$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Isolatie van renale proximale tubuli voor primaire Cultuur
- Verdoven het konijn, accijnzen beide nieren en leg ze in een petrischaal gevuld met steriele prep buffer (DMEM/F12-medium) in een laminaire stroming kap.
- Perfuseren elke nier met 50 ml buffer prep gevolgd door 50 ml steriele fosfaat-gebufferde zoutoplossing, pH 7,4 (PBS), en PBS-oplossing ijzeroxide (45 ml + 5 ml). De-capsulate nieren en overbrengen naar de prep buffer met deferoxamine.
- Oogst de cortex van elke nier.
- Homogeniseer het weefsel met een 15 ml Dounce homogenisator. Giet het homogenaat over 2 steriele mesh zeven (85 urn op de bodem en 235 urn geplaatst) geplaatst over een 1 L steriele beker. Spoel de zeven met deferoxamine-bevattende buffer.
- Vang weefsel achtergelaten op de 85 urn zeef in een steriele conische centrifugebuis gevuld met 35-40 ml van het deferoxamine bevattende buffer. Meng voorzichtig de celsuspensie.
- Plaats een sterke mAgnet buitenkant van de buis om ijzer gevuld glomeruli te verwijderen en laat de schorsing te regelen. Zuig ijzer uit de magneet met een Pasteur pipet. Herhaal dit proces.
- Bereid 1 ml digestiemedium met 2,400-2,500 eenheden collagenase I en 0,6 mg sojaboontrypsineremmer opgelost in het deferoxamine bevattende buffer. Filter-Steriliseer de spijsvertering medium.
- Het volume van de celsuspensie tot 40 ml en voeg 1 ml digestiemedium. Incubeer bij kamertemperatuur gedurende 17 min zachtjes mengen van de suspensie, centrifuge bij 50 xg gedurende 2 min bij 4 ° C, zuig het medium door vers deferoxamine buffer.
- Herhaal de ijzer-het verwijderen van de procedure met de magneet een paar keer, naar beneden draaien van de schorsing opnieuw te zuigen medium, en voeg 46 ml medium dat geen glucose.
- Meng voorzichtig en afmeten van 500 pi van de suspensie in twee vooraf gewogen Eppendorf buizen. Spin-cellen neer op 10.000 xg gedurende 1 minuut, zuigen de media, en wegen van de pellet. Bereken de totale opbrengst aan natte massa en eiwit.
- Plaat de cellen in steriele 35 mm kweekschalen de dichtheid van 1 mg eiwit / schaal met glucose-vrij DMEM/F12 medium. Kweekcellen in 2 ml glucose-vrij medium DMEM/F12 altijd op een schudapparaat in de incubator bij 37 ° C (95% lucht / 5% CO 2). 1,2
2. Nier-proximale tubulus Cultuur van de Cel
- Het kweekmedium een 50:50 mengsel van DMEM en Ham's F-12 voedingsstoffenmix zonder fenolrood, pyruvaat en glucose, aangevuld met 15 mM NaHCO 3, 15 mM HEPES en 6 mM lactaat (pH 7,4, 295 mosmol / KGH 2 O). De media worden aangevuld met L-ascorbinezuur-2-fosfaat (50 uM), runderinsuline (10 nM), humaan transferrine (5 mg / ml), hydrocortison (50 nM) en selenium (5 ng / ml) onmiddellijk vóór Daily Media verandering.
- Zuig oude media uit gerechten met behulp van een steriele techniek. Voeg 2 ml warm, vers medium aan elke schaal met een steriele techniek. Reinterne proximale tubulaire cellen (RPTC) te bereiken samenvloeiing in ongeveer 5-6 dagen na plating. 1,2
3. Adenovirale infectie van RPTC
- Adenovirale infectie wordt uitgevoerd in confluente, rustende culturen van RPTC na de dagelijkse verandering media. Dominant negatieve mutant PKC-ε (dnPKC-ε) werd geconstrueerd door het vervangen van: 1) lysine met arginine op positie 436 van de ATP-bindingsplaats en 2) alanine met glutamaat op positie 159 van het pseudosubstrate domein. Deze mutaties vernietigde construct de kinase-activiteit zonder de actieve conformatie van PKC-ε. 3 PKC-ε werd constitutief actief door deletie van residuen 154-163 van de remmende pseudosubstrate domein 4.
- Voeg voorraadoplossing van de adenovirus die caPKC-ε cDNA of dnPKC-ε cDNA aan elke schaal de gewenste multipliciteit van infectie (MOI) resulteert in een significante toename van PKC-en Epsil verkrijgenon; eiwitniveaus. RPTC incuberen met adenovirus gedurende 24 uur. Wijzig media en cultuur cellen voor nog eens 24 uur. Aanzienlijk hogere niveaus van gefosforyleerd en totale PKC-ε eiwitten kunnen worden verkregen met 25-50 MOI van adenovirale vector coderende caPKC-ε. Meer MOI resulteert in nog grotere toename in de niveaus van actieve PKC-ε, maar wordt niet aangeraden in RPTC door de snelle celdood en verlies. Aanzienlijk hogere niveaus van de inactieve PKC-ε eiwit kan worden verkregen met 50-100 MOI in RPTC zonder dat bijwerkingen. 5
- Op 48 uur na infectie aspiraat media, was de monolagen met PBS, en het verzamelen cellen voor immunoblot analyse eiwitniveaus van PKC-ε bepalen. 5
4. Meting van RPTC ademhaling
- Bereid een assay buffer voor het meten state 3 ademhaling (120 mM KCl, 5 mM KH 2PO 4, 10 mM HEPES, 1 mM MgSO4, en 2 mM EGTA, pH 7,4). Voor het meten van complex I-gekoppelde toestand 3 ademhaling vult deze assay buffer met 5 mM glutamaat, 5 mM malaat en 0,1 mg / ml digitonine. Voor complex II gekoppelde toestand 3 ademhaling vult deze assay buffer met 10 mM succinaat, 0,1 uM rotenon en 0,1 mg / ml digitonine. Voor complex IV-gekoppelde toestand 3 ademhaling vult deze assay buffer met 1 mM ascorbaat, 1 mM N, N, N ', N'-tetramethyl-p-fenyleendiamine (TMPD) en 0,1 mg / ml digitonine. Plaats de oplossing in een 37 ° C waterbad.
- Zuig media uit een cultuur schotel met RPTC monolaag, 2 ml van een warme toestand 3 ademhaling buffer toe te voegen, voorzichtig schrapen cellen van de schotel met een rubberen politieman, en breng de inhoud aan het zuurstofverbruik kamer voorzien van een Clark-type elektrode.
- Maatregel state 2 ademhaling (in afwezigheid van ADP). Initiëren state 3 ademhaling door toevoeging ADP tot een eindconcentratie van 0,4 mM. Start toestand 4 ademhaling door het toevoegen van oligomycine tot een definitief concentratie van 0,5 ug / ml. Afgekoppeld ademhaling wordt gemeten door het toevoegen van 0,5 uM FCCP aan cellen ademende bij toestand 3. 6,7
- Verzamel de celsuspensie uit de kamer neerslaan eiwit met perchloorzuur en spin down het precipitaat. Bepaal eiwitconcentratie in de cellulaire pellet.
5. Analyse van de mitochondriale membraanpotentiaal (ΔΨm)
- Bereid 0,5 mM JC-1 oplossing in de steriele kweekmedium.
- Voeg langzaam 20 pl JC-1-oplossing aan elke schaal tot een eindconcentratie van 5 urn. Zwenk de schotel naar de kleurstof goed te mengen. Breng de schalen in de broedstoof gedurende 30 minuten.
- Zet gerechten op ijs, aspiraat media, en twee keer wassen monolagen met ijskoude PBS. Aspiraat PBS, voeg 1 ml vers PBS, schrapen cellen van de schaal en breng ze over naar een Eppendorf buis. Verdeel monolagen in enkele cellen door pipetteren ze op en neer.
- Draai de schorsing neer op 1.000 xg gedurende 2 min, aspirate het supernatant, voeg 1 ml van PBS aan de pellet en resuspendeer aan een enkele celsuspensie te verkrijgen. Herhaal deze stap indien nodig.
- Spin cellen neer 1000 xg gedurende 2 min, zuig de supernatant, voeg 0,5 ml PBS en resuspendeer de pellet. Analyseren fluorescentie door flowcytometrie met excitatie door een 488-nm argon-ion laser. Lees de emissie in twee afzonderlijke kanalen FL1 bij 525 nm en bij 590 nm FL2. Mitochondriale membraanpotentiaal wordt uitgedrukt FL2/FL1 fluorescentieverhouding. 6
6. Isolatie van mitochondriën
- Bereid isolatie buffers: Buffer A (10 mM HEPES, 225 mM mannitol, 75 mM sucrose, 0,1 mM EGTA, pH 7,4), Buffer B (buffer A bevattende proteaseremmers, 1 mM Na 3 VO 4, 1 mM NaF), en Buffer C (10 mM HEPES, 395 mM sucrose, 0,1 mM EGTA, pH 7,4). Voer alle stappen op het ijs.
- Was tweemaal RPTC monolagen met ijskoude PBS-buffer. Schraap monolagen in Eppendorf buisjes en draaien zebij 500 xg gedurende 5 minuten. Was de pellet in 1 ml buffer A.
- Resuspendeer de pellet in 1 ml buffer B en breng de een 2 ml Dounce homogenisator.
- Meng cellen in de Dounce homogenisator totdat het meeste cellen in het homogenaat worden verbroken wanneer geïnspecteerd onder een microscoop.
- Centrifugeer het homogenaat bij 1000 xg gedurende 5 minuten bij 4 ° C. De bovenstaande en gedeactiveerd bij 15.000 xg gedurende 10 min bij 4 ° C.
- Verwijder het supernatant en resuspendeer de pellet bevattende ruwe mitochondria in 1 ml buffer C. Draai de supernatanten neer 15.000 xg gedurende 10 min bij 4 ° C. Herhaal het wassen van de pellet twee keer 5.
- Om de activiteiten van respiratoire complexen meten resuspendeer mitochondriale pellet in 50-100 pi van de assay buffer en bevriezing in vloeibare stikstof. Langzaam ontdooien monsters op ijs.
7. Meting van de activiteit van NADH-ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
- Bereid de assay buffer: 10 mM KH 2PO 4, 5 mM MgCl2, pH 7,2. Voeg vetzuur-vrij BSA en NADH tot eindconcentraties van 0,25% en 0,25 mM te verkrijgen, respectievelijk. Voeg 2 pl antimycin Een oplossing (1 mg / ml) tot een eindconcentratie van 2 ug / ml.
- Voer de monsters in een 48-well transparante plaat. Neem een blanco monster dat alle toevoegingen, maar geen mitochondriën heeft. Aan elke well 500 pi van de assay buffer met aanvullingen en mitochondria, en incubeer de plaat bij 30 ° C onder mengen gedurende 5 minuten.
- Vervolg de reactie door toevoeging van 10 ul van 3,25 mM ubiquinone aan elk putje. Noteer de absorptie (340 nm) gedurende 3 min in 20 seconde. Voeg 5 gl rotenone oplossing (1 mg / ml) aan elk putje en noteer de absorptie extra 2 minuten. Bereken complex I-activiteit als de rotenone-gevoelige NADH oxidatie. 7
8. Meting van de activiteit van succinaat-ubiquinon oxidoreductase (complex II)
- Bereid de assay buffer die 0,25% vetzuur-vrij BSA, 20 mM kalium succinaat, 0,25 mM 2,6-dichloroindophenol, 2 ug / ml antimycin A en 10 pg / ml rotenon.
- Voer de monsters in duplo in een 48-well transparante plaat met een blanco monster dat alle toevoegingen maar geen mitochondria heeft. Aan elke well 500 pi van de assay buffer met aanvullingen en mitochondria, en incubeer de plaat bij 30 ° C onder mengen gedurende 2 minuten.
- Vervolg de reactie door toevoeging van 10 ul van 3,25 mM ubiquinone aan elk putje. Noteer de absorptie (595 nm) gedurende 3 min in 20 seconde. Bereken Complex II activiteit door de reductie van 2,6-dichloroindophenol. 7
9. Meting van de activiteit van Ubiquinol-cytochroom c oxidoreductase (Complex III)
- Bereid de assay buffer die 0,1% vetzuur-vrij BSA, 80 mM kalium succinaat, 10 ug / ml rotenon en 0,24 mM kalium cyanide.
- Voer de monstersin duplo in een 48-well transparante plaat met een blanco monster dat alle toevoegingen maar geen mitochondria heeft. Aan elke well 291 pl van de assay buffer met aanvullingen en mitochondria, en incubeer de plaat bij 30 ° C onder mengen gedurende 5 minuten.
- Vervolg de reactie door toevoeging van 3 pi van 6 mM geoxideerd cytochroom c in elk putje. Noteer de absorptie (550 nm) gedurende 3 min in 20 seconde. Voeg 5 gl antimycin Een oplossing (1 mg / ml) aan elk putje en noteer de absorptie extra 2 minuten. Bereken complex III-activiteit als de antimycin A-gevoelige cytochroom c reductie. 7
10. Meting van de activiteit van cytochroom oxidase (complex IV)
- Bereiden verminderd cytochroom C door natriumascorbaat tot 9 mM oplossing van cytochroom c en dialyseren de oplossing overnacht bij 4 ° C in 1 L fosfaat buffer (10 mM KH 2PO 4, pH 7,2) met 5 mM MgCl2. Bereid de assay buffer die0,1% vetzuur-vrij BSA en antimycin A (2 ug / ml).
- Voer de monsters in een 48-well transparante plaat met een blanco monster dat alle toevoegingen maar geen mitochondria heeft. Aan elke well 233 pl van de assay buffer met aanvullingen en mitochondria, en incubeer de plaat bij 30 ° C onder mengen gedurende 5 minuten.
- Vervolg de reactie door toevoeging van gereduceerde cytochroom c (90 uM eindconcentratie). Noteer de absorptie (550 nm) gedurende 3 min in 20 seconde. Voeg 2 pl KCN oplossing (8 ug / ml) aan elk putje en noteer de absorptie nog 2 min. Bereken complex IV activiteit als KCN-gevoelige cytochroom c oxidatie. 7
11. Meting van de activiteit van F 0 F 1-ATPase (ATP synthase)
- Bereid F 0 F 1-ATPase assay buffer (10 mM Tris-HCl, 200 mM KCl, 2 mM MgCl2, pH 8,2). Mitochondriale pellet resuspendeer in de assay buffer, bevriezen mitochondriale monsters in liquidatied stikstof en ontdooien van de monsters langzaam op ijs.
- Voer de monsters in drievoud in een 48-well transparante plaat. Voor elke dosisgroep worden 2 wells worden uitgevoerd om de totale ATPase activiteit (275 pl van de assay buffer, 5 pl mitochondriale suspensie, en 5 ul van 95% ethanol) en 1 goed te meten oligomycine ongevoelig ATPase activiteit te meten (275 pi de assay buffer, 5 pl mitochondriale suspensie en 5 ui 1 mg / ml oligomycine oplossing in 95% ethanol).
- Incubeer monsters bij 31 ° C gedurende 10 minuten met constant schudden. Voeg 16 ul van 100 mM ATP oplossing (pH 7,0) en incubeer bij 31 ° C gedurende 5 min met constant schudden.
- Breng 200 pi van het incubatiemengsel op een buis die 50 pi van 3 M TCA. Incubeer monsters op ijs gedurende 10 min en draaien ze op bij 10.000 xg gedurende 5 minuten bij 4 ° C. Gebruik supernatanten en pellets fosfaat en eiwitgehalte respectievelijk te bepalen,.
- Bepaal fosfaatgehalte in de supernatanten met deanorganisch fosfaat assay. Bereid 100 ml van Reagens Sumner door toevoeging 0,88 g FeSO 4 tot 10 ml 3,75 MH 2 SO 4 en aanpassing aan 90 ml met H 2 O. Voeg 10 ml ammoniummolybdaatoplossing (0,66 g/10 ml H 2 O) aan de oplossing van FeSO 4 in H 2 SO 4. Beschermen tegen licht.
- Load 96-wells plaat met 50 ul van elke fosfaat standaard (0 - 1.000 uM KH 2 PO 4) en 50 ul van elk supernatant in duplo. Voeg 250 ul van de Sumner reagens aan elk putje en incubeer de plaat bij 30 ° C gedurende 15 min met constant schudden.
- Noteer de absorptie bij 595 nm bij kamertemperatuur. F 0 F 1-ATPase activiteit bepaald door de oligomycine-gevoelige afgifte van P i van ATP als eerder beschreven. 7,8 Bereken totaal oligomycine-ongevoelige F 0 F 1-ATPase activiteiten. Om de oligomycine-gevoelige ATPase geacti berekenenviteit, aftrekken oligomycine-ongevoelige activiteit van de totale ATPase activiteit. 8,9
12. Meting van intracellulaire ATP Content
- Place kweekschalen met RPTC monolagen op ijs, aspiraat medium en tweemaal wassen van de monolagen met ijskoude PBS buffer. Voeg 1 ml PBS aan elke monolaag schrapen elke monolaag in PBS en verzamel de celsuspensie in een Eppendorf buis. Draai de Eppendorf buizen in de microfuge gedurende 5 sec.
- Bepaal ATP-gehalte in elk monster RPTC de luciferase met gebruik van ATP Bioluminescence Assay Kit HS II (Roche) en protocollen van de fabrikant. Bepaal eiwitconcentratie in elk monster en bereken de concentratie ATP per mg eiwit. 8
13. Visualisatie van Mitochondriale Morfologie
- Wijzig cultuur media. Voeg 2 pi van 100 uM oplossing van MitoTracker Red 580 tot elk gerecht (eindconcentratie. 100 nM) en de terugkeer van de gerechten aan de incubator gedurende 30 minuten.
- Onderzoek de live-monolagen onder een fluorescentie microscoop met behulp van een water immersie objectief. 5
14. Analyse van de levensvatbaarheid van de cellen
- Na 24 uur voordat de assay bereiden 50 mM oplossing van cisplatine met cellen die dient als positieve controle voor apoptose (annexine V-positieve cellen) te behandelen. Ook bereiden 500 mM oplossing van tert-butylhydroperoxide voor cellen die fungeren als positieve controles voor oncosis (propidiumjodide-positieve cellen) te behandelen.
- Behandel 2 schalen met 2 ui 50 mM cisplatin en 2 schalen met 2 pi 500 mM tert-butylhydroperoxide. Wijd een schotel voor een no-vlek controle.
- Op 24 uur na behandeling met cisplatine en TBHP, bereidt de binding buffer (10 mM Hepes, 140 mM NaCl, 5 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1,8 mM CaCl2) en propidiumiodide (PI) oplossing (50 ug / ml) in de bindende buffer.
- Ze wast monolagen met de binding buffer. Voeg 1 ml van de ijskoude buffer en 50 pi PI oplossing aan elke schaal behalve de no-vlek en annexine V-positieve cellen. Betrekking schotels en incubeer op ijs gedurende 15 min onder zacht orbitaal schudden.
- Monolagen wassen met bindingsbuffer (10 min) en voeg 1 ml van de bindende buffer en 2 ui Annexine V-FITC oplossing aan elke schaal behalve no-vlek en PI-positieve cellen. Betrekking gerechten en incubeer bij kamertemperatuur gedurende 10 min onder zachtjes schudden orbital.
- Zuig het buffer en was de monolagen met 1 ml van ijskoude bindingsbuffer op ijs gedurende 10 minuten met zacht orbitaal schudden. Herhaal de wasstap.
- Zuig het bindingsbuffer en voeg 500 ul bindingsbuffer aan elke schaal. Voorzichtig schrapen de cellen met behulp van een rubberen politieman en breng de cellen om cytometrie buizen stromen. Dispergeer de cellen in een enkele celsuspensie door het pipetteren monsters op en neer. Verdeel elke cel clusters.
- Onmiddellijk kwantificeren PI en annexine V-FITC fluorescentie door flow cytometrie met excitatie bij 488 nm en emissie bij 590 en 530 nm voor FITC en PI respectievelijk. Tellen 10.000 gebeurtenissen voor elk monster.
- Plaats de FITC fluorescentie op de X-as en de PI fluorescentie op de Y-as van de flowcytometrie puntdiagram figuren. Cellen positief voor Annexine V en negatief voor PI worden beschouwd apoptotische. Cellen positief voor PI en negatief voor Annexine V worden beschouwd als oncotische. 10,11