Deel 1: RNAi-gemedieerde dubbel gen knockdown
1. dsRNA Synthese
- Ontwerp primers van dsRNAs targeting vg, usp en een controle-gen dat codeert voor groene fluorescentie eiwit (GFP) die niet in de honingbij genoom: primers werden ontworpen met behulp van online gratis software Primer3 ( http://frodo.wi.mit.edu/ ) .
- dsRNA synthese voor vg, usp en GFP: gebruik RiboMax T7 RNA productiesysteem van Promega voor in vitro transcriptie.
- dsRNA zuivering
- Denaturatie en renaturatie: warmte het dsRNA tot 85 ° C gedurende 5 minuten en laat het afkoelen op kamertemperatuur gedurende 1 uur.
- DNase I behandeling: voeg 1 pl DNase I in elk dsRNA reactie en meng ze door de buizen te vegen. Incubeer gedurende 15 minuten bij 37 ° C.
- Voeg 150 ul nuclease-vrij water en 750 pi Trizol - LS in elke reactie, en ze zachtjes mengen door inverting de buis. Incubeer de monsters gedurende 5 min bij 30 ° C.
- Voeg 200 ul chloroform in elk monster. Meng krachtig gedurende 20 sec. Centrifugeer de monsters gedurende 15 min bij 12.000 xg bij 4 ° C.
- Breng de bovenstaande fase aan elke nieuwe buis en voeg 500 ul isopropylalcohol in elke buis. Meng ze door het buisje. Incubeer gedurende 20 minuten bij -20 ° C werd het mengsel Centrifugeer gedurende 10 minuten bij 12.000 xg bij 4 ° C.
- Verwijder de bovenstaande vloeistof en gebruik 1000 ul 75% ethanol te wassen de pellet. Na het centrifugeren van de buis gedurende 5 min bij 7500 xg bij 4 ° C, de lucht drogen de dsRNA pellet, en gebruik nuclease vrij water tot ontbinding van de pellet. Om de effectiviteit van gen downregulatie waarborgen, dient de dsRNA concentratie ongeveer 9 -10 pg / pl zijn.
2. dsRNA Abdominale Injectie
Voor dubbel gen neerhalen, zijn er twee strategieën: 1) enkele injectie: mix dsRNA van twee genen en inject het mengsel; 2) twee-daagse injectie: injecteer de eerste dsRNA targeting een gen op de eerste dag, en injecteer het tweede dsRNA in dezelfde bijen op de tweede dag.
- Chill nieuw opgedoken bijen in een 4 ° C koelkast gedurende 1-2 minuten. Wanneer de bijen worden geïmmobiliseerd, monteren 3-4 bijen in parallel op petrischaaltjes vol met vaste was met insecten pinnen gekruist tussen hun buiken en thoraces.
- Chill de bijen weer in een 4 ° C koelkast. Zorg ervoor dat de bijen zijn volledig immobiel. Het duurt ongeveer 1-2 minuten. De bijen moeten kijken los. Als de bijen worden gekruld of verwrongen, het betekent dat ze zijn te lang, die moet vermeden worden gekoeld. Chilling teveel veroorzaakt hoge mortaliteit, maar volledige immobilisatie is belangrijk als elke beweging neemt de grootte van de wond en mortaliteit.
- Zet een wegwerp 30 G naald (BD) op een Hamilton micro spuit. Neem 3 pi dsRNA en zorg ervoor dat er geen luchtbel in de spuit. De naald wordt ingebracht om een kant van de buik om dama te vermijdenGing interne organen. Druk langzaam op de zuiger om de dsRNA te worden geabsorbeerd. Aangezien dsRNA is zeer viskeus, duurt 2-3 seconden volledig worden verwijderd van de injectiespuit. Na het volledig naar beneden te drukken de zuiger, laat de naald in de wond voor 4-5 sec. Observeren na injecties bijen voor 3-5 sec. Als een hemolymfe druppel lekken uit de wond, gooi de bijen.
- Gebruik verschillende kleuren om hun thoraces overeenkomen met verschillende behandelingen markeren. Op dit punt als de enkele injectie strategie werd gebruikt, de bijen kunnen worden terug in een kolonie geplaatst na 1 uur observatie. Indien de tweedaagse injectiestrategie werd gebruikt, na injectie met de eerste dsRNA, de bijen worden in een cilinder mesh kooi met aan de zijkant voorzien honing geplaatst in een incubator bewaard bij 34 ° C en 80% vochtigheid .
- Op de tweede dag, volgt u de stappen 2.2 en 2.3 aan de bijen relaxen in het gaas kooien en monteer ze op wasplaten. Voer injecties met de tweede dsRNA zoals het is described in stap 2.4.
- Laat de bijen terug bij kamertemperatuur gedurende 1 uur en te introduceren in een kolonie.
Opmerking: Knockdown effecten kunnen worden gedetecteerd door kwantitatieve RT-PCR (qRT-PCR) en western blotting. In het algemeen knockdown werkzaamheid varieert en hangt af van vele factoren. In onze studie kan een dubbele gen knockdown gedetecteerd 7 dagen na een enkele injectie en twee dagen injecties.
Deel 2: Zuigorganen extensie respons (PER) assay
1. Verzamelen Bijen van de Bijenkorf
Op dag 6 na de injecties, verzamel behandelde bijen uit de kolonie zonder gebruik van een roker. Verzamelen bijen in metalen gaas cilinder kooien. Houd 3 bijen in elke kooi.
2. Montage Bijen voor PER
Chill de bijen bij 4 ° C tot ze volledig geïmmobiliseerd. Monteer elke bij verticaal in een plastic buis speciaal ontworpen voor PER. Houd de buik in de buis door using twee kleine stukken tape, en houd het hoofd steken van de buis. Zet de buisjes op een rek met twee rijen van kleine plastic kolommen, en wijst elke buis (bee) met een ID-nummer. Zet vervolgens behandeld bijen op de rekken in een incubator (34 ° C en 80% luchtvochtigheid) en bewaar ze in de incubator voor 2 uur.
3. Het voorbereiden van een serie van sucrose Water Solutions
Bereid 0%, 0,1%, 0,3%, 1%, 3%, 10% en 30% sucrose water oplossingen en laadt de oplossingen in spuiten met 15-20 G naalden.
4. PER Assay
Druk antenne van de bij een druppel 0% oplossing (water) gevolgd door 0,1%, 0,3%, 1%, 3%, 10% en 30% sucrose wateroplossingen. Test alle bijen eerst met water en laat minstens twee minuten het interval tussen elke oplossing wordt gebruikt. Daarom hebben we meestal minstens 20 bijen voor elk onderzoek. Als een bij volledig breidt haar slurf, wordt een positieve reactie geteld.
5.Gegevensbeheer
Kortom het totale positieve reacties voor elk individu voor gustatory respons score (GRS). Voer een geschikte statistische analyse van de gegevens.
Deel 3. Gen knockdown validatie
Vetlaag ontleed uit een andere set van 7 dagen oude behandelde bijen. Een standaard TRIZol procedure wordt toegepast voor RNA-extractie, gevolgd door DNase I behandeling 24. Vg en usp genexpressie geanalyseerd door een twee-staps qRT-PCR. Actine gebruikt als een referentie-gen omdat zij stabiele expressie in verschillende weefsels van honingbijen. Gepubliceerd real-time PCR primers voor vg en usp gen worden in dit experiment 24. De gegevens worden geanalyseerd met behulp van Delta-Delta CT methode 25.