CorrelationCalculator 및 Filigree: 대사체학 데이터의 데이터 기반 네트워크 분석을 위한 도구

대사체학 데이터 분석은 많은 전문 소프트웨어 도구를 활용하는 다단계 프로세스입니다. 이 데이터 분석은 데이터 처리 및 품질 관리, 통계 분석 및 생물학적 데이터 해석의 세 가지 주요 단계로 나눌 수 있습니다. 이 프로토콜에 설명된 도구는 분석의 후반 단계를 활성화하도록 설계되었습니다.

지난 10년 동안 대사체학은 기체 크로마토그래피-질량분석법, 액체 크로마토그래피-질량분석법과 같은 분석 기술의 발전으로 인해 아노미 과학으로 부상했습니다. 이러한 기술을 사용하면 수백에서 수천 개의 저분자 대사 산물을 동시에 측정하여 복잡한 다차원 데이터 세트를 생성할 수 있습니다. 대사체학 데이터 분석은 경로 기반 농축 접근법에 대한 몇 가지 과제를 제시합니다.

첫째, 상당수의 대사 산물이 대사 경로에 매핑될 수 없습니다. 또한, 2차 및 지질 대사의 경로 커버리지는 충분하지 않습니다. 따라서 데이터의 생물학적 해석을 위한 대체 접근 방식이 필요합니다.

데이터 기반 네트워크 분석 기법은 대사체학 데이터에 대한 지식 기반 경로 농축 분석과 관련된 문제를 극복하는 데 도움이 될 수 있습니다. 예를 들어, 상관 관계 네트워크는 알려진 대사 산물과 알려지지 않은 대사 산물 간의 관계를 도출하는 데 도움이 될 수 있으므로 알려지지 않은 대사 산물의 주석을 용이하게 할 수 있습니다.