Alle experimenten worden uitgevoerd volgens protocollen goedgekeurd door de Institutional Animal Care en gebruik Comite op het College of William and Mary. Ontwikkelingsstadia waarnaar in dit protocol zijn volgens Nieuwkoop en Faber 46.
1. Ontleding
- Laat het celkweekmedium en Calcium Magnesium vrij medium (CMF) equilibreren tot kamertemperatuur. U zult ook moeten 0,1 x Marc's Gemodificeerd Ringer (MMR) pH 7,4-7,6.
- Steriliseer de volgende door een UV licht gedurende 30 min in een celkweek laminaire stroming kap. (Spuit elk item met 70% ethanol voordat u het in de kap.)
- 35 mm kunststof petrischaaltjes.
- 60 mm kunststof petrischaaltjes.
- 35 mm Nunclon oppervlak gerechten.
- 1,5 ml microcentrifugebuizen.
- P1000 micropipet (1.000 ul micropipet).
- Aerosol bestand P1000 tips (1.000 ul micropipet aerosol resistent tips).
- Alcoholbestendig pen.
- Fijn ontleden tang.
- * 15 ml conische buizen (alleen voor imaging calcium activiteit).
- * Alleen voor beeldvorming van calcium activiteit.
- Zodra de kap is UV gesteriliseerd en oplossingen moeten op kamertemperatuur komen, zet de laminaire luchtstroom in de kap, Spuit handschoenen en media flessen met 70% ethanol en plaats de media flessen in de motorkap.
- Binnen in de kap de voorbereiding van de volgende met een p1000 micropipet voor elke plaat van cellen, zorgen voor een passende etikettering.
- Een 60 mm kunststof petrischaal met 10 ml celkweekmedium - Dissection Plate.
- Een 35 mm Nunclon oppervlak schotel met 2 ml celkweekmedium - Cultuur Plate. (Nunclon plastic vaat niet verder behandeld met een lijm.)
- Een lege 1,5 ml microcentrifugebuis-Explantatie Dissociatie Tube.
- * Een 15 ml conische valkbuis met 15 ml celkweekmedium. Voor het wassen van het overtollige Fluo4-AM bij beeldvorming calcium activiteit.
- Binnen in de kap, de voorbereiding van de volgende met een p1000 micropipet voor elke dissectie sessie (meer dan een netvlies kan worden ontleed in een sessie).
- Een 35 mm kunststof petrischaal met 2 ml CMF - Explantatie spoelen Plate.
- Een 35 mm kunststof petrischaal met 2 ml CMF - Explantatie Dissociatie Plate.
- Buiten de kap de voorbereiding van de volgende:
- Een 60 mm kunststof Petrischaal per plaat van cellen met 10 ml 0,1 x MMR - Holding Plaat.
- Een 60 mm kunststof Petrischaal per plaat van cellen met 10 ml 0,1 x MMR - Broers en Plaat.
- Een 60 mm plastic petrischaal per sessie dissectie met 10 ml 0,1 x MMR + 0,5 mg / ml MS-222 (tricaine) - Plate verdoving.
- Voeg 40 ul 5% trypsine in CMF aan de Explantatie Dissociatie Plaat (resulterend in een 0,1% trypsine-oplossing), kolken te mengen, en zet apart.
- Als ontleden een embryo dat jonger is dan fase 30, voeg 10 mg collagenase B om de Dissection Plate (resulterend in een 1 mg / ml collagenase B-oplossing), zwenk om te ontbinden en zet apart.
- Selecteer een embryo van de gewenste fase, over te dragen aan de montageplaat met een niet-steriele pipet en verwijder de vitelline membraan (als het embryo nog niet uitgekomen) met behulp van fijne tang.
- Overdracht meerdere identieke geënsceneerd embryo's naar de Sibling Plaat met een niet-steriele transferpipet.
- Als het embryo fase 25 of eerder direct doorgaan met dissectie anderszins overdragen van de embryo de verdoving Plaat met een niet-steriele pipet en laat de embryo zitten totdat beweging en de reactie op stimuli eindigt. Dit kantot een minuut.
- Ga verder met dissectie (Figuur 2) onder een dissectie scope (4x objectief, 10x oculair).
Voor embryo stadium 25 of jonger:
- Transfer embryo naar de Dissection Plaat met een niet-steriele transferpipet.
- Gebruik van twee paar fijne forceps, een sagittale snede aan de ventrale zijde van het embryo, vanaf het achterste uiteinde en verder door de cement klier in het voorste gedeelte van de embryo.
- Open voorzichtig het embryo door grijpen de randen van de snede en het verspreiden van links en rechts. Dit resulteert in een embryo met de dorsale zijde in de plaat Dissection en de ventrale ectoderm opengespreid het endoderm en mesoderm in onthullen.
- Beginnen met het verwijderen van de endoderm en mesoderm (figuur 2A en 2B). De eerste en grootste laag van dit weefsel is "fluffy" in uiterlijk metgrote cellen en weinig duidelijk organisatie.
- Na het verwijderen laag, de somieten en notochorda zichtbaar. Voor beter contrast Verplaats de embryo een afzonderlijke 60 mm plastic petrischaal met 10 ml celkweekmedum en 100 pi 1% oplossing van Nile Blue Sulfate (in water) gedurende 2-3 minuten alvorens terug naar de Dissection Plate. Dit zal vlek het ectoderm, somieten, en notochord snellere identificatie en oriëntatie.
- Gericht op het voorste gedeelte van de embryo, verwijder de notochorda en alle resterende mesoderm blootstellen van de hersenen en optische vesicles (figuur 2C).
- Zodra de hersenen en optische vesicles volledig blootgesteld, met de tang om de neurale buis en onderliggende ectoderm juist achter de hersenen verbreken.
- Draai dit deel (de hersenen en het optische blaasjes) om, zodat de ectoderm is op de top.
- Zorg ervoor dat u de onderliggende optische blaasjes schade, zorgvuldig bentverplaatst het ectoderm (figuur 2D).
- Tenslotte behulp van een tang, scheiden de optische vesicles van de hersenen (figuur 2D en 2E).
Voor embryo's ouder dan stap 25:
- Hoewel het embryo in de verdoving Plate, verwijder het ventrale gedeelte van de embryo met forceps.
- Voor beter contrast Verplaats de embryo tot 60 mm plastic petrischaal met 10 ml 0,1 x MMR en 100 pi 1% Nile Blue sulfaat gedurende 2-3 minuten alvorens naar de Dissection Plate. Dit zal vlek het ectoderm blauw.
- Eenmaal in de Dissection Plate, trek de ectoderm bovenop het netvlies (of optische blaasje voor de embryo's stadium 26-30) (figuur 2F en 2G). Als Nile Blue sulfaat werd gebruikt, zal het ectoderm worden blauw gekleurd maar de onderliggende retinale weefsel niet.
- Verwijder voorzichtig de retina of optische blaasje met forceps (figuur 2h, 2i en 2J). Het is nuttig om de embryo plaats houden met een pincet en de retina of optische vesicle met de andere te verwijderen.
2. Dissociatie van weefsels en Plating van cellen
Belangrijk - Bij het overbrengen van weefsels, niet toestaan dat de retina of optische blaasje aan een lucht-vloeistof grenzen raken, als dit het geval is zullen de cellen te lyseren.
- Zodra de optische blaasje of retina is ontleed, voorzichtig overbrengen naar het explantaat spoelen Plaat met een micropipet met p100 aerosol dopjes en laat zitten voor 30 sec.
- Breng 80 pl van 0,1% trypsine in CMF van het explantaat Dissociatie Plate de explantatie Dissociation Tube.
- Met behulp van een p100 micropipet en aerosol bestendig tips, de retina of optische blaasje te brengen van de Explantatie Spoel plaat aan de Explantatie Dissociatiop Tube, voorkomen van het overbrengen van de explantaten spoeloplossing.
- Laat het weefsel in het explantaat Dissociation Tube dissociëren gedurende 1 uur bij kamertemperatuur. Een retina werd gebruikt per plaat, maar we dat het mogelijk is om meer dan een per plaat gebruiken als gewenst om het aantal cellen per plaat vergroten.
- Om de plaat cellen eerst langzaam verwijderen 40 pi van de oplossing van het explantaat Dissociation Tube en gooi met een micropipet en p100 aerosol dopjes. Met behulp van een p100 ingesteld op 40 pi en aerosol bestendig tips, de overdracht van de cellen (nu dat het weefsel gedissocieerde heeft) in de petrischaal. Wanneer de cellen afzuigen op de plaat langzaam pipetteren en houden de cellen in een klein gebied in het midden van de plaat.
Opmerking: als meerdere beelden van de cellen worden de tijdens het experiment, sluit een rooster (Cellattice) aan de onderzijde van de petrischaal met een klein druppeltje superlijm. Hierdoor kunnen beelden van identieke cellen in dezelfde oriëntatie aan die op diverse punten in de procedure.
- Laat de cellen ongestoord zitten gedurende ten minste 1 uur te houden aan de Nunclon plaat. Na deze tijd, moeten zij zeer voorzichtig worden behandeld of ze kunnen raken.
- Kweekcellen gewenste fase en houdt de sibling embryo's die gekweekt bij dezelfde temperatuur als de cellen. Als levende cellen niet worden gebruikt voor verdere manipulatie, kunnen ze worden vastgesteld MEMFA oplossing op dit moment.
Belangrijke opmerking: De meeste van onze experimenten worden vastgesteld binnen 6 uur van plateren de cellen. De levensduur van de cellen in kweek is afhankelijk van de fase waarin het weefsel werd ontleed en de hoeveelheid dooier nog aanwezig in de cellen, cellen geprepareerd uit jongere (neurula stadia) gezond blijven in kweek gedurende 5-6 dagen, terwijl cellen verkregen van ouder embryo's (zwemmen kikkervisjestadia) levensvatbaar zal blijven in cultuur voor 2-3 dagen.
3. Calcium Imaging 47 tot 49
Dit protocol maakt gebruik van calcium-gevoelige Fluo4-AM en confocale microscopie aan calcium transiënten kwantificeren in individuele cellen. Alle stappen met behulp van Fluo4-AM dient te worden uitgevoerd uit de buurt van licht, zoals Fluo4-AM is lichtgevoelig. Alle wassingen moeten worden toegevoegd of verwijderd met een p1000 micropipet en aerosol-resistente tips. Pipetteren en langzaam naar de rand van de plaat te vermijden, dat de cellen worden gedaan. Het papier is niet veranderd omdat de culturen zijn over het algemeen vastgesteld binnen 6 uur te worden ontleed. Langere termijn kweken moeten de media dagelijks veranderd.
- Fluo4-AM opgeslagen bij -20 ° C, en stellen voor opslag in 5 pi aliquots. Voordat u, ontdooi een 5 ul aliquot van Fluo4-AM uit de buurt van licht en voeg 2 pl Pluronic F-127 rechtstreeks op deze hoeveelheid.
- Na kweken van de cellen voor de gewenste tijd (min.1 uur), verwijderen 1 ml van de celkweek medium van de petrischaal. Voeg dit toe aan de Fluo4-AM en Pluronic, mengen door voorzichtig pipetteren.
- Langzaam terug overdracht van al deze oplossing aan de rand van de petrischaal van de cellen af te beelden en laat de cellen in deze oplossing ongestoord gedurende 1 uur de Fluo4-AM absorberen.
- Uit te spoelen overtollige Fluo4-AM van de celkweek medium, voert u de volgende wasbeurt serie:
- Verwijder 1 ml van de media van de plaat.
- 3 ml vers kweekmedium (de 15 ml conische buis) aan de plaat.
- Voer twee extra wassingen telkens langzaam verwijderen 3 ml oplossing uit de plaat en het toevoegen van 3 ml vers celkweekmedium.
- De cellen moet nu in 4 ml van het celkweekmedium en bevatten Fluo4-AM. Fluo4-AM wordt enzymatisch gesplitst eenmaal in de cel, zodat het niet diffunderen uit de cel of in een membraangebonden compartimenten.
- Voor het laden van de plaat op het podium van de confocale microscoop voor beeldvorming, trek een verticale rode lijn met permanent marker op de schotel terwijl deksel op tot markeerdraad deeltjes te voorkomen dat besmetting van de cultuur. De verticale lijn wordt getrokken langs de zijkant van de petrischaal (de basis van de petrischaal, niet het deksel). Het doel is om de oriëntatie van de petrischaal geven met betrekking tot het gezichtsveld zodat de precieze oriëntatie en uitlijning van de individuele cellen kunnen worden hersteld op een later tijdstip.
- De plaat is nu gereed voor het laden van de fase van de confocale microscoop voor beeldvorming. Visualiseer de cellen met behulp van de helderveld instellingen op een laser scanning confocale microscoop (20X objectief). Zoek een gebied van dichte cellen dat geen klontjes, bij voorkeur met een veld van mening dat de grote raster nummers op de Cellatice dekglaasje om het vinden van hetzelfde gezichtsveld gemakkelijker later bevat wanneer de beeldvorming van de cultuur na in situ hybridisatie. Voorafgaand aan beeldvorming, scherpstellen door de cultuur en neem een helderveld beeld van de onderstaande tabel de cellen naar de plaats en oriëntatie van de celkweek op te nemen. Dit zorgt voor aanpassing van de cellen voor verdere analyse.
- Til de focal plane en het veroveren van een helder veld beeld van de cellen voor het begin van calcium imaging (Figuur 3A).
- Zodra het middenvlak van de cellen in focus, de plaat klaar voor beeldvorming van calcium activiteit. Instellingen zullen variëren afhankelijk van de microscoop en de toepassing. We beeld de cellen met een Argon laser 488 nm voor 1, 2 of 12 uur met de volgende parameters:
- 1 uur foto's:
- Argon 488 nm laser scant op 4% van zijn maximale 30 mW vermogen.
- Scan eens in de 4 sec (900 scans per uur).
- 2 uur afbeeldingen:
- Argon 488 nm laser scant op 4% van zijn maximale 30 mW vermogen.
- Scan een keer per8 sec (450 scans per uur).
- 12 uur afbeeldingen:
- Argon 488 nm laser scant op 2% van zijn maximale 30 mW vermogen.
- Scan eenmaal per 48 sec (75 scans per uur).
Deze parameters zal resulteren in een set van 900 stilstaande beelden per periode. Calcium activiteit kan dan worden opgenomen door analyse fluorescentie niveaus gedurende het tijdsverloop beelden (Figuur 3B) met behulp van een beeldbewerkingsprogramma zoals ImageJ 50.
4. Bevestiging Cellen
- Na imaging kunnen cellen worden vastgesteld op 30 min door het verwijderen van 3 ml oplossing uit de plaat en het toevoegen van 1 ml 2X MEMFA de resterende 1 ml kweekmedium.
- Na fixatie en drogen verwijderen MEMFA cellen met een reeks van 5 min wassingen, elk een volume van 1 ml:
- 25% ethanol in 1X fosfaat gebufferde zoutoplossing (PBS).
- 50% ethanol in 1X PBS.
- 75% ethanol in sdd H 2 O (steriel gedeïoniseerd gedestilleerd water).
- Vervang de laatste wassing met 1 ml 100% ethanol en bewaar plaat bij -20 ° C.
Opmerking: Methanol kan ook worden gebruikt voor deze wasbeurten en voor opslag.
5. Fluorescente in situ hybridisatie (FISH)
Culturen kan worden geanalyseerd met de standaard FISH protocol voor Xenopus beschreven 51 met wijzigingen voor celkweek als geschetst in het Anderson Lab 52. Wijzigingen aan de Anderson Lab protocol worden hieronder vermeld. Alle wassingen wordt uitgevoerd op 35 mm platen in Nunclon volumes van ongeveer 1 ml, tenzij anders aangegeven. Oplossingen zijn zoals gedefinieerd in Sive et al. 53. Tenzij anders vermeld.
Belangrijke opmerking: Gebruik geen fluoresceïne-gelabelde RNA-probes bij het uitvoeren van in situ hybridisatie op cellen afgebeeld voorcalcium-activiteit. Anti-fluoresceïne antilichamen binden aan residuele Fluo4-AM in de cellen en kan positief signaal in alle cellen in de cultuur veroorzaken.
Dag 1: Permeabilisatie en hybridisatie
- Rehydratatie wasbeurten moeten worden ingedeeld naar de uitdroging oplosmiddel gebruikt voor opslag. Voor onze experimenten werden wassingen gedegradeerd tot ethanol in 1X PBS.
- Na rehydratatie, was de cellen drie keer extra in 1X PBS gedurende 5 minuten elk bij kamertemperatuur.
- Meng 25 ml 0,1 M triethanolamine (pH 8,0) met 62,5 pi azijnzuuranhydride in een Falcon buis en snel mengen tot grondig gedispergeerd zoals besproken in de Anderson Lab 52 protocol. Incubeer culturen in dit mengsel gedurende 10 min bij kamertemperatuur. Na azijnzuuranhydride behandeling wassen cellen in 1X saline natriumcitraat (SSC) gedurende 5 min bij kamertemperatuur.
- Verwijder de laatste SSC gewassen en vervangen met 0,2 M HCl (in SDD H 2 O) gedurende 10 min aan cellen permeabiliseren.
- Spoel HCl twee wasbehandelingen in 1X PBS gedurende 5 minuten.
- Prehybridize in ISH buffer bij 60 ° C in een schuddend waterbad gedurende ten minste 6 uur, maar niet prehybridize nachts als deze ernstig vermindert signaal.
- Hybridiseren gedurende de nacht bij 60 ° C voor 8-14 uur in 750 pl verdunde probe (1:250 verdunning van een gezuiverd probe). Het gezuiverde probe concentratiebereiken 1.0 tot +1,5 ug / ul.
Dag 2: verwijdering van ongebonden Probe en Antilichaam Incubation
- Verwijder de probe en spoel culturen gedurende 5 min in 0,2 x SSC bij 60 ° C. Wassen in vers 0,2 X SSC gedurende 1 uur bij 60 ° C.
- Verwijder culturen uit het waterbad en laat ze op kamertemperatuur gedurende 5 minuten.
- Spoel in 0,2 x SSC bij kamertemperatuur gedurende 5 minuten.
- Wassen 15 min in 1X PBS met 0,1% Triton-X-100 (PBT).
- Endogeen peroxidasen inactiveren, wassen gedurende 1 uur in een 2% H 2 O 2-oplossing in PBT.
- Spoel met een 15 min wassen in 1X Tris gebufferde zoutoplossing met 0,1% Tween 20 (TBST).
- Blok in 2% Blocking Reagent in maleïnezuur Buffer (MAB) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur. We hebben gevonden dat deze werkwijze blokkeren gevoeligheid verhoogt in vergelijking met eerdere methoden blokkeren in 20% serum in schapen PBT.
- Incubeer kweken in 1 ml 2% Blocking Reagent in MAB met een 1:1000 verdunning van een POD-geconjugeerde antilichaam overnacht bij 4 ° C.
Dag 3: Verwijdering van niet-gebonden antilichaam en Fluorescentie Ontwikkeling
- Verwijder antilichaam en spoel 3 keer in TBST gedurende 5 min bij kamertemperatuur.
- 4 keer wassen in TBST gedurende 15 min bij kamertemperatuur onder voortdurend schommelen op lage snelheid.
- Tweemaal spoelen in PBT bij kamertemperatuur gedurende 10 minuten.
- 750 ul van toepassing 1:200 fluoresceïne tyramide of 1:25 verdund Cy3 tyramide in PBT. Incubeer gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur en voeg 2,5 ui 0,3% H 2 O 2. Rock gedurende 40 minuten om een signaal te ontwikkelen.
- Wassen minstens 4 maal gedurende 15 min elk in TBST bij kamertemperatuur schudden.
- Zodra signaal volledig ontwikkeld was voor 5 min in 1X PBT.
- Fix in 1X MEMFA gedurende 1 uur bij kamertemperatuur en opslag in 1X PBS bij 4 ° C.
6. Afbeelding FISH Resultaten en Co-registreert bij een Calcium Imaging gegevens
- Na voltooiing van FISH worden celkweek-platen belicht te bepalen welke cellen vertonen een positief fluorescentiesignaal voor een bepaalde probe. Gebruik de Cellattice dekglaasje de exacte gezichtsveld bestudeerd tijdens calcium imaging vinden en de plaat af te stemmen op de oriëntatie van het calcium beeldrasters.
- Concentreren van het middenvlak van de cellen en maak een hoge resolutie met de Helium-Neon HeNe-laser bij 543 nm 15% van de maximale 1 mW vermogen (Figuur 3C).
- In de oorspronkelijke 900 chassis set van beelden uit de Calcium Imaging-protocol,identificeren afzonderlijke cellen gebieden van belang (ROI) door het gebruik van een beeldbewerkingsprogramma (zoals ImageJ 50). Extract ROI fluorescentie gegevens als een verzameling data die representatief time-fluorescentie paar waarden (Figuur 4).
- Overlay de FISH resultaten beeld met de geïdentificeerde ROI van de calcium-beelden (Figuur 3D).
- Geef iedere ROI als positief voor de probe, negatief voor de probe, of onbekende - in het geval dat de cel overeenkomt met de ROI niet meer worden gevonden binnen het gezichtsveld van de vissen.
- Proces ROI fluorescentie gegevens met behulp van statistische analyse scripts (zoals ontworpen door MATLAB of andere programmeertaal) bent voor calcium activiteit te vergelijken tussen de verschillende doorsneden fasen (figuur 5a en 5c) of cellen positief voor verschillende FISH probes (Figuur 5B en 5D). Alle scripts die in ons lab zijn vrij beschikbaar op aanvraag.