액체 크로마토그래피, Trapped Ion Mobility Spectrometry 및 Time-Of-Flight Mass Spectrometry를 사용한 Histone Modification Screening

액체 크로마토그래피, 포획 이온 이동도 분광법 및 비행 시간 질량 분석법(LC-TIMS-ToF MS/MS)을 기반으로 하는 분석 워크플로우는 주요 매개변수(머무름 시간[RT], 충돌 단면[CCS] 및 정확한 질량 대 전하[m/z] 비율)를 기반으로 히스톤 변형 및 식별에 대한 높은 신뢰도와 재현성 있는 "상향식" 분석을 제공합니다.

95 % 효율의 히스톤 추출 프로토콜을 사용하여 방법을 제안합니다. LC-TIMS-ToF MS/MS와 함께 짧은 시간에 히스톤에 존재하는 PTM에 대한 스크리닝을 얻을 수 있습니다. 그리고 무엇보다도, 이성질체를 분리할 수 있는 가능성.

이성질체 펩타이드의 분리는 탠덤 질량분석법만으로는 가능하지만 종종 어렵습니다. TIMS를 통합함으로써 추가적인 차원의 분리를 도입하여 많은 위치 이성질체 식별을 단순화합니다. 또한 패시브 기술은 이러한 실험의 민감도를 높여 후성유전학적 변이를 분석하는 능력을 더욱 향상시킵니다.

PTM 위치를 식별하는 능력이 향상됨에 따라 다양한 환경 또는 생물학적 요인 간의 상관 관계와 후성유전체에 미치는 영향을 추가로 결정할 수 있습니다. 히스톤 분석을 개선하고 촉진하는 방법은 의료 및 환경 화학을 포함한 여러 연구 분야에 적용될 수 있습니다. 네이티브 또는 손상된 상태에서의 단백질 확인의 역학은 HDX를 사용한 TIMS MS/MS의 구현을 통해 확립됩니다.

LC-TIMS-ToF MS/MS 및 Nano LC-TIMS-ToF MS/MS를 통해 다양한 생체 시료에 존재하는 PTM의 차이를 차트로 작성합니다.