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Neuroscience
생체 내 3차원 형광 현미경을 사용한 제브라피쉬 유충의 전뇌 이미징
생체 내 3차원 형광 현미경을 사용한 제브라피쉬 유충의 전뇌 이미징
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Neuroscience
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JoVE Journal Neuroscience
In Vivo Whole-Brain Imaging of Zebrafish Larvae Using Three-Dimensional Fluorescence Microscopy

생체 내 3차원 형광 현미경을 사용한 제브라피쉬 유충의 전뇌 이미징

Full Text
5,796 Views
06:27 min
April 28, 2023

DOI: 10.3791/65218-v

Eun-Seo Cho1, Seungjae Han1, Gyuri Kim1, Minho Eom1, Kang-Han Lee2, Cheol-Hee Kim2, Young-Gyu Yoon1,3

1School of Electrical Engineering,KAIST, 2Department of Biology,Chungnam National University, 3KAIST Institute for Health Science and Technology

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a detailed protocol for in vivo whole-brain imaging of larval zebrafish utilizing three-dimensional fluorescence microscopy. The zebrafish model is favored due to its optical transparency and genetic accessibility to study neural computation and activity. The protocol addresses common issues such as motion artifacts and agarose gel aberrations, ensuring high-quality image data acquisition.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Biophysics
  • Imaging Techniques

Background

  • Larval zebrafish are a vital model for neuroactivity studies due to their transparency.
  • Significant challenges include aberrations from agarose gel and motion artifacts during imaging.
  • Current protocols lack detailed steps for effective sample mounting and positioning.
  • High-resolution imaging is critical for understanding neural computation.

Purpose of Study

  • To develop a reproducible protocol for high-quality imaging of zebrafish brain activity.
  • To reduce noise and motion artifacts during imaging sessions.
  • To facilitate the study of neural computation over long periods.

Methods Used

  • The main platform used is three-dimensional fluorescence microscopy.
  • The biological model involves larval zebrafish, prepared and immobilized for imaging.
  • An optimized experimental workflow is instituted to ensure minimal artifacts.
  • Critical steps include precise positioning of the zebrafish and correct imaging parameter adjustments.
  • Visualization of acquired data is achieved using software tools like napari.

Main Results

  • The imaging protocol allows for comprehensive visualization of brain areas, including neuronal structures in the forebrain, midbrain, and hindbrain.
  • Neuronal activity can be captured through time-series imaging, revealing significant insights into neural functions.
  • Clear visibility of all brain regions indicates the protocol's effectiveness.

Conclusions

  • This study demonstrates a novel imaging approach that enhances the understanding of zebrafish neuroactivity.
  • The protocol not only sets a standard for zebrafish imaging but also has implications for broader neural research.
  • Further development of imaging pipelines is anticipated to improve brain mapping and neural computation studies.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using larval zebrafish?
Larval zebrafish are advantageous due to their optical transparency, which allows for clear imaging of neural structures and activities using fluorescence microscopy.
How is the zebrafish prepared for imaging?
Zebrafish are paralyzed and positioned in a solidified agarose gel within a Petri dish to ensure stability during imaging.
What type of data is obtained from this imaging protocol?
The protocol facilitates the acquisition of volumetric structural images and time-series functional imaging of neuronal activity in the zebrafish brain.
How can this method be adapted for other applications?
While focused on brain imaging, the protocol can be adapted for visualizing other organs in larval zebrafish and potentially other transparent models.
What are some limitations of this imaging approach?
Limitations include potential artifacts from the agarose gel and any inevitable movement of the zebrafish during the imaging process.
How does the imaging method improve upon previous protocols?
This method provides a comprehensive, detailed workflow for zebrafish preparation and imaging, addressing gaps in existing protocols that often overlook critical steps.

여기에 제시된 것은 3차원 형광 현미경을 사용한 유충 제브라피쉬의 생체 내 전뇌 이미징을 위한 프로토콜입니다. 실험 절차에는 샘플 준비, 이미지 획득 및 시각화가 포함됩니다.

우리는 높은 공간적, 시간적 해상도로 뇌 전체의 신경 활동을 기록하고 분석하기 위해 광학 면역 시스템과 계산 알고리즘을 개발하고 있습니다. 실험용 물고기는 연구에 이상적인 모델 동물입니다. 각각의 광학적 투명성 및 다양한 유전 도구의 이용 가능성 덕분에, 샘플 장착에 사용되는 아가로스 겔에 의해 도입된 수차로 인해 광학 이미지 품질이 저하될 수 있으며, 기록 중에 물고기가 움직여 이미지에 모션 아티팩트를 유발하거나 이미지로부터 정확도 신호 추출을 방해할 수 있습니다.

공개적으로 이용가능한 프로토콜은 실험 절차에 대한 간략한 개요, 아가로스 응고, 정밀 장착 기술 및 간단한 위치 지정과 같은 세부 사항의 실질적인 부분만을 제공합니다. 따라서 고품질 이미지 데이터를 획득하기 위해서는 효과적이고 재현 가능한 프로토콜이 필요합니다. 최소한의 소음과 움직임으로.

당사의 프로토콜은 최적화되고 재현 가능한 실험 절차를 제공합니다. 이 프로토콜은 장기간에 걸친 생체 내 전뇌 영상과 획득한 영상 데이터의 시각화를 가능하게 합니다. 워크플로는 전체 뇌 영상에 중점을 두었지만 많은 얼룩말 물고기의 다른 기관을 영상화하는 데 쉽게 적용할 수 있습니다.

우리의 목표는 신경 계산의 기본 원리를 밝히는 것입니다. 이를 위해 우리는 체계적인 뇌 매핑을 위해 신경 활동과 구조의 대규모 이미징과 계산 분석을 포함하는 파이프 라인에서 계속 작업 할 것입니다.

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신경 과학 문제 194

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