Werkwijze voor het traceren van synaptisch verbonden neuronen beschreven. We maken gebruik van TVA specificiteit van een upstream cel te peilen of een cel populatie van belang synaptische input van genetische gedefinieerde celtypes ontvangt.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Werkwijze voor het traceren van synaptisch verbonden neuronen beschreven. We maken gebruik van TVA specificiteit van een upstream cel te peilen of een cel populatie van belang synaptische input van genetische gedefinieerde celtypes ontvangt.
Klassieke methodes voor het bestuderen van neuronale circuits zijn vrij geringe capaciteit. Transsynaptic virussen, met name de pseudorabies (PRV) en rabiësvirus (RABV), en meer recent vesiculair stomatitis virus (VSV), voor het bestuderen schakelingen, wordt steeds populairder. Deze hogere doorvoersnelheid methoden gebruiken virussen die overbrengen tussen neuronen in zowel de anterograde of retrograde richting.
Onlangs werd een aangepaste RABV voor monosynaptic retrograde tracing ontwikkeld. (Figuur 1A). In deze methode wordt het glycoproteïne (G) gen verwijderd uit het virale genoom en alleen in bevoorraad gerichte neuronen. Infectie specificiteit wordt bereikt door het substitueren van een chimeer G, bestaande uit het extracellulaire domein van de ASLV-A glycoproteïne en het cytoplasmatische domein van de G-RABV (A / RG) voor de normale RABV-G 1. Deze chimere G infecteert specifiek cellen die de TVA-receptor 1. Het gen dat codeert TVA kan zijn delivered op verschillende manieren 2-8. Na RABV-G infectie van een TVA-expressie neuron kan de RABV verzenden naar andere, synaptisch verbonden neuronen in een achteruitgaande richting van nature eigen G was geleverd samen met TVA receptor. Deze techniek labels een relatief groot aantal ingangen (5-10%) 2 op een bepaald celtype, die een bemonstering van alle ingangen op een bepaald celtype starter.
We hebben onlangs gemodificeerd deze techniek VSV als een tracer transsynaptic 9. VSV heeft een aantal voordelen, waaronder de snelheid van genexpressie. Hier hebben we detail een nieuwe virale tracing systeem met behulp van VSV nuttig voor het sonderen van microcircuits met verhoogde resolutie. Terwijl de oorspronkelijke gepubliceerde strategieën Wickersham et al.. 4 en Beier et al.. 9 vergunning etiket van neuronen die aanvankelijk op geïnfecteerd TVA-expressie-cellen hier VSV werd ontworpen om slechts aan TVA-expressie brengende cellen (Figuur 1B). Het virus wordt eerst met pseudogetypeerd RABV-G infectie van neuronen stroomafwaarts van TVA-expressie neuronen mogelijk. Na het infecteren deze eerste populatie van cellen, het virus infecteren model alleen TVA tot expressie brengende cellen. Omdat de transsynaptic virale verspreiding beperkt tot TVA tot expressie brengende cellen, of afwezigheid van connectiviteit van gedefinieerde celtypes kunnen worden onderzocht met hoge resolutie. Een experimentele stroomschema van deze experimenten wordt getoond in Figuur 2. Hier laten we een model circuit, dat van richting-selectiviteit in de muis retina. We onderzoeken de connectiviteit van starburst amacrine cellen (SBZ) aan retinale ganglioncellen (RGC).
1. Virus maken van cDNA: Terugwinning van VSV uit cDNA met Vaccinia-T7 System 10
2. Passage en Concentratie van VSV
3. Virons Injectie
4. Oogsten Tissue / Tissue Preparation
5. Representatieve resultaten
Het virus dat wordt gered van cDNA moeten kunnen TVA800 cellen, maar niet 293T-cellen (Figuur 3) infecteren. Het leveren van de RABV-G maakt de infectie van meerdere cellen tYpes, inclusief 293T. Aangezien de A / RG genoom wordt gecodeerd in het genoom, verdeeld over cellen optreedt bij een veel hogere snelheid in TVA tot expressie brengende cellen.
Zodra het virus geconcentreerd, typisch titers tussen 10 8 ffu / ml en 10 10 ffu / ml. Deze titers zijn geschikt voor gebruik in vivo.
Tijdens LGN injectie in de muis, doen we geen onderscheid dorsale LGN (dLGN) van ventrale LGN (vLGN), aangezien beide doorgaans besmet raken. Daarom raken meerdere types gelabeld RGC (figuur 4), inclusief die project de vLGN zoals melanopsine RGCs (Figuur 4D) en ON-DSGCs (Figuur 4E), en die aan het project dLGN zoals de kleine prieel RGC (Figuur 4C) en ON-OFF-DSGCs (Figuur 4F). Hoewel meer dan een type RGC overgebracht virus SACs, zoals elders beschreven (Beier et al.., In review), hier alleen richtenop de goed bestudeerde verbindingen van ON-OFF-DSGCs tot SBZ.
(-) Als we muizen van het genotype cTVA (+) / ChAT-Cre injecteren, waar geen TVA worden uitgedrukt, worden alleen RGCs gemerkt (bijvoorbeeld figuur 4). Deze zijn het gevolg van de eerste opname van de RABV-G pseudogetypeerde virus door de RGC en de verspreiding optreedt. Geen RGCs besmet door een infectie van LGN rVSV (A / RG) virus niet met pseudogetypeerd RABV-G, door een onvermogen van deze virions tot overdwarse de lange axonen van deze RGCs. Echter, bij het injecteren cTVA (+) / ChATCre (+) (en R26TdT (+)) muizen in de LGN gaat virusverspreiding optreden alleen rode cellen, die het Cre reporter (bijvoorbeeld figuur 5) te drukken. Deze cellen ook co-label met de anti-ChAT antilichaam en stratificeren gedurende maximaal twee laminae ChAT bevestigt hun identiteit als SAC (Figuren 5B ', C'). Het aantal viraal gelabeld SAC per DSGC varieerde van een tot negen.

Figuur 1. Onze retrograde transsynaptic tracering dan de oorspronkelijk ontwikkelde methode. (A) (i) In de werkwijze die door Wickersham en collega's "starter cellen" worden getransfecteerd met drie genen: het TVA receptor, die specifiek mogelijk infectie van getransfecteerde cellen, het RABV-G, gebruikt om de RABV vullen die zelf had het G-gen verwijderd en een rode fluorescerende eiwit getransfecteerde cellen. (Ii) A RABV pseudogetypeerd de A / RG eiwit infecteert TVA tot expressie brengende cellen, waardoor ze geel. (Iii) Retrograde transsynaptic overdracht plaatsvindt aan upstream neuronen. (B) (i) In onze methode worden TVA tot expressie brengende cellen genetisch bepaald en worden aangeduid met een voorwaardelijke rood fluorescerend protein (ii) De "starter cellen" zijn geïnfecteerd met een VSV codeert de A / RG gen in het virale genoom. Deze starter cellen niet drukken de TVA-receptor. (Iii) Retrograde transsynaptic overdracht plaatsvindt aan TVA-expressie neuronen alleen als deze cellen synaptische input op de starter neuronen. Klik hier om een grotere afbeelding te bekijken .

Figuur 2. Schema van de experimentele procedure. (A) Eerst wordt het virus gered van cDNA. Vervolgens wordt gepasseerd en met pseudogetypeerd RABV-G, en geconcentreerd en getitreerd. Dit virus wordt dan geïnjecteerd in de hersenen, waar het is toegestaan te incuberen voor de gewenste tijdsduur. Hiernatijd wordt het oog geoogst en de retina ontleed en geanalyseerd. (B) Schematische voorstelling van pseudotypering het virus met RABV-G. Dit is noodzakelijk voor infectie van retinale ganglioncellen van hersenen injectie. De RABV-G-gen wordt eerst getransfecteerd in weefselkweek cellen die de TVA-receptor. Deze cellen worden vervolgens geïnfecteerd met het rVSV (A / RG) virus. Vrijgekomen virions zal RABV-G in de virale envelop, maar het gen voor RABV-G niet in het virale genoom. (C) Een schema van de muis kruist nodig triple transgene dieren. Voorwaardelijke TVA en tdTomato allelen gekruist met een Cre driver keuze, zodat beide TVA en tdTomato alleen worden uitgedrukt in cellen met een Cre expressie geschiedenis. In dit voorbeeld hebben we gebruik gemaakt ChAT-Cre. (D) Een schema van de retinale infectie om DSGC-SAC circuits sporen. De chat-cellen zijn gemaakt om uitdrukkelijke TVA en tdTomato, zoals in (C). RGC zijn besmet door een LGN infection van het virus geproduceerd in (B). Omdat het virus uitdrukt GFP, zullen deze RGC groen zijn. Het virus dan alleen uitbreiden tot TVA-expressie ChAT amacrine cellen als ze zijn aangesloten op de gelabelde RGC. Deze cellen zullen zowel rood en groen of geel. Klik hier om een grotere afbeelding te bekijken .

Figuur 3. Gedrag van rVSV (A / RG) virus op 293T en TVA800 cellen. Deze cellen werden geïnfecteerd met een lage titer rVSV (A / RG) pseudogetypeerd met RABV-G. Het virus spreads tussen TVA tot expressie brengende cellen in enkele uren, zoals bij 6 uur na infectie (HPI), 1 en 2 dagen na infectie (DPI). De spreiding op 293T-cellen die niet de expressie TVA receptor, hoewel ikt zich voordoen doet, gebeurt er veel trager. Schaal bar = 100 urn.

Figuur 4. Representatieve infecties van RGCs van niet-TVA expressie muizen. Dieren werden geïnjecteerd met de LGN rVSV (A / RG) virus met pseudogetypeerd RABV-G, en weefsel geoogst 2 dpi. (A) Sparse (RGC aangegeven door gele pijlpunten) of (B) dicht infecties kunnen worden verkregen, afhankelijk van de titer van virus en kwaliteit van injectie. Veel verschillende soorten RGC kan worden geïdentificeerd op basis van morfologie, met inbegrip van (C) klein prieel RGC, (D) type 1 melanopsine RGC, (E) ON-DSGCs, en (F) ON-OFF-DSGCs, onder anderen. Schaal bar = 50 um.
Figuur 5. RVSV (A / RG) overdracht van ON-OFF-DSGCs aan SBZ volgt het verwachte patroon. (A) ON-OFF-DSGCs (witte pijlpunt met groene vulling) virus overdragen naar meerdere SAC (gele pijlpunten). (A). Alle groene cellen die niet de DSGC co-label met het Cre verslaggever, wat aangeeft dat ze TVA-expressie SBZ. (BC) De DSGC (witte pijlpunt met groene vulling) en SAC (geel pijlpunten) stratificeren in de juiste ChAT lagen van het netvlies binnenste plexiform laag (IPL). De cellen waarin het virus verstuurt zowel op als buiten de SBZ. Getallen in panelen B 'en C' geven de IPL laminae. De locatie van het DSGC soma slechts aangegeven door de pijl, maar niet getoond in paneel C de SACs markeren. Schaal bar = 50 um.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Met virussen neurale circuits studie een relatief high throughput werkwijze voor het analyseren verbonden neuronen. Echter, het genereren van zowel VSV en RABV virionen is niet triviaal. Hoewel het bovenstaande protocol voor reddings virus van cDNA wordt, is het nog steeds een lage waarschijnlijkheid event. De niveaus van elk van de N, P en L plasmiden moeten fijn worden aangepast en vele proeven en gerepliceerd moet worden gedaan om virale rescue waarborgen. De vorming van de ribonucleotide deeltjes waarin een volledig...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Geen belangenconflicten verklaard.
We willen graag Sean Whelan erkennen voor hulp bij het redden van recombinante VSV-varianten, en Didem Goz en Ryan Chrenek voor technische ondersteuning. Dit werk werd ondersteund door HHMI (CLC), en # NS068012-01 (KTB).
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Weefselkweek | |||
| Baby Hamster Kidney (BSRT7) cellen | beschikbaar op aanvraag | ||
| vaccinia (vTF7-3) | beschikbaar op aanvraag | ||
| pN, pP, pl plasmiden | beschikbaar op aanvraag | ||
| Calciumchloride | Sigma | C1016 | |
| Magnesiumchloride | Sigma | M8266 | |
| HEK 293T cellen | Open Biosystems | HCL4517 | |
| 60 mm TC-behandelde kweekschaal | Corning | 430166 | |
| 75 cm2 rechthoekige kweekfles met schuine hals en ventilatiedop | Corning | 430641 | |
| Medium: DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium) | Invitrogen | 12491-015 | |
| 1 M HEPES pH 7.4 | Gibo | 15630-080 | |
| FBS: Foetaal Bovien Serum | Gibco | 10437-028 | |
| PKS | Invitrogen | 15140-163 | |
| Lipofectamine 2,000 transfectiereagens | Invitrogen | 11668-019 | |
| Spuit: 5 ml Luer-Lock spuit | Sigma | Z248010-1PAK | |
| Spuitfilters | Nalgene | 190-2520 | |
| PEI: High Potency Lineair PEI | Polysciences | 23966 | |
| Virale Centrifugatie | |||
| Corning 150 ml buis vacuümfiltersysteem, 0.45 μm porie | Corning | 430314 | |
| Dunwandige, ultracleare ultracentrifugebuizen, 38.5 ml, 25 x 89 mm | Beckman-Coulter | 344058 | |
| Ultracentrifuge | Beckman-Coulter | optima XL-80K | |
| SW28 ultracentrifugerotor | Beckman-Coulter | 342207 | |
| Injectie in muis | |||
| Capillaire micropipetten | Drummond | 5-000-2005 | |
| Stereotax | Narishige | SR-5M | |
| Micromanipulator | Narishige | SM-15 | |
| Ump injector | World Precision Instruments | Sys-Micro4 | |
| Vierkanaals microcontroller | World Precision Instruments | UMP3 | |
| M.TXB tafelmotor met C.EMX-1 draaischakelaar, 115 Volt | Foredom | M.TXB-EM | |
| H.10 handstuk, snelwisselend | Foredom | H.10 | |
| Trapsboormachine, 0.5 mm | Foredom | A-58005P | |
| Micro–elektrodehouder | World Precision Instruments | MEH2S | |
| Ketamine | Henry Schein | 995-2949 | |
| Xylazine | Henry Schein | 4015809TV | |
| Buprenorfine | Henry Schein | 1118217 | |
| 1 ml spuit | Becton-Dickinson | 309628 | |
| 30 gauge injectienaald | Becton-Dickinson | 305106 | |
| Beschermende oogzalf | Doctors Foster and Smith | 9N-014748 | |
| Ethanol | Sigma | 493511 | |
| Jodium | Sigma | PVP1 | |
| Chirurgische en dissectie-instrumenten | |||
| Scharen | Fine Science Tools | 91402-12 | |
| Standaard pincetten | Fine Science Tools | 11000-12 | |
| Fijne pincetten | Fine Science Tools | 11255-20 | |
| Vannas veerscharen | Fine Science Tools | 15000-00 | |
| Scalpelhouder | Fine Science Tools | 10003-12 | |
| Scalpelmesjes | Fine Science Tools | 10015-00 | |
| Hechtmaterialen | Robbins Instruments | 20.SK640 | |
| Dissectie en antilichaamkleuring | |||
| paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
| Fosfaatgebufferde zoutoplossing | Sigma | P4417 | |
| Triton X-100 | Sigma | T9284 | |
| Donkeyserum | Jackson Immunoresearch | 017-000-121 | |
| Antilichamen | |||
| Antilichamen | millipore | AB144P | |
| Anti-gfp | Abcam | ab13970 | |
| Donkey anti-chicken Dylight 488 | Jackson immunoresearch | 703-545-155 | |
| Donkey anti-chicken Alexa Fluor 647 | Jackson immunoresearch | 705-605-147 | |
| DAPI | Invitrogen | D1306 | |
| Montage van weefsel | |||
| Superfrost plus microscopische objectglazen | Fisher | 12-550-100 | |
| Dekglas 22 x 22, 0 dikte | Electron Microscopy Sciences | 72198-10 | |
| Siliconen elastomeer | Rogers Corp | HT-6220 | |
| Transparante nagellak | Electron Microscopy Sciences | 72180 | |
| Prolong Gold antifade reagens | Invitrogen | P36930 | |
|
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.