야 합니다.</li>
		</ol>
</li>
		<li>각 AFM 캔틸레버 칩을 조심스럽게 헹구어 보시고 자합니다.<ol>
<li>PEG와 PS 폴리머의 경우 톨루엔으로 두 번, 에탄올로 두 번, 10분 간 식힌 후 초순수로 한 번 헹구세요.</li>
			<li>PNiPAM 폴리머의 경우 에탄올로 두 번, 초순수로 두 번 헹구어 두 번 헹구어 두 번.</li>
		</ol>
</li>
		<li>실험에서 사용할 때까지 각 AFM 캔틸레버 칩을 4°C에서 초순수로 채워진 작은(1 mL) 페트리 접시에 따로 보관합니다.</li>
	</ol></li>
</ol>4. 표면 준비
<ol><li>실리콘 산화물 웨이퍼 참고: 이 표면은 PEG 및 PNiPAM이 있는 SMFS에 사용되었습니다.<ol>
<li>다이아몬드 나이프를 사용하여 작은 조각으로 실리콘 산화물 웨이퍼를 잘라.</li>
		<li>실리콘 산화물 조각을 마이크로 원심 분리 튜브에 별도로 넣고 이 튜브를 에탄올로 채웁니다.</li>
		<li>10 분 동안 실리콘 산화물 조각을 초음파 처리합니다.</li>
		<li>에탄올로 산화실리콘 조각을 두 번 헹구고 질소 흐름 하에서 조심스럽게 건조시면 됩니다. 즉시 산화 실리콘 조각을 사용합니다.</li>
	</ol>
</li>
	<li>금에 소수성 알카네 티올의 자체 조립 단층 (SAM) 참고: 이 표면은 PS를 사용하는 SMFS에 사용되었습니다. SAM에대한 자세한 내용은 문헌39,49를 참조하십시오.<ol>
<li>금 코팅 실리콘 웨이퍼(A[100], 5nm 티타늄, 100 nm 골드)를 사용하여 4.1 – 4.1.4 단계를 수행합니다.</li>
		<li>표면 조각을 1-도칸티올 용액(2 mM)에서 18시간 동안 배양한다.</li>
		<li>갓 준비한 SAM을 에탄올로 두 번 헹구는다.</li>
		<li>직접 사용하기 위해 질소 흐름이 있는 건조 된 SAM또는 나중에 사용하기 위해 최대 4 일 동안 에탄올에 보관하십시오.</li>
	</ol>
</li>
</ol>5. 데이터 수집
참고: 여기에 표시된 모든 측정은 온도 변화에 대한 가열 및 냉각 샘플 단계를 사용하여 Cypher ES AFM을 사용하여 초순수에서 수행되었습니다. 일반적으로 액체를 측정할 수 있는 기능을 제공하는 모든 AfM을 사용할 수 있습니다.
<ol><li>기능화된 AFM 캔틸레버 칩을 AFM에 삽입합니다.</li>
	<li>액체에서 측정에 적합한 샘플 홀더에 준비된 표면을 접착제(예: 고분해능 복제 화합물 101RF 또는 UV 경화 접착제). 참고 : 이러한 접착제는 매우 불활성이며 많은 극성 용매에 내성이 있습니다. 비극성 용매(예: 톨루엔 또는 헥산)에 대한 접착제의 저항은 사용하기 전에 확인해야 합니다.</li>
	<li>AFM 캔틸레버 칩과 프로브 샘플을 액체에 담그세요: 초순수. 참고: 용매 드롭(약 100 μL)을 AFM 캔틸레버 칩 홀더에 증착할 수 있습니다. 용매로 AFM 캔틸레버 칩을 덮으면 모세관력이 감소하며, 이는 공기 용매 인터페이스를 통과하는 샘플 표면에 접근할 때 AFM 캔틸레버에서 작용합니다.</li>
	<li>필요한 경우 온도를 조정하고 시스템이 평형화하도록 하십시오. 참고: 온도 변화는 알루미늄이나 금과 같은 반사 코팅이 있는 AFM 캔틸레버의 바이메탈 효과로 인해 AFM 캔틸레버의 편향이 발생할 수 있습니다. 평형은 편향 신호의 추가 변화가 관찰되지 않을 때까지 표면(수 μm)에서 멀리 수행되어야 합니다(MLCT-Bio-DC의 경우 최대 15분).</li>
	<li>기능화의 노화의 영향을 배제하기 위해 임의로 온도를 변화시다. 적용된 온도가 AFM 캔틸레버의 돌이킬 수 없는 굽힘으로 이어지지 않도록 하십시오. 참고: 용매 특성에 대한 온도 영향(예: 증발 또는 점도 변화)은 실험을 방해할 수 있습니다. 제시된 예에서, 온도는 용매로서 물을 취하는 10 K의 단계에서 최대 40 K의 범위에 걸쳐 변화하였다(예를 들어, 278 K로부터 318 K).</li>
	<li>단단한 표면(예: 실리콘 산화물)에서 힘 연장 곡선을 취하여 InvOLS(역 광학 레버 감도)를 결정하기 위해 표면에 접근합니다. 이를 위해 광검출기(V) 대 압전 거리의 편향 신호를 취하고 선형 함수를 사용하여 AFM 캔틸레버 팁의 들여쓰기를 나타내는 부품의 기울기를 기본 표면(반발 정권)으로 결정합니다. 오류를 줄이기 위해 평균 5개 이상의 값을 사용하여 최종 InvOLS 값을 가져옵니다. 자세한 내용은 문헌4,,39를참조하십시오. 참고: InvOLS는 단단한 표면에서만 안정적으로 판단할 수 있습니다. 부드러운 표면이나 인터페이스에 대한 실험의 경우 부드러운 표면 가까이에 단단한 표면을 배치해야 합니다. 그런 다음 AFM 설정을 분해할 필요 없이 소프트 표면 실험 전후에 InvOLS 교정을 수행할 수 있습니다.</li>
	<li>스프링 상수 판정의 경우 AFM 캔틸레버 팁과 표면(여러 μm) 사이의 매력적이거나 반발적인 상호 작용이 없는 높이로 AFM 캔틸레버를 이동합니다. 그런 다음 전력 스펙트럼 밀도(PSD) 대 주파수가 플롯되는 열 노이즈 스펙트럼을 기록합니다. 다음 단계는 일반적으로 상용 AFM 소프트웨어의 자동화된 내장 기능에 의해 수행됩니다: 첫째, 획득한 열 노이즈 스펙트럼은 PSD(예: 간단한 고조파 발진기)에 함수를 피팅하여 분석됩니다. 피팅은 첫 번째 와 두 번째 공진 사이의 최소까지 수행됩니다. 둘째, PSD 대 주파수 플롯의 피팅된 부분 아래의 영역은 수직 방향으로 AFM 캔틸레버의 평균 제곱 변위를 나타내는 것으로 결정된다. 마지막으로, equipartition 정리는 AFM 캔틸레버 힘 상수28,,50을얻기 위해 사용된다. 참고: AFM 캔틸레버의 제1 공진 피크를 포함하는 적절한 주파수 범위를 사용해야 한다. 만족스러운 신호 대 잡음 비를 얻으려면 가능한 가장 높은 주파수 분해능으로 최소 10개의 PSD를 축적해야 합니다.</li>
	<li>실험을 시작합니다. 그리드와 같은 방식으로 힘 연장 곡선을 사용하여 힘 맵을 기록합니다(예: 20 x 20 μm2의영역에 대해 10 x 10포인트) 로컬 표면 효과(예: 불순물, 전위)를 피하고 서로 다른 표면적을 평균화합니다. 참고: 일반적인 파라미터는 1 μm/s의 당기는 속도와 충분한 해상도를 보장하기 위해 5kHz의 샘플링 속도입니다. 끌어당기는 속도가 변할 때 샘플링 속도를 조정해야 합니다. 후퇴 거리는 측정된 폴리머의 윤곽 또는 탈착 길이에 맞게 조정되어야 합니다(예상 길이의 약 2배).</li>
	<li>단일 중합체가 표면에 부착될 수 있도록 표면을 향한 거주 시간을 사용하고 변화시다(일반적으로 0 – 5s).</li>
	<li>시스템의 일관성과 안정성을 확인하기 위해 실험이 끝날 때 InvOLS 및 스프링 상수의 결정을 반복합니다. 참고: 폴리머와 표면 간의 강한 접착력의 경우, 기능화를 유지하기 위해 실제 실험 후에 교정을 수행할 수 있습니다.</li>
</ol>6. 데이터 평가
참고: 데이터 평가를 위해 Igor Pro를 기반으로 한 맞춤형 소프트웨어가 다음 단계를 수행하는 데 사용되었습니다.
<ol><li>원시 편향 신호(볼트)를 기록된 InvOLS 및 결정된 스프링 상수와 곱하여 힘 값(뉴턴)으로 변환합니다.</li>
	<li>진정한 확장(tip-surface 거리)을 얻기 위해 수직 방향으로 압전 요소에 의해 구동되는 거리에서 AFM 캔틸레버(InvOLS와 원시 편향 신호를 곱한 후)의 편향을뺍니다.4.</li>
	<li>마지막 이벤트 후 기준선에 선형 함수를 장착하고 힘 확장 곡선에서 동일한 값을 빼서 드리프트에 대해 얻은 힘 확장 곡선을 수정합니다. 장착된 부품은 AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 간에 매력적이거나 반발적인 상호 작용이 관찰되지 않는 표면에서 충분한 확장을 나타내야 합니다. 그런 다음 기준선이 0축으로 설정됩니다. 참고: 금과 같이 반사율이 높은 표면에서 측정하는 경우 간섭이 나타날 수 있습니다. 이는 표면과 AFM 캔틸레버 의 뒷면에서 레이저 빔의 부분 반사에서 발생합니다. 따라서, 얻어진 힘 연장 곡선은 수직 확장을 따라 정현파 힘 신호 아티팩트를 나타낼 수 있다. 이것은 최종 힘 값을 방해하는 아티팩트입니다. 이러한 힘 확장 곡선을 여전히 고려하기 위해 보정이가능합니다(그림 2).</li>
	<li>간섭이 힘 연장 곡선에 나타나는 경우, 비특이적 접착력과 동일한 정현파 아티팩트(즉, 진폭 및 위상)의 피크(즉, 진폭 및 위상)를 제외한 다른 이벤트가 없는 대표적인 힘 연장 곡선(후퇴 곡선)을 선택합니다(그림2A). 참고: 간섭의 저주파 패턴을 얻기 위해 대표적인 힘 연장 곡선을 부드럽게 합니다.</li>
	<li>수정할 힘 확장 곡선을 선택합니다(그림2B).</li>
	<li>6.4단계에서 두 힘 확장 곡선을 오버레이합니다. 및 6.5. 둘 다 동일한 정현파 아티팩트(즉, 진폭 및 위상)를 표시하도록합니다(그림 2C).</li>
	<li>부동 연진 기준선이 아닌 직선으로 이어지는 힘 연장 곡선에서 (스무딩된) 대표 힘 연장 곡선을 뺍니다(그림2D). 참고: 대표적인 곡선의 비특이적 접착 피크는 수정할 곡선에 나타나는 단일 분자 이벤트와 구별됩니다. 사실, 대표 곡선의 선택은 적절한 수정을 위해 중요합니다.</li>
</ol>

저자는 그들이 경쟁 금전적 이익이 없다고 선언합니다.

AFM 기반 SMFS는 중합체 물리학에서 단일 분자 상호 작용을 조사하기위한 주요 도구 중 하나입니다. 진정한 단일 분자 실험을 위해서는 AFM 캔틸레버 팁에 프로브 폴리머를 공유 부착하는 것이 필수적입니다.
많은 이전 작품은 나노 피싱 실험을 기반으로, 특히 PNiPAM에 대한, 여기서 폴리머는 표면에 흡착하고 무작위로 AFM 캔틸레버 팁30,,31을사용하여 기판에서 그들을 따기로 뻗어있다. 이것은 결과를 바꾸고 단 하나 분자 행동의 오해로 이끌어 낼 수 있습니다. 인접한 폴리머와의 상호 작용을 배제할 수 없기 때문에 협조적인 효과가 결과를 지배할 수 있습니다. 이는 결과에 큰 영향을 미치며, 특히 단일 단리 분자57,,58에비해 대량으로 유의하게 다른 거동을 보이는 폴리머에 대해.
여기에 제시된 기능화 프로토콜은 신뢰할 수 있으며 윤곽 길이, 소수성 또는 단량체의 입체적 장애에 관계없이 다양한 폴리머에 쉽게 적용할 수 있습니다. 또한 단일 프로브 폴리머와 AFM 캔틸레버 팁, AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 간의 원치 않는 상호 작용을 방지하기 위한 패시베이션이 제공됩니다. 또한 스트레칭 이벤트를 보여주는 힘 연장 곡선의 평가가 표시됩니다. 거기에서 마스터 힘 확장 곡선의 결정을 위한 절차가 제안됩니다. 이는 예를 들어 힘 확장 동작에 대한 온도 관련 효과를 더 잘 드러내는 더 나은 수단을 제공합니다. 더욱이, 일정한 힘 고원을 특징으로 하는 단 하나 분자 탈착 사건의 분석은 제공됩니다. 또한, 힘 확장 곡선에서 정현파 힘 신호 아티팩트를 보정하는 간단한 방법이 제공되어 실험 결과를 손상시킬 수 있습니다.
Stetter et al.39에비해, 여기에 제시된 기능화 절차는 4단계가 아닌 3단계로 감소하고 절차의 견고성이 향상된다. 한 단계에서 PEGylation 및 실란화를 수행하는 주요 이점은 더 잘 제어된 반응을 가지고 수율을 높이는 것입니다. 또한 준비할 수 있는 솔루션이 줄어들고 헹구는 단계가 줄어듭니다. 이것은 준비를 위한 노력과 시간을 감소시키고 재현성을 증가시킵니다. 또한 AFM 캔틸레버를 이동하는 것은 항상 기능화 프로세스의 중요한 부분입니다. 한 솔루션에서 다른 솔루션으로 의한 전송은 항상 공기-물 인터페이스를 통한 전송 또는 핀셋의 부적절한 사용으로 AFM 캔틸레버를 잃어버리는 기능화 품질에 큰 영향을 미칠 위험이 있습니다.
AFM 캔틸레버 팁에 단일 폴리머의 적절한 공유 부착을 증명하기 위해서는 서로 다른 조건이 충족되어야 합니다. 첫째, 제어 AFM 캔틸레버가 매우 중요하며 모든 기능화에 대비해야 합니다. 실험을 수행하기 위한 기능화 과정 및 유체 세포는 소수의 힘 연장 곡선이 대조군 실험에서 늘어나거나 고원을 보이는 경우에만 깨끗한 것으로 간주된다(제시된 예에서 2% 미만).
더 이상 방울이나 최대가없는 명확한 스트레칭 패턴은 적절한 단일 분자 스트레칭 이벤트를 갖는 데 필수적이다. 부가적으로, 다중중합체(59,,60)의동시 탈착을 배제하기 위해서는 파열 또는 연신 곡선의 완전한 탄성 반응에서의 힘 하중 속도에 대한 파열력의 의존성을 분석해야 한다. PEG 및 PNiPAM의 경우, 표면의 상이한 위치에서 취해진 힘 연장 곡선의 19% 및 42%는 각각 이러한 연신 패턴을 보였다. 스트레칭 이벤트를 얻기 위해서는 각각의 기본 표면에 대한 폴리머의 물리 흡착이 강해야 합니다. 그렇지 않으면 고원과 같은 탈착 이벤트가 관찰됩니다. 이것은 높은 힘 (최대 500 pN 이상)에서 스트레칭 이벤트를 감지하는 데 더욱 결정적입니다. 이 강력한 물리 발생은 모든 힘 연장 곡선에 대해 충족되지 않기 때문에, 그러한 이벤트의 수율은 순수한 고원과 같은 탈착 이벤트보다 적습니다. 대안으로, 폴리머와 기본 표면 사이의 카테콜 또는 화학흡수와 같은 강하게 밀착하는 그룹이 사용될 수 있다. 그러나, 이는 폴리머61,,62에서추가의 작용기 또는 커플링 부위의 도입이 요구한다.
실제로, 중합체의 질량(즉, 윤곽 길이)은 귀중한 지문을 제공한다. 질량은 다음과 같은 이유로 측정된 등고선 길이로 직접 변환될 수 없지만 길이 분포는 단일 분자 이벤트를 정의하는 데 매우 유용합니다. 낮은 다분산성을 가진 PNiPAM 폴리머의경우(θ = 1.28), 우리는 실험에서 수득된 연산 이벤트(및 따라서 폴리머 길이)에 대한 확장 값에서 유의한 차이를 발견했다. 그 이유 중 하나는 폴리머 길이및 분포의 결정일 수 있습니다. 크기 배제 크로마토그래피(SEC)에서, 표적 중합체의 상대적인 중량은 PS 또는 폴리(메틸 메타크릴레이트) (PMMA)63과같은 표준과 비교하여 결정된다. 추정된 상대 중량은 표적 중합체및 표준의 유체역학적 반경이 현저하게 다를 수 있기 때문에 절대 분자량에서 벗어날 것으로 예상된다. 부가적으로, 실린층은 기능화 과정 동안 톨루엔내의 스퓨리어스 워터에 의해 올리고머화될 수 있다. AFM 캔틸레버 팁에 이러한 올리고머를 부착하면 앵커포인트가 64가적어보다 유연한 레이어가 됩니다. 또한, 실리콘 층에 폴리머의 부착점은 반드시 검출된 길이값(29)의이동으로 이어지는 정점에 있지 않을 수도 있다. 웜라이크 체인(WLC) 또는 자유 관절 사슬(FJC) 모델과 같은 폴리머 모델은 전체,확장 범위18,29,,41,65,,66에걸쳐 PEG 또는 PNiPAM에 대한 각각의 힘 확장 거동을 적절하게 재현할 수 없지만, 이러한 폴리머 모델은 다른 중합체 및 단백질 시스템10,,15,,,67,,68에유용할 수 있다.
단일 PS 폴리머(윤곽 길이가 1 μm 이상)의 공유 부착은 상당한 수의 힘 연장 곡선이 일정한 힘의 충분히 긴 고원을 보일 때 성공적이라고간주됩니다(그림 5). 단일 폴리머를 탈착하여 발생하는 고원은 도 5A에주어진 바와 같이 특정 연장에서 기준선에 일정한 힘의 단일 날카로운 강하에 의해 정의된다. 더 많은 중합체가 AFM 캔틸레버 팁에 부착되는 경우, 고원의 폭포가관찰된다(도 5C).Figure 5 고원 길이(탈착 길이)는 폴리머 윤곽길이(51)와상관관계가 있으며, AFM 캔틸레버 팁의 비특이적 접착력으로 인해 임의의 접착 피크보다 훨씬 더 길어야 한다(여기 약 200 nm). 단일 힘 확장 곡선에만 나타나는 피쳐를 해석해서는 안 됩니다. 제시된 실험에서, 100개의 곡선 중 적어도 80개는 표면의 두 개의 상이한 지점에서 적어도 2개의 힘 맵에서 200 nm 보다 더 긴 고원을 보였다. 또한 그림 5B 및 5D와같은 산란플롯을 사용하여 탈착 길이의 분포는 AFM 캔틸레버 팁에 결합된 중합체의 수와 수를 보여줍니다. PS의 경우, 포스 익스텐션 커브의 고원에서 가져온 탈착력과 길이의 좁은 분포는 성공적인 공유 부착의 증거로 작용했습니다. 이것은 마침내 기능화 프로토콜의 성공을 입증했습니다. 따라서 이러한 힘과 길이 분포를 출판물에 표시하는 것이 좋습니다.
미리 설정된 많은 매개 변수를 구성하는 기본 제공 알고리즘을 사용하여 힘 확장 곡선을 평가하면 주의해서 수행해야 합니다. 예를 들어 고정 샘플링 속도가 적용된 모든 끌어당기 속도에 적합하지 않거나 힘 확장 곡선의 자동 스무딩이 중요한 세부 정보를 평균화할 수 있기 때문에 그 이유가 있습니다. 일반적으로 각 평가 절차를 적절히 이해하면 평가 절차의 오류를 방지할 수 있으며, 이는 AFM 기반 SMFS 실험의 최종 결과에 큰 영향을 미칠 수 있습니다.
요약하자면, 우리는 신뢰할 수 있고 다양한 폴리머에 쉽게 적용 될 수있는 기능화 프로토콜을 제시한다. 또한 단일 분자 힘 확장 곡선의 적절한 평가가 제공되어 연신력, 탈착력 및 탈착 길이와 같은 물리적 파라미터를 결정할 수 있습니다. 제시된 프로토콜 및 절차는 단일 분자 수준에서 자극 반응 시스템의 조사에 유용합니다.

1980년대1호에발명된 이래, 원자력 현미경(AFM)은 나노미터 이하의 공간 분해능, 서브피코뉴턴 힘 분해능 및 다양한 용매 및 온도 조건에서 측정할 수 있는 가능성을 특징으로 하는 자연과학에서 가장 중요한 이미징 기술 중 하나가되었으며, 2,3,34,,5,46,7.,7
,이미징8,9,AFM은 단일 중합체와 표면 간의 접착제 상호 작용, 단일 중합체의 물리적 특성 및 단백질,7,,7,10,11,,12,,13,14,15,16사이의 점착 작용에 대한 통찰력을 제공하는 단일 분자 힘 분광법 (SMFS)을 수행하는 데 사용됩니다.,, 정기적인 SMFS 실험에서 기능화된 캔틸레버 팁이 표면과 접촉하여 AFM 캔틸레버의 폴리머가 이 표면에 물리를 수 있도록 합니다. 표면에서 AFM 캔틸레버 팁을 후퇴시킴으로써, AFM 캔틸레버의 편향의 변화는 힘 연장곡선(4)으로이어지는 힘으로 변환된다. 연신력, 탈착력 및 탈착 길이와 같은 물리적 파라미터는 당기기 속도, 표면에 거주 시간, 표면에 대한 들여쓰기 깊이, 온도, 용매17,,18 및 고체 기질, 폴리머 필름 또는 지지성 지질 이중층19,20,,,,21, 22와같은 상이한 파라미터에 따라 결정될 수 있다.21 더욱이, 중합체는 상이한 공간 방향으로 조사될 수 있고, 따라서 중합체23,,24,,25,,26의마찰 특성을 조사한다.
조사된 폴리머를 AFM 캔틸레버 팁에 공유 부착하는 것은 이러한 연구에 필수적입니다. 따라서, AFM 캔틸레버 팁에 결합된 하나의 단일 분자 발생물의 높은 수율은 AFM 캔틸레버27,,28,다양한 부착점29 또는 다양한 폴리머(상이한 윤곽 길이)의 보정으로 인한 결과의 어떠한 편향도 방지한다(다양한 윤곽 길이)는 나노피싱 실험의 경우30,,31, 32.,32 또한, 다른 중합체와의 상호 작용뿐만 아니라 평균 효과는 널리 방지 될 수있다18,,28. AFM 캔틸레버 팁에 폴리머를 공유 부착하기 위해 다양한 유형의 화학 적 변형을 적용 할 수 있으며, 그 중 많은 부분이 Hermanson33에의해 책에 요약되어 있습니다. 아민 및 티올 기반 연결 반응뿐만 아니라 클릭 화학은 AFM 캔틸레버 팁 기능화34,,35,,36,,37,38, 39,,39,,40,,41, 42에서가장 일반적으로 사용되는 방법을 나타낸다.41, Becke et al.40은 AFM 캔틸레버 팁에 단백질을 부착하기 위해 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디미드(EDC)/NHS 화학을 사용하는 방법을 보여준다. 그러나, 이러한 작용기는 상호 연결되는 경향이 있어 기능의 손실로 이어진다43,,44. 또한, 카보디마이드는용액(43)에서가수분해가 빠른 경향을 보여준다. 말레미드와 티올 그룹은 일반적으로 더 안정적이며 가교 반응을 보이지 않습니다. 제시된 프로토콜은 참조35,,39에주어진 이전에 게시된 프로토콜의 최적화이다.
여기서, 등고선 길이 또는 소수성등의 성질에 관계없이 많은 수의 상이한 중합체로 용이하게 조절할 수 있는 신뢰할 수 있는 기능화 프로토콜이 제시된다. 3개의 상이한 중합체는 예를 들면: 친수성 폴리에틸렌N글리콜 (PEG) 및 폴리 (N-isopropylacrylamide) (PNiPAM) 뿐만 아니라 높은 몰 질량 소수성 폴리스티렌 (PS). 적절한 링커 분자를 가진 공유 결합 기능을 제공하기 위해, 3개의 중합체는 기능성 말단군으로서 텔레첼릭 티올 모에티를 특징으로 하기 위해 선택되었다. 링커 분자 자체는 전형적으로 2개의 활성 부위를 가진 짧은 PEG 중합체, 한쪽 끝에 실란 군 및 다른 쪽 끝에 있는 말미마이드 그룹이다. 전자는 AFM 캔틸레버 팁에 공유 부착을 가능하게 하고 후자는 기능화된 고몰 질량 중합체의 티올 기와 결합 반응을 가능하게 한다. 또한 비활성 PEG 링커 분자는 프로브 폴리머와 AFM 캔틸레버 팁 뿐만 아니라 AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 사이의 원치 않는 상호 작용을 방지하는 패시베이션 층역할을 합니다.

<table><tbody><tr><td>1-도데칸티올 (&ge; 98%)</td><td>Sigma-Aldrich, 미국</td><td>417364-500ML</td><td>SAM</td></tr><tr><td>암모니아 용액에 사용 (30%)</td><td>Roth, 독일</td><td>CP17.2</td><td>청소에 사용</td></tr><tr><td>Cypher ES</td><td>Asylum Research, an Oxford Instruments company, USA-AFM</td><td></td><td></td></tr> <tr><td>에탄올 (&ge; 99.9%)</td><td>Roth, 독일</td><td>PO76.1</td><td>솔벤트</td></tr><tr><td>골드 코팅 실리콘 웨이퍼</td><td>Fraunhofer Institute for Applied Solid State Physics IAF, 독일</td><td>-</td><td>SAM</td></tr><tr><td>고해상도 복제 화합물</td><td>Microset Products Ltd, 영국</td>에 사용 <td>101RF</td><td>결합제</td></tr><tr><td>과산화수소 용액</td><td>Sigma-Aldrich, 미국</td><td>H1009</td><td>Igor</td></tr><tr><td>Pro</td> <td>청소에 사용Wavemetrics, 미국</td> <td>-</td> <td>소프트웨어 환경</td></tr><tr><td>테트라 - 30 - LF - PC</td><td>Diener 전자, 독일</td> <td>-</td> <td>플라즈마 챔버</td></tr><tr><td>말레이미드 - 폴리에틸렌 글리콜 - 트리에 톡시 실란</td><td>크리 에이 티브 PEG 작품, 미국</td><td>PHB - 1923</td><td>링커 폴리머</td></tr><tr><td>MLCT - 바이오 - DC</td><td>브루 커, 미국</td><td>MLCT - 바이오 - DC</td><td>AFM 캔틸레버</td></tr><tr><td>프라임 CZ-Si 웨이퍼, n 형 (인광체) TTV < 10 &마이크로; m</td><td>MicroChemicals, 독일</td><td>WSA40600250 P1314SNN1</td><td>실리콘 웨이퍼</td></tr><tr><td>Purelab Chorus 1, 18.2 M & Omega; cm</td><td>Elga LabWater, 독일</td><td>10034-540</td><td>초순수 수원</td></tr><tr><td>R3 SA</td><td>Vomm GmbH, 독일</td><td>5803 블랭크</td><td>핀셋</td></tr><tr><td>티올 종단 폴리 (N- 이소 프로필 아크릴 아미드)</td> <td>Gallei Group, Saarland University,</td><td></td> <td>Germany-PNiPAM 프로브 폴리머</td></tr><tr><td>티올 말단 폴리스티렌</td><td>고분자 소스, 캐나다</td><td>P40722-SSH</td><td>PS 프로브 고분자</td></tr><tr><td>티올-폴리에틸렌 글리콜-티올</td><td>크리에이티브 PEGWorks, 미국</td><td>PSB-615</td><td>PEG 프로브 고분자</td></tr><tr><td>톨루엔(99.99%)</td><td>Fisher Chemicals</td><td>T324-500</td><td>용매</td></tr></tbody></table>

afm 기반 힘 분광학을 위한 단일 분자의 공유 부착

Covalent Attachment of Single Molecules for AFM-based Force Spectroscopy

원자력 현미경 검사법 (AFM) 기반 단일 분자 힘 분광법은 단일 폴리머와 표면 사이의 상호 작용을 조사하기위한 이상적인 도구입니다. 진정한 단일 분자 실험을 위해, 프로브 분자의 공유 부착은 그 때 에만 1개의 동일한 단 하나 분자를 가진 힘 연장 추적의 수백을 장악할 수 있기 때문에 필수적입니다. 많은 흔적은 단독으로 단 하나 분자가 탐사된다는 것을 증명하기 위하여 차례로 필요합니다. 또한 단일 프로브 분자와 AFM 캔틸레버 팁, AFM 캔틸레버 팁과 기본 표면 간의 원치 않는 상호 작용을 방지하는 데 패시베이션이 중요합니다. 여기에 제시된 기능화 프로토콜은 신뢰할 수 있고 다양한 폴리머에 쉽게 적용할 수 있습니다. 특징적인 단일 분자 이벤트(즉, 스트레칭 및 고원)는 힘 연장 추적에서 검출됩니다. 이러한 이벤트에서 는 연신력, 탈착력 및 탈착 길이와 같은 물리적 파라미터를 얻을 수 있습니다. 이것은 단 하나 분자 수준에 자극 반응하는 시스템의 정밀한 조사를 위해 특히 중요합니다. 예시적인 시스템인 폴리(에틸렌 글리콜) (PEG), 폴리(N-이소프로필라크릴라미드) (PNiPAM) 및 폴리스티렌(PS)은 SiOx(PEG 및 PNiPAM용) 및 소수성 자가 조립단열 표면(PS용)으로부터 연신 및 탈착된다.N

다음 의 예는 중합체 PEG, PNiPAM 및 PS의 단일 분자 스트레칭 및 탈착의 결과를 나타낸다. 모든 AFM 캔틸레버 팁은 위에 제공된 프로토콜로 기능화되었습니다. PEG 및 PNiPAM은 온도 변화와 함께 SiOx에서 측정되었다. PEG 및 PNiPAM에 대한 생성 된 온도 의존 스트레칭 곡선에 대한 자세한 논의를 위해, Kolberg 등18 다른 힘 확장 모티프는 일정한 힘의 고원입니다 (예를 들어, 메틸의 자체 조립 단층에서 PS를 탈지 할 때 물4,,27,,39,,51)에알카네 티올을 종료하였다.
실시예 1: 물 속에서 PEG 및 PNiPAM 스트레칭 물에서의 온도 의존적 연신 거동은 한쪽 끝에 AFM 캔틸레버 팁에 공유결합된 단일 PNiPAM 및 PEG 폴리머를 사용하여 측정하고 다른 쪽 끝에 있는 SiOx 표면에 물리를 묻히게 되었다. 캘리브레이션 및 클린 컨트롤 실험(힘 확장 곡선의 2% 미만이 단일 분자 이벤트를 표시함) 후, 각 AFM 캔틸레버에 대해 적어도 2개의 힘 맵을 기록하였다. 온도 의존적 실험은 각 온도에서 적어도 하나의 힘 맵을 기록함으로써 수행되었다. 몇 개의 스트레칭 이벤트만 나타났을 때, 각각의 AFM 캔틸레버가 폐기되고 칩의 다음 AFM 캔틸레버가 촬영되었습니다(일반적으로 MLCT-Bio-DC의 순서 C, B, D 및 E). PEG의 예시적인 데이터에 대해, 단일 스트레칭 이벤트는 500개의 측정된 힘 연장 곡선 중 95개에서 관찰되었다(19%). PNiPAM의 경우 600개의 힘 연장 곡선 중 252개에서 스트레칭 패턴(42%)이 나타났습니다. 힘 확장 곡선을 더 잘 비교하기 위해 모든 온도에 대해 단일 마스터 곡선이 생성되었습니다. 이를 위해, 형태 변동 및 용매 효과가 무시할 수 있는 500 pN 이상의 스트레이징 이벤트가 있는 곡선만52를선택했다. 최종 스트스트레칭 수는 278K에서 3, 298K에서 7, PEG의 경우 318K에서 4, 278 K에서 3, PNiPAM18의경우 318 K에서 3이었다.
마스터 커브 생성 절차는 그림 3에제공됩니다. 선택한 힘 연장곡선(그림 3A)은길이 L0(500pN의 힘에서 확장)으로 재조정되고 그림 3B를참조하십시오.0 접착 피크는 표면과 AFM 캔틸레버 팁 사이의 비특이적 접착의 큰 변화를 나타내지만 폴리머 연산 거동에 영향을 미치지 는 않습니다. 재스케일링된 힘 확장 곡선을 병합한 후 그림3C에제시된 바와 같이 이노미날 스무딩에 의해 평균화됩니다. 이를 위해 가우시안 필터는 스무딩 매개변수 2053과동일한 수준에서 파스칼의 삼각형에서 파생된 정규화된 계수로 데이터를 컨볼루싱합니다. 마지막으로, 마스터 커브는 도 3D에주어진 바와 같이 모든 온도에 대해 얻어진다. 확대는 힘 확장 동작에 대한 온도 영향이 가장 두드러지는 범위를 표시합니다.
그림 4에서PEG(A)와 PNiPAM(B)의 온도 거동을 비교한 것을 확인할 수 있습니다.AB PEG의 경우 온도가 증가하면서 연이력의 감소가 관찰되었다. 온도를 278에서 318 K로 증가시킬 때 100 pN에서 재스케일링 된 확장의 약 5 %의 증가가 관찰되었다. PNiPAM의 경우 온도에 따라 달라는 반대의 변화가 드러날 수 있습니다. 온도가 278에서 328 K로 증가했을 때 100 pN에서 재스케일링 된 확장의 약 1 %의 감소가 관찰되었다. 또한, 주어진 힘 값에 대한 곡선 아래의 영역을 결정함으로써 힘 연장 마스터 곡선으로부터 스트레칭 자유 에너지를 얻을 수 있었다. 이는 분자 역학(MD) 시뮬레이션18의도움으로 스트레칭 자유 에너지의 에너지 및 엔트로픽 기여를 추출하는 데 사용될 수 있다.
예 2: 물 속에서 SAM 표면에서 PS의 탈착 물 속에서 SAM 표면으로부터 PS의 탈착은 탈착력 및 길이를 결정하고 소수성 상호작용을 정량화하는 데 사용될 수 있다. 보정 후, 적어도 두 개의 힘 맵이 표면의 두 개의 다른 지점에 기록되었다. 폴리머 부착이 성공했을 때, 힘 연장 곡선은 특징적인 특징으로, 그림 5A 및 그림 5C를참조하여 일정한 힘의 고원을 보였다. 고원과 같은 탈착은 프로브 결합의 역학이 AFM 캔틸레버 팁(준평형)의 당기는 속도보다 훨씬 빠를 때 관찰됩니다. 고원과 같은 힘 연장 곡선의 탈착력은 힘 연장 추적54를통합하여 접착 자유 에너지를 직접 제공합니다. 그들은 액체 환경,,,2,,4,23,51,,54,55의표면에 단일 폴리머의 마찰 특성뿐만 아니라 정전기, 분산 및 소수성 상호 작용을 결정하는 데 사용되었습니다.
일정한 힘의 각 고원은 탈착력과 탈착 길이를 결정하기 위해 시그모이드 곡선을 장착한 다음 히스토그램으로 플롯되었습니다. 히스토그램은 최대 값과 표준 편차를 추출하기 위해 가우시안을 장착했다. 더 나은 개요를 위해 그림 5B 및 그림 5D에제공된 대로 탈착력과 길이 값이 분산형 플롯에 함께 표시되었습니다.
물에서 SAM에 폴리스티렌의 경우, 결정된 탈착력은 이전에 얻은 값19,,23에해당합니다. 탈착 길이가 폴리머 윤곽길이(51)와상관관계가 있는 바와 같이, 탈착 길이 분포는 기능성 단부들을 통해 AFM 캔틸레버 팁에 대한 각각의 중합체의 공유 결합의 증거로 사용될 수 있다. 따라서, 탈착 길이는 지문 역할을 한다.
AFM 캔틸레버 팁에 부착된 하나 이상의 폴리머의 경우, 고원(이산 단계)의 캐스케이드는 힘 연장곡선(56)에서관찰될 수 있다. 각 고원은 상이한 연장에서 중합체의 탈착을 나타낸다. 도 5 Figure 5C 및 도 5D에 주어진 실험은 동시에 AFM 캔틸레버 팁에 부착된 두 개의 중합체의 전형적인 사례를 보여주었다. 최종 파열을 피팅함으로써 탈착 길이에 대해 이중 모달 분포를 찾을 수 있었고 탈착력은 좁은 분포를 보였습니다. 이 경우, 더 작은 탈착 길이는 도 5C에제시된 바와 같이 단일 고원 또는 더 긴 고원에 대한 추가 고원으로서 힘 연장 곡선의 90%에서 발견될 수 있다. 더 높은 탈착 길이는 얻어진 힘 연장 곡선의 37%에서 발견되었다. 따라서, 탈착 길이 분포는 AFM 캔틸레버 팁에 부착된 상이한 중합체의 수를 결정하는데 사용될 수 있다. 일반적으로, 탈착 길이 값의 좁은 분포는 하나 및 동일한 단일 중합체가 얻어진 힘 연장 곡선에서 조사되었다는 좋은 표시이다. 동시에, 각각의 힘-확장의 중첩은 하나 및 동일한 단일 중합체가 측정되었는지 여부를 결정하는데 사용될 수 있다.
단일 PS 폴리머의 공유 결합을 입증한 후, 이 PS 폴리머를 위한 추가 실험은 다양한 기판(고체 표면뿐만 아니라 폴리머 필름), 용매 조건, 온도, 당기는 속도 또는 거주 시간을 수행할 수 있다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60934/60934fig1a.jpg"> 그림 1: 팁 기능화 프로세스의 회로도 개요입니다. AFM 캔틸레버 팁의 화학적 변형을 포함(1)플라즈마 활성화(2)실란화/PEGylation 및(3)폴리머 부착. 또한, 사용되는 폴리머, 즉 PEG, PNiPAM 및 PS의 상세한 화학 구조가 도시된다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60934/60934fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60934/60934fig2a.jpg"> 그림 2: 힘 확장 곡선의 간섭 제거. (A)확장을 따라 정현파 힘 신호 아티팩트를 나타내는 힘 확장 곡선을 찾았지만 단일 분자 스트레칭 이벤트가 없습니다. (B)단일 분자 이벤트가 있는 힘 확장 곡선을 선택하고, 이는 정현파 아티팩트로부터 수정되어야 한다. (C)곡선의 정현파 아티팩트가 실제로 일치하는지 제어하기 위해 곡선을 중첩합니다. (D)(B)에서힘 연장 곡선(A)을빼면 직선 기준선이있는 힘 연장 곡선이 얻어진다. 추가 해석에는 접착 피크를 사용할 수 없지만, 힘 연장 곡선은 이제 단일 분자 이벤트 영역에서 훨씬 더 정확한 힘 값으로 이어지는 아티팩트에 대해 보정됩니다(여기: &gt; 0.2 μm 의 확장). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60934/60934fig2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60934/60934fig3a.jpg"> 그림 3: 298K에서 PEG의 힘 연장 곡선에서 마스터 커브의 결정. (A)7개의 힘 연장 곡선을 사용하여 298K에서 실험 데이터를 사용합니다. 500pN(B)의힘에서 길이L0으로 재스케일링한 후, 힘 연장 곡선은 마스터 커브(C)를 획득하는C바이노미날 스무딩에 의해 병합및 평균화될 수 있다. L 재배선 커브는 점으로 지정되고 마스터 커브는 실선으로 표시됩니다. 마지막으로, 상이한 온도에 대해 얻어진 마스터커브(D)를비교할 수 있다. 확대/축소는 힘 확장 동작에 대한 온도 영향이 가장 두드러지는 범위를 나타냅니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60934/60934fig3large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60934/60934fig4a.jpg"> 그림 4: PNiPAM 및 PEG의 온도 의존마스터 곡선비교. PEG의 경우온도(A)를증가시킬 때 100 pN(mid-force range)에서 재스케일링 된 확장의 증가가 관찰되고, PNiPAM의 경우 반대 온도 의존적 변화가 드러난다(B).B <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60934/60934fig4large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60934/60934fig5.jpg"> 그림 5: 물 속에서 SAM에 대한 PS의 힘 연장 곡선 분석. (A)고원의 시그모이달 핏(보라색)을 가진 예시적인 힘 연장 곡선(파란색). 또한 화살표는 고원의 결정된 힘(빨간색)과 길이(녹색)를 표시합니다. sigmoidal 맞춤에 의해 얻어진 탈착력 및 탈착 길이 값이 분산도표에 표시되고 그 결과 히스토그램에는 가우시안이 장착됩니다. (b)결정된 평균 탈착력 및 탈착 길이 값은 (112±6) pN 및 (659±7) nm이며, 여기서 힘 연장 곡선의 93%는 이러한 단일 고원 이벤트를 나타낸다. (C)AFM 캔틸레버 팁에 부착된 2개의 폴리머에 대해 동시에 포스-익스텐션 커브(파란색)를 예로 들 수 있다. 여기서, 탈착력은 (117±5) pN의 평균 힘 값을 가진 단모달 분포를 나타내고, 이중모달 분포는 탈착 길이(656±9) nm 및 (1050±16) nm의 평균 길이 값을 이월하는 동안 발견될 수 있다. (D)샘플링된 힘 연장 곡선의 90%는 단일 고원 이벤트만 표시합니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60934/60934fig5large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

원자력 현미경 검사법 (AFM) 캔틸레버 팁에 프로브 분자의 공유 부착은 물리적 특성의 조사를위한 필수적인 기술입니다. 이를 통해 높은 재현성을 가진 AFM 기반 단일 분자 힘 분광학을 통해 연신력, 탈착력 및 폴리머 길이를 결정할 수 있습니다.

AFM 기반 힘 분광학을 위한 단일 분자의 공유 부착

Atomic force microscopy (AFM)-based single molecule force spectroscopy is an ideal tool for investigating the interactions between a single polymer and ...

단일 분자 힘 분광법은 중합체의 기계적 및 접착제 특성을 설명하는 물리적 매개 변수를 측정할 수 있게 합니다. 단일 분자를 연구하기 위해 AFM 기반 힘 분광법을 사용하는 경우 이러한 분자를 AFM 캔틸레버 팁에 공유하여 결합하기 위한 신뢰할 수 있고 효율적인 프로토콜을 갖는 것이 필수적입니다. 이 프로토콜은 등고리 길이 또는 소수성에 관계없이 많은 상이한 폴리머에 채택될 수 있다.모든 단계는 유기 증기의 흡입을 피하기 위해 연기 후드에서 수행해야합니다. 또한 용매 방지 유리, 실험실 코트 및 눈 보호가 필요합니다. 먼저 새로 청소된 핀셋을 사용하여 플라즈마 챔버에 AFM 캔틸레버 칩을 배치하십시오.시작 및 예를 선택하여 플라즈마 챔버 표면 활성화 프로그램을 시작합니다. 플라즈마 공정이 제대로 작동하는지 확인합니다. 산소 함량이 높은 플라즈마 공정은 밝은 파란색을 보여줍니다.표면 활성화 프로그램이 실행되는 동안, 톨루엔에 실레인-PEG-mal을 용해하여 밀리리터당 1.25 밀리그램의 농도를 얻습니다. 플랫 페트리 접시에 용액 의 3 밀리리터를 배치합니다. 플라즈마 공정이 완료되면 확인 을 선택한 다음 환기를 선택하여 플라즈마 챔버를 환기시다.오염 물질의 흡수를 방지하기 위해 즉시 다음 단계로 진행합니다. 칩을 페트리 접시에 놓고 칩을 섭씨 60도에서 3시간 동안 배양합니다. 오븐에서 페트리 접시를 제거하고 적어도 10 분 동안 식힙니다.다음으로 칩을 헹지 마십시오. PEG 또는 폴리스티렌 바인딩의 경우 톨루엔으로 칩을 세 번 헹른다. 폴리니캄 바인딩의 경우, 칩은 톨루엔으로 한 번 헹구고 에탄올로 두 번 헹구어야 합니다.모세관이 AFM 캔틸레버에 미치는 영향을 줄이려면 헹군 때 칩을 약간 기울이십시오. AFM 캔틸레버 칩은 실험에 영향을 미칠 수 있는 과도한 물리적 중합체를 제거하기 위해 제대로 헹을 필요가 있다. 헹도 은 AFM 캔틸레버에 손상을 방지하기 위해 신중하게 수행해야합니다.마지막으로, 공유 폴리머 부착을 거치지 않는 컨트롤역할을 하기 위해 적어도 두 개의 칩을 준비한다. PEG 및 폴리스티렌 칩과 비교하여 컨트롤의 경우 에탄올로 두 번 헹구고 물을 한 번 헹구십시오. 폴리니캄 칩과 비교하여 컨트롤을 원하면 물로 두 번 헹구세요.PEG 또는 폴리스티렌의 공유 부착을 수행하려면 밀리리터 당 1.25 밀리그램의 농도로 톨루엔에 3 밀리리터의 폴리머 용액을 준비합니다. 솔루션과 칩을 페트리 접시에 넣고 칩을 섭씨 60도에서 1시간 동안 배양합니다. PEG 또는 폴리스티렌을 배양한 후 칩이 10 분 동안 식힙니다.톨루엔으로 칩을 두 번 헹구고, 에탄올로 두 번, 한 번은 물로 헹구세요. 폴리니캄의 공유 부착을 수행하려면 밀리리터당 1.25 밀리그램의 농도로 에탄올에 폴리머 용액 3밀리리터를 준비합니다. 솔루션과 칩을 페트리 접시에 넣고 실온에서 3시간 동안 칩을 배양합니다.폴리니밍으로 인큐베이션 한 후, 에탄올로 칩을 두 번 헹구고 물로 두 번 헹구세요. 실험에 사용할 때까지 칩을 저장하려면 각 칩을 물로 채워진 1 밀리리터 페트리 접시에 따로 놓습니다. 페트리 요리를 섭씨 4도까지 유지하십시오.먼저 기능화된 AFM 캔틸레버 칩을 칩 홀더에 삽입합니다. 준비된 표면을 액체의 측정에 적합한 샘플 홀더에 붙입니다. 파이펫을 사용하여 칩을 물에 담급다.샘플 표면을 AFM에 장착합니다. 샘플 표면을 물에 담급다. 칩 홀더를 AFM에 연결합니다.그런 다음 칩에 샘플 표면에 접근합니다. 환경 패널을 사용하여 대상 온도를 설정하고 모드와 피드백 라디오 버튼을 켭팅합니다. 그런 다음 시스템이 약 15 분 동안 평형하게하십시오.힘 확장 곡선을 사용하려면 AFM 캔틸레버 팁에 접근하여 표면에 접근하고 단일 힘을 선택합니다. 결과 곡선은 빨간색으로 표시된 표면에 대한 접근 방식과 파란색으로 표시된 철회와 함께 압착 거리에 대한 편향을 표시합니다. AFM 캔틸레버 팁의 들여쓰기를 나타내는 곡선의 부분을 기본 표면으로 확장합니다.선형 맞춤을 수행하려면 접근 방식 또는 철회 곡선에 커서를 설정하고 컨텍스트 메뉴에서 INVOLS 업데이트를 선택합니다. 역 광학 레버 감도 값의 결과 값은 왼쪽 상단의 패널에 나타납니다. 이 절차를 최소 5회 반복한 후 역 광학 레버 감도에 대한 평균을 계산하고 패널의 평균을 입력합니다.AFM 캔틸레버를 사전 참여로 이동을 선택하여 표면 위에 약 100 마이크로미터의 높이로 배치합니다. 열 소음 스펙트럼에 대한 만족스러운 신호 대 잡음 비율을 얻으려면 평균 수를 최소 10개로 설정하고 가능한 가장 높은 주파수 해상도를 선택합니다. 다음으로, 캡처 열 데이터를 선택하여 열 잡음 스펙트럼을 기록합니다.간단한 고조파 발진기 기능으로 열 잡음 스펙트럼에 맞게, 첫 번째 공명 피크를 나타내는 곡선의 부분을 확장합니다. 그런 다음 초기화 맞춤을 선택합니다. 마지막으로, 핏 열 데이터 버튼을 사용하여 핏을 개선합니다.각 힘 상수는 패널에 나타납니다. 데이터 수집을 시작하려면 실험의 매개 변수를 설정합니다. 당김 속도를 초당 1마이크로미터로 설정하고 1나노뉴턴으로 방아쇠를 강제로 설정합니다.표면에 AFM 캔틸레버 팁을 접근하고 단일 곡선을 기록하기 위해 단일 힘을 선택하고 원고에 설명된 대로 매개 변수를 조정해야 하는지 여부를 결정합니다. 마스터 패널에서 F 맵을 선택합니다. 100개의 커브가 있는 힘 맵을 얻으려면 힘 점과 힘 줄 수를 10개로 설정합니다.F 맵을 선택하여 힘 맵 녹화를 시작합니다. 로컬 표면 효과를 방지하고 다른 표면 영역을 평균하기 위해 그리드와 같은 방식으로 힘 확장 곡선을 사용하십시오. 실험 후, 역 광학 레버 감도 및 스프링 상수의 결정을 반복하여 시스템의 일관성과 안정성을 확인합니다.단일 폴리니캄과 PEG 폴리머는 한쪽 끝에 AFM 캔틸레버 팁에 동질적으로 결합되었고 다른 쪽 끝에는 이산화규 표면에 물리분해되었다. 온도 의존적 스트레칭 거동을 측정하기 위해, 명확한 단일 분자 스트레칭 이벤트와 각각의 힘 연장 곡선의 끝에 최종 최대가 확인되었다. 그런 다음 모든 온도에 대해 단일 마스터 커브가 생성되었습니다.PEG의 경우, 증가된 온도로 스트레칭 력의 감소가 관찰되었다. 폴리니캄의 경우, 반대 추세가 관찰되었다. 물 에서 SAM 표면에서 폴리스티렌의 탈착력과 길이를 결정하는 데 사용할 수 있습니다.중합체 부착이 성공했을 때, 힘 연장 곡선은 일정한 힘의 고원을 보였다. 각 고원은 탈착력 및 탈착 길이를 결정하기 위해 시그모이드 곡선을 장착했다. 관찰된 탈착력은 이전에 획득한 값에 대응하였다.AFM 캔틸레버 팁에 부착된 하나 이상의 폴리머가 힘 연장 곡선에서 고원의 폭포를 관찰했다. 2개의 폴리머가 부착된 상태에서, 탈취 력은 좁은 분포를 보였을 때 탈착 길이에 대해 바이모달 분포가 발견되었다. 기능화된 AFM 캔틸레버 팁은 액체 환경과 외부 자극으로 단일 분자의 힘 반응을 정량화하는 데 사용할 수 있습니다.청정 장비, 용매, AFM 캔틸레버 팁 및 반복 헹구기의 사용은 설명된 제어 실험 전에 확인해야 하는 높은 수준의 청결에 도달하는 것이 매우 중요합니다. 제시된 프로토콜과 절차는 자극 반응성 폴리머 시스템을 더 잘 이해할 수 있는 길을 열었습니다. 결과는 분자 동적 시뮬레이션과 직접 비교할 수 있습니다.

covalent-attachment-single-molecules-for-afm-based-force

Research

연구

JoVE Journal

Chemistry

화학

셀룰로솜은 셀룰로오스를 소화하도록 설계된 다효소 복합체입니다. AFM 기반 SMFS는 셀룰로솜 관련 단백질 어셈블리의 기계적 특성과 접힘 구성을 연구하는 데 사용되었습니다. 우리는 셀룰로솜 조립에 관여하는 개별 수용체-리간드 복합체의 상호 작용을 연구하기 위해 단백질 고정화, 데이터 수집 및 데이터 분석을 위한 완전한 워크플로우를 제시합니다.

AFM 기반 Single-molecule Force Spectroscopy를 사용한 셀룰로솜의 수용체-리간드 시스템 조사

다양한 단일 분자를 AFM 팁에 공유 결합하는 프로토콜이 제시됩니다. 고체 지지체 및 생체 계면에서 이러한 분자의 접착력과 자유 에너지를 결정하기 위한 절차와 예가 제공됩니다.

원자 힘 분광학에 의해 단일 ​​분자 접착 조사

여기서 우리는 원 자간 력 현미경 (AFM)을 사용하여 단일 분자 힘 분광법 측정에 의해 잘 정의 된 무기 표면 중 펩티드 또는 아미노산의 상호 작용의 힘을 측정하기위한 프로토콜을 제시한다. 측정으로부터 얻어진 정보는 더 펩타이드 무기물 계면을 이해하는 것이 중요하다.

단일 분자 힘 분광학을 사용하여 무기 재료와 아미노산 및 펩타이드의 상호 작용에 대한 통찰력

우리는 상세한 절차 및 전략 기계적 특성 및 기계적 전개 경로 원자 힘 현미경을 사용 하 여 단일 단백질 분자의 측정을 설명 합니다. 우리는 또한 선택과 좋은 단일 단백질 분자 기록의 정당성에 대 한 참조로 대표적인 결과 보여줍니다.

원자 힘 현미경을 사용 하 여 단일 단백질 분자 힘 분광학

이 프로토콜에 설명 합니다 heterobifunctional 실 란 커플링 에이전트와 원자 힘 현미경 검사 법 기반 단일 분자 힘 분광학을 위한 실리콘 산화물 표면에 의해 궁 행 되는 단백질의 화학식 동원 정지는 RrgA의 상호 작용 (pilus-1 팁 adhesin의 S. 균) fibronectin 함께.

단일 분자 힘 분광학에 대 한 단백질의 화학식 동원 정지

우리는 면역학적 연구를 위한 단 하나 T 세포 및 비드 입자를 가진 원자력 현미경 (AFM) 캔틸레버를 기능화하는 프로토콜을 제시합니다. AFM에 의해 단일 쌍 T 세포 수지상 세포 결합을 조사하고 형광 이미징을 통해 AFM에 의해 단일 고체 입자에 대한 대식세포의 실시간 세포 반응을 모니터링하는 절차가 도시된다.

단일 T 세포또는 면역 학적 단세포 힘 분광학을 위한 단입자를 가진 원자력 현미경 캔틸레버의 기능화

우리는 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)을 사용하여 유리 표면을 패시베이션하는 방법을 설명한다. 이 프로토콜은 표면 세정, 표면 기능화 및 PEG 코팅을 다룹니다. 우리는 기존의 방법에 비해 보호의 우수한 품질을 얻을 수있는, 두 차례에 걸쳐 PEG 분자와 표면을 치료하기위한 새로운 전략을 소개합니다.

단일 분자의 단백질 연구에 대한 표면 패시베이션

우리는 표면에 BMP-2를 효율적으로 고정화를 달성하기위한 방법을 설명합니다. 우리의 접근은 유리 아민 잔기를 통해 BMP-2 공유 결합을 달성하기 위해 자기 조립 단분자막의 형성에 기초한다. 이 방법은 세포막에서 신호를 연구 할 수있는 유용한 도구입니다.

공유 결합은 자기 조립 단분자막의 접근 방식을 사용하여 표면에 BMP-2의 결합

실리카 나노 입자는 실록산 전구체의 산 촉매 작용과 마이크로파 보조 합성 기술을 사용하여 제조되어 직경 30-250 nm 범위의 나노 물질의 성장을 제어했습니다. 성장 역학은 초기 규산 농도, 반응 시간 및 반응 온도를 변화시켜 제어할 수 있습니다.

전자 레인지를 이용한 산 - 촉매 반응을 통해 실리카 나노 입자의 제조

전원 초음파에 제출 액체의 음향 공동화 음파 발광으로 알려진 특이한 화학 반응성 및 발광의 원점입니다 붕괴 거품 안에 과도 극한 상황을 만듭니다. 불활성 기체의 존재하에, 비평 형 플라즈마가 형성된다. 거품 붕괴에 의해 생성 된 "핫"입자와 광자 용액에 종을 자극 할 수 있습니다.

분자, 이온, 및 음향 공동 현상과 고체 입자를 활성화

학습하세요 AFM 기반 힘 분광학에서 단일 분자의 공유 부착 방법을. 플라즈마 처리, 실란화, 중합체 부착 단계를 통해 PEG, 폴리스티렌 등 다양한 중합체의 기계적 특성을 정밀 측정할 수 있습니다.

AFM 기반 힘 분광학을 위한 단일 분자의 공유 부착

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