Name: 살아있는 바이오 뱅크의 창조 및 유지 보수 - 우리가 그것을 하는 방법 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-04-10T14:00:00.000+00:00
Duration: 13 min 8 s
Description: 학습하세요 대장암 및 췌장암을 위한 살아있는 바이오뱅크 구축 및 유지 관리 방법을. 환자유래 모델을 활용한 기능적 전임상 테스트와 정밀의학 연구에 활용할 수 있습니다.

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우리는 비디오의 녹음 및 편집에 대한 제니 버마이스터, 우리의 그래픽 조수를 인정합니다. 또한, 우리는 오랜 협력에 대한 외과 및 병리학 부서의 동료에게 감사드립니다. 또한 로스토크 대학교 IT 미디어 센터의 프로덕션 매니저인 마커스 뮐러(Marcus Müller)에게 오디오 녹음 장비를 제공하고 음질을 개선해 주신 것에 대해 감사드립니다.
자금 조달: 독일 암 원조 재단 (DKH e.V.), 교부금 번호 108446, 주 메클렌 부르크 - Vorpommern에서 번호 TBI-V-1-241-VBW-084를 부여 부분적으로이 연구에 자금을 지원.

<ol><li>Sartore-Bianchi, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PIK3CA+mutations+in+colorectal+cancer+are+associated+with+clinical+resistance+to+EGFR-targeted+monoclonal+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">PIK3CA mutations in colorectal cancer are associated with clinical resistance to EGFR-targeted monoclonal antibodies.</a> Cancer research. 69 (5), 1851-1857 (2009).</li>
<li>Pauli, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+In+Vitro+and+In+Vivo+Cancer+Models+to+Guide+Precision+Medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+discovery%22%5BJournal%5D)">Personalized In Vitro and In Vivo Cancer Models to Guide Precision Medicine.</a> Cancer discovery. 7 (5), 462-477 (2017).</li>
<li>Lipson, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+new+ALK+and+RET+gene+fusions+from+colorectal+and+lung+cancer+biopsies%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+medicine%22%5BJournal%5D)">Identification of new ALK and RET gene fusions from colorectal and lung cancer biopsies.</a> Nature medicine. 18 (3), 382-384 (2012).</li>
<li>Wilding, J. L., Bodmer, W. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cancer+cell+lines+for+drug+discovery+and+development%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">Cancer cell lines for drug discovery and development.</a> Cancer research. 74 (9), 2377-2384 (2014).</li>
<li>Mouradov, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorectal+cancer+cell+lines+are+representative+models+of+the+main+molecular+subtypes+of+primary+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">Colorectal cancer cell lines are representative models of the main molecular subtypes of primary cancer.</a> Cancer research. 74 (12), 3238-3247 (2014).</li>
<li>Klier, U., Maletzki, C., Kreikemeyer, B., Klar, E., Linnebacher, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combining+bacterial-immunotherapy+with+therapeutic+antibodies%3A+a+novel+therapeutic+concept%5BTitle%5D)+AND+%22Vaccine%22%5BJournal%5D)">Combining bacterial-immunotherapy with therapeutic antibodies: a novel therapeutic concept.</a> Vaccine. 30 (17), 2786-2794 (2012).</li>
<li>DiMasi, J. A., Reichert, J. M., Feldman, L., Malins, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+approval+success+rates+for+investigational+cancer+drugs%5BTitle%5D)+AND+%22Clinical+pharmacology+and+therapeutics%22%5BJournal%5D)">Clinical approval success rates for investigational cancer drugs.</a> Clinical pharmacology and therapeutics. 94 (3), 329-335 (2013).</li>
<li>Gao, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+screening+using+patient-derived+tumor+xenografts+to+predict+clinical+trial+drug+response%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+medicine%22%5BJournal%5D)">High-throughput screening using patient-derived tumor xenografts to predict clinical trial drug response.</a> Nature medicine. 21 (11), 1318-1325 (2015).</li>
<li>Mullins, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+Biobanking+and+Tumor+Model+Establishment+of+Human+Colorectal+Carcinoma+Provides+Excellent+Tools+for+Preclinical+Research%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Integrated Biobanking and Tumor Model Establishment of Human Colorectal Carcinoma Provides Excellent Tools for Preclinical Research.</a> Cancers. 11 (10), (2019).</li>
<li>Kuehn, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+and+characterization+of+HROC69+-+a+Crohn%27s+related+colonic+carcinoma+cell+line+and+its+matched+patient-derived+xenograft%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+reports%22%5BJournal%5D)">Establishment and characterization of HROC69 - a Crohn's related colonic carcinoma cell line and its matched patient-derived xenograft.</a> Scientific reports. 6, 24671(2016).</li>
<li>Dangles-Marie, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+of+human+colon+cancer+cell+lines+from+fresh+tumors+versus+xenografts%3A+comparison+of+success+rate+and+cell+line+features%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">Establishment of human colon cancer cell lines from fresh tumors versus xenografts: comparison of success rate and cell line features.</a> Cancer research. 67 (1), 398-407 (2007).</li>
<li>Gock, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tumor+Take+Rate+Optimization+for+Colorectal+Carcinoma+Patient-Derived+Xenograft+Models%5BTitle%5D)+AND+%22BioMed+research+international%22%5BJournal%5D)">Tumor Take Rate Optimization for Colorectal Carcinoma Patient-Derived Xenograft Models.</a> BioMed research international. 2016, 11715053(2016).</li>
<li>Collins, A. T., Lang, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+systematic+review+of+the+validity+of+patient+derived+xenograft+%28PDX%29+models%3A+the+implications+for+translational+research+and+personalised+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22PeerJ%22%5BJournal%5D)">A systematic review of the validity of patient derived xenograft (PDX) models: the implications for translational research and personalised medicine.</a> PeerJ. 6, 5981(2018).</li>
<li>Brown, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patient-derived+xenograft+models+of+colorectal+cancer+in+pre-clinical+research%3A+a+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Oncotarget%22%5BJournal%5D)">Patient-derived xenograft models of colorectal cancer in pre-clinical research: a systematic review.</a> Oncotarget. 7 (40), 66212-66225 (2016).</li>
<li>Zhang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+extent+of+inflammatory+infiltration+in+primary+cancer+tissues+is+associated+with+lymphomagenesis+in+immunodeficient+mice%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+reports%22%5BJournal%5D)">The extent of inflammatory infiltration in primary cancer tissues is associated with lymphomagenesis in immunodeficient mice.</a> Scientific reports. 5, (2015).</li>
<li>Moyer, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spontaneous+murine+tumors+in+the+development+of+patient-derived+xenografts%3A+a+potential+pitfall%5BTitle%5D)+AND+%22Oncotarget%22%5BJournal%5D)">Spontaneous murine tumors in the development of patient-derived xenografts: a potential pitfall.</a> Oncotarget. 10 (39), 3924-3930 (2019).</li>
<li>Prall, F., Maletzki, C., Hühns, M., Krohn, M., Linnebacher, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorectal+carcinoma+tumour+budding+and+podia+formation+in+the+xenograft+microenvironment%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+one%22%5BJournal%5D)">Colorectal carcinoma tumour budding and podia formation in the xenograft microenvironment.</a> PloS one. 12 (10), 0186271(2017).</li>
<li>Guenot, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Primary+tumour+genetic+alterations+and+intra-tumoral+heterogeneity+are+maintained+in+xenografts+of+human+colon+cancers+showing+chromosome+instability%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+pathology%22%5BJournal%5D)">Primary tumour genetic alterations and intra-tumoral heterogeneity are maintained in xenografts of human colon cancers showing chromosome instability.</a> The Journal of pathology. 208 (5), 643-652 (2006).</li>
<li>Mattie, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+characterization+of+patient-derived+human+pancreatic+tumor+xenograft+models+for+preclinical+and+translational+development+of+cancer+therapeutics%5BTitle%5D)+AND+%22Neoplasia%22%5BJournal%5D)">Molecular characterization of patient-derived human pancreatic tumor xenograft models for preclinical and translational development of cancer therapeutics.</a> Neoplasia. 15 (10), New York, N.Y. 1138-1150 (2013).</li>
<li>Cho, Y. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorectal+cancer+patient-derived+xenografted+tumors+maintain+characteristic+features+of+the+original+tumors%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+surgical+research%22%5BJournal%5D)">Colorectal cancer patient-derived xenografted tumors maintain characteristic features of the original tumors.</a> The Journal of surgical research. 187 (2), 502-509 (2014).</li>
<li>Maletzki, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+Characterization+and+Drug+Response+of+Freshly+Established+Patient-Derived+Tumor+Models+with+CpG+Island+Methylator+Phenotype%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+one%22%5BJournal%5D)">Functional Characterization and Drug Response of Freshly Established Patient-Derived Tumor Models with CpG Island Methylator Phenotype.</a> PloS one. 10 (11), 0143194(2015).</li>
<li>Katsiampoura, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modeling+of+Patient-Derived+Xenografts+in+Colorectal+Cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+cancer+therapeutics%22%5BJournal%5D)">Modeling of Patient-Derived Xenografts in Colorectal Cancer.</a> Molecular cancer therapeutics. 16 (7), 1435-1442 (2017).</li>
<li>Wege, A. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Humanized+tumor+mice--a+new+model+to+study+and+manipulate+the+immune+response+in+advanced+cancer+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22International+journal+of+cancer%22%5BJournal%5D)">Humanized tumor mice--a new model to study and manipulate the immune response in advanced cancer therapy.</a> International journal of cancer. 129 (9), 2194-2206 (2011).</li>
<li>Herndler-Brandstetter, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Humanized+mouse+model+supports+development%2C+function%2C+and+tissue+residency+of+human+natural+killer+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Humanized mouse model supports development, function, and tissue residency of human natural killer cells.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (45), 9626-9634 (2017).</li>
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<li>Vlachogiannis, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patient-derived+organoids+model+treatment+response+of+metastatic+gastrointestinal+cancers%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Patient-derived organoids model treatment response of metastatic gastrointestinal cancers.</a> Science. 359 (6378), New York, N.Y. 920-926 (2018).</li>
<li>Gao, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Organoid+cultures+derived+from+patients+with+advanced+prostate+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Organoid cultures derived from patients with advanced prostate cancer.</a> Cell. 159 (1), 176-187 (2014).</li>
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<li>Abe, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+phosphoproteomic+analysis+for+phosphosignaling+and+active-kinome+profiling+in+Matrigel-embedded+spheroids+and+patient-derived+organoids%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+reports%22%5BJournal%5D)">Improved phosphoproteomic analysis for phosphosignaling and active-kinome profiling in Matrigel-embedded spheroids and patient-derived organoids.</a> Scientific reports. 8 (1), 11401(2018).</li>
<li>Neal, J. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Organoid+Modeling+of+the+Tumor+Immune+Microenvironment%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Organoid Modeling of the Tumor Immune Microenvironment.</a> Cell. 175 (7), 1972-1988 (2018).</li>
</ol>

살아있는 바이오 뱅크의 세대는 개인 정보 보호, 의료법 및 동물 복지, 좋은 인프라 및 잘 조정 된 팀의 법적 규정을 준수하는 것 외에도 전제됩니다. 조직 기증을 위해 개별 환자의 적합성을 아주 잘 평가할 수 있기 때문에 연구 절차에 있는 외과 직원의 일부를 직접 관련시키는 것이 유리하다는 것을 입증했습니다. 더욱이, 환자는 그들의 서면 승인이 외과 통보 동의 토론의 과정 내에서 얻어지는 때, biobanking와 더 자주 동의하는 경향이 있습니다. 시간과 자원을 절약하기 위해, 아마도 종양 조직의 부족한 양을 산출 할 경우는 바이오 뱅킹을 위해 선택해서는 안됩니다. 표본 획득에 관해서, 격언 "통신은 핵심입니다"간단하지만 종종 간과 진실이다. 그것은 단지 평소와 같이 진행하고 절제술 견본에 포름알데히드를 추가하여 처음부터 바로 표본을 망치기 위하여 단 하나 통보되지 않은 극장 간호원 또는 외과 동료를 취합니다. 따라서 관련 직원의 모든 구성원이 바이오 뱅킹을 위한 SOP에 익숙해지는 것이 절대적으로 중요합니다. 외과 의사는 예정된 조직 수집에 대한 절차의 시작 전날과 바로 눈치 채야한다. 또한 바이오뱅킹에 선정된 경우는 전자 또는 계획에서 강조표시되어야 합니다. 외과 표본에서 조직 수확은 병리학자에 의해 수행되어야한다. 첫째, 이것은 조직 수확이 최종 병리학 적인 보고를 방해하지 않는다는 것을 보장할 것입니다. 둘째, 이것은 실행 가능한 암 조직의 적당한 양으로 조직을 수신의 확률을 증가시킵니다. 특히 뚜렷한 담수화 반응과 빈번한 괴사 부위를 가진 췌장암에서는, 실행 가능한 부분은 훈련되지 않은 눈을 위해 매크로를 식별하기 어렵다. 이 규칙에 예외로, 큰 간 또는 폐 전이에서 조직 블록, 외과 마진이 매크로로 정의 될 수있는 경우, 외과 의사에 의해 때때로 "백 테이블"을 절제 할 수있다. 총 중각 절제술(TME)에 의해 제분된 직장암은 파라핀 포함 이전에 절제된 표본에서 채취된 조직 수확이 TME 품질 평가를 방해할 수 있기 때문에 바이오뱅킹에 적합하지 않을 수 있다. 대안적으로, 바이오뱅킹을 위한 조직은 직장암의 트랜스아날 생검에 의해 취득될 수 있다.
본래 종양으로부터 유래된 1차 세포 배양을 위한 확립비율은 일반적으로 낮다. PDX 유래, 이차 세포 배양은 더 성공적으로 설치될 수 있다. 각 경우에 대해 다른 매체를 테스트하고 수확 된 조직이 거의 멸균되지 않으므로 오염을 최소한으로 줄이기 위해 첫 번째 통로에 대한 항생제 보충제를 사용하는 것이 좋습니다. 성공적인 전파 후, 각 개별 세포주 FACS 분석에 의해 암 세포주로 확인 하 고 정기적으로 마이코 플라즈마 오염에 대 한 테스트 해야 합니다. 교차 오염을 제외하려면 정기적인 STR 분석이 좋습니다. 1차 세포주 및 이차 세포주를 위한 설립 프로토콜이 지속적으로 최적화를 받는다는 점에 유의해야 한다. 단일 미디어의 구성 및 성공률에 대한 세부 사항은 이 작품의 범위를 분명히 벗어나 별도로 게시될 것입니다.
PDX 이식의 경우 종양 조직은 10% DMSO 또는 유사한 동결 매체를 통해 태아 종아리 혈청에서 절제 후 직접 이식하거나 냉동 보존될 수 있다. 종양 조직 수확 시 즉시 이식하면 물류 및 실험실 직원에게 부담을 주며, 냉동 보존 후 xenografting 결과는 10전혀열등하지 않습니다. 더욱이, 종양 이식 전에 마트리겔에서 조직의 배양, 크게 이식 속도 증가12. 명확한 병리학적 발견과 잘못 수집된 조직 표본의 즉각적인 폐기에 따라 이식이 지연되는 것이 좋습니다. 수령 마우스의 면역 결핍으로 1 차 생생의 성공률이 증가하기 때문에, 우리는 최초의 PDX 통로에 NSG 마우스를 사용하는 경향이 있습니다. 첫 번째 성공적인 PDX 이식 후, NMRInu/nu 마우스는 후속 통로 및 조직 확장을 위해 사용될 수 있고 사용해야 합니다. 이 균주는 NSG 또는 유사한 면역 결핍 균주에 비해 더 강력하고 저렴하며 번식하기 쉽지만 여전히 합리적인 이식 속도를 보여줍니다. 또한, 그것의 누드 이식 및 종양 성장 모니터링을 촉진. 후속 구절에서 이식 속도를 높이기 위해, 우리는 특히 느린 성장 PDX및 낮은 기본 이식 성공률을 가진 경우에 대 한, 가능한 한 마우스를 호스트 하는 갓 수확 PDX 조직의 직접 전송 하는 것이 좋습니다. 콜린스와 랭은 최근 대장 PDX 설립의 14 연구를 검토하고 68 %의 중간 PDX 설립 비율로 14에서 100 %의 다양한 접목 비율을보고, 후자는 우리의 연구 결과와 일치되고13. 문헌에 따라, 우리는 대장암 PDX14에비해 췌장의 낮은 설립 비율을 관찰했다. 숙주 마우스 균주 및 종양 실체에 관계없이, 이식 측에서 인간, 엡스타인-바 바이러스(EBV)-연관된 B세포 림프종 및 뮤린 림프종의 아웃성장은 중요한 함정15,16을제기한다. 인식되지 않는 경우, 이러한 종양은 후속 구절을 "오염"할 수 있으므로 연속 결과를 혼동 할 수 있습니다. 특이한 빠른 PDX 성장과 자궁 경부의 붓기, axillar 및 inguinal 림프절은 뮤린 림프종 성장의 강한 지표이지만 PDX의 정기적 인 조직학적 검사는 그럼에도 불구하고 권장됩니다. 더욱이, PDX와 해당 기증자 환자 사이의 유전 적 일치는 STR 분석에 의해 정기적으로 테스트되어야한다. 이상적으로, 바이오뱅크는 환자 특성(일반 정보, 생존, 재발 자유로운 생존, 치료, 이차 신화증 등)을 포함하는 임상 데이터베이스에 연결되어야 한다. 개인 정보 보호의 법적 규정과 이러한 익명화된 데이터 기반의 부족으로 인해 당사의 임상 데이터 세트는 협력 의사가 정기적으로 관리하고 수동으로 업데이트합니다.
기존의 바이오뱅크는 천문대 연구로 제한되어 있지만, 살아있는 바이오뱅크는 체외 및 생체 내정간섭의 기회를 제공합니다. 환자 유래 세포주근본적인 연구, 고처리량 약물 스크리닝 및 새로운 제약에이전트4의평가를 위한 중요한 도구이다. 그러나 상응하는 PDX 모델은 원래 종양17,18의 공증을 면밀히 재구성하고19,20의여러 구절에 걸쳐 높은 유전적 안정성을 나타내기 때문에 중요성이 커지고 있다. 우리의 PDX 바이오 뱅크는 전임상 및 기초 연구를위한 우수한 플랫폼으로입증6,21. 더욱이, 대형 PDX 수집은 환자 집단의 개별 간 이질성을 적절히 반영하기 때문에, PDX 임상시험(PCT) 접근법(치료당 모델당 1마리)은 신약 및조합요법에대한 임상반응의 충실한 예측을 허용하기 때문에 약물 개발에 대한 중요성을 얻고 있다. 우리는 또한 현재 작은 PCT 예심에 있는 새로운 실험적인 약을 평가하고 있습니다.
이러한 유망한 결과에도 불구하고, 12.2개월의 중간 설립 기간은 PDX 모델의 임상 적용가능성을 항암 치료 옵션 테스트용 "아바타 마우스"로 방해하며, 적어도 즉각적인 보조 또는 신아드주반트 치료가 필요한환자(22)를대상으로 한다. 표준 PDX 모델의 추가 단점은 숙주 마우스의 면역 결핍으로 인한 면역 요법 테스트용 유용성이 부족하다는 것입니다. 이러한 한계를 극복하기 위해 여러 "인간화"마우스 균주가 개발되었습니다. 이들 마우스는 면역장애가 심하지만, PDX 에 이어 다양한 유형의 인간 골수유래 세포 또는 CD34+조혈줄기세포로 재구성될 수있으며,림프구 매개 세포독성 및 면역체크포인트 억제제 치료에 대한 치료 반응의 평가를 허용한다.
최근 몇 년 동안, 환자 유래 오르가노이드 (PDO)는 PDX와 경쟁하는 중요한 암 모델로 부상했습니다. 그대로 종양 조각에서 파생되고 세포외 매트릭스 스캐폴드에서 배양된 이 3차원 구조는 원래 종양의 조직학적 및 유전적 특성을 밀접하게 반영한다. 장기 확장 및 냉동 보존의 가능성은 PDO살아있는 바이오 뱅크26,27의이상적인 보충을 렌더링합니다. 비교적 높은 확립률 외에도, 여러 종양개체(28)의PDO에 대해 신뢰할 수 있는 약물 반응 예측이 보고되었다. 더욱이, PdOs는 종양 세포를 순환시키고 또한 대응하는 건강한 조직에서 organoids의 동시 설치가 가능하여 환자-개인 기준29,30에대한 치료 관련 독성의 평가를허용함으로써발생하였다. 그러나, 종래의 2D 세포 배양에 비해, 오르가노이드 배양은 시간과 자원이 소모되고 인공 세포외 매트릭스 화합물은 특정 분석절차(31)를방해할 수 있다. 더욱이, 암 오르가노이드는 건강한 상피(30)에서파생된 더 빠른 성장, 비 악성 오르가노이드에 의해 과성장에 취약하다. 기질, 혈관 및 면역 세포의 부족으로 인해, PdOs는 항 혈관 신생 면역 치료제의 테스트에 주로 적용되지 않습니다. 그러나 새로운 배양 방법은 시험관내종양 미세 환경을 모델링할 수 있게 하여 PDX모델(32)에대한 PDOs의 진정한 경쟁자가 되었다. 가까운 장래에 차세대 염기서열분석과 같은 강력한 유전 적 도구와 결합 된 환자 개인 종양 모델은 진정한 정밀 의학 및 맞춤형 치료 접근법으로가는 길을 열어 줄 것입니다.

최근 몇 년 동안, 암의 형태학, 임상 및 유전 적 특성에 대한 축적 된 지식은 이질성, 개별 질환으로 암의 개념으로 이어졌습니다. 결과적으로, 신생물의 돌연변이 특성화는 임상 및 병리학적 특징 외에도 임상 의사 결정에 중요성을 얻고 있으며 다양한 분자 변경을 위해 많은 표적 치료법이 개발되었습니다. 예를 들어, 대장암 치료에서 세툭시맙의 효능은 KRAS 및 PIK3CA 돌연변이 상태1의분석에 의해 예측될 수 있다. 정밀 의학은 각 환자에서 가장 높은 치료 반응을 제공하고 불부한 치료법2의독성을 피하기 위해 맞춤형 접근 방식을 목표로합니다. 바이오뱅크에는 임상 데이터와 연결된 암 환자의 조직, 혈액 및 기타 생물학적 물질이 포함되어 있어 번역암 연구를 위한 훌륭한 도구입니다. 많은 수의 임상 샘플로 인해 바이오뱅크는 희귀하지만 잠재적으로 약물이 가능한 돌연변이의 검출을 가능하게 하며, 이는 개별 환자에게 새로운 치료 기회를제공한다 3.
가능한 한 광범위하게 종양학 연구 스펙트럼을 커버하기 위해, 우리는 단독으로 견본 수확에 우리의 활동을 억제하지 않았습니다, 그러나 환자 유래암 세포주 및 xenografts (PDX)의 설치에 집중했습니다. 전통적인 2D 세포주 체외 연구의 코너 돌 남아 있으며 대규모 약물스크리닝4,5에대한 최고의 선택이다. 또한, 세포주 분석은 종종 더 쉽고 저렴하며 더 쉽게 사용할 수 있습니다. 또한, 환자 유래 말초 혈액 림프구(PBL)가 가능하기 때문에 종양 면역학도 시험관 6에서연구될 수 있다. 그러나, 시험관 내 또는 생체 내 실험에 기반한 세포에서 유망한 전임상 효과성을 가진 새로 개발된 약물의 대다수는 임상 시험7에서실망스러운 결과를 보였다. 대조적으로, 생체 내 PDX에 기초한 전임상 연구는 훨씬 더 충실하게 항신성형제의 임상 활성을 반영하였다8. PDX 조직은 기증자 종양의 조직학적 및 분자 특성을 밀접하게 반영하기 때문에 PDX 모델은 바이오 뱅크의 무결성을 유지하고 연구 그룹과 기관 간의 샘플 교환을 허용하기 위해 종종 매우 제한된 양의 실행 가능한 종양 조직을 전파하는 좋은 방법입니다. 더욱이, PDX 조직에서 유래된 암 세포주9보다 훨씬 쉽게 확립될 수있다. 최근 몇 년 동안, 우리의 워킹 그룹은 문제의 모든 생물학적 샘플에 대한 작업 흐름을 단계별 표준화 및 최적화하여 포괄적 인 통합 대장암 및 췌장암 바이오 뱅크를 설립했습니다(그림 1).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62065/62065fig01.jpg"> 그림 1: 바이오뱅크의 워크플로우 및 조직은 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62065/62065fig01large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

<table><tbody><tr><td>바실롤&레지; 심방세동; 1L</td><td>Bode, Hartmann</td><td>REF 973380</td><td>소독</td></tr><tr><td>PP 원심 분리기 튜브, 15ml; 멸균</td><td>Greiner Bio One</td><td>GBO Cat. 아니오.:188271</td><td>원심분리기 튜브</td></tr><tr><td>PP 원심분리기 튜브, 50ml, 멸균</td><td>Sarstedt</td><td>주문 번호: 62.547.254</td><td>원심분리기</td></tr><tr><td>튜브 BD DiscarditTM II 주사기 20ml</td><td>BD</td><td>REF 300296</td><td>채혈</td></tr><tr><td>세럼 7,5ml Sarstedt Monovette</td><td>Sarstedt</td><td>품목 번호: 01.1601</td><td>혈액 채취</td></tr><tr><td>혈청학 피펫 10ml</td><td>Sarstedt</td><td>REF 86.1254.001</td><td>액체 전달</td></tr><tr><td>Pipetboy ratiolab&reg; accupetta</td><td>Ratiolab</td><td>품목 번호: RL3200300</td><td>액체 전달</td></tr><tr><td>PIPETBOY acu 2</td><td>Integra Biosciences</td><td>VWR Cat.No: 613-4438</td><td>액체 전달</td></tr><tr><td>DPBS; Ca & 제외 Mg</td><td>팬 생명 공학</td><td>고양이 벽지 번호 : P04-36500</td><td></td></tr><tr><td>세척 Pancoll human</td><td>Pan Biotech</td><td>Cat. 번호: P04-60500</td><td>밀도 구배 원심분리</td></tr><tr><td>DMEM/F12 (Dulbecco' s Modified Eagle Medium)PAN</td> <td>Biotech</td><td>Cat. 번호: P04-41500</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>FBS Good Forte (Filtrated Bovine Serum)</td><td>PAN Biotech</td><td>Cat. 번호: P40-47500</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>L-글루타민 200mM</td><td>PAN 생명공학</td><td>고양이. 번호: P04-80100</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>트립신 / EDTA</td><td>PAN 생명공학</td><td>Cat. 번호: P10-023100</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>DMSO(세포 배양용 디메틸 설폭시드)</td><td>PanReac AppliChem</td><td>VWR Cat.No: A3672.0250</td><td>세포 동결</td></tr><tr><td>냉동 매체(10% DMSO가 포함된 FCS)</td><td>자체 제작</td><td>---</td><td>세포 동결</td></tr><tr><td>cryotube- CryoPure 2ml</td><td>Sarstedt</td><td>72380</td><td>세포 동결</td></tr><tr><td>6-웰 세포 배양 플레이트; 멸균; 뚜껑 포함</td><td>Greiner bio-one</td><td>Cat.-No.: 657 160</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>페트리 접시 92 x 16 mm, PS, 캠 없음</td><td>Sarstedt</td><td>Cat. 번호 : 82.1472.001</td><td>조직 준비</td></tr><tr><td>멸균 수술 용 블레이드</td><td>B.Braun (Aesculap)</td> <td>REF BB510</td><td>조직 준비</td></tr><tr><td>BD DiscarditTM II 주사기 10ml</td><td>BD</td><td>REF 309110</td><td>조직 준비</td></tr><tr><td>세포 여과기; 노란색; 100&micro; m</td><td>Falcon</td><td>REF 352360</td><td>조직 준비</td></tr><tr><td>CoolCell</td><td>biocision</td><td>품목 번호: -</td><td>1&deg의 210004 냉각 용기; C/min</td></tr><tr><td>듀어&nbsp; 운송 선박 유형 27 B, 2 l, 138 mm</td><td>KGW</td><td>Cat. 아니오: HT39.1</td><td>수송 체계</td></tr><tr><td>피펫 끝 200&micro; l</td><td>Sarstedt</td><td>REF 70.760.002</td><td>액체 이동</td></tr><tr><td>여과기 끝 1000&micro; l</td><td>Sarstedt</td><td>REF 70.762.411</td><td>액체 이동</td></tr><tr><td>피펫 200&micro; l, 노란색</td><td>Eppendorf</td><td>Cat. 번호: 3121 000.082</td><td>액체 전달</td></tr><tr><td>피펫 1000&micro; l, 블루</td><td>Eppendorf</td><td>Cat. 번호: 3121 000.120</td><td>액체 이송</td></tr><tr><td>인큐베이터&nbsp; BB 6220 CU</td><td>Heraeus</td><td>Cat.-No.: 51012839</td><td>세포 배양</td></tr><tr><td>가열판 PR&Auml; ZITHERM</td><td>Harry Gestigkeit GmbH</td><td>---</td><td>가열</td></tr><tr><td>현미경 Zeiss Primo Vert</td><td>Carl Zeiss MicroImaging GmbH</td><td>일련 번호.3842000839</td><td>이미징 세포 배양</td></tr><tr><td>멸균 벤치 Safe flow 1.8 nunc</td><td>nunc GmbH & Co. KG</td><td></td>---<td>멸균 작업대</td></tr><tr><td>냉동고 -80&deg; C</td><td>Kryotec-Kryosafe GmbH</td><td>---</td><td>sample storage</td></tr><tr><td>Electronic balance MP-300</td><td>Chyo</td><td>---</td><td>Scale</td></tr><tr><td>BD Micro-fine, U100 insulin syringe</td><td>BD</td><td>REF 324826</td><td>injection aneesthetic</td></tr><tr><td>Rompun 2%; 25ml</td><td>Bayer</td><td>승인 번호: 6293841.00.00</td><td>마취제</td></tr><tr><td>Ketamin 100 mg/ml, 25ml</td><td>CP-Pharma GmbH</td><td>승인 번호: 401650.00.00</td><td>마취</td></tr><tr><td>GES3S 리더</td><td>Datamars</td><td>사용할 수 없음</td><td>RFID 리더</td></tr><tr><td>ISO-트랜스폰더 FDX-B (1,4x8mm)</td><td>Peddymark</td><td>---</td><td>RFID 칩</td></tr><tr><td>Cotrim-ratiopharm&reg; &nbsp; 암풀렌 SF 480&nbsp; 마그네슘/5&nbsp; ml</td><td>Ratiopharm</td><td>PZN-03928197</td><td>항생제 식수</td></tr><tr><td>가열판 #FM-20 42x28cm</td><td>드래곤</td> <td>---</td><td></td></tr> <tr><td>난방 램프</td><td>전기 Petra, Burgau</td> <td>---</td> <td>눈</td></tr><tr><td>과 코용 연고 (5 % Dexpanthenol) Bepanthen</td><td>Bayer</td><td>PZN-01578675</td><td>눈 보호</td></tr><tr><td>해부학 핀셋</td><td>B.Braun Aesculap</td><td>BD21 OR</td><td>수술 기구</td></tr><tr><td>수술용 핀셋</td><td>B.Braun Aesculap</td><td>BD50 1 R</td><td>수술용 기구</td></tr><tr><td>가위</td><td>B.Braun Aesculap</td><td>BC05 6R</td><td>수술용 기구</td></tr><tr><td>바늘&nbsp; 홀더</td><td>B.Braun Aesculap</td><td>BH1 1 또는</td><td>수술 기구</td></tr><tr><td>Prolene 5-0</td><td>Ethicon</td><td>XN8870. P32</td><td>외과용 봉합사 재료</td></tr><tr><td>반대편 수증기 투과성 스프레이 드레싱</td><td>Smith& 조카</td><td>REF 66004978, PZN- 02063507</td><td>외과용 봉합사 재료</td></tr><tr><td>접착 조리개 드레이프</td><td>장벽</td><td>REF 904622</td><td>멸균 OP 조직</td></tr><tr><td>거즈 스왑 Gazin>; 멸균; 10x10cm</td><td>Lohmann& Rauscher</td><td>REF 18506</td><td>멸균 OP 티슈</td></tr><tr><td>Raucotupf 코튼 팁 애플리케이터</td><td>Lohmann& Rauscher</td><td>REF 11969</td><td>애플리케이터</td></tr><tr><td>Corning&reg; Matrigel Basement Membrane Matrix</td><td>Corning</td><td>Cat.-No.: 354234</td><td>Basement Membrane Matrix</td></tr><tr><td>요오드 용액 Braunol (7,5g povidone iodine)</td><td>B.Braun Melsungen AG</td><td>품목 번호: 18839</td><td>desinfection</td></tr><tr><td>MACS&reg; 조직 보관 솔루션</td><td>Miltenyi Biotec GmbH</td><td>주문 번호:130-100-008</td><td>보관 솔루션</td></tr><tr><td>Formafix 4%</td><td>Grimm med. Logistik GmbH</td><td>품목 번호: F10010G</td><td>고정 솔루션</td></tr><tr><td>Software FreezerworksBasic</td><td>Dataworks Development, Inc</td><td>---</td><td>sample organization</td></tr><tr><td>Zebra TLP 2844 프린터</td><td>Zebra</td><td>---</td><td>라벨 프린터</td></tr></tbody></table>

살아있는 바이오 뱅크의 창조 및 유지 보수 - 우리가 그것을 하는 방법

Creation and Maintenance of a Living Biobank - How We Do It

암의 개별 적인 속성 및 이질성에 관하여 증가하는 지식의 관점에서, 개인화한 약의 신흥 필드는 전임상 연구를 위한 발판이 필요합니다. 최근 몇 년 동안, 우리는 1 차종양 조직, 정상 조직, 세라, 고립 된 말초 혈액 림프구 (PBL), 환자 유래 제노 이식 (PDX), 뿐만 아니라 1 차 및 이차 암 세포주로 구성된 대장암 및 췌장암의 바이오 뱅크를 설립했습니다. 원래 종양 조직이 제한되어 있고 1차 암 세포주의 확립속도가 여전히 상대적으로 낮기 때문에, PDX는 바이오뱅크의 보존 및 확장뿐만 아니라 이차암 세포주의 생성을 허용한다. 또한 PDX 모델은 전임상 약물 검사를 위한 이상적인 생체 내 모델로 입증되었습니다. 그러나 바이오뱅킹은 신중한 준비, 엄격한 지침 및 잘 조율된 인프라가 필요합니다. 콜절제술, 십이지장 생성 절제술 또는 절제된 전이 표본은 절제 직후 수집되어 병리학 부서로 옮겨질 수 있습니다. 해부를 수행하는 출석 병리학자의 재량에 따라 편견없는 조직 병리학 보고서의 우선 순위를 존중하는 것은 작은 종양 조각 및 비 종양 조직을 수확합니다. 
괴사 부품은 버려지고 나머지 종양 조직은 작고 동일한 큐브로 절단되고 나중에 사용하기 위해 냉동 보존됩니다. 추가적으로, 종양의 작은 부분은 1 차적인 암 세포 배양을 위해 다진 및 긴장됩니다. 추가적으로, 수술 전 및 수술 후 환자에게서 뽑아낸 혈액 샘플은 혈청 및 PBL을 얻기 위하여 처리됩니다. PDX 이식의 경우, 냉동 보존 된 표본은 면역 결핍 마우스의 측면으로 해동되고 이식됩니다. 결과 PDX는 "기증자" 종양의 역사학을 밀접하게 재구성하고 후속 xenografting 또는 나중에 사용하기 위해 냉동 보존에 사용될 수 있습니다. 다음 작업에서, 우리는 대장암과 췌장암의 큰 바이오 뱅크의 생성, 유지 보수 및 관리의 개별 단계를 설명합니다. 또한 바이오뱅킹과 관련된 중요한 세부 사항과 주의 사항을 강조합니다.

우리 손에는 1차 세포 배양(그림 2A&amp;B)의설립률은 대형 시리즈9에서12.9%였다. 새로운 외과 절제 된 표본에서 확장 가능한 종양 세포를 분리 하는 시도의 대부분은 성장 또는 초기 오염의 부족으로 인해 실패. 세포주 설립은 표준 배양 조건(DMEM, 10% FCS, 표준 배양 용기)에서 꾸준한 성장을 이한 3개 통로와 FACS 분석을 통한 상피 분화검증(10)에성공한 것으로 간주되었다. PDX종양(도 2C &amp; D)에서유래한 세포주들은 23.6%의 높은 확립율을 보였으며, 이는 또한 1차 절제된 종양9과는 대조적으로 반복적 시도의 가능성 때문이기도 하다. 그러나, 일부 혼합배양(도 2E)은섬유아세포 성장에서 해방될 수 없거나 섬유아세포 과성장(도2F)으로인해 손실되기도 한다.
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62065/62065fig02.jpg"> 그림 2: 세포 배양. 1차 암 세포주, 대장암 케이스 HROC313의 전이로부터 유래된, 통과 21(A) 및 췌장암 케이스 HROP88, 통로 5(B). PDX 유래 암 세포주 결장 PDX HROC285 T0 M2 (D) 및 췌장 PDX HROP10 T5 M2, 통로 4 (E). 췌장암 HROP75, 통로 8 (C) 및 섬유 아세포 과성장 (F)에서 섬유 아세포 및 암세포의 혼합 배양. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62065/62065fig02large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
PDX 생성 프로토콜의 변화를 고려하면, 마우스 균주 사용 및 또한 몇 년 동안 실험자, 이식에 사용할 수있는 종양 조직의 양에 큰 차이뿐만 아니라, PDX 생성의 전반적인 성공률을 제공하는 것은 사소한 일이 아니다. 최근 2명의 연구원(S.M 및 F.B.)에 의해 수행된 PDX 세대 실험의 아주 최근 시리즈에서, 대장 PDX에 대한 63%의 1차 성장률(그림 3A에서예시적인 히스토릭이 묘사될 수 있음) 및 췌장 PDX(그림3B)의경우 48%가 관찰되었다. 이식 부위에서 뮤린 또는 인간 림프종의 자라나는 것은 비교적 드물지만 성공적인 PDX 아웃성장을 모방할 수있습니다(도 3C). 조직 병리학 검사 외에도 PDX 모델과 기증자 환자 간의 일치는 짧은 탠덤 반복 (STR) 분석(그림 3D)에의해 정기적으로 확인되었습니다. 현재까지 바이오뱅크는 &gt;50초및 &gt;50초, 3차 및 6차 췌장암 세포주와 &gt;150대장 및 19개의 췌장 PDX 모델로 구성된다.
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62065/62065fig03.jpg"> 그림 3: 대장(A) 및 췌장 PDX(B)의 대표적인 조직학적 비교. PDX 아웃성장을 모방하는 이식 부위의 인간 림프종(C). PDX 모델(HROC430 T1 M2)의 유전자 ID 검사는 짧은 탠덤 반복(STR) 분석에 의하여 원래 환자 종양 조직(HROC430Tu)에 대한 것이다. 9개의 STR loci, vWA, THO1, TPOX, CSF1 PO(FAM 염료) 및 D5S818, D13S317, D7S820, D16S539(HEX 염료)의 비교는 모세관 및 소형성 전기포에 따른 다중PCR을 이용한 멀티플렉스 PCR을 사용하여 유전자검사(유전자펜소)를 확인하였다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62065/62065fig03large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

다음 작업에서는 대장암과 췌장암의 대형 바이오뱅크 설립에 필요한 연속적인 단계를 설명합니다.

In light of the growing knowledge about the inter-individual properties and heterogeneity of cancers, the emerging field of personalized medicine requires ...

살아있는 바이오 뱅크의 창조와 유지 보수는 우리가 어떻게 하는지. 소개. 전통적인 biobanks는 일반적으로 비 실행 가능한 조직 및 혈액 견본을 포함합니다. 암 환자 집단의 다양성을 적절히 반영하고 유전 및 조직학적 분석을 허용함에도 불구하고 치료 전략을 평가하는 전임상 분석에는 적합하지 않습니다.또한 환자 파생 모델을 통합하는 바이오 뱅크는 이러한 한계를 극복합니다. 따라서 정밀 의학을 위한 기능 적 테스트를 가능하게 합니다. 샘플 수집.대장암과 췌장암의 바이오뱅킹을 위해, 입증된 진단과 충분한 종양 크기로 케이스를 선출하는 것은 필수입니다. 수술이 시작되기 전에, 분리 된 주사기를 사용하여 20ml의 혈액과 혈청 모노벳으로 추가 7.5ml를 그립니다. 혈청 처리 및 PBL 격리.1, 128 RCF에서 128 RCF에서 4도에서 15분 동안 원심 분리 후 혈청은 미리 표지된 극저온튜브에서 알리인용되고 액체 질소에 직접 침수된다. 헤파린화 혈액은 폴리 프로필렌 튜브로 옮겨지고 15ml PBS로 희석됩니다. 세로지학적 파이펫을 사용하여 15ml 판콜과 천천히 혼합물을 밑아래 놓습니다.밀도 그라데이션 원심 분리 후, 단핵 세포를 포함하는 불투명층은 세로지학적 파이펫으로 채택되어 새로운 PP 튜브로 이송된다. PBS로 세척하고 원심분리에 의해 단일 핵 세포를 펠릿화 한 후, 상체를 폐기하고 냉동고 배지에서 펠릿을 다시 중단하고 미리 표시된 냉동고로 분배하십시오. 튜브를 분당 1도로 느린 동결에 적합한 냉각 용기로 옮기고 임시 80도에서 임시 보관하십시오.조직 처리. 조직 표본이 외과 의사에 의해 절제되는 즉시, 적합한 용기에 넣어. 조직이 포르말린으로 덮여있는 모든 상황에서 피하십시오.절제 마진의 병리학적 평가와 관련이 없는 종양 물질의 절제를 위한 병리학으로 가능한 한 빨리 운반한다. 종양 조각은 가능한 한 무균으로 처리되어야한다. 또한 건강한 조직의 표본을 얻고 얼음에 조직 저장 용액으로 미리 채워진 별도의 튜브에 둘 다 배치하십시오.멸균 조건하에서 조직 처리를 시작하기 위해 즉시 실험실로 돌아갑니다. 티슈 피스는 탈수를 피하기 위해 조직 저장 솔루션으로 채워진 멸균 플라스틱 접시에 배치됩니다. 우선, 획득한 조직 표본의 크기에 따라 스냅 동결을 위해 하나 이상의 핀헤드 크기의 조각을 소비한다.기본 조직을 미리 표기된 냉동튜브에 넣고 액체 질소에 즉시 담급됩니다. 나머지 조직을 3x3단위로 3분의 3의 큐브로 자른다. 괴사 조직이 완전히 해부되어야하지만 폐기해서는 안된다는 것을 고려하십시오.큐브를 네 배로 배열하여 중요한 저장을 위한 알리쿼트 수를 결정합니다. 충분한 수의 냉동고에 라벨을 부착하고 각각 1.5ml의 냉동고 배지로 미리 채웁니다. 냉동고 배지의 DMSO는 세포 독성이기 때문에 중단 없이 다음 단계를 신속하고 수행하였다.메스 블레이드를 사용하여 튜브 당 4 개의 티슈 조각을 떠서 보냅니다. 모든 조각이 튜브 바닥에 이상적으로 냉동고 매체에 완전히 침수되어 있는지 확인하고 동결 용기를 사용하여 튜브를 빠르게 동결하십시오. 건강한 표본과 같은 방식으로 진행하십시오.장기 보관을 위해 모든 알리따옴표를 액체 질소 탱크에 보관하십시오. 세포 배양. 메스 블레이드를 가능한 한 작게 괴사 부위를 포함하는 종양 조직 처리의 유적을 갈아냅니다.멸균 PP 튜브의 상단에 셀 스트레이너를 놓고 세포 스트레이너를 통과하기 위해 혈청 피펫으로 서스펜션을 흡인합니다. 단일 사용 주사기의 플런저를 사용하여 세포 스트레이너를 통해 남아 있는 조직을 눌러 단일 세포 현탁액을 생성합니다. PBS로 헹구고 재료가 남지 않은 때까지 다음 단계를 반복합니다.세포 스트레이너를 제거하고 서스펜션을 180 RCF에서 7분간 원심분리합니다. 그 동안, 상이한 미디어 조성물로 콜라겐 프리 코팅 6웰 플레이트를 준비하여 종양이 나올 확률을 높입니다. 상체를 버리고 PBS에서 펠릿을 다시 중단하고 우물 당 500 마이크로 리터를 분배하십시오.그 후, 표준 인큐베이터에 접시를 배치합니다. 환자 유래 제노이식의 생성. 면역 손상된 마우스에서 환자 유래 제노이식의 생성을 위해, 동물은 특정 병원체 없는 환경에서 보관되어야 합니다.스크럽, 앞치마, 얼굴 마스크, 헤어 커버 및 장갑으로 구성된 개인 보호 장비를 착용하십시오. 작업 공간을 정리한 후 액체 질소 용기에서 욕망 종양 표본을 가져 가라. 신선한 PP 튜브에 35ml PBS를 채운 다음 해동 공정을 조심스럽게 씻고 저온 튜브를 위아래로 기울이십시오.내용이 슬러시가되면 PBS에 부어 종양 조각을 헹구습니다. 대부분의 PBS를 버리고 큐브를 뚜껑에 비웁습니다. 멸균 플라스틱 접시를 얼음 팩에 넣고 100 마이크로리터 마트리겔을 추가합니다.집게를 사용하여 종양 조각을 마모젤에 배치하고 종양을 10 분 동안 배양하십시오. 그 동안, 두 마리의 마우스를 마취한다. 동물의 발을 꼬집어 마취의 깊이를 확인하십시오.모든 움직임은 부족한 마취를 나타내며 대기 또는 추가 적인 치료가 필요합니다. 눈 연고를 적용, 목에 마우스를 꼬집어 피하 마이크로 칩을 주입. 다음 단계를 병렬로 수행합니다.마우스의 측면을 소독하고 스트라이프 메젠바움 가위로 작은 피부 절개를 하고 무딘 준비로 피하 포켓을 형성한다. 해부학 적 집게를 사용하여 종양 조각을 삽입하십시오. 조각이 피부 포켓의 후면 끝에 놓여 있는지 확인하십시오.나머지 마트리겔을 흡인하고 네 개의 주머니에 동등하게 분배합니다. 젤의 경화를 기다리고 바늘로 종양 조각을 손상시키지 않고 단일 버튼 봉합사로 피부를 닫습니다. 매듭 위에 가능한 한 짧게 스레드를 잘라 봉합사의 고개를 끄덕 방지하기 위해 스프레이 드레싱을 적용합니다.마이크로칩을 스캔하고 동물의 나중에 식별을 위해 데이터베이스에 종양 정보를 추가합니다. 신선한 침구와 중첩 재료로 케이지를 준비하고, 적외선 램프 앞에 마우스를 배치하고 마취가 가라 앉을 때까지 동물을 모니터링하십시오. PDX의 농장.PDX 종양이 필요한 크기에 도달하면 마우스는 CO2 질식 및 후속 자궁 경부 탈구에 의해 안락사됩니다. 조심스럽게 종양에서 피부를 해부하고 PDX를 완전히 제거합니다. 대표적인 결과.멸균 플라스틱 접시에 종양을 놓고 멸균 메스 블레이드를 사용하여 추가 처리를 하십시오. 슬라이스로 구멍을 잘라, 조직학 카세트에 배치하고 나중에 조직학적 평가를위한 파라핀 임베디드 표본을 생성하기 위해 포르말린에 잠급. 종양의 나머지 부분을 조직 저장 용액으로 옮기고 바이오 뱅크를 위해 새로운 생체 보존 및 스냅 냉동 표본을 만듭니다.또한, PDX 종양의 유해를 장 세포 배양과 유사하게 사용하여 이차 종양 세포주를 확립한다. 추가 PDX를 생성하려면, 이전에 표시된 대로 새로운 수신자 마우스로 Matrigel을 가진 2개 이상의 종양 조각을 전송합니다. 결론. 제시된 프로토콜을 통해, 우리는 지금까지 9개의 췌장 및 100개 이상의 대장 환자 유래 암 세포주뿐만 아니라 19개의 췌장 및 150개 이상의 colorectal PDX 모형을 설치하는 데 성공했습니다.

creation-and-maintenance-of-a-living-biobank-how-we-do-it

Research

연구

JoVE Journal

Cancer Research

암 연구

피부 종양은 모스 (Mohs) 현미경 수술 후 폐기됩니다. 임상 지원 직원이 임상 작업을 방해하지 않고 하류 실험실 응용을위한 피부 종양 ( 예 : 편평 세포 암종, 기저 세포 암종 및 흑색 종) 샘플을 효과적으로 처리하고 저장할 수있는 프로토콜이 여기에 설명되어 있습니다.

클리닉 기반 생물 저장소의 설립

실용적인 응용 프로그램 및 다운스트림 분석 biobank 프로젝트에서의 광범위 한 스펙트럼에 대 한 돼지 동물 모델의 대표적인 조직 샘플의 세대를 위한 방법의 성능을 시연, volumetry를 포함 하 여 체계적인 무작위 샘플링 그리고 차동 질적 및 양적 형태 론 적과 분자 분석 유형에 대 한 조직 샘플의 처리.

샘플링 전략 및 돼지 생물 의학 모델에서 Biobank 조직 샘플의 처리

이 방법은 급진적 인 전립선 절제술을 따르는 바이오 뱅킹 조직이 샘플링 절차를 안내하기 위해 전립선 암 환자에 대한 임상 진단 데이터를 활용하는 것을 포함합니다. 이것은 다운스트림 응용의 넓은 범위에 대한 새로운 조직의 효율성과 가용성에 관한 이전에 게시 된 방법과 문제를 극복한다.

전립선암 바이오뱅킹을 위한 샘플링 절차를 안내하기 위해 자기 공명 영상 및 생검 데이터 사용

이 프로토콜은 뇌 기증 프로그램과 뇌의 적절한 특성을 통해 개별 뇌 노화 궤적을 추적하는 방법을 설명합니다. 두뇌 기증자는 연쇄 다차원 평가를 포함하여 장기 종방향 연구 결과에 관여합니다. 이 프로토콜에는 뇌 처리에 대한 자세한 설명과 정확한 진단 방법론이 포함되어 있습니다.

노화 뇌 수집, 처리 및 특성화를 위한 Abbiategrasso 브레인 뱅크 프로토콜

바이오뱅크는 생물의학 연구를 위한 중요한 자원이며 유럽 종양학 연구소의 중개 및 디지털 의학 부서를 위한 바이오뱅크는 이 분야의 모델입니다. 여기에서는 다양한 유형의 인간 생물학적 샘플 관리를 위한 바이오뱅크의 표준 운영 절차에 대한 자세한 설명을 제공합니다.

중개 의학을 위한 바이오뱅크: 최적의 시료 관리를 위한 표준 운영 절차

이 프로토콜은 근치적 전립선 절제술 표본에서 샘플 수집을 용이하게 하는 방법을 설명합니다. 목표는 해부병리학적 기준에 따라 표본의 조직 샘플을 Biobank에 저장하기 전에 매핑, 특성화 및 미시적 매크로 절개하는 것입니다.

개선된 샘플링 기법 및 조직학적 특성 분석을 통한 전립선 종양 바이오뱅킹 신뢰성 향상

이 프로토콜은 단백질체학, 대사체학 및 글리코믹스를 포함한 분자 다운스트림 분석을 위한 고품질 인간 방수액 및 유리체 액체 생검의 표준화된 수집, 주석 및 바이오뱅킹을 위한 통합 생물 저장소 플랫폼을 제공합니다.

분자 분석을 위한 인간 수성 및 유리체 액체 생검의 바이오뱅킹

이 프로토콜은 다양한 질병 단계의 난소암 오가노이드 확립을 위한 체계적인 프레임워크를 제공하고 환자별 변동성 문제를 해결하여 수율을 높이고 후속 응용 분야에서 강력한 장기 확장을 가능하게 합니다. 여기에는 조직 처리, 파종, 배지 요구 사항 조정 및 면역형광 염색을 위한 자세한 단계가 포함됩니다.

난소암 오가노이드의 바이오뱅킹 전략: 조직학적 아형 및 질병 단계에 걸친 환자 간 이질성 해결

이 기사에서는 바이오뱅킹, 맞춤형 의학 및 기타 연구 응용 분야에 대한 유용성을 최적화하도록 설계된 유방암 샘플 수집을 위한 자세한 프로토콜을 제시합니다. 유방 생검 및 유방 절제술 절차를 포함한 샘플 수집 작업 흐름은 조직 손상을 최소화하고 샘플 품질을 극대화하는 데 중점을 두고 자세히 설명합니다.

바이오뱅킹, 맞춤형 의학 및 연구 응용을 위한 유방 생검 및 유방 절제술 샘플 수집 절차의 최적화

여기에서 우리는 가교 및 당화 산물 (은 AGEs)에 의해 유도 된 기저막 (BM)의 증가 강성 병리학 적 관련성이있는 생물 물리학 적 미세 환경을 모델링하기위한 프로토콜을 설명합니다.

전립선 암과 기타 노화 관련 병리 또는 대사 질환의 생물 물리학 트리거로 지하실 막 강성을 공부하는 방법

학습하세요 대장암 및 췌장암을 위한 살아있는 바이오뱅크 구축 및 유지 관리 방법을. 환자유래 모델을 활용한 기능적 전임상 테스트와 정밀의학 연구에 활용할 수 있습니다.

살아있는 바이오 뱅크의 창조 및 유지 보수 - 우리가 그것을 하는 방법

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