Door opmerkelijke vooruitgang in technologie die onderzoek van de transcriptoom en proteoom op celniveau toelaat, is het nu duidelijk dat de biochemie en de resulterende flux van metabolieten en ionen zijn zeer specifiek celtype. Bijvoorbeeld, in de lever van zoogdieren, sequentiële glutamine afbraak en synthese gelijktijdig uitgevoerd door periportale cellen en periveneuze cellen respectievelijk toevoeren ammonium om het ureum cyclus in het eerste type cel en verbruikt overmaat ammoniak in de laatste 1-3. In sommige gevallen is significant biochemische heterogeniteit waargenomen zelfs in een "celtype" 4, 5. Naast dergelijke ruimtelijke specificiteit, de cellulaire niveaus van metabolieten en ionen die aan snelle veranderingen (bijv. signaalmoleculen zoals Ca2 + en cyclische nucleotiden). De spatiotemporele metabolieten en ionen spelen vaak cruciale rol in signaaltransductie. MMonitoring van cellulaire dynamiek van metabolieten en ionen, echter, vormen unieke uitdaging. In veel gevallen de verandering in concentraties snelle en voorbijgaande, geïllustreerd door het geval van signalerende moleculen zoals Ca2 +, die vervalt binnen ~ 20 msec dendritische 6. Bovendien compartimentering van biochemische pathways in en tussen de cellen maakt het moeilijk om de dynamiek van metabolieten en ionen kwantificeren middels extractie en chromatografie / massaspectrometrie technieken.
Genetisch gecodeerde sensoren voor biologische moleculen worden nu op grote schaal gebruikt vanwege de hoge spatiotemporal resolutie waarmee de experimentator om kortstondige en / of gecompartimenteerde moleculaire dynamica te bestuderen (beoordeeld 7, 8). Deze genetisch gecodeerde sensoren kunnen grofweg worden onderverdeeld in twee categorieën; intensiteit gebaseerde sensoren en ratiometic sensoren. Intensiteit gebaseerde sensoren bestaan doorgaans uit een bindend domein en een grieporescent eiwit (FP), en de opgeloste binding aan het bindingsdomein verandert de fluorescentie-intensiteit. Ratiometic sensoren, daarentegen, vaak gebruik maken van Foster Resonance Energy Transfer (FRET) tussen twee KP die functioneren als FRET-paar. Deze sensoren bestaan uit een bindend domein en twee KP's, en de opgeloste stof binding induceert de verandering in de FRET efficiëntie tussen de twee KP's. Een groot aantal sensoren voor biologische belangrijke metabolieten en ionen ontwikkeld in het afgelopen decennium 8, 9.
Een van de interessante mogelijkheid die zodanig genetisch gecodeerde sensoren is hun gebruik in de hoge-resolutie analyse van membraantransport processen die voorheen moeilijk te detecteren op cellulair niveau. Genetisch gecodeerde sensoren vergemakkelijken de analyse van mechanismen vervoer, zoals substraat specificiteit en pH-afhankelijkheid 10, 11. Bovendien, in combinatie met de genetische resRONNEN zoals de bibliotheek van RNAi constructen voor modelorganismen, is het nu mogelijk om genoom-brede bevragen voor nieuwe transportprocessen met genetisch gecodeerde sensoren. Inderdaad, het gebruik van genetisch gecodeerde sensor aan de ontdekking van eerder gekenmerkte transporters in meerdere gevallen 12, 13.
Onlangs heeft ons laboratorium een reeks van FRET-gebaseerde sensor voor glutamine ontwikkeld. We hebben aangetoond dat cellulaire glutamine niveaus kunnen worden gevisualiseerd met behulp van dergelijke FRET glutamine sensoren 10. Deze sensoren omvatten een FRET-donor (mTFP1) ingebracht in een bacterieel glutamine bindingseiwit glnH en een FRET acceptor (venus) en de C-termini van glnH (figuur 1). FRET efficiëntie van deze sensoren verminderen na binding van glutamine, waardoor de afname van acceptor / donor intensiteitverhouding. Fijnregeling glutamine transportprocessen belangrijk in biologische processen zoals neurotransmissie 14, 15 en het behoud van ureum cyclus in de lever 1, 16, 17.
Hier laten we de methodologie voor het analyseren van transportactiviteiten met FRET sensoren voor glutamine, met behulp van een wide-field fluorescentie microscoop set-up. Het doel van de experimenten hier moeten transporter activiteiten op te sporen in een vak en substraatspecificiteit van een tijdelijk tot expressie transporter onderzoeken.