Name: 바이오마커 발견에서 표적되지 않은 눈물액 지피도믹스를 위한 페놀 레드 실 샘플링 절차 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-12T14:25:00.000+00:00
Duration: 8 min 16 s
Description: 배우세요 페놀 레드 실을 이용한 인간 눈물액 샘플링 방법으로 LC-MS/MS 기반 지질체 분석을 수행하는 표준화된 절차입니다. 이 프로토콜은 눈물 지질 바이오마커 발견을 위한 재현성 있는 연구에 필수적입니다.

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<ol><li>Esam, S., Singh, S., Konda, N., Gandhi, R., Vemuganti, G. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tear+film+lipid+layer+thickness%3A+Measurement+techniques%2C+normative+values+and+alteration+in+ocular+surface+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Eye+Res%22%5BJournal%5D)">Tear film lipid layer thickness: Measurement techniques, normative values and alteration in ocular surface diseases.</a> Curr Eye Res. , (2025).</li>
<li>Ambaw, Y. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Profile+of+tear+lipid+mediator+as+a+biomarker+of+inflammation+for+meibomian+gland+dysfunction+and+ocular+surface+diseases%3A+Standard+operating+procedures%5BTitle%5D)+AND+%22Ocul+Surf%22%5BJournal%5D)">Profile of tear lipid mediator as a biomarker of inflammation for meibomian gland dysfunction and ocular surface diseases: Standard operating procedures.</a> Ocul Surf. 26, 318-327 (2022).</li>
<li>Sheppard, J. D., Nichols, K. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dry+eye+disease+associated+with+meibomian+gland+dysfunction%3A+Focus+on+tear+film+characteristics+and+the+therapeutic+landscape%5BTitle%5D)+AND+%22Ophthalmol+Ther%22%5BJournal%5D)">Dry eye disease associated with meibomian gland dysfunction: Focus on tear film characteristics and the therapeutic landscape.</a> Ophthalmol Ther. 12 (3), 1397-1418 (2023).</li>
<li>Lam, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lipidomic+analysis+of+human+tear+fluid+reveals+structure-specific+lipid+alterations+in+dry+eye+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22J+Lipid+Res%22%5BJournal%5D)">Lipidomic analysis of human tear fluid reveals structure-specific lipid alterations in dry eye syndrome.</a> J Lipid Res. 55 (2), 299-306 (2014).</li>
<li>Borchman, D., Ramakrishnan, V., Henry, C., Ramasubramanian, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differences+in+meibum+and+tear+lipid+composition+and+conformation%5BTitle%5D)+AND+%22Cornea%22%5BJournal%5D)">Differences in meibum and tear lipid composition and conformation.</a> Cornea. 39 (1), 122-128 (2020).</li>
<li>Miyamoto, M., Sassa, T., Sawai, M., Kihara, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lipid+polarity+gradient+formed+by+%CF%89-hydroxy+lipids+in+tear+film+prevents+dry+eye+disease%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Lipid polarity gradient formed by ω-hydroxy lipids in tear film prevents dry eye disease.</a> eLife. 9, 53582(2020).</li>
<li>Zhao, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lipidomics+profiles+revealed+alterations+in+patients+with+meibomian+gland+dysfunction+after+exposure+to+intense+pulsed+light%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neurol%22%5BJournal%5D)">Lipidomics profiles revealed alterations in patients with meibomian gland dysfunction after exposure to intense pulsed light.</a> Front Neurol. 13, 827544(2022).</li>
<li>Bland, H. C., Moilanen, J. A., Ekholm, F. S., Paananen, R. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Investigating+the+role+of+specific+tear+film+lipids+connected+to+dry+eye+syndrome%3A+A+study+on+o-acyl-%CF%89-hydroxy+fatty+acids+and+diesters%5BTitle%5D)+AND+%22Langmuir%22%5BJournal%5D)">Investigating the role of specific tear film lipids connected to dry eye syndrome: A study on o-acyl-ω-hydroxy fatty acids and diesters.</a> Langmuir. 35 (9), 3545-3552 (2019).</li>
<li>Khanna, R. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolomics+and+lipidomics+approaches+in+human+tears%3A+A+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Surv+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Metabolomics and lipidomics approaches in human tears: A systematic review.</a> Surv Ophthalmol. 67 (4), 1229-1243 (2022).</li>
<li>Winiarczyk, M., Biela, K., Michalak, K., Winiarczyk, D., Mackiewicz, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Changes+in+tear+proteomic+profile+in+ocular+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Environ+Res+Public+Health%22%5BJournal%5D)">Changes in tear proteomic profile in ocular diseases.</a> Int J Environ Res Public Health. 19 (20), 13341(2022).</li>
<li>Bertram, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Influence+of+Schirmer+strip+wetness+on+volume+absorbed%2C+volume+recovered%2C+and+total+protein+content+in+canine+tears%5BTitle%5D)+AND+%22Vet+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Influence of Schirmer strip wetness on volume absorbed, volume recovered, and total protein content in canine tears.</a> Vet Ophthalmol. 24 (4), 425-428 (2021).</li>
<li>Zhan, X., Li, J., Guo, Y., Golubnitschaja, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+spectrometry+analysis+of+human+tear+fluid+biomarkers+specific+for+ocular+and+systemic+diseases+in+the+context+of+3p+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22EPMA+J%22%5BJournal%5D)">Mass spectrometry analysis of human tear fluid biomarkers specific for ocular and systemic diseases in the context of 3p medicine.</a> EPMA J. 12 (4), 449-475 (2021).</li>
<li>Gijs, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pre-analytical+sample+handling+effects+on+tear+fluid+protein+levels%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Pre-analytical sample handling effects on tear fluid protein levels.</a> Sci Rep. 13 (1), 1317(2023).</li>
<li>Kecskeméti, G., Tóth-Molnár, E., Janáky, T., Szabó, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+extensive+study+of+phenol+red+thread+as+a+novel+non-invasive+tear+sampling+technique+for+proteomics+studies%3A+Comparison+with+two+commonly+used+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">An extensive study of phenol red thread as a novel non-invasive tear sampling technique for proteomics studies: Comparison with two commonly used methods.</a> Int J Mol Sci. 23 (15), 8647(2022).</li>
<li>Barmada, A., Shippy, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+sample+collection+and+processing+impacts+on+fiber-based+tear+fluid+chemical+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Transl+Vis+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Quantifying sample collection and processing impacts on fiber-based tear fluid chemical analysis.</a> Transl Vis Sci Technol. 9 (10), 23(2020).</li>
<li>Hao, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+of+the+phenol+red+thread+test+in+a+Chinese+population%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Validation of the phenol red thread test in a Chinese population.</a> BMC Ophthalmol. 23 (1), 498(2023).</li>
<li>Matyash, V., Liebisch, G., Kurzchalia, T. V., Shevchenko, A., Schwudke, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lipid+extraction+by+methyl-tert-butyl+ether+for+high-throughput+lipidomics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Lipid+Res%22%5BJournal%5D)">Lipid extraction by methyl-tert-butyl ether for high-throughput lipidomics.</a> J Lipid Res. 49 (5), 1137-1146 (2008).</li>
<li>Ulmer, C. Z., Jones, C. M., Yost, R. A., Garrett, T. J., Bowden, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+Folch%2C+Bligh-Dyer%2C+and+Matyash+sample-to-extraction+solvent+ratios+for+human+plasma-based+lipidomics+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">Optimization of Folch, Bligh-Dyer, and Matyash sample-to-extraction solvent ratios for human plasma-based lipidomics studies.</a> Anal Chim Acta. 1037, 351-357 (2018).</li>
<li>Lam, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Extensive+characterization+of+human+tear+fluid+collected+using+different+techniques+unravels+the+presence+of+novel+lipid+amphiphiles%5BTitle%5D)+AND+%22J+Lipid+Res%22%5BJournal%5D)">Extensive characterization of human tear fluid collected using different techniques unravels the presence of novel lipid amphiphiles.</a> J Lipid Res. 55 (2), 289-298 (2014).</li>
<li>Quah, J. H., Tong, L., Barbier, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patient+acceptability+of+tear+collection+in+the+primary+healthcare+setting%5BTitle%5D)+AND+%22Optom+Vis+Sci%22%5BJournal%5D)">Patient acceptability of tear collection in the primary healthcare setting.</a> Optom Vis Sci. 91 (4), 452-458 (2014).</li>
<li>Saini, R. K., Prasad, P., Shang, X., Keum, Y. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+lipid+extraction+methods-a+review%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Advances in lipid extraction methods-a review.</a> Int J Mol Sci. 22 (24), 13643(2021).</li>
<li>Chen, J., Nichols, K. K., Wilson, L., Barnes, S., Nichols, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Untargeted+lipidomic+analysis+of+human+tears%3A+A+new+approach+for+quantification+of+o-acyl-omega+hydroxy+fatty+acids%5BTitle%5D)+AND+%22Ocul+Surf%22%5BJournal%5D)">Untargeted lipidomic analysis of human tears: A new approach for quantification of o-acyl-omega hydroxy fatty acids.</a> Ocul Surf. 17 (2), 347-355 (2019).</li>
<li>Köfeler, H. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recommendations+for+good+practice+in+MS-based+lipidomics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Lipid+Res%22%5BJournal%5D)">Recommendations for good practice in MS-based lipidomics.</a> J Lipid Res. 62, 100138(2021).</li>
<li>Ulmer, C. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+of+efforts+to+improve+lipid+stability+during+sample+preparation+and+standardization+efforts+to+ensure+accuracy+in+the+reporting+of+lipid+measurements%5BTitle%5D)+AND+%22Lipids%22%5BJournal%5D)">A review of efforts to improve lipid stability during sample preparation and standardization efforts to ensure accuracy in the reporting of lipid measurements.</a> Lipids. 56 (1), 3-16 (2021).</li>
<li>Sens, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pre-analytical+sample+handling+standardization+for+reliable+measurement+of+metabolites+and+lipids+in+LC-MS-based+clinical+research%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mass+Spectrom+Adv+Clin+Lab%22%5BJournal%5D)">Pre-analytical sample handling standardization for reliable measurement of metabolites and lipids in LC-MS-based clinical research.</a> J Mass Spectrom Adv Clin Lab. 28, 35-46 (2023).</li>
<li>Salem, M., Bernach, M., Bajdzienko, K., Giavalisco, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+fractionated+extraction+method+for+the+comprehensive+analysis+of+metabolites%2C+lipids%2C+and+proteins+from+a+single+sample%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">A simple fractionated extraction method for the comprehensive analysis of metabolites, lipids, and proteins from a single sample.</a> J Vis Exp. (124), e55802(2017).</li>
<li>Fong, P. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Role+of+tear+film+biomarkers+in+the+diagnosis+and+management+of+dry+eye+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Taiwan+J+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Role of tear film biomarkers in the diagnosis and management of dry eye disease.</a> Taiwan J Ophthalmol. 9 (3), 150-159 (2019).</li>
<li>Sanroque-Muñoz, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tear-derived+extracellular+vesicles+as+diagnostic+biomarkers+for+ocular+and+neurodegenerative+diseases%3A+Opportunities+and+challenges%5BTitle%5D)+AND+%22Extracell+Vesicles+Circ+Nucl+Acids%22%5BJournal%5D)">Tear-derived extracellular vesicles as diagnostic biomarkers for ocular and neurodegenerative diseases: Opportunities and challenges.</a> Extracell Vesicles Circ Nucl Acids. 6 (3), 609-625 (2025).</li>
<li>Vera-Montecinos, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+throughput+tear+proteomics+with+data+independent+acquisition+enables+biomarker+discovery+in+allergic+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">High throughput tear proteomics with data independent acquisition enables biomarker discovery in allergic conditions.</a> Sci Rep. 15 (1), 31181(2025).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>아세토니트릴(ACN), LC-MS 등급</td><td>RCI Labscan</td><td>LM1005</td><td></td></tr><tr><td>액퀴티 UPLC CSH C18 컬럼</td><td>워터스 코퍼레이션</td><td>186005297</td><td>130&Aring;, 1.7 &micro; m, 2.1 mm X 100 mm</td></tr><tr><td>암모늄 포마트, LC-MS 등급</td><td>시그마-올드리치</td><td>55674</td><td></td></tr><tr><td>오토샘플러 유리 바이알</td><td>웰 리치 사이언티브</td><td>2ML-9-V1002</td><td>2mL 투명 유리 12*32mm 평평한 베이스 9-425 나사산 바이알, 라벨 포함 (필기 패드 포함)</td></tr><tr><td>파란색 9-425 오픈 탑 리브 스크류 캡;</td><td>웰 리치 사이언티브</td><td>9-SP1003</td><td>9mm, 흰색 PTFE/빨간색 실리콘 Septa 1mm</td></tr><tr><td>클로로포름, HPLC 등급</td><td>덕산 시약들</td><td>1271</td><td></td></tr><tr><td>에펜도르프 세이프락 튜브, 1.5 mL</td><td>에펜도르프</td><td>30120086</td><td></td></tr><tr><td>개미산(FA)과 nbsp; LC-MS 등급</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>A117-50</td><td></td></tr><tr><td>유리 마이크로 인서트</td><td>웰 리치 사이언티브</td><td>2ML-N2002</td><td>250 & 마이크로; L 인서트, 투명 유리, 폴리스프링 원뿔형 베이스, 크기: 5.8*28.5mm</td></tr><tr><td>이소프로판올, LC-MS 등급</td><td>RCI Labscan</td><td>LM1162</td><td></td></tr><tr><td>LipidSearch 소프트웨어</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>OPTON-30879</td><td>버전 5</td></tr><tr><td>메탄올, 그리고 nbsp; LC-MS 등급</td><td>RCI Labscan</td><td>LM1115</td><td></td></tr><tr><td>페놀 레드 스레드&nbsp; (PRT)</td><td>톈진징밍 신기술개발유한회사</td><td>20192160086</td><td></td></tr><tr><td>냉장 원심분리기</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>75007200</td><td></td></tr><tr><td>냉장 CentriVap 원심 농축기 및 CentriVap 콜드 트랩</td><td>Labconco</td><td>16108335</td><td></td></tr><tr><td>스크류 캡 마이크로 튜브</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>3488</td><td></td></tr><tr><td>터트-부틸 메틸 에테르(MTBE), HPLC 등급</td><td>덕산 시약들</td><td>1070</td><td></td></tr><tr><td>써모 사이언티브 다이오넥스 얼티메이트 3000 HPLC</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>ULTIM3000RSLCNANO</td><td></td></tr><tr><td>서모 사이언티픽 오비트랩 IQ-X 트라이브리드 MS</td><td>서모피셔 사이언티픽</td><td>FSN05-10001</td><td></td></tr><tr><td>서모믹서 C</td><td>에펜도르프</td><td>5382000015</td><td></td></tr><tr><td>초음파 세척기</td><td>크레스트 초음파</td><td>P500D-45</td><td></td></tr><tr><td>보텍스 믹서</td><td>벤치마크</td><td>BV1003</td><td></td></tr></tbody></table>

바이오마커 발견에서 표적되지 않은 눈물액 지피도믹스를 위한 페놀 레드 실 샘플링 절차

Phenol Red Thread-based Sampling Procedure for Untargeted Tear Fluid Lipidomics in Biomarker Discovery

Tear lipids are crucial for tear film stability and ocular surface health. Changes in tear composition could be associated with ocular and systemic ...

phenol-red-thread-based-sampling-procedure-for-untargeted-tear-fluid

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연구

JoVE Journal

Medicine

의학

이 프로토콜은 세포에서 유리 및 에스테르화된 생체 활성 지방산의 추출 및 분석을 보여줍니다. 지방산은 안정 동위원소 희석, 키랄 액체 크로마토그래피, 전자 포획, 대기 화학 이온화, 다중 반응 모니터링 질량 분석법(SID-LC-ECAPCI-MRM/MS)을 사용하여 정확하게 정량화됩니다.

타겟 안정 동위 원소 희석 액체 크로마 토그래피 - 질량 분광법 분석을위한 세포 지질 추출

이 동영상은 인간 눈물의 사이토카인을 분석하기 위한 비드 기반 멀티플렉스 분석을 보여줍니다. 이 방법을 사용하면 단일 샘플에서 여러 사이토카인을 동시에 분석할 수 있어 다양한 병태생리학적 조건에서 면역 반응을 연구하기 위한 감도를 높일 수 있습니다.

인간 눈물 샘플의 사이토카인을 분석하기 위한 멀티플렉스 비드 기반 분석

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배우세요 페놀 레드 실을 이용한 인간 눈물액 샘플링 방법으로 LC-MS/MS 기반 지질체 분석을 수행하는 표준화된 절차입니다. 이 프로토콜은 눈물 지질 바이오마커 발견을 위한 재현성 있는 연구에 필수적입니다.

바이오마커 발견에서 표적되지 않은 눈물액 지피도믹스를 위한 페놀 레드 실 샘플링 절차

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