다중 모드 폐 영상: CT 및 Hyperpolarized 129Xe MRI의 보완 정보를 사용하여 폐 구조-기능 평가
April 12th, 2024
CT 및 129Xe MRI는 이미지 정합을 사용하여 국소 분석에 활용할 수 있는 보완적인 폐 구조-기능 정보를 제공합니다. 여기에서는 오픈 소스 플랫폼을 사용하여 129Xe MR에서 CT 이미지 등록에 대한 기존 문헌을 기반으로 하는 프로토콜을 제공합니다.
먼저 원하는 이미지 시각화 소프트웨어에서 이미지를 연 다음 마스크를 열어 모든 CT, Proton 및 Xenon 파일에 대해 이미지와 마스크 방향이 일치하는지 확인합니다. 그런 다음 이미지 DICOMS 및 단일 레이블 마스크를 reg. py 파일과 동일한 폴더에 NIfTI 파일로 저장합니다.
CT Xenon MRI 정합을 위해 원하는 Python 컴퓨팅 환경 설정에서 reg. py 파일을 엽니다. 가상 환경을 사용하는 경우 중앙 처리 장치 수, 스레드 수 및 RAM을 원하는 대로 또는 컴퓨팅 환경에서 사용 가능한 대로 설정합니다.
그런 다음 원하는 변형과 보간을 설정한 다음 고정 이미지와 동영상을 설정합니다. Python 컴퓨팅 환경에서 reg. py 실행합니다.
등록이 완료되면 평가를 진행합니다. ct. nii 이미지를 기본 이미지로 유지하고, 환기 warp.nii를 엽니다.
gz를 다른 이미지로 변환하고 원하는 컬러 맵으로 CT 이미지에 오버레이합니다. 모든 이미지 평면에서 크세논 MR 이미지와 CT 이미지의 중첩을 검토하여 카리나 및 폐 경계와 같은 랜드마크의 시각적 정렬을 평가합니다. 등록 결과는 건강한 참가자의 모든 폐 경계가 잘 정렬되어 있음을 보여주었습니다.
만성 폐쇄성 폐질환을 앓고 있는 3명의 참가자에서 미만성 환기 이상, 정점 폐 경계가 없는 상엽 환기 이상, 횡격막 폐 경계가 없는 하엽 환기 이상에 이르기까지 폐 경계의 정렬이 양호했습니다.
개요
이 기사는 폐 구조-기능 분석을 향상시키기 위해 CT 이미지와 129 Xe MRI를 등록하는 프로토콜을 제시합니다. 이 방법은 이미지 등록을 위한 오픈 소스 플랫폼을 활용하여 지역 분석을 용이하게 합니다.
주요 연구 구성 요소
과학 분야
- 신경과학
- 의료 영상
- 방사선 의학
배경
- CT와 129 Xe MRI는 폐 구조 및 기능에 대한 보완적인 정보를 제공합니다.
- 이미지 등록은 정확한 지역 분석에 필수적입니다.
- 129 Xe MR 기법에 대한 기존 문헌이 이 프로토콜을 알려줍니다.
- 오픈 소스 플랫폼은 연구자들의 접근성을 향상시킵니다.
연구 목적
- CT와 129 Xe MRI 이미지 등록을 위한 튼튼한 프로토콜을 개발합니다.
- 향상된 영상 기법을 통해 폐 기능 분석을 개선합니다.
- 해당 분야의 연구자들에게 재현 가능한 방법을 제공합니다.
사용된 방법
- 이미지 시각화 소프트웨어에서 이미지 및 마스크를 엽니다.
- CT, 양성자 및 제논 파일의 방향을 확인합니다.
- 이미지 및 마스크를 NIfTI 파일로 저장합니다.
- 등록을 위해 Python 컴퓨팅 환경을 활용합니다.
주요 결과
- 이 프로토콜은 CT와 129 Xe MRI 이미지의 효과적인 등록을 가능하게 합니다.
- 폐 구조 및 기능의 상세한 지역 분석을 용이하게 합니다.
- 의료 영상에서 오픈 소스 도구의 유용성을 입증합니다.
- 폐 영상 연구의 미래 연구를 위한 기반을 제공합니다.
결론
- 개발된 프로토콜은 폐 영상 분석의 정확성을 향상시킵니다.
- CT와 129 Xe MRI를 결합하여 폐 기능에 대한 포괄적인 통찰을 제공합니다.
- 오픈 소스 플랫폼은 연구에서의 협업 및 혁신을 촉진합니다.
