Het volgende protocol schetst het proces van het pancreas dissectie voor virtuele slice beeldvorming, en de daaropvolgende kwantificering van alle GFP-gelabelde beta-cellen in de gehele alvleesklier.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Het volgende protocol schetst het proces van het pancreas dissectie voor virtuele slice beeldvorming, en de daaropvolgende kwantificering van alle GFP-gelabelde beta-cellen in de gehele alvleesklier.
Traceren veranderingen van specifieke cel populaties in gezondheid en ziekte is een belangrijk doel van het biomedisch onderzoek. Het proces van de controle pancreatische beta-cel-proliferatie en eilandje groei vormt een bijzondere uitdaging. We hebben een methode ontwikkeld om de distributie van beta-cellen vast te leggen in het intacte pancreas van transgene muizen met fluorescentie-gelabeld beta-cellen met een macro geschreven voor ImageJ (rsb.info.nih.gov / ij /). Na de pancreas dissectie en weefsel clearing wordt de hele alvleesklier vastgelegd als een virtuele slice, waarna de GFP-gelabelde beta-cellen worden onderzocht. De analyse omvat de kwantificering van de totale bèta-cel gebied, eilandje aantal en de grootte distributie met verwijzing naar specifieke parameters en locaties voor elk eilandje en voor kleine clusters van beta-cellen. De gehele verdeling van de eilandjes kunnen worden uitgezet in drie dimensies, en de informatie van de distributie op de grootte en vorm van elk eilandje staat een kwantitatieve en kwalitatieve vergelijking van de veranderingen in de totale beta-cel gebied in een oogopslag.
Deel 1: Voorbereiding van Monsters
Deel 2: Imaging en kwantificeren van de beta-cel gebied in de intacte alvleesklier

Figuur 1A Virtual Slice beeldanalyse van de volledige distributie van de beta-cellen in een intacte volwassen pancreas
Beelden van afzonderlijke optische panelen van een mannelijke muizen alvleesklier op 10-wk genomen uit hoofde van een 2x doelstelling. De beelden zijn van de volledige distributie van de eilandjes, zelfs kleine clusters van beta-cellen (<10 cellen).

Figuur 1B Virtual Slice beeldanalyse van de volledige distributie van de beta-cellen in een intacte volwassen pancreas
Een geïntegreerde virtuele slice met de dorsale alvleesklier aan de rechterkant en de ventrale alvleesklier aan de linkerkant. Schaal bar is 5 mm.
Representatieve resultaten
Vakkundig de voorbereiding van een pancreas voor de Virtual Slice imaging zal zorgen voor een effectieve kwantificering van alle GFP-gelabelde beta-cellen in een hele alvleesklier als een Virtual Slice beeld met helder en duidelijk eilandjes. Succesvolle Virtual Snijd beeldvorming van de gehele alvleesklier in situ biedt de middelen om te onderzoeken en te kwantificeren van de beta-cellen, niet alleen de individuele en de totale oppervlakte eilandje, maar ook eilandje grootteverdeling, regionale analyses, en groeipatronen ook. Terwijl ImageJ handhaaft de capaciteit om gelijktijdig detecteren alle beta-cellen in de analyse van de Virtual Slice beelden, maar kan ook bepalen welke bèta-cellen te kwantificeren door het beperken van de analyse tot bepaalde eilandje maten (per gebied of diameter), of per locatie. Een standaard analyse sluit artefacten zoals puin kleiner is dan een enkele beta-cel (<170 um 2) en registreert de oppervlakte, omtrek (de afstand rond een gebied), rondheid (een zekere mate van rondheid, waarbij 1,0 staat voor een perfecte cirkel), Feret en de diameter van (de langste afstand binnen een gebied) voor elk eilandje ontdekt. Virtual Slice analyse is in staat het verbeteren virtuele slice afbeeldingen door het gebruik van Watershed segmentatie, wat onderscheidt en scheidt overlappende eilandjes in afzonderlijke eilandjes op basis van hun vormen. De analyse levert verder een reeks gedetailleerde beelden, dit omvat maskers van de beelden onder zowel lage als hoge intensiteit (Fig. 1C), een overzicht van alle veronderstelde eilandjes, die elk individueel genummerd en vermeld in een tabel met bijbehorende informatie (Fig . 1D), en de oorspronkelijke Virtual Slice afbeelding (Fig. 1B). Merk op dat eventuele technische vooringenomenheid bij de keuze van drempelwaarden kan tot gevolg hebben de kwantificering van de eilandjes door het opnemen van gratis licht omliggende grote structuren, of door vermindering van het aantal kleine eilandjes, in het bijzonder zwakke signalen uit kleine deeltjes.

Figuur 1C Virtual Slice beeldanalyse van de volledige distributie van de beta-cellen in een intacte volwassene pancreas
Een masker van de fluorescerende deeltjes in de virtuele slice. Kleurcodes: [1] blauw: lage intensiteit fluorescentie; [2] groen: intermediate intensiteit fluorescentie, en [3] rood: een hoge intensiteit fluorescentie.

Figuur 1D Virtual Slice beeldanalyse van de volledige distributie van de beta-cellen in een intacte volwassen pancreas
Kwantificering van de afzonderlijke eilandjes / clusters van de beta-cellen. Merk op dat elk eilandje (met inbegrip van kleine clusters van beta-cellen) is genummerd, met de informatie zoals gespecificeerd in een bijbehorende grafiek. Vier parameters werden genomen voor elke structuur: (1) gebied, (2) perimeter, (3) circulariteit: een zekere mate van rondheid, waar het nummer 1.0 staat voor een perfecte cirkel, en (4) Feret de diameter van: de langste afstand binnen een gebied. Merk op dat # 706 de analyses resolutie schermen met een oppervlakte van slechts een paar beta-cellen. Watershed segmentatie detecteert groepen van naburige eilandjes, zoals aangegeven de ene, en op passende wijze onderscheidt hen als afzonderlijke eilandjes (eilandjes 1554, 1555 en 1556).

Figuur 1E Virtual Slice beeldanalyse van de volledige distributie van de beta-cellen in een intacte volwassen pancreas
3-dimensionale plot van de virtuele slice-analyse, waarbij de assen van oppervlakte, omtrek en de diameter van Feret. Elke stip staat voor een eilandje.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De analyse van Virtual Slice beelden van eilandjes en beta-cel clusters in de intacte alvleesklier zorgt voor een grote weergave van de gehele verdeling van de eilandjes. Ontwikkelingen en veranderingen in het totaal eilandje verdeling over de tijd kan dus worden bestudeerd en vergeleken. Zo'n voorbeeld wordt gedemonstreerd in onze analyse van de eilandjes van Langerhans formatie (1). Een uitgebreide analyse van neonatale muizen pancreata op verschillende tijdstippen (P1-P21) heeft aangetoond dat eilandjes worden gevorm...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De studie wordt ondersteund door US Public Health Service Grant DK-081527, DK-072473 en DK-20595 aan de Universiteit van Chicago Diabetes Research and Training Center (Animal Models Core), en een geschenk van de Kovler Family Foundation.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Pincet | Miltex Inc. | ||
| Schaar | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
| Schaar | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
| Groot objectglas | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
| Groot dekglas | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
| Objectglas | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
| Dekglas | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
| Dekglas | Erie Scientific | 25mm cirkel | |
| Fluorescentiemicroscoop | Olympus Corporation | ||
| Dissectiemicroscoop | Olympus Corporation | ||
| Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
| MIP-GFP muizen | Jackson Laboratory |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.