Ontwikkeling van een plaat gebaseerde robot stamcellen cultuur platform.
De vraag naar iPSCs groeit als gevolg van hun nut in de ontwikkeling van geneesmiddelen en regeneratieve geneeskunde. Toch schaalbare productie is gericht op suspensiecultuur 32 in relatief complexe apparatuur die veel onderzoekers uitsluit en afwijkt van gevestigde aanhangend kweekmethoden. Eerder dan bewezen plaat gebaseerd stamcellen celcultuur methoden, zoals overschakelen naar een schorsing cultuur of met behulp van een microdrager drastisch veranderen, hebben we ons gericht op de miniaturisering en het automatiseren van onze bestaande aanhangend iPSC kweektechnieken. Het hoofddoel was automatiseren voeding en passeren van de gehele kweekproces normaliseren. Een platform die snel opschaling bestaande technologie werd ook vereist. Om deze doelstellingen een methode ontwikkeld om de cultuur stamcellen in een 96-well plaat met behulp van een geautomatiseerd vloeistofverwerkingsysteem (figuur 1) te bereiken. De protocols hier ontwikkeld met de liquid handling robot voor het voeden en passage niet een centrifugatiestap of continue controle door een technicus nodig. Deze protocollen werden ontwikkeld met twee voedingsvrije iPSC lijnen; één afgeleid van fibroblasten en de ander van vetcellen 33.
De computergestuurde vloeistofverwerkingsysteem (figuur 1A) bestaat uit een flatbed die voor en achter beweegt. Het bed heeft negen, ongeveer 5 x 3,3 inch genummerde uitsparingen met druk clips behoud van de standaard celkweek platen, vloeibare reservoirs en andere aangepaste hardware te accepteren. De pipet kop beweegt van links naar rechts (loodrecht op bed beweging) en op en neer. Samen met het bed, kan de pipet hoofd worden geprogrammeerd om te verwijderen of te leveren overal op het bed media na het oppakken van pipet tips van een hervulbare rek. Eventueel kan elk van de 96-wells gescheiden gehouden om kruisbesmetting te elimineren. In deze configuratie, 0 tot200 ul van de media kan worden verplaatst door elk punt van de pipet hoofd, maar ook andere volume bereiken zijn mogelijk op basis van tip grootte.
Bij passage stamcellen in standaard platen, enzymatische of chemische dissociatie vereist normaliter incubatie bij 37 ° C. Initiële testen bevestigd dissociatie met proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens of EDTA gebaseerde reagens beter presteerden bij 37 ° C KT zowel de tijd tot dissociatie en homogeniteit van koloniegrootte geproduceerd voor onze twee 96-well iPSC lijnen (gegevens niet getoond). Om de splitsing proces te automatiseren en te voorkomen dat het verplaatsen van platen in en uit een incubator, hellende, temperatuurgecontroleerde hellingen die te accepteren en reproduceerbaar te positioneren standaard kweekplaten werden gebouwd (Figuur 1A). Wanneer de opritten 37 ° C, een proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens of EDTA gebaseerd dissociatie van de iPSCs van 96-well platen werden verhit was vergelijkbaar met platen geplaatst in een 37 ° C incubator (data not getoond). De hellende hellingen werden gebruikt om pipet tips in staat om de inhoud van een hele put (minder dan 5 uL restvolume) verzamelt door het laagste punt van de put terwijl aspiratie bereiken van een vlakke plaat hebben een restvolume van ongeveer 10-15 pl, resulterend in cel verlies. De schuine hellingbaan ook toegestaan de putjes worden gewassen (getritureerd) van het uitwerpen media bovenin de put hellende en te verzamelen op de bodem.
Robotic kweek van stamcellen in de 96-well plaat formaat; voeden en passage.
Cultuur van iPSCs met behulp van de robot liquid handling systeem heeft twee fasen; passage en voeding. Wanneer een kolonie direct passage wordt gesplitst op een vooraf bepaalde verhouding om een nieuwe plaat, die vervolgens wordt toegevoerd regelmatig zaad tot het klaar voor passage opnieuw (Figuur 1B). Bevroren of niet-96-well cultures gestart worden in de 96-well formaat en onmiddellijk in de doorgang / voedingcycle. Cellen die niet worden gebruikt om de kolonie, die de meerderheid van een plaat behouden, geoogst voor andere doeleinden en vertegenwoordigen de productie component van dit systeem.
Feeding 96-well gekweekte iPSCs is volbracht wanneer sommige of alle van de media wordt verwijderd na een periode van cultuur en gestort in een afvalreservoir. Dan verse media hoeveelheden verdeeld op dezelfde plaat. De robot kan nieuwe tips en media dalen gebruiken om elk goed te scheiden voor volledig klantgericht voeden, met inbegrip van het mengen van geconditioneerde media met nieuwe media.
Typische passage van stamcellen is een werkwijze voor dissociatie en vaak centrifugatiestap. De hier beschreven protocollen beoogt dissociatie normaliseren en te elimineren centrifugatie. De passage protocol begint wanneer de robot levert dissociatie reagens 96-well platen gemonteerd op 37 ° C hellende hellingen. Na een vooraf ingestelde tijd, worden de gescheiden cellen verzameld met een wasmachine actie waar de gebruiker heeft control over de positie, de herhaling, volume, en trituratie tarief. Enzyme tijd, aanwrijven rate en het aantal verwrijving herhalingen waren voldoende om los kolonie grootte en homogeniteit (figuur 2) variëren, maar elke parameter is instelbaar aan de eisen van een bepaalde cel lijn past. Deze controle verwijdert variabiliteit geïntroduceerd door technici die pipet met verschillende tarieven, posities, en herhalingen. Zodra de gedissocieerde cellen verzameld en samengevoegd in een reservoir met vers medium, worden ze geleverd aan een nieuwe plaat. Om centrifugeren en zaaien problemen van substraat degradatie of celdood ten gevolge van acties enzym te vermijden, werd dissociatie reagens verdund tot het minimum punt van aanvaardbare dissociatie dat resulteerde in betrouwbare zaaien. Deze techniek was effectief voor een proteolytisch en collagenolytische dissociatie reagens in mTeSR1 medium 34, die een relatief hoog eiwitgehalte heeft, maar ook effectief in lage eiwit media zoals Essentiele-8 35 , die beide compatibel met het systeem (E8 data niet getoond).
Beheersing van de seeding dichtheid van stamcellen na passage is van cruciaal belang voor routine en succesvolle stamcel cultuur. Zaaien te laag of hoog kan resulteren in ectopische differentiatie en verlies van pluripotentie in Naast het veroorzaken onregelmatige tussenpozen passage. Typische stamcel cultuur baseert zich op verhouding splitsen waarbij één putje van een 6-wells plaat wordt gebruikt om een hele nieuwe 6-well plaat zaad (een 1: 6 split). Met de vloeistofverwerking robot Deze verhouding kan worden aangepast aan de wensen van de gebruiker aangepast (bijvoorbeeld 1: 6, 1: 9, 1:12, etc.) en het heeft de meeste invloed op de passage interval. De robot kan dan een kolom, een volledige kolom (8 wells), of meer dan één kolom oogsten afhankelijk van de behoeften van de gebruiker, welke empirisch worden bepaald. De vet- en fibroblast afgeleid iPSCs onderhouden een regelmatige driedaagse voeden schema met passage op de vierde dag, toen gesplitst 01:12. In dit geval werd een kolom geoogst en gebruikt voor zaad een nieuwe 96-well plaat, waardoor een 01:12 split met elke cyclus (Figuur 3A). De resterende 11 putjes werden vervolgens beschikbaar voor verdere toepassingen. Om deze 11 productieputten oogsten, werd de passage protocol herhaald, behalve de cellen werden gestort in een trog voor de collectie. Als alternatief kunnen de cellen worden op het bord en direct.
Consistente entdichtheid doorgang naar doorgang een routine splitting schema bereiken zonder te tellen en te onderhouden, onze protocols roepen splitsen hetzelfde voorafbepaald aantal kolommen als de kolonie op een ideale dichtheid voor passage. Om gebruikers de juiste densiteit voor passage een reeks beelden gegenereerd met een reeks van dichtheden een ideale passage dichtheid gemarkeerd (Figuur 3B). Om te bepalen wanneer passage, een technicus onderzoekt hun bord en vergelijkt het met de belichting schaal. Het ideel dichtheid passage werd bepaald uit kweek van de vet- en fibroblast afgeleide iPSCs en gevonden wanneer de ruimte tussen de meeste kolonies was ongeveer 25% van aangrenzende kolonie diameter. Het is belangrijk dat de koloniën homogeen verdeeld. Deze hoeveelheid kolonie scheiding correleert met de maximale wenselijke dichtheid omdat een extra voerbeurt leidt tot kolonies raken, wat een trigger voor ectopische differentiatie.
Een noodzakelijke protocol hier ontwikkeld adressen hoe een cultuur starten in de 96-well formaat en hoe een cultuur resetten na een dichtheid probleem. Wanneer een nieuwe kweek wordt gestart, de beste zaaidichtheid en het aantal voedingscycli vóór passage onbekend. Een bruikbare dichtheid na het zaaien verlenen de robot verspreidt bestaande of ontdooide cellen over een 96-wells plaat in een seriële verdunning (figuur 4A). Voorbeeld resultaten van een dergelijke gradiënt worden getoond in Figuur 4B-E. Na een aantal voedingcycli, een aantal zuilen naderen de ideale dichtheid te splitsen, op welk punt een technicus gebruikt de robot om zaad van een uniform verdund plaat regelmatig cultuur beginnen. Deze dichtheidsgradiënt protocol werd ook toegepast om regelmatig passage tussenpozen kolonie homogeniteit herstellen naar een onregelmatige plaat. Als doorgang wordt vertraagd of gemist, te hoog kolonie dichtheid en grootte te worden, terwijl als passage is te vroeg, kolonie dichtheid is te laag en individuele kolonies te groot geworden zonder gelijkmatig verdeeld over de put. De dichtheidsgradiënt protocol lost deze problemen en stelt de gebruiker opnieuw op te starten door het plukken van een ideaal gezaaid set van putten.
Twee iPSC lijnen bleef pluripotente na 3 maanden robotachtige cultuur.
Onderhoud van stamcellen pluripotency kan negatief worden beïnvloed door kweekomstandigheden 36,37. Om te evalueren of vet- en fibroblast afgeleide iPSC lijnen (a-iPSC, f-iPSC respectievelijk) gehandhaafd pluripotency robot indien gekweekt in 96-well platen gedurende langere tijd, de beide lijnen werden gekweekt op de vloeistofverwerking robot zoals boven beschreven voor 3 maanden en pluripotentie markers onderzocht. Voor deze periode beide lijnen werden gepasseerd door een proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens meer dan 20 maal zonder centrifugeren. Vaste 96-wells platen uit een iPSC en f-iPSC lines gekleurd voor Oct4 en Nanog vertoonden nucleaire accumulatie van deze markers terwijl SSEA-4 werd waargenomen op het celoppervlak (figuur 5A-L). Dit is consistent met eerdere rapporten voor pluripotent iPSCs 38-41. Tegenkleuring met DAPI geen additionele cellen die geen positief voor de drie pluripotentie markers werden ook zien. Chromosomale abnormaliteiten worden vaak waargenomen tijdens stamcelkweek 42,43 maar brengen geen verdeling van pluripotentie markers zoals die getoond in figuur 5A-L. Karyotype analyse bleek zowel robot passage iPSC lijnen had 46 normale chromosomen, wat suggereert dat de robot kweekmethode heb chromosomale instabiliteit dan wat normaal zou kunnen optreden (figuur 5M-N) niet te introduceren.
Om sonde opgericht stamcel genexpressie markers 1,41,44,45 in de robot gekweekte iPSC lijnen, werd totaal RNA verzameld parallel aan vlekken en karyotype analyse. Zowel de 96-well plaat iPSC lijnen had soortgelijke uitdrukking van pluripotentie markers NANOG, POU5F1 en REX1 terwijl hartspiercellen onderscheiden van elke regel niet, noch een aparte lijn van de menselijke huid fibroblasten (HDF) (Figuur 6). De hartspiercellen afgeleid van beide lijnen waren MYL7 positief, terwijl de HDF en stamcellen had MYL7 niet uiten. Beide iPSC lijnen werden onderscheiden in hartspiercellen met de kleine molecule, Wnt-route manipulatie techniek onlangs beschreven 46 . Wanneer gekleurd, hartspiercellen van beide lijnen waren cTnT positief met duidelijke sarcomeer vorming (Figuur 7). Differentiatie in cardiomyocyten als de 96-well formaat was succesvol in meer dan 80% van de putjes (data niet getoond). Tezamen suggereren deze gegevens 3 maanden en meer dan 20 passages robotachtige cultuur resulteerde in chromosomaal normale cellen vertonen een transcriptie-programma in overeenstemming met pluripotentie die ook in staat waren differentiatie in hartspiercellen.

Figuur 1. Overzicht van de robot stamcellen cultuur apparatuur en typische iPSC cultuur routine. (A) Robotic liquid handling systeem getoond met typische bed lay-out voor 96-well stamcellen cultuur. Nieuwe steriele pipet tips (tips), afneembare tip afvalcontainer (Waste), multi-well autoclavable dal te houden vereiste vloeibare reagentia (Liquids), 96-well platen worden gepositioneerd een d ondersteund op een constante temperatuur schuine helling (96-well platen), 8 kanaals pipet robotachtige kop die links / rechts en op / neer (Pipet weg) beweegt. Plate deksel houden rack (PLHR). Bed positie nummers in tabel weergegeven. (B) Robotic iPSC cultuur heeft twee fasen: Voeding en Passage. De cyclus van cel productie begint wanneer een kolonie plaat klaar is om passage. De gebruiker de gewenste verhouding om doorgang kiest op de robot zaden een nieuwe groep van 96-wells platen opnieuw gevoed regelmatig tot klaar voor passage. Wanneer de platen klaar voor passage meeste elke plaat wordt niet gebruikt voor latere kolonie platen zaad en is beschikbaar voor andere toepassingen, waardoor die de productiefase van het systeem. Bevroren of bestaande cellijnen kan op elk moment worden ingevoerd en in stand gehouden in het voer / passage-cyclus. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
e_content "fo: keep-together.within-page =" always ">
Figuur 2. Robotic vloeistofverwerking parameters kunnen worden gebruikt om iPSC kolonie dissociatie eigenschappen regelen. Elk beeld representatief toont fibroblasten afgeleid iPSCs los nadat de geïndiceerde behandeling, terwijl nog steeds opgeschort in de 96-well. (Top Row,
A -
C) Enzyme Time, geen wrijven. Fibroblasten afkomstig iPSCs gekweekt in 96-well platen werden blootgesteld aan toenemende tijd van proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens dissociatie en geen robotachtige tritureren werd uitgevoerd. (Midden-Row,
D -
F) Triturering tarief, 3 minuten enzym. De cellen werden blootgesteld aan drie minuten van proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens behandeling en vervolgens 175 ul groeimedium werd toegepast en elk goed op en neer ooit gepipetteerd op de aangegeven snelheid. gl / sec = microliter per tweede. (Onderste rij,
G -
I) Triturering Herhalingen, 3 minuten enzym, 160 ul / sec. De cellen werden blootgesteld aan proteolytische en collagenolytische dissociatie reagens voor 3 minuten werd 175 ul groeimedia toegepast, dan aangewreven bij 160 pl / sec voor het aangegeven aantal herhalingen.
Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken. 
Figuur 3. Typische vet- en fibroblast iPSC kolonie onderhoudsschema en een reeks beelden kolonie dichtheid te bepalen wanneer overgang naar een normale voeding / passage-cyclus te handhaven. (A) Beginnend met een vet of fibroblast 96 putjes iPSC kolonie direct passage, een kolom cellen werd gepasseerd over de robot zonder centrifugatie en verdund12 nieuwe kolommen die gevoed werden op specifieke tijdstippen daarna tot de plaat was klaar om passage opnieuw. Voor celproductie, werden de kolommen niet gebruikt om de kolonie handhaven gepasseerd en verzameld voor verder gebruik. Elk aantal kolommen kan worden gepasseerd expansie te regelen. (B) om te bepalen wanneer passage, een serie beelden dichtheid gevangen elke 24 uur werd verstrekt aan de gebruikers. In de bovenste rode doos (binnen 72 uur na de eerste zaaien) de kolonie is niet dicht genoeg om de doorgang en moeten worden gevoed. Wanneer de dichtheid overeenkomt met de gegevens in de groene box (bij ~ 96 uur), de kolonie op een ideale dichtheid voor passage. Door 120 uur, de kolonie te dicht om passage en dit scenario moet worden vermeden. De laatste kan worden opgelost met een helling seeding dichtheid maar routine cultuur in deze dichtheid wordt sterk afgeraden. Witte balk is gelijk aan 200 uM. Klik hier om een grotere versi bekijkenop van dit cijfer.

Figuur 4. 96-well robot kweeksysteem kunnen gebruikers cultures gaan van bevroren of actieve cellijnen en voer een seeding gradiënt. (A) Een cel wordt bereid door de gebruiker uit een bevroren cel stock of na het oogsten van een actieve cultuur gebracht op de robot. Het robotsysteem voert vervolgens een seriële verdunning protocol bij de aanvankelijke celoplossing langs de 96-well plaat met de dichtheidsgradiënt gedistribueerd door kolom- verdelen. (B - E) Voorbeelden van celdichtheid van vier van de twaalf kolommen van A, 48 uur na de dichtheidsgradiënt zaaien protocol. Witte lijnen gelijk aan 225 micrometer. Klik hier om een grotere versie van deze fotofiguur.

Figuur 5. Pluripotentie wordt gedurende vet- en fibroblast afgeleide iPSC lijnen in 96-well robot cultuur 22 (vet) en 23 (fibroblast) doorgangen (~ 3 maanden). (A - L) vet- en fibroblast afgeleide iPSC cellijnen waren robotically gevoed en gepasseerd zoals beschreven in de tekst zonder centrifugatie in 96-well platen voor 22 of 23 passages vervolgens gefixeerd en gekleurd voor pluripotentie markers Oct4, Nanog of Ssea4 met DAPI tegenkleuring. Witte balk is gelijk aan 100 micrometer. (M - N). Parallel culturen met die in A beschreven werden ingediend voor karyotype analyse die een normale complement van 46 chromosomen onthuld Klik hier om een grotere versie te bekijken of dit cijfer.

Figuur 6. Vetweefsel (96-A) en fibroblast (96-F) afgeleide iPSCs gekweekt gedurende meer dan 20 passages in de 96-well formaat, waarin robot pluripotentie genexpressie en onderscheiden in hartspiercellen. Totaal mRNA werd geëxtraheerd uit met robot gekweekte iPSC lines alsmede cardiomyocyten onderscheiden van beide lijnen (CM-A = adipose iPSC afgeleide cardiomyocyten, CM-F = fibroblast iPSC afgeleide cardiomyocyten, verzameld 14 dagen na differentiatie inductie) en gebruikt voor RT-PCR om pluripotentie markers NANOG, POU5F1, REX1 probe, cardiomyocyte marker MYL7 en laden controle GAPDH. Menselijke dermale fibroblasten (HDF) werden ook verzameld en gebruikt als een niet-iPSC, niet-cardiomyocyt control. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 7. Fibroblasten en vetweefsel afgeleide iPSCs behouden het vermogen om te differentiëren in cardiomyocyten na langdurige 96 putjes robotic kweek (A - H). Adipose en fibroblast iPSCs gekweekt in 96-well format robot meer dan 20 passages werden gedifferentieerd tot cardiomyocyten . 14 dagen na de differentiatie inductie, werden 96-well plaat gebonden hartspiercellen los en opnieuw uitgeplaat bij een lage dichtheid op glas dia's voor immunokleuring van troponine T (rood), F-actine (groen) en kernen (blauw). Klik hier om te bekijken grotere versie van deze figuur.
p_upload / 52755 / 52755fig8.jpg "/>
Figuur 8. Opschaling 96-well plaat stamcelkweek. Opwaardering van stamcelproductie afhankelijk van het aantal gebruikte platen naar de volgende groep platen zaad. De gebruiker kan een productieniveau hetzij handhaven door passage van hetzelfde aantal platen bij elke splitsing gelegenheid of uitbreiden productie met zaaien meer platen. Bijvoorbeeld, in cyclus 0, is een 96-putjesplaat gepasseerd twaalf nieuwe platen (cyclus 1), waardoor een 12-voudige expansie. Dit percentage kan worden gehandhaafd als één van de twaalf platen wordt gepasseerd om een nieuwe set van twaalf platen (Cyclus 1-2), of uitgebreid door passage van meerdere platen (Cyclus 2-3). Tijdens passage kentekenplaten niet gebruikt om de kolonie handhaven vindt verdere toepassingen. Daarom passage 12 platen routinematig kunnen wel 144 platen op in twee passages: 12 voor colony onderhouds- en 132 voor andere toepassingen."> Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 9. Doelmatigheid van 96-well plaat gebaseerde cultuur celproductie ruim overtreft manuele cultivatie. Zoals in figuur 8, kan een plaat worden gepasseerd twaalf platen, die vervolgens kunnen worden gepasseerd om 144 platen zaad. Deze expansiesnelheid kan op twee gesplitste mogelijkheden. Een technicus vereist ongeveer 3,5 minuten te voeden een 6-wells plaat terwijl ze besteden ongeveer 30 seconden met een 96-wells plaat te onderzoeken op de microscoop en plaats het op de robot. Als de technicus draagt 144 platen, zullen ze ongeveer 1,2 uur hanteren platen besteden bij het voeren met de robot, terwijl handleiding cultuur zal een speciale 8 uur te voeden nodig. Klik hier om vIEW een grotere versie van deze figuur.