Analyzing DNA-Protein Interactions with Streptavidin-Based Biolayer Interferometry

Tripthi Battapadi; Madhumita Sridharan; Degang Liu; John Turchi; Lata Balakrishnan

doi:10.3791/66534

JoVE Journal
Biochemistry

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Analyzing DNA-Protein Interactions with Streptavidin-Based Biolayer Interferometry

스트렙타비딘 기반 생물층 간섭계를 사용한 DNA-단백질 상호작용 분석

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08:07 min

January 17, 2025

DOI: 10.3791/66534-v

Tripthi Battapadi¹, Madhumita Sridharan¹, Degang Liu², John Turchi³, Lata Balakrishnan¹

¹Department of Biology,Indiana University Indianapolis, ²Sartorius Corporation, ³Department of Medicine,Indiana University School of Medicine

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

이 논문에서는 스트렙타비딘 기반 생물층 간섭계(BLI) 시스템을 사용하여 DNA-단백질 상호 작용을 연구하기 위한 프로토콜에 대해 설명합니다. 상호 작용의 평형 결합 친화도(K_D)를 결정하기 위해 기본 또는 고급 결합 역학을 활용하기 위한 필수 단계와 고려 사항을 간략하게 설명합니다.

단백질-단백질 및 단백질-DNA 상호 작용을 포함한 생체 분자 상호 작용은 생화학 연구에 필수적입니다. 이 연구에서는 이러한 상호 작용을 분석하기 위한 효율적인 기술인 생물층 간섭계(BLI)를 사용합니다. 우리는 BLI의 원리와 기능을 보여주기 위해 복제 단백질 A와 단일 가닥 DNA에 대한 결합 친화도에 초점을 맞춥니다.

생물층 간섭계(Biolayer interferometry)는 단백질 반응속도학을 연구하기 위한 쉽고 비용 효율적인 방법입니다. 이를 통해 단백질 상호 작용을 실시간으로 빠르게 모니터링할 수 있으며 다른 기술보다 복잡성이 적은 간단한 워크플로우를 제공합니다. 우리 연구실에서는 게놈 안정성을 유지하는 데 필수적인 단백질의 구조와 기능에 대한 번역 후 변형의 영향을 연구합니다.

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