2024년 11월 8일
코딩 경험이 없는 연구자가 간단한 다운로드 및 조작으로 마우스의 수면 단계를 점수화할 수 있도록 그래픽 사용자 인터페이스가 포함된 소프트웨어 패키지를 제공합니다.
우리는 쥐의 수면 단계를 자동으로 점수화하기 위해 원격 수면 점수에서 사용하기 쉬운 GUI 소프트웨어를 개발했습니다. 우리는 노동 집약적인 수동 채점 문제를 해결하고 코딩 경험이 많지 않은 연구원의 접근성을 개선하는 것을 목표로 합니다. 원격 수면 점수는 마우스의 수면 단계를 자동으로 채점하는 데 95.2%의 정확도를 달성했으며 공개적으로 사용 가능한 두 개의 다른 독립 데이터 세트에서 일반화 가능성을 입증했습니다.
GUI에는 수동 수정 기능이 포함되어 있어 사용자가 모든 epoch에 대해 점수가 매겨진 절전 단계를 수정할 수 있습니다. 또한 모델 점수 결정을 설명하기 위해 최대한 빠른 가치 시각화를 제공합니다. 숙련된 사용자는 GitHub에서 필요한 모든 파일과 추출 스크립트를 사용할 수 있으므로 자신의 데이터로 트리 이전 모델을 미세 조정할 수도 있습니다.
우리의 연구는 새로운 유전학을 생물학으로 전환하고 차세대 치료법이 정신 질환을 치료할 수 있도록 하는 데 중점을 둡니다. 우리는 체외 및 동물에서 분자, 세포 및 전기 생리학적 접근 방식을 사용하여 이러한 질병과 관련된 기능 장애가 있는 유전자에 대해 연구해 왔습니다.
본 연구에서는 코딩 기술 없이도 연구자가 마우스의 수면 단계를 자동으로 판독할 수 있도록 설계된 사용하기 쉬운 그래픽 사용자 인터페이스(GUI) 소프트웨어인 IntelliSleepScorer를 선보입니다. 이 소프트웨어는 95.2%의 높은 판독 정확도를 보여주며, 수동 수정 및 판독 결정 근거를 설명하기 위한 SHAP 값 시각화 기능을 제공합니다.
설치류 모델에서 자동화된 고정밀 수면 단계 점수 산정은 중개 신경과학 및 신경정신과적 약물 발견에 있어 매우 중요합니다. IntelliSleepScorer는 수면 구조의 확장 가능하고 재현 가능한 정량화를 가능하게 하여, 전임상 연구에서의 기전적 리스크 제거 및 표적 검증을 지원합니다. 접근성 높은 인터페이스와 설명 가능한 출력값은 부서 간 도입 및 포트폴리오 전반의 데이터 표준화를 용이하게 합니다.
IntelliSleepScorer는 초기 타겟 검증부터 리드 화합물 발굴, 신경생물학의 중개 연구에 이르기까지 전임상 발견 연속체에 통합됩니다.