Name: 조기 암 발견을 위한 맞춤형 단백질 코로나 프로파일링을 위한 표준화된 SDS-PAGE 워크플로우 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-19T12:50:00.000+00:00
Duration: 10 min 2 s
Description: 학습하세요 SDS-PAGE를 활용한 단백질 코로나 프로파일링 방법으로 췌관선암 조기 진단을 위한 재현 가능한 암 바이오마커 검출 기술을 개발하는 과정입니다.

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<ol><li>Cai, R., Chen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+crown+and+the+scepter%3A+Roles+of+the+protein+corona+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Mater%22%5BJournal%5D)">The crown and the scepter: Roles of the protein corona in nanomedicine.</a> Adv Mater. 31 (45), 1805740(2019).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanotechnology+meets+oncology%3A+A+perspective+on+the+role+of+the+personalized+nanoparticle-protein+corona+in+the+development+of+technologies+for+pancreatic+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Nanotechnology meets oncology: A perspective on the role of the personalized nanoparticle-protein corona in the development of technologies for pancreatic cancer detection.</a> Int J Mol Sci. 23 (18), 10591(2022).</li>
<li>Lundqvist, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolution+of+the+protein+corona+around+nanoparticles%3A+A+test+study%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">The evolution of the protein corona around nanoparticles: A test study.</a> ACS Nano. 5 (9), 7503-7509 (2011).</li>
<li>Hajipour, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+protein+coronas%3A+A+%26%2334%3Bkey%26%2334%3B+factor+at+the+nanobiointerface%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Personalized protein coronas: A &#34;key&#34; factor at the nanobiointerface.</a> Biomater Sci. 2 (9), 1210-1221 (2014).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona-enabled+serological+tests+for+early-stage+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sens+Int%22%5BJournal%5D)">Protein corona-enabled serological tests for early-stage cancer detection.</a> Sens Int. 1, 100025(2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Size+and+charge+of+nanoparticles+following+incubation+with+human+plasma+of+healthy+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Colloids+Surf+B+Biointerfaces%22%5BJournal%5D)">Size and charge of nanoparticles following incubation with human plasma of healthy and pancreatic cancer patients.</a> Colloids Surf B Biointerfaces. 123, 673-678 (2014).</li>
<li>Barrán-Berdón, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time+evolution+of+nanoparticle-protein+corona+in+human+plasma%3A+Relevance+for+targeted+drug+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Langmuir%22%5BJournal%5D)">Time evolution of nanoparticle-protein corona in human plasma: Relevance for targeted drug delivery.</a> Langmuir. 29 (21), 6485-6494 (2013).</li>
<li>Yu, Y., Luan, Y., Dai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+process%2C+mechanisms%2C+influencing+factors%2C+and+study+methods+of+protein+corona+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biol+Macromol%22%5BJournal%5D)">Dynamic process, mechanisms, influencing factors, and study methods of protein corona formation.</a> Int J Biol Macromol. 205, 731-739 (2022).</li>
<li>Hadjidemetriou, M., Kostarelos, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+the+nanoparticle+corona%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nanotechnol%22%5BJournal%5D)">Evolution of the nanoparticle corona.</a> Nat Nanotechnol. 12 (4), 288-290 (2017).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+protein+corona-enabled+blood+test+for+early+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">A protein corona-enabled blood test for early cancer detection.</a> Nanoscale. 9 (1), 349-354 (2017).</li>
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<li>Vence, M. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potential+clinical+applications+of+the+personalized%2C+disease-specific+protein+corona+on+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">Potential clinical applications of the personalized, disease-specific protein corona on nanoparticles.</a> Clin Chim Acta. 501, 102-111 (2020).</li>
<li>Di Domenico, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-biomolecular+corona%3A+A+new+approach+for+the+early+detection+of+non-small-cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Physiol%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-biomolecular corona: A new approach for the early detection of non-small-cell lung cancer.</a> J Cell Physiol. 234 (6), 9378-9386 (2019).</li>
<li>Papi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploitation+of+nanoparticle-protein+interactions+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">Exploitation of nanoparticle-protein interactions for early disease detection.</a> Appl Phys Lett. 114 (16), 163702(2019).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+profile+of+graphene+oxide+allows+detection+of+glioblastoma+multiforme+using+a+simple+one-dimensional+gel+electrophoresis+technique%3A+A+proof-of-concept+study%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Protein corona profile of graphene oxide allows detection of glioblastoma multiforme using a simple one-dimensional gel electrophoresis technique: A proof-of-concept study.</a> Biomater Sci. 9 (13), 4671-4678 (2021).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synergistic+analysis+of+protein+corona+and+haemoglobin+levels+detects+pancreatic+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Synergistic analysis of protein corona and haemoglobin levels detects pancreatic cancer.</a> Cancers. 13 (1), 93(2020).</li>
<li>Colapicchioni, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+liposome-protein+corona+in+the+blood+of+breast%2C+gastric+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Personalized liposome-protein corona in the blood of breast, gastric and pancreatic cancer patients.</a> Int J Biochem Cell Biol. 75, 180-187 (2016).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+graphene+oxide-protein+corona+in+the+human+plasma+of+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Personalized graphene oxide-protein corona in the human plasma of pancreatic cancer patients.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 491(2020).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+pancreatic+cancer+detection+through+personalized+protein+corona+of+gold+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Biointerphases%22%5BJournal%5D)">Efficient pancreatic cancer detection through personalized protein corona of gold nanoparticles.</a> Biointerphases. 16 (1), 011010(2021).</li>
<li>Caputo, D., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-enabled+blood+tests+for+early+detection+of+pancreatic+ductal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Lett%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-enabled blood tests for early detection of pancreatic ductal adenocarcinoma.</a> Cancer Lett. 470, 191-196 (2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Challenges+in+molecular+diagnostic+research+in+cancer+nanotechnology%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Challenges in molecular diagnostic research in cancer nanotechnology.</a> Nano Today. 27, 6-10 (2019).</li>
<li>Ashkarran, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measurements+of+heterogeneity+in+proteomics+analysis+of+the+nanoparticle+protein+corona+across+core+facilities%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Measurements of heterogeneity in proteomics analysis of the nanoparticle protein corona across core facilities.</a> Nat Commun. 13 (1), 6610(2022).</li>
<li>Pederzoli, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+and+nanoparticles%3A+How+can+we+investigate+on%5BTitle%5D)+AND+%22Wiley+Interdiscip+Rev+Nanomed+Nanobiotechnol%22%5BJournal%5D)">Protein corona and nanoparticles: How can we investigate on.</a> Wiley Interdiscip Rev Nanomed Nanobiotechnol. 9 (6), e1467(2017).</li>
<li>Otoo, J. A., Schlappi, T. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((REASSURED+multiplex+diagnostics%3A+A+critical+review+and+forecast%5BTitle%5D)+AND+%22Biosensors%22%5BJournal%5D)">REASSURED multiplex diagnostics: A critical review and forecast.</a> Biosensors. 12 (2), 124(2022).</li>
<li>Papi, M., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Principal+component+analysis+of+personalized+biomolecular+corona+data+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Principal component analysis of personalized biomolecular corona data for early disease detection.</a> Nano Today. 21, 14-17 (2018).</li>
<li>Giulimondi, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reproducibility+of+biomolecular+corona+experiments%3A+A+primer+for+reliable+results%5BTitle%5D)+AND+%22Part+Part+Syst+Charact%22%5BJournal%5D)">Reproducibility of biomolecular corona experiments: A primer for reliable results.</a> Part Part Syst Charact. 40 (2), 2200169(2023).</li>
<li>Renzi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structuring+lipid+nanoparticles%2C+DNA%2C+and+protein+corona+into+stealth+bionanoarchitectures+for+in+vivo+gene+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Structuring lipid nanoparticles, DNA, and protein corona into stealth bionanoarchitectures for in vivo gene delivery.</a> Nat Commun. 15 (1), 9119(2024).</li>
<li>Van Dorpe, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+automated+liquid+handling+in+the+separation+workflow+of+extracellular+vesicles+enhances+specificity+and+reproducibility%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">Integrating automated liquid handling in the separation workflow of extracellular vesicles enhances specificity and reproducibility.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 157(2023).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+protein+corona+on+graphene+oxide%3A+Implications+for+biomedical+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">The influence of protein corona on graphene oxide: Implications for biomedical theranostics.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 267(2023).</li>
<li>Jiříčková, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+and+applications+of+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22Materials%22%5BJournal%5D)">Synthesis and applications of graphene oxide.</a> Materials. 15 (3), 920(2022).</li>
<li>Saorin, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+redefined+protocol+for+protein+corona+analysis+on+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nanosci+Au%22%5BJournal%5D)">A redefined protocol for protein corona analysis on graphene oxide.</a> ACS Nanosci Au. , (2025).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-protein+corona+enhances+accuracy+of+Ca-19.9-based+pancreatic+cancer+classification%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-protein corona enhances accuracy of Ca-19.9-based pancreatic cancer classification.</a> Nanoscale. 17 (12), 7066-7075 (2025).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+the+accuracy+of+pancreatic+cancer+clinical+staging+by+exploitation+of+nanoparticle-blood+interactions%3A+A+pilot+study%5BTitle%5D)+AND+%22Pancreatology%22%5BJournal%5D)">Improving the accuracy of pancreatic cancer clinical staging by exploitation of nanoparticle-blood interactions: A pilot study.</a> Pancreatology. 18 (6), 661-665 (2018).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+decade+of+the+liposome-protein+corona%3A+Lessons+learned+and+future+breakthroughs+in+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">A decade of the liposome-protein corona: Lessons learned and future breakthroughs in theranostics.</a> Nano Today. 47, 101657(2022).</li>
<li>Wu, S. Y., An, S. S. A., Hulme, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+applications+of+graphene+oxide+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">Current applications of graphene oxide in nanomedicine.</a> Int J Nanomedicine. 10 Suppl 1, 9-24 (2015).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+detection+of+pancreatic+cancer+by+combining+a+nanoparticle-enabled+blood+test+and+plasma+levels+of+acute-phase+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Multiplexed detection of pancreatic cancer by combining a nanoparticle-enabled blood test and plasma levels of acute-phase proteins.</a> Cancers. 14 (19), 4658(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1.5ML 단백질 로바인드 튜브</td><td>에펜도르프</td><td>22431081</td><td></td></tr><tr><td>10배 트리스/글리신/SDS</td><td>바이오라드</td><td>1610732</td><td></td></tr><tr><td>원심분리기</td><td>노동기술자</td><td>Z 216 MK 헤름</td><td>18,620 RCF에서 4 & 도에서 20분간 사용; C</td></tr><tr><td>케미닥 영상 시스템</td><td>바이오-래드</td><td>12003153</td><td>젤 이미지 획득에 사용됨</td></tr><tr><td>클로로포름</td><td>시그마 올드리치</td><td>C2432-1L</td><td>DOTAP용 용매</td></tr><tr><td>코닝 1-200 및 마이크로; L 유니버설 핏 벌크 팩드 피펫 팁</td><td>코닝</td><td>4845</td><td></td></tr><tr><td>크라이테리언 TGX 얼룩 없는 프리캐스트 젤</td><td>바이오라드</td><td>5678095</td><td></td></tr><tr><td>증류수 6 x 1L</td><td>서모피셔</td><td>15230001</td><td></td></tr><tr><td>도탭 (1,2-디올레올-3-트리메틸암모늄-프로판)</td><td>아반티 극지 지질</td><td>890890P-200mg</td><td>양이온성 리포좀 제조에 사용되었으며; 클로로포름에 용해되어 증발, 수화, 압출</td></tr><tr><td>엔듀로 300V 전원 공급 장치와 nbsp;</td><td>Labnet&nbsp;</td><td>E0303-230V</td><td></td></tr><tr><td>글로맥스 디스커버 마이크로플레이트 리더</td><td>프로메가</td><td>GM3000</td><td></td></tr><tr><td>금 나노입자 (시트레이트 안정화)</td><td>시그마-올드리치</td><td>742031-25ML</td><td>나노소재로 사용; 추가 정제 없이 사용</td></tr><tr><td>그라데이언트 폴리아크릴아마이드 젤 (4&ndash; 20% TGX)</td><td>바이오-래드</td><td>5678095</td><td>SDS&ndash에 사용; 페이지</td></tr><tr><td>그랜트 악기 &nbsp; 열셰이커 HC24N (24 x 1.5mL 마이크로튜브)</td><td>피셔 사이언티픽</td><td>PHMT-PSC24N</td><td></td></tr><tr><td>그래핀 옥사이드(GO) 용액</td><td>그래페네아</td><td>고-4-1000</td><td>나노소재로 사용; 0.25 mg/mL로 희석하고 초음파 검사를 했습니다</td></tr><tr><td>인간 혈장(HP)</td><td>시그마-올드리치</td><td>P9523-5ML</td><td>나노입자 배양에 사용</td></tr><tr><td>이미지랩 소프트웨어</td><td>바이오-라드. 버전 6.1.0.07</td><td>/</td><td>젤 이미지를 tiff 파일로 내보낼 때 사용됩니다</td></tr><tr><td>Laemmli 로딩 버퍼 2x</td><td>바이오라드</td><td>1610737</td><td>펠릿 재현탁에 사용됩니다</td></tr><tr><td>MATLAB</td><td>MathWorks. 버전 R2022a</td><td>/</td><td>이미지 처리, 데이터 분석 및 프로파일 계산에 사용됩니다</td></tr><tr><td>미니 익스트루더</td><td>아반티 극지 지질</td><td>610020</td><td>리포좀 준비에 사용됨</td></tr><tr><td>NuPAGE 샘플 감소제 (10배)</td><td>써모 사이언티픽</td><td>NP004</td><td></td></tr><tr><td>인산염 염수 완충제</td><td>코닝&nbsp;</td><td>21-031cm</td><td>DOTAP-HP 샘플에 사용</td></tr><tr><td>피어스 BCA 단백질 분석 키트, 1개 키트 (1L)</td><td>서모피셔</td><td>23225</td><td></td></tr><tr><td>피펫 팁 0.5-10ul 투명</td><td>악시겐</td><td>T-300-STK</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN L P10L, 0.5-10 및 마이크로; L, 금속 배출기</td><td>길슨</td><td>FA10002M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P20, 2-20 및 마이크로; L, 금속 배출기</td><td>길슨</td><td>F144056M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P200, 20-200 및 마이크로; L, 금속 배출기</td><td>길슨</td><td>F144058M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAX 자동 피펫팅 시스템</td><td>길슨</td><td>GSYS0021</td><td>자동 샘플 취급에 사용</td></tr><tr><td>폴리카보네이트 필터 (0.1 & 마이크로; m)</td><td>아반티 극지 지질</td><td>610005-1EA</td><td>리포좀 압출에 사용</td></tr><tr><td>프리시전 플러스 프로틴 올 블루 프리스테인 단백질 기준</td><td>바이오라드</td><td>1610373</td><td></td></tr><tr><td>프리시전 플러스 단백질 무염색 기준 &nbsp;</td><td>바이오라드</td><td>1610363EDU</td><td></td></tr><tr><td>비브라 셀 소닉 케이터 VC505</td><td>소닉스 앤 머티리얼즈 주식회사</td><td>VC505</td><td></td></tr><tr><td>제타사이저</td><td>말번</td><td>ZS90</td><td>동적 광산란(DLS) 및 미세전기영동(ME) 측정에 사용됩니다</td></tr></tbody></table>

조기 암 발견을 위한 맞춤형 단백질 코로나 프로파일링을 위한 표준화된 sds-page 워크플로우

Standardized SDS-PAGE Workflow for Personalized Protein Corona Profiling in Early Cancer Detection

조기 암 발견을 위한 맞춤형 단백질 코로나 프로파일링을 위한 표준화된 SDS-PAGE 워크플로우

The formation of a personalized protein corona (PC) on nanoparticles (NPs) upon exposure to biological fluids has emerged as a promising, minimally ...

standardized-sds-page-workflow-for-personalized-protein-corona

Research

연구

JoVE Journal

Cancer Research

암 연구

그러면 표면 항원 (DotScan CRC microarray)를 인식 맞춤 항체 microarrays에 캡처되어 가능한 단일 세포를 생산하는 대장암 (CRC)의 disaggregation에 대한 절차를 설명했다. microarray에 바인딩된 세포의 하위 인구는 형​​광 염료와 태그 단클론 항체를 사용하여 형광 멀티플렉싱하여 프로파일 수 있습니다.

항체 Microarray 및 형광 멀티플렉싱을 사용하여 대장암 세포 표면 단백질 프로파일

RPPA이 휘황이라는 항체를 사용하여 동시에 심문을 할 수 니트로 셀룰로스 슬라이드에 인쇄 샘플 수백의 단백질 표현을 할 수 있습니다. 이 기술은 투명 세포 신장 암에서 약물 치료 이질성의 효과를 연구에 적용되었습니다.

개인 신장 세포 암에서 단백질 표현 변화를 탐험하기 위해 역 위상 단백질 배열 (RPPA)의 사용

암세포 단백질체에 대한 심층 분석은 새로운 약물 표적 및 진단 바이오마커의 식별을 용이하게 합니다. 우리는 액체 및 고체 종양에서 유래한 암세포 하위 집단에서 (인) 단백질체의 정량 분석을 위한 실험적 워크플로우를 설명합니다. 이는 세포 농축 전략과 정량적 Super-SILAC 기반 질량 분석법을 결합하여 달성됩니다.

액체 및 고체 종양 유래의 암세포 프로테옴 정량적 질량 분석 프로파일

이 비디오의 목적은 임상에서 드문 돌연변이를 검출하는 포르말린 고정 파라핀 (FFPE) 참조 표준 셀 라인과 디지털 방울 PCR (ddPCR) 분석 자동화 된 DNA 추출을 수행하는 방법을 설명하는 것입니다. FFPE 샘플에서 돌연변이를 검출하는 것은 FFPE 샘플에서 ddPCR의 임상 적 유용성을 보여줍니다.

디지털 물방울 PCR은 포르말린 고정 파라핀 포함 된 참조 표준 세포주에서 BRAF의 V600E 돌연변이를 검출하기 위해 채용

고형 종양 조직의 정량적 면역 프로파일을 결정하고 면역 종양학 바이오마커 발견을 위한 임상 코호트를 활용하는 RNA 기반 접근법의 사용은 분자 및 정보학 프로토콜을 통해 설명된다.

고형 종양의 예측 면역 모델링

여기에서는 종양 미세 환경을 더 잘 특성화하고 특정 세포 집단을 식별하기 위해 Spatial Omics 기술의 관심 영역(ROI)을 미세 조정하는 프로토콜을 설명합니다. 단백질체학 분석의 경우 자동화된 맞춤형 프로토콜이 ROI 선택을 안내할 수 있는 반면, 전사체학 분석은 50μm의 작은 ROI를 활용하여 미세 조정할 수 있습니다.

조직에서 단백질 및 RNA 발현의 공간 프로파일링: 가상 미세 해부를 미세 조정하는 접근 방식

단백질체 조절 장애는 확산 침윤성 신경교종의 확산에 중요한 역할을 하지만 몇 가지 관련 단백질은 아직 확인되지 않았습니다. 디지털 공간 처리(DSP)는 침윤성 신경교종의 침습 및 이동에 기여할 수 있는 후보 단백질의 차등 발현을 특성화하기 위한 효율적인 고처리량 접근 방식을 제공합니다.

성인형 미만성 침윤성 신경교종의 미세환경 특성화를 위한 디지털 공간 프로파일링

여기에서는 포르말린 고정, 파라핀 포매 조직 절편에서 분리된 관심 영역을 사용하여 질량 분석 기반 단백질체학 방법을 확립합니다. 이 프로토콜은 보관된 포르말린 고정, 파라핀 포매 조직 절편의 특정 조직 영역에서 단백질체를 분석하는 데 사용됩니다.

선택된 조직 영역을 사용하는 질량 분석 기반 단백질체학을 위한 간소화된 접근법

여기에서는 화학 프로브 및 질량 분석법을 사용하여 천연 세포 및 조직에서 질병 특이적 단백질-단백질 상호 작용을 포착하고 식별할 수 있는 프로토콜을 제시합니다. 결과 상호 작용 데이터 세트는 전용 웹 기반 플랫폼을 통해 분석되어 질병과 관련된 동적 네트워크 기능 장애 및 경로 변경을 밝힙니다.

질병에서 기능 장애 단백질-단백질 상호 작용 매핑

이 프로토콜은 유방암 뼈 전이의 쥐 모델에서 자기 공명 영상 (MRI) 및 양전자 방출 단층 촬영 /컴퓨터 단층 촬영 (PET/CT)에서 파생 된 이미징 매개 변수의 조합을 사용하여 기계 학습 알고리즘을 훈련하여 조기 전이성 질환을 감지하고 거식세포에 대한 후속 진행을 예측하도록 설계되었습니다.

실험래기 모델에서 뼈 전이를 조기에 감지하기 위한 기계 학습 알고리즘

학습하세요 SDS-PAGE를 활용한 단백질 코로나 프로파일링 방법으로 췌관선암 조기 진단을 위한 재현 가능한 암 바이오마커 검출 기술을 개발하는 과정입니다.

조기 암 발견을 위한 맞춤형 단백질 코로나 프로파일링을 위한 표준화된 SDS-PAGE 워크플로우

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